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微生物学前景微生物学前景 作者 hampc 出自 hampc 浏览 评论 1 381 6 日期 2006年10月12日 22 55 一 微生物学在解决人类面临的五大危机中的作用 人所共知 当前人类正面临着多种危机 诸如粮食危机 能源匮乏 资源紧缺 生态 恶化和人口爆炸等 人类进入21世纪后 将遇到从利用有限的矿物资源时代过渡到利用无 限的生物资源时代而产生的一系列新问题 由于微生物细胞不仅是一个比面值 specificsurface 大 生化转化能力强 能进行快速自我复制的生命系统 而且它们还具 有物种 遗传 代谢和生态类型的多样性 使得它们能够在解决人类面临的各种危机中发 挥其不可替代的独特作用 现分述如下 一 微生物与粮食 粮食生产是全人类生存中至关重要的大事 微生物在提高土壤肥力 改进作物特性 如构建固氮植物 促进粮食增产 防治粮食作物的病虫害 防止粮食霉腐变质以及把多 余粮食转化为糖 单细胞蛋白 各种饮料和调味品等方面 都可大显身手 二 微生物与能源 当前 化石能源日益枯竭问题正在严重地困扰着世界各国 微生物在能源生产上有其 独特的优点 把自然界蕴藏量极其丰富的纤维素转化成乙醇 据估计 我国年产植物秸 秆多达5 6亿吨 如将其中的10 进行水解和发酵 就可生产燃料酒精700 800万吨 余 下的糟粕仍可作饲料和肥料 以保证土壤中钾 磷元素的正常供应 目前已发现有高温厌 氧菌例如 Closiridiumthermocellum 热纤梭菌 等能直接分解纤维素产生乙醇 利用产 甲烷菌把自然界蕴藏量最丰富的可再生资源 生物量 biomass 转化成甲烷 这是一 项利国 利民 利生态 利子孙的具有重大战略意义的措施 利用光合细菌 蓝细菌或 厌氧梭菌类等微生物生产 清洁能源 氢气 通过微生物发酵产气或其代谢产物来提 高石油采收率 研究微生物电池并使之实用化 三 微生物与资源 微生物能将地球上永无枯竭之虞的纤维素等可再生资源转化成各种化工 轻工和制药 等工业原料 这些产品除了传统的乙醇 丙酮 丁醇 乙酸 甘油 异丙醇 甲乙酮 柠 檬酸 乳酸 苹果酸 反丁烯二酸和甲叉丁二酸等外 还可生产水杨酸 乌头酸 丙烯酸 己二酸 丙烯酰胺 癸二酸 长链脂肪酸 长链二元醇 2 3 丁二醇 亚麻酸油和聚羟 基丁酸酯 PHB 等等 由于发酵工程具有代谢产物种类多 原料来源广 能源消耗低 经济效益高和环境污染少等优点 故必将逐步取代目前需高温 高压 能耗大和 三废 严 重的化学工业 微生物在金属矿藏资源的开发和利用上也有独特的作用 第九章中已述及的细菌沥滤 技术 就可把长期以来废弃的低品位矿石 尾矿 矿渣中所含的铜 镍 铀等十余种金属 不断溶解和提取出来 变成新的重要资源 四 微生物与环境保护 在环境保护方面可利用微生物的地方甚多 利用微生物肥料 微生物杀虫剂或农用 抗生素来取代会造成环境恶化的各种化学肥料或化学农药 利用微生物生产的 PHB 制 造易降解的医用塑料制品以减少环境污染 利用微生物来净化生活污水和有毒工业污水 利用微生物技术来监察环境的污染度 例如用艾姆氏法检测环境中的 三致 物质 利用 EMB 培养基来检查饮水中的肠道病原菌等 五 微生物与人类健康 微生物与人类健康有着密切的关系 首先是因为各种传染病构成了人类的主要疾病 而防治这类疾病的主要手段又是各种微生物产生的药物 尤其是抗生素 自从遗传工程开 创以来 进一步扩大了微生物代谢产物的范围和品种 使昔日只由动物才能产生的胰岛素 