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文档简介
1、定量PCR实验故障排除,扩增曲线-v1.4,扩增曲线-v2.0,标准曲线-v1.4,标准曲线-v2.0,原始数据-v1.4,原始数据-v2.0,原始信号-v1.4,原始信号-v2.0,融解曲线-v1.4,融解曲线-v2.0,1 没有标准曲线,常见问题一:没有标准曲线,常见问题一:没有标准曲线,组分,扩增曲线,常见问题二:没有扩增曲线,光谱,原始数据只有1个循环,常见问题二:没有扩增曲线,原因1:PCR参数设置错误 数据收集步骤只有一个循环,只收集了一个数据点。,常见问题二:没有扩增曲线,原因2:硬盘休眠,数据采集中断,常见问题二:没有扩增曲线,原因2:硬盘休眠,数据采集中断,常见问题二:没有扩
2、增曲线,7900,7500,常见问题三:基线不平滑,从原始数据找原因 1-9循环,ROX的信号下降,与试剂质量有关 基线设定4-13范围内,ROX信号值变化,FAM的信号值基本固定;FAM/ROX的校正后,基线不是水平的直线; 应该取ROX信号稳定的10-20循环为合理的基线范围。,常见问题三:基线下滑,修改基线范围为10-20,重新分析,常见问题三:基线下滑,基线范围取10-20循环的数据,重新分析后的图谱;,常见问题三:基线下滑,原因:模板浓度高,基线的终点大于CT值 通常是因为模板DNA浓度偏高,CT值 15,而基线范围仍然取3-15,其中包含部分扩增信号,导致标准差偏大,阈值过高 解决
3、方法:减小基线终点至CT值前4个循环,重新分析数据,常见问题四:扩增曲线弯曲,原因:样品浓度跨度太大,有的样品浓度太高,在同一基线设置情况下,会导致Ct值太小(小于基线右侧)的样品的曲线在右侧下跌。 解决方案:对于能检测出Ct的样品,读出数据;浓度太高的样品,需稀释后另做实验。,常见问题四:扩增曲线弯曲,常见问题五:直线扩增曲线,部分探针降解后,部分reporter从探针上脱落,导致:基线抬高;扩增与荧光信号的增加不一致。,常见问题六:V型扩增曲线,双击纵坐标,打开Graph Settings 关闭Y轴Auto Scale 设置到正常范围如0-12000,常见问题六:V型扩增曲线,扩增曲线是水
4、平直线 没有检测到信号升高提示没有扩增,常见问题六:V型扩增曲线,常见问题七:扩增曲线不光滑,如果信号10000点,就不会打折 弱的信号经过校正后,点与点之间的差异被放大,常见问题七:扩增曲线不光滑,解决方法 使用高质量的探针 补救方法:关闭ROX校正,重新分析数据,关闭ROX校正,常见问题七:扩增曲线不光滑,关闭ROX校正的效果,常见问题七:扩增曲线不光滑,常见问题八:重复性不佳,常见问题八:重复性不佳,原因:盖子未盖紧,溶液蒸发,常见问题八:重复性不佳,常见问题九:参比荧光,常见问题九:参比荧光设置不当,常见问题九:参比荧光设置不当,常见问题九:参比荧光设置不当,常见问题九:参比荧光设置不当,常见问题十:无柱状图,现象:扩增曲线正常,无基因表达结果(柱状图) 原因:软
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