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文档简介
1、 第十二章第十二章 基因信息的传递基因信息的传递 第一节第一节 dnadna的生物合成的生物合成* * 第二节第二节 rnarna的转录的转录* * 第三节第三节 翻译翻译蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成* * 1 1、dnadna半保留复制半保留复制 半保留复制:半保留复制:在复制过程中,首先亲代双链解开,然后以每条链作为模板,在其上合成互补的子代链,结果每个子代dna分子中有一条链完全来自亲代dna,另一条是新合成的。 1953年,watson和crick在提出dnadna双螺双螺旋结构模型旋结构模型时就推测dna可能按照半保留机制进行自我复制。第一节第一节 dnadna的生物合成的生物合
2、成 一、一、dnadna指导的指导的dnadna的生物合成的生物合成dnadna复制复制 (一)(一)dnadna复制的机制复制的机制15n标记的e.coli. dna密度梯度离心试验meselson和stahl, 1958年 2 2、半不连续复制、半不连续复制 dna聚合酶催化的方向是5,3,。 前导链: 滞后链: 1968年,发现冈崎片段 (二)参与(二)参与dnadna复制的有关物质复制的有关物质 1 1、 dnadna聚合酶聚合酶 (1 1)聚合作用)聚合作用 (2 2)3 3 5 5外切酶活性外切酶活性 (3 3) 5 5 3 3外切酶活性外切酶活性 2 2、 解螺旋酶解螺旋酶 大肠
3、杆菌的解螺旋酶大肠杆菌的解螺旋酶、与与reprep蛋蛋白共同作用,将白共同作用,将dnadna两条链解开。两条链解开。 解螺旋酶解螺旋酶i i、iiii、iiiiii沿着模板链的沿着模板链的5353方向随着复制叉的前进而移动,而方向随着复制叉的前进而移动,而reprep蛋白则在另一条模板链上沿蛋白则在另一条模板链上沿3535方向方向移动。移动。 3 3、 单链单链dnadna结合蛋白(结合蛋白(ssbssb) 复制叉上的解螺旋酶,沿双链复制叉上的解螺旋酶,沿双链dnadna前进,前进,产生单链区,大量的单链产生单链区,大量的单链dnadna结合蛋白与单链结合蛋白与单链区结合,阻止复性和保护单链
4、区结合,阻止复性和保护单链dnadna不被核酸酶不被核酸酶降解。降解。 4 4、 拓扑异构酶(拓扑异构酶(或称旋转酶)或称旋转酶) 属dna拓扑异构酶,可引入负超螺旋,消除复制叉前进时带来的扭曲张力。 拓扑异构酶分两类:i和ii,广泛存在于原核生物和真核生物。 (1) 拓扑异构酶i 使dna的一条链发生断裂和再连接,反应无须供给能量,主要集中在活性转录区,与转录有关。 (2)拓扑异构酶 使dna的两条链同时断裂和再连接,当它引入超螺旋时需要由atp供给能量。分布在染色质骨架蛋白和核基质部,与复制有关。 5 5、 dnadna连接酶连接酶 连接双链连接双链dnadna上的切口。上的切口。 大肠杆
5、菌连接酶只能在模板上连接大肠杆菌连接酶只能在模板上连接dnadna缺缺口。口。t t4 4dnadna连接酶即可连接粘性末端的连接酶即可连接粘性末端的dnadna,又,又可连接平齐末端的双链可连接平齐末端的双链dnadna。 e.coli.e.coli.和其它细菌的和其它细菌的dnadna连接酶以连接酶以nadnad为为能源,动物细胞和噬菌体能源,动物细胞和噬菌体dnadna连接酶以连接酶以atpatp为为能源。能源。 6 6、 rnarna引物和引发酶引物和引发酶 细胞内,细胞内,dnadna的复制需要引物(的复制需要引物(dnadna或或rnarna),引物酶或),引物酶或rnarna聚合
