细菌的分类及命名

1、一、细菌分类学一、细菌分类学对细菌进行对细菌进行分类，分类， 命名与鉴定命名与鉴定的的 一门学科。一门学科。 任务：任务： 在全面了解在全面了解细菌生物学特征细菌生物学特征的基础上，的基础上， 研究它们的研究它们的种类种类，探索其，探索其起源起源，演化演化以以 及与及与其他类群之间的亲缘关系其他类群之间的亲缘关系，进而提，进而提 出能反映出能反映自然发展的分类系自然发展的分类系统，并将细统，并将细 菌加菌加以分门别类以分门别类。 细菌分类学细菌分类学包括分类，命名和鉴定包括分类，命名和鉴定 1、细菌分类：、细菌分类：根据细菌各自的特征，并根据细菌各自的特征，并 按照按照亲缘关系亲缘关系分类，以

2、不同等级分类，以不同等级编排系编排系 统统。分类有两种：。分类有两种： 细菌的生理生化分类法细菌的生理生化分类法，包括有传，包括有传 统分类法和数值分类法。统分类法和数值分类法。 细菌核酸、蛋白质结构的同源程度细菌核酸、蛋白质结构的同源程度 进行分类法进行分类法，称种系分类或自然分类。，称种系分类或自然分类。 2、细菌命名、细菌命名：在分类基础上，给每种：在分类基础上，给每种 细菌一个细菌一个科学名称科学名称，便于交流并保证所，便于交流并保证所 有的科研工作者给予同样名称。有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则，将未知细菌按分类原则， 确定细菌的分类地位确

3、定细菌的分类地位。 古菌古菌 细菌细菌 3、细菌的分类单元、细菌的分类单元 细菌的分类单元与动植物一样，依次为细菌的分类单元与动植物一样，依次为 科及科以上的划分在细菌不太完善，且随科及科以上的划分在细菌不太完善，且随 着研究的深入科属的划分会发生变动着研究的深入科属的划分会发生变动 Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus Rosenbach 1884Rosenbach 1884 属名葡萄球菌属名葡萄球菌种名金黄色种名金黄色命名人的姓命名人的姓 命名年份命名年份 金黄色葡萄球菌的学名为金黄色葡萄球菌的学名为 Peptostreptococcus

4、foetidus Peptostreptococcus foetidus （ Veillon Veillon ）SmithSmith 属名消化链球菌属名消化链球菌 种名恶臭种名恶臭原命名者原命名者 改名者 恶臭消化链球菌的学名恶臭消化链球菌的学名 恶臭消化链球菌是由恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的首先发现和定名的 ，后，后 Smith 重新定为现名。重新定为现名。 这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。应用价值。 形态形态 染色染色

5、 培养培养 细胞壁结构细胞壁结构 生理生化生理生化 抗原特性抗原特性 1）DNA碱基碱基G+C%比例的测定比例的测定 u亲缘关系相近的种比也相近，亲缘关系相近的种比也相近， 比差别大亲缘关系必然远比差别大亲缘关系必然远 （G+C）%=100% A+T+G+C G+C 简称简称GC比比 u种内差距种内差距2.54.0, 种间种间5%, 属间属间 差距差距10% 2）核酸分子杂交法）核酸分子杂交法 DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA 方法方法: : u待测菌株待测菌株dsDNA-ssDNA u参照菌株，同位素标记的参照菌株，同位素标记的ssDNA 检测杂合检测杂合DNA的放射性强

6、度的放射性强度，参照菌株自，参照菌株自 身为身为DNA复性的放射性强度复性的放射性强度100% uDNA-DNA杂交同源性性杂交同源性性 60%为同种为同种 70%同一亚种同一亚种 2060%为同一属为同一属 3）rRNA寡核苷酸编目分析寡核苷酸编目分析 urRNA是细胞中的是细胞中的“活化石活化石” 原核生物：原核生物：23s、16s、5s 真核生物：真核生物：28s、18s、5.8s u16s或或18s用作系统分类用作系统分类：（提出三域：（提出三域 学说）学说） u生理功能重要又恒定、含量高易提取、生理功能重要又恒定、含量高易提取、 核苷酸序列保守、分子质量适中、信息核苷酸序列保守、分子

