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个人总结及展望 下一步工作 主要工作介绍 毕业提纲设想 所学所感 目录 其他工作 所学所感 习惯与养成 QQ 新浪 微博 1 养成习惯 每天至少收一次邮件 最好用foxmail或outlook随时收邮件2 学会用中国知网 学术Google搜索论文3 每周实验室都会有组会 文体活动 希望积极参加去4 论坛59 77 16 75注册并仔细读实验室工作板块的置顶帖子 所学所感 研究生的开始 一个简单的网站 根据用户输入的身份证前17位 计算第18位 主要工作介绍 简介 数据挖掘流程 1 确定业务对象 2 数据准备1 数据的选择2 数据的预处理3 数据的转换 3 数据挖掘 4 结果分析 5 知识的同化 主要工作介绍 miRNA简介 介绍microRNA MicroRNA miRNA 是一种长度约为18 29个核苷酸 nucleotides 的非编码小分子RNA 作为小分子RNA家族中的一员 MicroRNA已经受到广泛的关注 在2006年度诺贝尔生理学或医学奖就颁发给了小分子RNA的研究者 主要工作介绍 miRNA简介 介绍microRNA 生物合成图 主要工作一介绍 miRNA预测综述 二级结构对RNA正常功能非常重要 有时甚至于较序列重要 这可以帮助用于分析非编码RNA 生物信息学的应用会使用一些二级结构的概念来分析RNA 所以我们分析了不同的二级结构预测软件 主要工作一介绍 miRNA预测综述 主要工作二介绍 miRNA前体预测 microRNA序列 预处理 特征提取 预测 分类器投票 结果 主要工作二介绍 miRNA前体预测 预测结果 主要工作三介绍 miRNA家族分类 研究显示miRNA有利于疾病和药物设计的发展 我们发现同样的家族总是拥有同样的发病机制和类似的工作机制 家族的研究一定程度上利于疾病和药物研究 我们提出了一种分层思想的家族预测方法 有效地预测miRNA的家族进而从PubMed中挖掘这个家族与一些疾病的关系 特征提取方法 n gram miRNA一共有四种碱基 A C G U 对于N Gram我们使用N 1 2 3 为了提取n grams 用一个大小为n的滑动窗口在miRNA序列的5 到3 之间扫描 在序列上的每一个位置 被长度为n的滑动窗口覆盖的子序列都对应与一个n gram 随着窗口移动 每一个遇到的n gram的出现频率被记录下来 用n gram特征提取 分层预测 主要工作三介绍 miRNA家族分类 主要工作四介绍 miRNA物种差异 miRNA的降解或翻译抑制 对多种生物学过程起调控作用 在植物和动物中 miRNA执行这种调控作用的机理却不尽相同 同时miRNA在动植物体内的形成过程也存在很多的不同之处 1 植物miRNA前体的茎环结构更大 更复杂 大约是动物中的3倍长 2 加工方式不同3 植物miRNA具有较高的进化保守性 因此 对植物miRNA目标基因的预测要相对简单 4 基因组上的存在位置不同 5 植物miRNA长度多为21nt 而动物miRNA长度多为22 23nt 6 作用机制不同 主要工作四介绍 miRNA物种差异 主要工作四介绍 miRNA物种差异 在生物进化过程中 动 植物从最后的共同祖先分化后 各自miRNA基因的进化是彼此独立的 但miRNA依然普遍存在于动 植物中 从一定侧面证明了miRNA对于生物个体形成和发展具有重要的意义 其他工作 其他工作 其他工作 毕业论文 实习 毕业提纲设计 microRNA miRNA 的研究是目前生物信息学领域最重要的课题之一 MicroRNA已经受到广泛的关注 在2006年度诺贝尔生理学或医学奖就颁发给了小分子RNA的研究者 研究表明人类全部基因的三分之一都受到miRNA调控 miRNA重要的调控表达作用使越来越多的生物信息学研究人员致力于miRNA的预测 分类以及功能研究 本文从分析miRNA前体预测软件 家族分类以及不同种族miRNA功能差异分析出发 发掘最优miRNA前体预测分析软件 用最有软件预测前体miRNA 然后使用数据挖掘方法高效判定前体miRNA所属家族 最后对miRNA不同物种功能特性进行分析 毕业提纲设计 1 对从头计算的的microRNA识别方法