用CLUSTAL和MEGA4做系统发生树.ppt_第1页
用CLUSTAL和MEGA4做系统发生树.ppt_第2页
用CLUSTAL和MEGA4做系统发生树.ppt_第3页
用CLUSTAL和MEGA4做系统发生树.ppt_第4页
用CLUSTAL和MEGA4做系统发生树.ppt_第5页
已阅读5页，还剩27页未读， 继续免费阅读

下载本文档

版权说明：本文档由用户提供并上传，收益归属内容提供方，若内容存在侵权，请进行举报或认领

文档简介

用CLUSTAL和MEGA做系统发生树,CLUSTAL能读取的数据格式,把所有的序列放到一个文本文档里，在序列名的前面加上#号,由于测序长短不一，需要选择一个对齐的位点，如上图的62号位点，同样的，末端也需要对齐,684位对齐,在目标序列所在的文件夹会生成两个文件，一个是ALN文件，另一个是dnd文件，以下的步骤我们需要aln文件,打开MEGA4.1,先将aln文件转化成meg文件，MEGA4才能处理。FileConvertToMEGAFormat,找到刚才生成的aln文件,有时在转化好的MEGA文件下面会有一些星号，要把这些星号删除掉,保存,我保存到了桌面上,接下来就要做树了，点击左侧的选项,选择蛋白序列还是核酸序列，点击OK,选择是否是蛋白编码序列,选择核酸的类型，点击OK,这个窗口给出了好多这些序列的统计信息。可以看一下，关闭。,如图所示，从上面的选项可以选择自己需要做的树，为什么选择哪种树，要考虑好,双击那些数字就可以编辑，将数字替换成物种的名字,最后将这个图拷贝到剪切板上，可以粘到Word上,粘到Word上的效果图,谢谢！,
人人文库> 全部分类> 应用文书 > 技术指导

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明，都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等，如果需要附件，请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸，网页内容里面会有图纸预览，若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间，仅对用户上传内容的表现方式做保护处理，对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑，并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容，请与我们联系，我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

最新文档

评论

0/150

提交评论