干扰素和白细胞介素等高效药物纷纷转向由 工程菌 来生产 与人类生殖 避孕等密切相 关的甾体激素类药物也早已从化工生产方式转向微生物生物转化 biotransformation 或 bioconver sion 的生产方式 此外 一大批与人类健康 长寿有关的生物制品 例如疫苗 菌苗和类毒素等均是微生物的产品 无怪乎有人估计 自从发明种痘以来 人类平均寿命 提高了10岁 而自从发现抗生素以来 平均寿命又提高了10岁以上 当然 要制止人口的 过度增长就不光是微生物学范围内的事了 二 现代微生物学的特点及其发展趋势 当前 由于分子生物学研究的逐步深入 各种新方法 新技术在微生物学研究中的广 泛应用 各学科间的积极渗透和交叉 以及生产实践中大量有关问题的提出 为微生物学 的发展提供了巨大的推动力 总的看来 现代微生物学的特点和发展趋势有以下六个方面 一 研究工作向着纵深方向和分子水平发展 由于分子生物学的飞速发展 使整个生命科学都推进到分子水平上来了 微生物学也 不例外 当前 在微生物领域中的几乎所有问题都深入到分子水平上进行了深入的研究 诸如细胞构造和功能 微生物对营养物质的吸收机制 生长 繁殖和分化 代谢类型 途 径和调控 遗传 变异和进化 传染和免疫 以及分类和鉴定 等等 二 在基础理论深入研究的基础上 一批新的学科 或潜学科 正在形成 例如真菌毒素 学 细菌质粒 学 微生物分子育种 学 重组微生物生理学 原生质 体融合遗传学 极端环境微生物学 菌种保藏 学 混菌发酵生理学 甲烷菌生物学 厌 氧菌生物学 古细菌 学 亚病毒 学 微生物酶学 固氮生物化学 固氮遗传学 微 生物分子遗传学 微生物生态遗传学 微生物生物转化 学 等等 三 微生物学与其他学科的渗透 交叉和融合 形成了新的边缘学科 在学科的发展中 各学科间的相互渗透 交叉和融合 往往起着生长点和带头的作用 其结果不仅产生了一系列新概念 新理论和新技术 而且会形成一系列具有旺盛生命力的 新的边缘学科 这或许就是学科间的 互补 共生 或 杂种优势 效应的一种体现 这类例 子很多 例如分析微生物学 化学分类学 微生物数值分类学和微生物地球化学 等等 四 新技术 新方法在微生物学中的广泛应用 在现代的数 理 化和多门工程技术学科的推动下 为微生物学的发展创造了空前的 有利条件 它主要体现在新方法 新技术 新仪器 新装备和新试剂的提供上 例如同位 素标记技术 电子显微镜技术 X 射线衍射技术 电子计算机技术 超离心技术 电泳技 术 层析技术 离子交换技术 质谱技术 分光光度计技术 细胞破碎技术 免疫学技术 氨基酸自动分析技术 核酸自动合成技术 蛋白质或核酸的顺序测定技术 低温技术 新 型微生物培养技术 微生物计数技术 微生物快速鉴定技术 固定化生物催化剂技术 微 量物质的分离 纯化和测定技术 等等 这些技术的广泛应用 大大促进了对微生物细胞 的结构与功能的研究 把原来以静态 描述 定性为主的研究逐步提高到以动态 定量 定序和定位的新的研究水平上 五 向着复合生态系统和宏观范围拓宽 在生物圈中 微生物的生存范围是最广 最立体化的 当人们对身边的常见微生物作 了一定的研究后 其兴趣便逐步转向更广 更不易触及的空间和各种复合生态系统 接踵 而来的就是又一批新学科的诞生和发展 例如极端环境微生物学 资源微生物学 热带真 菌学 地下生态学 土壤微生物生态学 陆地微生物生态学 海洋微生物生态学 大气微 生物生态学以及宇航微生物生态学 等等 六 一大批应用性高技术微生物学分科正在孕育和形成 微生物学是一门高度扎根于生产实践的学科 当代应用微生物学所包括的分支学科越 