2013ASCO肿瘤生物标记物进展.ppt

主要内容,基因指导的个体化治疗肺癌驱动基因突变谱靶向治疗耐药问题基因检测研究进展,通过驱动基因选择靶向治疗可以延长患者OS,14家LCMC成员单位入组1102例转移性肺腺癌患者,检测KRAS,EGFR,HER2,BRAF,PIK3CA,AKT1,MEK1，NRAS突变，ALK重排和MET扩增,1007例至少一个基因检测的患者中，622例检测到至少一个驱动基因状态的改变；733例行多重基因组检测的患者中，465例检测到至少一个基因状态改变,JohnsonBE,etal.2013ASCOAbstract8019.,LCMCIncidenceofMutationDetected,通过驱动基因选择靶向治疗可以延长患者OS,279例(28%)伴驱动基因突变患者的数据用于选择靶向治疗或入组靶向研究在有后续临床随访信息的938例患者中，总生存分析如下：,结论：伴有已确定驱动突变的患者中，接受靶向治疗者的生存时间较未接受靶向治疗者明显延长多重基因组检测有助于临床医生选择适当的患者进行靶向治疗和入组靶向治疗临床研究,JohnsonBE,etal.2013ASCOAbstract8019.,NSCLC驱动基因突变谱：欧美人群,迄今晚期NSCLC患者中开展的规模最大的生物标志物研究,BarlesiF,etal.2013ASCOAbstract8000;GiacconeG,etal.2013ASCOAbstract7513.,首个评估生物标志物配对治疗疗效的前瞻性临床研究,NSCLC腺癌基因突变谱：亚洲研究,EGFR依然是亚裔腺癌最常见的驱动基因,KohY,etal.2013ASCOAbstract7572.WuYL,etal.2011.,早期肺腺癌中EGFR突变率和晚期相似,ZhangX,etal.2013ASCOAbstract1547.YangPC,etal.2012ASCOAbstract1534.,8023：NTRK1基因融合作为肺癌新的癌基因靶点,结论在肺腺癌中通过NGS/FISH发现了一种新的癌基因NTRK1融合需要开展更多研究以明确NTRK1融合在肺癌中的发生率和特征该研究提示需要在NTRK1融合阳性患者中开展前瞻性Trk抑制剂的临床研究,DoebeleRC,etal.2013ASCOAbstract8023.,3/91(3.3%),肺鳞癌驱动基因突变研究,71肺鳞癌病人标本NGS和定量PCR检测突变和基因扩增,KohY,etal.2013ASCOAbstract7572.GovindanR,etal.2012ASCOAbstract7006.,2013ASCO,178例肺鳞癌标本127例（75%）患者确认潜在治疗靶点检测基因拷贝数，外显子突变，mRNA表达和启动子甲基化,2012ASCO,40.9%的鳞癌患者存在联合基因突变，表明了鳞癌患者基因型的复杂性,NSCLC中FGFR1基因拷贝数增加,475例已行手术切除的I-III期NSCLC,多因素分析，在校正吸烟、性别和肿瘤大小后，伴FGFR1基因扩增的I/II期肺鳞癌患者的OS显著长于FGFR1未扩增的患者（HR=0.26;95%CI:0.08-0.84,P=0.02）18%的脑转移出现FGFR1拷贝数增加，而相应原发部位无增加,TangXM,etal,etal.2013ASCOAbstract7552.,FISH3(75);AdaptedfromSequistLV,etal.2012ASCO.,cMET/ErbB3激活和过表达在EGFR-TKI耐药过程中的作用,研究目的：1)根据RTKs和通路蛋白的表达/激活比较ORR2)评价EGFR-TKI治疗期间RTK和通路蛋白的调节3)在接受EGFR-TKI治疗的患者中，评估EGFR基因突变的激活和RTK激活的相关性,RTK=络氨酸激酶,AhnMJ,etal.2013ASCOAbstract11113.,EGFR-TKI治疗NSCLC耐药过程中cMET/ErbB3激活和过表达的作用,无论EGFR突变状态如何，EGFR/cMET相对水平高的患者PFS显著更好随着cMET参与的程度越高或E/M指数越低，NSCLC的临床获益越差PFS越短(8个月)的患者,结论：cMET和ErbB3在NSCLC患者对EGFR-TKI产生耐药过程中具有重要作用E/M指数及其活化可作为选择EGFR抑制剂和cMET抑制剂的预测标志物，但还需要前瞻性临床研究的验证,AhnMJ,etal.2013ASCOAbstract11113.,NGS发现NSCLC靶向治疗新的合并突变,在人类H3255NSCLC细胞株(携带EGFRL858R，但无BRAFV600E，对厄洛替尼敏感)中，BRAFV600E的过表达会导致耐药性的产生BRAFV600E介导的厄洛替尼耐药可通过BRAF抑制剂Vemurafenib逆转,结论：EGFR突变NSCLC可包含额外BRAF致癌驱动突变且在治疗前发生率低EGFRTKI治疗可以导致BRAFV600E表达肿瘤细胞扩增，产生获得性EGFRTKI耐药，而BRAF抑制剂治疗后可逆转,10倍,BlakelyCB,etal.2013ASCOAbstract11004.,收集EGFR-TKI治疗前及EGFR-TKI耐药后的FFPE标本，使用IlluminaHiSeq2000进行398个肿瘤相关基因的外显子测序,伴T790M突变的EGFR突变型NSCLC患者中ROR1mRNA表达（来自EURTAC研究）,入组EURTAC研究中的95例患者：65%伴有治疗前T790M突变，评估45例患者的ROR1表达与治疗和生存的关系,结论：高ROR1表达显著限制伴T790M突变患者的PFSROR1导向治疗可提高厄洛替尼治疗伴ROR1过表达的EGFR突