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文档简介

,答辩人：XXX指导老师：XXX,华山松居群谱系地理分布研究,3.1遗传多样性检测,3.3空间遗传结构分析,3.4居群内和居群间的遗传变异,3.5中性检验,1研究的内容和意义,2实验方法与步骤,3结果分析,4讨论,目录,3.2线粒体单倍型变异及其分布,1研究的内容和意义谱系地理学是生物地理学的一个新兴分支学科，主要探讨物种演化与地质历史的相互关系,通过分析现有种群的遗传结构，探讨物种遗传变异的分布模式，并推断冰期气候对生物种群的影响，推测其冰期避难所和冰期后的迁移路线。目前关于华山松居群谱系地理分布的研究还未见报道。本文运用DNA分子测序技术对华山松进行进行遗传多样性、遗传分化的分析，初步鉴定了单倍型的地理分布模式以及系统发育关系，追溯了现代分布居群的进化历程、地理分界位置以及可能的冰期避难所。为研究和保护华山松物种多样性提供理论参考。,2试验方法与步骤,2.1试验样品的采集,2.2总DNA提取,2.3PCR扩增,2.4PCR产物纯化,2.5测序,应用DNA序列排列软件进行对位排列，并对所有居群的单倍型多样性指数h与核苷酸多样性指数的分析。从线粒体单倍型多样性来看，在物种水平上，单倍型多样性为h=0.76;在居群水平上,多达16个居群的遗传多样性为0,其次,从核苷酸多样性上来看,在物种水平上,核苷酸多样性=0.0037。,3.1遗传多样性检测,3结果分析,3.2线粒体单倍型变异及其分布,图2-1线粒体单倍型分布图，右框中表示11种单倍型类型,分析表明，当K=3时，结果显示组间达到最高分化(FCT=0.78)(图3-3)。从表中可以看出，有89.63%的变异存在于组间，1.07%的变异存在于组内居群间，9.30%的变异存在于居群内，表现出较高的组间分化和较低的居群间分化程度。组间固定指数FCT=0.78，组间的遗传变异已经达到显著水平(PGST，0.01p0.10)，所有的中性检验值均为不显著。因此，基因座位的进化模式不拒绝中性假设。,4讨论,遗传多样性是生物多样性的基础，是居群和物种长期进化的产物，也是其适应、生存和进化、发展的前提。本研究对华山松的不同地居线粒体DNA片段的标记获得的遗传多样性都较高。分析结果表明3个组之间具有很大的遗传差异；居群间的基因流非常小（Nm=0.38)；另外，种内居群间的遗传分化(GST=0.762)很大，线粒体单倍型具有明显的谱系地理结构(GSTNST,0.01P0.05)。因此得出有限的种子传播可能是导致居群间遗传分化较大，谱系地理结构明显的原因之一。,本文经线粒体DNA序列分析表明秦岭是华山松在冰期时一个独立的冰期避难所。这与许多学者研究中国针叶林在冰期时南移、冰期后北迁的假设基本吻合。我们结合地质历史资料，可以推测古老单倍型所在地理位置即为该物种的冰期避难所，因此可以说，巴山-武陵山一带也是华山
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