来越多 它们具有交叉性强 自觉度高和覆盖面广等特点 交叉性强 例如发酵工程学 细菌冶金 学 水处理微生物学 真菌遗传工程学 微生物生态工程学 农业微生物学以 及生物工业等 自觉度高 当前 在分子生物学理论和实践的带动下 很多应用性的生 物学科都在朝着目的性强 自觉度高 可控性强和工效高的方向发展 一批标以 工程 名 称的学科就是其中的代表 例如基因工程 细胞工程 生化工程 酶工程 蛋白质工程和 最新的代谢途径工程 pathwayengineering 等 覆盖面广 从大的方面来看 微生物的 应用范围主要联系着工业 农业 医药 环保和国防等领域 从细的方面来看 每个大领 域又可分出若干个分支领域 例如细菌冶金 学 污水处理微生物学 沼气发酵微生物学 应用土壤微生物学 微生物生物防治 学 农用抗生素学 食用蕈菌学 药用真菌学 药 用微生物学 以及人畜共患微生物学 等等 三 微生物在 生物学世纪 中的作用 当前 不少有远见卓识的科学家都同意 21世纪将是生物学世纪 的见解 其主要原因 有四方面 由物质运动发展的规律所决定 物质运动一般由机械运动 物理运动 化学 运动 生命运动方向发展 复杂的运动规律必须建立在简单运动规律基础上 目前 人类 对机械运动 物理运动和化学运动的客观规律已经有了深刻的认识 因此 为人类进一步 认识生命运动规律提供了良好的基础和提出了迫切的任务 由生物界的多样性及对其认 识的长期性所决定 生物界的多样性正是它有别于非生物界的主要特点之一 人类对生物 界多样性的认识还处在低级阶段 而生物界的多样性恰恰是人类赖以生存的主要物质基础 由当代人类面临的五大危机及其解决的迫切性所决定 由其他学科对生命科学的促进 和生命科学对其 反馈 或 回敬 的规律所决定 在 生物学世纪 中 微生物学将起着特别重要的作用 在自然科学中 如果说生命科学还 是一个 朝阳科学 的话 则微生物学只能认为是一门 晨曦科学 如果说微生物学是一个 富矿 的话 则目前它还是一个 刚剥去一层表土的富矿 这是因为在微生物中存在着高 度的物种 遗传 代谢和生态类型的多样性 微生物的多样性构成了微生物资源的丰富性 而微生物资源的丰富性则决定了对它的研究 开发和利用的长期性 人类对丰富的微生物资源的开发工作 还只能说刚开了一个头 不管如何估计 微生 物界 包括病毒在内 的物种总数应大大超过动 植物界物种总数之和 目前约知道有150 万种 可是目前前者至多还只有后者的1 10 而据科学估计 在自然界真正存在的动 植物物种数至少还要比现今知道的数字大好几倍 从以下几个事实就可充分证明微生物资源将是多么丰富 微生物的新种数每年正在 急剧地增长着 仅形态较大的真菌每年即有1500种新种记载 在土壤中约有90 的微生 物还无法在实验室中加以培养 其中有不少被称作 活的不可培养状态的细菌 viablebutuncultur ablestatebacteria 由于几乎在所有动 植物和微生物中都找到了相 应的病毒 因此可以想象 在微生物中 仅病毒的种数即有可能接近甚至超过其他动 植 物和微生物种数之总和 更何况有的一种宿主可同时有多种病毒寄生呢 例如仅人类病毒 目前就发现300多种 人类真正研究微生物的历史还只有130年左右 可以想象 今 后的微生物资源该可发现和利用多少 在曾描述的微生物中 被人类利用的种数大约还未超过1 例如 在约1万种大型蕈 菌中 有30多属即2000种左右是可食用的 但至今只有80种在实验室作过栽培试验 约有 20种作了商业性栽培 而市场上常见的仅5 6种而已 至于对微生物特种代谢类型 