中国生物医学文献

第二讲中国生物医学文献数据库(CBM),访问路径：,数据库概况,中国生物医学文献数据库(ChinaBioMedicalLiteraturedatabase)简称CBM，由中国医学科学院医学信息研究所开发。该数据库收录了1978年以来1,600多种中国生物医学期刊以及汇编、会议论文的文献题录与文摘530余万篇，年增长量约40万篇，每月更新。学科覆盖基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学各领域。,1.收录范围广、年代跨度大CBM收录1978年以来1600多种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录，年增长量约40余万篇，数据总量达350余万篇。学科范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、口腔医学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。2.数据规范CBM注重数据的规范化处理和知识管理，全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版医学主题词表、中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表，以及中国图书馆分类法医学专业分类表进行主题标引和分类标引。3.检索系统与PUBMED具有良好兼容性CBM检索系统(CBMWEB)具有检索入口多，检索方式灵活，以及主题、分类、期刊、作者等多种词表辅助查询功能，可满足简单检索和复杂检索的需求，与PUBMED具有良好兼容性。可获得良好的查全率和查准率。,二、检索途径和检索方式,基本检索主题检索分类检索,期刊检索作者检索检索历史,（一）基本检索,缺省字段检索，“缺省”表示系统默认在中文题目、文摘、主题词、期刊名称字段查找。二次检索表示在当前检索结果中，再次进行and运算。,举例：,检索有关“高血压”的文献；检索标题中含有“高血压”的文献；检索“高血压”与“糖尿病”相关的文献；检索老年人高血压治疗相关文献；,维普全文链接,二次检索举例：,缺省字段：“病毒性肝炎”二次检索相当于and逻辑运算符比如接上二次检索“感染”“感染”and“病毒性肝炎”注意：输入多个检索词，检索词之间默认为“AND”运算。如：肝炎预防。检索词之间可直接使用逻辑运算符“AND，OR和NOT”。如：肝炎NOT预防。智能检索不支持逻辑组配,限定检索,检索2004年到2005年以来癫痫的文献，要求限于带摘要的综述，并且文献涉及到的实验对象为儿童（612岁）,例：,（一）欲查找有关“不同剂量血管紧张素受体拮抗剂对老年心力衰竭中NT-proBNP的影响”方面的文献。提炼检索词：,基本检索的步骤：,1、分析课题2、确定检索词或检索式3、选择检索入口，输入检索词或检索式4、根据需要，调整检索策略,（二）主题检索,所谓主题检索，指采取规范化的主题词基于主题概念进行检索。与“关键词检索”相比，“主题检索”能有效提高查全率和查准率。,主题词,医学主题词表和中医药学主题词表是CBM进行主题标引和主题检索的依据。（1）医学主题词表（MedicalSubjectHeadings）简称MeSH词表，是由美国国立医学图书馆编著。是目前最权威最常用的标准医学主题词表。到2004年为止，字顺表共收录医学主题词22568个。（2）中医药学主题词表是由中国中医研究院中医药信息研究所出版。用来规范中医药检索词的，共收录主题词13878条。（3）中国图书馆分类法医学专业分类表。,主题词词表对表达文献内容的主题概念、名词术语进行了规范化处理，还配备了副主题词表与主题词组配，检索时尽量采用词表的规范化主题词、副主题词进行检索，以提高查全率和查准率。主题检索可用中文主题词、英文主题词及同义词进行查找，可浏览主题词注释信息和树形结构，帮助您确定恰当的主题词。通过设置是否加权、是否扩展、选择合适的副主题词，使检索结果更符合您的需求。主题词参见系统：“艾滋病”、“AIDS”see主题词：获得性免疫缺陷综合（唯一性）,主题词参照系统：,将自由词引见到主题词，如：艾滋病see获得性免疫缺陷综合征cancerofthebreastseebreastneoplasmsAcetylsalicylicAcid（乙酰水杨酸）seeAspirin（阿司匹林）,主题词是经过严格规范化的词和词组，是对同一概念具有不同表达方式的词语进行规范。主题词的作用：利于查全和查准便于扩大或缩小检索范围便于限定文献的主要概念及方面,1.