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文档简介

一、 CERVUS用于群体遗传学分析1. 先将数据输入excel表格中。SSR的输入格式如图1图1Individual一列指的是某一群体中的个体编号；sex指编号对应个体的性别，这一列可有可无；20a，20b两列表示的是编号为20的微卫星位点在一个个体中的两个等位基因。用0,0表示没有数据 或者测不出来或者这个位点丢失。2. 将excel中的数据转化为文本文件格式，如图2，图3图2图33. 将生成的txt文件导入到CERVUS，如图4图4出现图5对话框点击“select”，选择刚才生成的txt文件，导入。ID in column指的是个体编号所在的列，一般都为1。First allele in column指的是最先出现等位基因的列。如果有sex那一列，就填3,；如果没有sex那一列，就填2。Number of loci 指的是输入的数据中包括几个SSR位点。点击save as，选择计算完生成的文件保存的地址。生成的文件有两个，如图6图6打开123.txt，如图7图7 Locus一列指的是SSR位点的名称，K指的是某一SSR位点的等位基因数，N指的是群体个体数，Hobs指的是观测杂合度，HExp指的是期望杂合度，PIC指的是多态信息含量。SNP输入格式如图8图8因为SNP是二等位性的，所以可以
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