例如极端环境下微生物的开发 还停留在起跑线上呢 四 大力开展我国微生物学研究 由于历史等的原因 目前我国微生物学离国际先进水平还有很大的差距 作为中华民 族的子孙 有义务为使我国科技水平赶超国际水平而努力 微生物学工作者自然责无旁贷 要发展我国的微生物学 必须从我国具体国情出发 在有限的条件下 集中主要人力 物力 攻占一些具有我国特色 又有一定基础 在学术上和经济 社会效益上较明显的少 数项目作为突破口 做到突破一点 带动一片 再逐步扩大战果 因此现阶段的研究重点 应放在应用性理论的研究上 一 资源调查与分类鉴定 我国土地广袤 地形复杂 地跨寒 温 热三带 生态环境多样 是一个难得的微生 物资源大国 可是 目前资源调查与分类鉴定队伍薄弱 技术较落后 发表的成果较少 据统计 我国目前研究过的细菌和真菌数均仅占全世界已知数的5 10 在这一领域内 我们要努力调查有我国特色的 近期有应用前景的菌种资源 并借此来带动形态 分类和 鉴定 尤其是新的鉴定手段 工作的开展 例如 固氮微生物资源的调查 根瘤菌的分类 鉴定 新型拮抗性放线菌的筛选与化 学分类学的研究 菌根资源的调查 食用与药用真菌资源的调查和真菌分类系统的研究 虫生微生物和昆虫杆状病毒资源的调查 主要作物病毒病原的分离 检测及其病害防治的 研究 单细胞蛋白 SCP 资源的开发 极端微生物 尤其是嗜盐 嗜碱和嗜热菌 资源 的调查和菌种分类鉴定的研究 等等 二 生理代谢与发酵工程 生理代谢研究的成果可促进发酵工程 农业和医学微生物等多个应用领域的发展 在 这方面应开展的研究项目甚多 例如重组微生物生理学 固定化微生物生理学 混菌培养 微生物生理学 极端微生物生理学 光合细菌生理学 厌氧菌生理学 固氮生物化学 次 生代谢产物 例如抗生素 合成途径与代谢调控 多级连续培养动力学 胞外酶分泌机制 酶抑制剂与激活剂 高密度菌体的生长规律 非粮食发酵原料的研究 发酵生产中提高产 物浓度 转化率和生产率 g L h 等参数的研究 液体发酵中氧载体的研究 纤维素 木质素和半纤维素的微生物分解机制 微生物产氢机制 生物传感器 biosensor 的研究 电子计算机在线控制发酵的研究 中草药有效成分对病毒的抑制 工业产品的霉腐机制 厌氧菌代谢产物的调查和利用 等等 三 遗传变异与菌种选育 微生物种质资源的研究及其改良是微生物学中一项长期的不可缺少的工作 自从遗传 工程问世以来 使微生物遗传育种工作登上了一个新的台阶 在遗传变异与菌种选育领域 中 值得进一步研究的问题如下 微生物分子育种原理与技术 原生质体育种的原理与技术 重组菌的遗传稳定性 放线菌 遗传学 与发酵工程有关的各种新型受体 载体系统的建立 如芽孢杆菌 棒杆菌 酵母菌 放线菌 丝状真菌 若干极端微生物 根瘤菌遗传学 固氮基因导入非豆科植物 分解纤 维素 木质素 半纤维素工程菌的组建 致病菌耐药性的遗传学原理 以及传统菌种筛选 技术的突破 等等 四 生态学理论与环保实践 在微生物生态学的研究领域内 深入的工作还较罕见 有大量的工作等待着人们去研 究 例如土壤中微生物新类群的调查 土壤微生物的群体结构与功能 共生和致病微生物 与宿主相互识别的分子基础 用微生物防治病虫害的理论基础 我国传统酿造中的微生物 生态问题 微生态学的研究 霉腐微生物的种类 霉腐机制和防治方法 重要致病菌在自 然界的生存状态 瘤胃 盲肠 马等 蟑螂肠道的微生物区系及其分解纤维素的机制 厌 氧降解生态学 顽固性有机
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