主题词注释：包括主题词的中英文名称、款目词、树状结构号、相关主题词、检索回溯注释、标引注释、历史注释、主题词详解（定义）。2.主题词树状结构：供逐级查看其上位词和下位词，可据需要更改主题词，选择更泛指的上位词或更专指的下位词进行检索。3.主题词扩展检索：指对当前主题词及其所有下位主题词进行检索，“不扩展检索”则仅限于当前主题词的检索。如：对主题词“HIV感染”4.主题词加权检索：主题词加权表示该主题词是本文论述的重点。选择“加权”检索，表示要检索用主要概念主题词(即带*主题词)标引的文献，即检索时追求“少而精”。,主题检索的作用和功能,寻找合适的主题词,1、用上位词或倒置创伤性休克-？病毒性肝炎-？2、多用几个自由词查找先天性髋关节脱位-？3、用关键词先试行检索，“抛砖引玉”找到适用的主题词。,小技巧：如何寻找适当的主题词？,（1）仔细阅读主题词的注释信息，特别注意相关词、上位词及专指词。（2）可以在基本检索界面找出标题包含某个检索词的文献，浏览检索结果，看其对应的标引词是什么，这个就是要找的主题词。（3）为了检索的准确性，建议尽量使用最专指的主题词进行检索；在未找到最专指主题词时，建议选择其最邻近的上位词。,限定主题概念的规范化词汇，限定文献于主题词的某一方面对主题词起细分作用或揭示多个主题词之间的关系；副主题词没有独立的检索意义，其作用是增加主题概念的专指性，提高检索效率；副主题词现有83个。注意：主题词与副主题词的组配有严格的规定，不是所有的副主题词均能与每个主题词进行组配。,副主题词：,主题词的加权检索：,主题词“加权”表示主题词的重要程度，反映文章论述的主要内容。加权主题词用“*”表示加权检索表示仅对加星号(*)主题词(主要概念主题词)检索，非加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词（非主要概念主题词）均进行检索。,举例：主题检索,有关登革热药物治疗的文献（包括中药和西药）,练习-主题检索：,查找关于阿司匹林治疗高血压的文献唾液酸与艾滋病及恶性肿瘤的关系贺普丁治疗慢性乙型肝炎,回顾,智能检索：在“缺省”字段，自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索。,（三）分类检索,从文献所属的学科角度进行检索，有利于提高族性检索，查找某学科主题的文献。CBM分类标引和检索的依据是中国图书馆分类法医学专业分类表；可通过分类号和分类名进行检索；（1）在类名、类号输入框输入学科类名或类号来实现；（2）通过分类导航逐级展开来实现。单独使用或与其它检索方式组合使用。,分类检索：,分类检索：,CBM分类标引和检索的依据是中国图书馆分类法医学专业分类表。根据分类导航查找分类名或者分类号。发表文献时，正确提供本文所属中图分类号。,检索入口：分类导航、分类词和分类号,例：欲查找关于“婴幼儿麻疹病因”方面的文献,进入分类检索界面，选择“类名”检索字段并输入检索词“麻疹”；从系统返回的命中类名列表中选择准确类名“小儿麻疹”；根据需要，选择是否扩展检索；对于可复分的类号，选择复分组配检索（可选择多个复分号）；最后点击“分类检索”按钮，操作完成。,1.通过类名、类号快速查找来实现：,例：欲查找关于“婴幼儿麻疹病因”方面的文献,依据分类树逐级展开，直至浏览到您所需要的类目“小儿麻疹”后点击进入；根据需要，选择是否扩展检索；对于可复分的类号，选择复分组配检索（可选择多个复分号）；最后点击“分类检索”按钮进行文献查找。,2.通过分类导航实现：,分类检索中各选项的作用(1)扩展/不扩展检索：选“扩展检索”表示对某分类类目及其所有下位分类类目进行检索，不选“扩展检索”表示仅对当前分类类目进行检索。(2)复分组配检索：复分组配用于对主类号某一特定方面加以限制。类目号及其类目名下列出了可与当前主类号组配的全部复分号。选择某一复分号，表示仅检索当前主类号的某一方面文献。,不是所有类号都有复分组配，仅以下类号可进行复分组配：R25/278中医各科及中医急症学、R5/8临床各科疾病与“临床医学复分表”进行复分组配；R282.71/.77各种药材与“各类药材专类复分表”进行复分组配。,举例：“江苏病毒性肝炎的流行病学调查”,提取中心词：分类名检索：,练习：,检索有关舌癌遗传学方面的文献。,从检索入口处选择刊名、出版地、出版单位、期刊主题词或者ISSN直接查找期刊；例如检索入口选刊名，输入检索词“癌症”.通过“分类导航”或“首字母导航”逐级查找浏览期刊；点击刊名，得到期刊的有关信息，继续点击“期刊检索”，得到该期刊上发表的文献。