7、质量适中、信息 量大易于分析量大易于分析 球菌球菌 杆菌杆菌 丝状或树枝状丝状或树枝状 葡萄球菌葡萄球菌 链球菌链球菌 粪肠球菌粪肠球菌 微球菌微球菌 MZN染色阴性染色阴性 MZN染色阳性染色阳性 牛放线菌牛放线菌 粘性放线菌粘性放线菌 星形奴卡菌星形奴卡菌 刚果嗜皮菌刚果嗜皮菌 产芽胞产芽胞 无芽胞无芽胞 抗酸染色阳性抗酸染色阳性 抗酸染色阴性抗酸染色阴性 梭菌梭菌 芽胞杆菌芽胞杆菌 炭疽杆菌炭疽杆菌 分支杆菌分支杆菌 牛分支杆菌和禽分支杆菌牛分支杆菌和禽分支杆菌 鼠麻风杆菌鼠麻风杆菌 副结核分支菌副结核分支菌 棒状杆菌棒状杆菌 化脓放线菌化脓放线菌 马红球菌马红球菌 产单核李氏杆菌产单核

8、李氏杆菌 猪丹毒杆菌猪丹毒杆菌 球菌球菌/球杆菌球杆菌 杆菌杆菌 MZN染色阴性染色阴性 MZN染色阴性染色阴性 弧状杆菌弧状杆菌 中等大小杆菌中等大小杆菌 螺旋状菌螺旋状菌 丝状菌丝状菌 弯曲菌弯曲菌 弧菌弧菌 耐瑟菌耐瑟菌 生摩拉菌生摩拉菌 不动杆菌不动杆菌 肠杆菌科肠杆菌科 假单胞菌假单胞菌 波氏杆菌波氏杆菌 放线杆菌放线杆菌 嗜血杆菌嗜血杆菌 巴氏杆菌巴氏杆菌 拟杆菌拟杆菌 钩端螺旋体钩端螺旋体 蛇形螺旋体蛇形螺旋体 密螺旋体密螺旋体 疏螺旋体疏螺旋体 坏死杆菌坏死杆菌 布氏杆菌属布氏杆菌属 鹦鹉热衣原体鹦鹉热衣原体 这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的这些表型特征对细菌的鉴定和

9、分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。应用价值。 形态形态 染色染色 培养培养 细胞壁结构细胞壁结构 生理生化生理生化 抗原特性抗原特性 2）核酸分子杂交法）核酸分子杂交法 DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA 方法方法: : u待测菌株待测菌株dsDNA-ssDNA u参照菌株，同位素标记的参照菌株，同位素标记的ssDNA 检测杂合检测杂合DNA的放射性强度的放射性强度，参照菌株自，参照菌株自 身为身为DNA复性的放射性强度复性的放射性强度100% uDNA-DNA杂交同源性性杂交同源性性 60%为同

10、种为同种 70%同一亚种同一亚种 2060%为同一属为同一属 球菌球菌 杆菌杆菌 丝状或树枝状丝状或树枝状 葡萄球菌葡萄球菌 链球菌链球菌 粪肠球菌粪肠球菌 微球菌微球菌 MZN染色阴性染色阴性 MZN染色阳性染色阳性 牛放线菌牛放线菌 粘性放线菌粘性放线菌 星形奴卡菌星形奴卡菌 刚果嗜皮菌刚果嗜皮菌 产芽胞产芽胞 无芽胞无芽胞 抗酸染色阳性抗酸染色阳性 抗酸染色阴性抗酸染色阴性 梭菌梭菌 芽胞杆菌芽胞杆菌 炭疽杆菌炭疽杆菌 分支杆菌分支杆菌 牛分支杆菌和禽分支杆菌牛分支杆菌和禽分支杆菌 鼠麻风杆菌鼠麻风杆菌 副结核分支菌副结核分支菌 棒状杆菌棒状杆菌 化脓放线菌化脓放线菌 马红球菌马红球菌 产单核李氏杆菌产单核李氏杆菌 猪丹毒杆菌猪丹毒杆菌 球菌球菌/球杆菌球杆菌 杆菌杆菌 MZN染色阴性染色阴性 MZN染色阴性染色阴性 弧状杆菌弧状杆菌 中等大小杆菌中等大小杆菌 螺旋状菌螺旋状菌 丝状菌丝状菌 弯曲菌弯曲菌 弧