变型NSCLC患者的疗效,*仅在低ROR1表达者中有效,KarachaliouN,etal.2013ASCOAbstract11027.,EGFR-TKI获得性耐药的综合基因组分析,从11例EGFR突变NSCLC患者中获取厄洛替尼敏感性和耐药性肿瘤的FFPE活检标本从所有肿瘤和相应正常组织标本中提取DNA，进行全外显子组测序从所有肿瘤标本中提取RNA，进行全转录组测序,WeissmanJS,etal.2013ASCOAbstract11010.,通过全外显子和转录组测序对厄洛替尼获得性耐药的EGFR突变NSCLC的肿瘤标本进行完整基因组分析,本研究：证实了完整基因组分子测序在接受靶向治疗的NSCLC患者的临床管理中具可行性和实用性发现了NSCLC患者中厄洛替尼获得性耐药的已知和新的分子生物标志物揭示了在NSCLC患者中调控干细胞和神经元表型以及免疫逃逸的遗传事件在厄洛替尼获得性耐药中具重要作用，而这一作用以往却被忽略了使我们深入了解了NSCLC中逃逸EGFR癌基因抑制的分子发病机制,WeissmanJS,etal.2013ASCOAbstract11010.,耐药驱动基因研究小结,耐药后驱动基因图谱发生了变化，且这种变化在靶向治疗的同时不断演变更多的实验认为这种变化是靶向治疗后基因筛选的结果耐药后再次活检是明确新的致癌驱动基因的有效方法更多针对获得性耐药的药物正在研发中,基因检测改变了我们的临床实践,基因检测技术,新一代测序技术,所谓新一代测序方法，包括大量基于不同技术的方法。都采用了大规模矩阵结构的微阵列分析技术阵列上的DNA样本可以被同时并行分析。测序是利用DNA聚合酶或连接酶以及引物对模板进行一系列的延伸,通过显微设备观察并记录连续测序循环中的光学信号实现的。,MitraRD,etal.AnalBiochem,2003,320:5565ShendureJ,etal.Science,2005,309:17281732,优势：,通过临床新一代测序技术(NGS)揭示基因变异高检出率以指导肺癌的靶向治疗,386个肺癌FFPE标本，95%为NSCLC(367/386)通过NGS为基础的诊断性检验方法来描绘基因变异图谱检测182个癌症相关基因的3320个外显子检测肿瘤中重排频率较高的14个基因的37个内含子结果：确认1205个基因改变，平均每个肿瘤3.31个改变(0-10)85%(310)标本包含1个可作为靶点的基因改变*，平均每个标本1.79个(0-6)在68%(248)的肿瘤中，至少1个检测到的基因变异会被目前“热点”检测*所遗漏,AliSM,etal.2013ASCOAbstract8020.,*可作为靶点的基因改变定义为具有相应的靶向抗肿瘤药物或能够在临床研究中加以评价的基因靶点改变*热点检测包括EGFR,KRAS和EML4:ALK等,通过临床新一代测序(NGS)揭示基因变异高发生率以指导肺癌的靶向治疗：结果,结论：该研究发现了通过热点检测所无法检测到的一系列基因变异，可显著提高驱动基因的检出率，指导靶向治疗决策,AliSM,etal.2013ASCOAbstract8020.,actionablegenomicalterations(GA)inlungcancer(LC),新一代测序技术检测NSCLC细针吸取标本,在19例NSCLCFNA组织中发现97个GA，平均每例患者5.1个变化68%患者的TP53上具有GA，21%在KRAS上具有GA仅16%的患者没有显示出可作为靶点的GA,19例NSCLC的FNA细胞蜡块，抽提DNA使用新一代测序，检测14个常见重排基因的37个内含子和182个肿瘤相关基因的3320个外显子,结论：新一代测序技术可以可靠地分析小的FNA标本，所发现的GA与在相匹配的原发肿瘤中所发现的GA显著相关本研究进一步拓宽了常见标本类型的范围，具有进一步研究的价值,HawrylukMJ,etal.2013ASCOAbstract11100.,从血浆DNA检测EGFR活化突变作为FAST-ACT2研究中有利的生存预测标志物,MokT,etal.2012ESMOAbstract1226O.MokT,etal.2013ASCOAbstract8021.,主要终点：PFS(独立审查委员会评估)次要终点：亚组分析、所有患者与亚组的OS、ORR、缓解持续时间、TTP、16周未进展、安全性、QOL,从血浆DNA检测EGFR活化突变作为FAST-ACT2研究中有利的生存预测标志物,回顾性测定FFPET和血浆中EGFR突变(451例入组患者，268个肿瘤样本)分析90%(241/268)的肿瘤样本，40%(96/241)包含1个活化的EGFR突变451例患者中427份血浆样本可用于分析，32%(136/427)为EGFR突变阳性,224份配对组织和血浆样本检测*的一致性,MokT,etal.2013ASCOAbstract8021.,*方法为cobas-EGFR_FFPET检测,血浆检测的敏感性为77%(69/90)，特异性为96%(129/134)EGFR活化突变阳性和阴性预测价值分别为93%(69/74)和86%(129/150)总一致性为88%(198/224),从血浆DNA检测EGFR活化突变作为FAST-ACT2研究中有利的生存预测标志物,MokT,etal.2013ASCOAbstract8021.,结论：cobasEGFR_blood检测能可靠地被用于检测血浆EGFR突变在FASTACT2研究中，血浆EGFR突变是生存结果的有力预测因素,基因检测研究小结,治疗前后NSCLC肿瘤组织驱动基因状态将可能发生明显变化，重复多次基因检测对二线后治疗变得尤为重要新一代测序技术(NGS)无论对肿瘤组织标本还是对针吸活检小标本，均可明