,（四）期刊检索,可通过选择刊名、出版地、出版单位、期刊主题词或者ISSN等检索入口直接查找期刊。也可通过“分类导航”或“首字母导航”逐级查找浏览期刊。例题6：请问南方医科大学学报2006年第6期中有关肝移植的文献有多少？,期刊检索,功能：,（1）目标期刊定位：您可通过检索入口处选择刊名、出版地、出版单位、期刊主题词或者ISSN直接查找期刊；也可通过“期刊分类导航”或“首字母导航”逐级查找浏览期刊。（2）期刊文献查找：您可以直接指定年、卷期进行浏览，也可以输入欲检索的内容后在指定的年卷期中查找浏览具体文献。,作用：,全面了解某学科主题方面的期刊分布：初涉某学科领域时，可以通过“期刊主题词”检索或“分类导航”来获取涵盖或涉及该学科领域的所有期刊信息。解决期刊更名带来的烦恼：如：在“北京大学学报医学版”中查阅有关文献。通过选择“含更名期刊”，您可以方便快捷地检索浏览到该刊及其更名期刊“北京医科大学学报”、“北京医学院学报”中的文献。辅助投稿：通过期刊信息详细列表，您可以了解目标期刊的学科主题信息、出版频率、编辑部联系方式等。,（五）作者检索,查指定作者发表的文献。步骤：点击进入“作者检索”页面，输入作者姓名，点击“查找”，在作者列表中点击所要查找的作者姓名，或点击作为第一作者发表的文献。,（1）如此多的重名，我怎样才能全而准确地定位到XXX机构XXX研究员在该领域的研究情况呢？（2）系统返回的检索结果太多，但我只想了解他以第一著者身份发表的论文情况，怎么办？如：查找“中国医学科学院基础医学研究所沈岩教授”以第一著者身份发表的论文情况,举例：,请检索我校瞿佳校长作为第一作者发表的文献,（六）检索历史,检索历史：,*最多允许保存100条检索表达式。*可从中选择一个或多个检索表达式并用逻辑运算符AND、OR、NOT组成更恰当的检索策略。*根据需求选择一个或多个有意义的检索表达式保存成特定的“检索策略”。在“我的空间”中可定期调用该检索策略，及时获取最新信息。*无意义的检索表达式选中后点击“删除检索史”可进行删除。*系统退出后，检索历史清除。,（七）辅助检索-限定检索,把年代、文献类型、研究对象、性别等在基本检索窗口可实现的常用限定条件整合到一个表单中供用户选择。目标：减少二次检索操作，提高检索效率。,温馨提示：,进行限定检索时，您可以在检索前设置限定条件，也可以在检索后设置限定条件，还可以根据需要随时修改限定条件。如果是在检索后设置限定条件，或对限定条件进行了修改，需点击“检索条件”才能对当前检索条件执行新限定检索。,（八）检索结果的显示与输出,检索过程中不断发现新的检索点、产生新的检索需求,检索结果分析：,我校瞿佳校长以第一作者发表的文章，刊载在哪个期刊上的最多？哪一年发表的文章最多？,个性化服务我的空间,定题检索：,定题检索可用来定制和跟踪某一课题的最新文献。登录定题检索后，先前已经保存的检索策略名称会显示在页面下方，可以点击亮显的检索策略名称浏览其对应的检索式。可选择一个或多个检索策略文件进行重新检索、最新文献检索或删除该检索策略。,检索举例与分析,例1：检索2002年以来中医药治疗慢性肝炎的文献在基本检索的“缺省”状态下不同检索式过程及结果如下：#140篇慢性肝炎AND中医药治疗#2535篇慢性肝炎AND中医药AND治疗#32920篇慢性AND肝炎中医药AND治疗#47014篇慢性AND肝炎AND(中医OR中药OR中医药)AND治疗,结果分析：,以上第4个检索式检出的文献最全。其它3个检索式漏检文献的原因有二：一是先组式检索词“慢性肝炎”与出现“慢性黄疸性肝炎”和“慢性乙型肝炎”等文献不匹配，而用后组式的“慢性AND肝炎”能检索命中；二是检索词“中医药治疗”和检索式“中医药AND治疗”与“中药治疗”的文献不匹配，而用“(中医OR中药OR中医药)AND治疗”能检索命中。第4个检索式虽然查得最全，但也可能有部分误检，如检索到的文献中出现“民间常用岩黄莲治疗慢性腹痛、火眼白翳及肝炎等”，其中提及的肝炎并非一定是慢性肝炎。,例1：检索2002年以来中医药治疗慢性肝炎的文献基本检索：主题检索：分类检索：组合检索：,例2：检索中华内科杂志上有关消化系统肿瘤的文献。,检索过程：期刊检索：9篇刊名(含更名)=中华内科杂志and全部字段:消化系统肿瘤#11262篇刊名=中华内科杂志（基本检索）#26776篇缺省:消化系统肿瘤（基本检索）#312362篇缺省:消化系统肿瘤（基本检索）#4225383篇主题词:消化系统肿瘤/全部树/全部副主题词（主题检索）#5218421篇分类号=R735/扩展/全部复分（分类检索）#1AND#?,作业：,1基本检索