6、酶可合成聚合酶可合成6-106-10个碱个碱基的基的rnarna引物。引物。 dnadna复制为什么要用复制为什么要用rnarna引物?(为什么引物?(为什么dnadna聚合酶要用引物,聚合酶要用引物,rnarna聚合酶不需要引聚合酶不需要引物?)物?) 从模板复制最初几个核酸时,碱基堆集力从模板复制最初几个核酸时,碱基堆集力和氢键都较弱,易发生错配和氢键都较弱,易发生错配 新复制的最初几个核苷酸,没有与模板形新复制的最初几个核苷酸,没有与模板形成稳定双链,成稳定双链,dnadna聚合酶的聚合酶的5 5,33,校对功能难校对功能难发挥作用。发挥作用。 (三)(三)dnadna复制过程复制过程
7、1 1、起始起始 (1 1)复制的起始点和方向)复制的起始点和方向 复制起点是以一条链为模板起始dna合成的一段序列。有时,两条链的复制起点并不在同一点上(不对称复制,如d环复制)。 多数生物的复制起点,都是dna呼吸作用强烈的区段,即经常开放的区段,富含a.t,而且可能含有大量的反向重复和保守序列。环状环状dna复制起点复制起点 (2 2)dnadna复制的起始复制的起始 引发:引发:当dna的双螺旋解开后,合成rna引物的过程。 引发体:引发体:引物合成酶与各种蛋白质因子(dnab、dnac、n、nni)构成的复合体,负责rna引物的合成。 引发体沿着模板链53方向移动(与冈崎片段合成的方
8、向正好相反,而与复制叉移动的方向相同),移到一定位置上即可引发rna引物的合成。 e.coli.dna复制原点ori c,由245bp组成,三组13bp重复序列(近5端处),四组9 bp重复序列(另一端处)。 2 2、复制、复制的延长的延长 前导链只需要一个rna引物,后随链的每一个冈崎片段都需要一个rna引物,链的延长反应由dna pol.催化。 复制体:复制体:在dna合成的生长点(既复制叉上)分布着许多与复制有关的酶和辅助因子,它们在dna的模板链形成离散的复合物,彼此配合进行高度精确的复制,称为复制体。 复制体沿着复制叉方向前进就合成dna。3 3、复制的终止、复制的终止rnarna引
9、物的切除及缺口补齐:引物的切除及缺口补齐:dna poldna pol的的5 5, 3 3,外切活力,切除外切活力,切除rnarna引物。引物。dnapoldnapol的的5 5, 3 3,合成活性补齐缺口。合成活性补齐缺口。dnadna切口的连接:切口的连接:dna ligasedna ligase,动物、真核由,动物、真核由atpatp供能,原核由供能,原核由nadnad供能。供能。dnadna合成的终止:合成的终止:环状环状dnadna、线性、线性dnadna,复制叉相遇即终止。,复制叉相遇即终止。(四)真核生物(四)真核生物dnadna复制的特殊规律复制的特殊规律 1 1、 复制起点和
10、单位复制起点和单位 真核生物染色体dna是多复制子,有多个复制起点,可以多点起始,分段进行复制。每个复制子大多在100-200bp之间,比细菌染色体dna(单复制子)小得多。 试验证据:5-氟脱氧胞苷标记 真核生物dna复制叉移动的速度此原核的慢,如哺乳动物复制叉移动的速度每分钟1-3kb,细菌每分钟5kb。 真核生物染色体全部复制完成前,起点不再从新开始复制。而在快速生长的原核生物中,起点可以连续发动复制。真核生物在快速生长时,可采用更多的复制起点同时复制。如黑腹果蝇,早期胚胎细胞中相邻复制起点的平均距离为7.9kb,而在培养的成体细胞中,平均距离为40kb,成体细胞只利用一部分复制起点。
11、2、真核生物的染色体在全部复制完成前,各起始点上不能开始下一轮的dna复制。在原核生物中,在起始点上可以连续地开始新的dna复制。 3 3、 复制过程中组蛋白的装配复制过程中组蛋白的装配 核小体的结构核小体的结构 试验证据:试验证据:环己酮亚胺抑制组蛋白合成,电子显微镜下观察 二、二、rnarna指导的指导的dnadna的生物合成的生物合成逆转逆转录录 逆转录: 以rna为模板,合成dna。与通常转录过程中遗传信息流从dna到rna的方向相反。 ( (一一) )逆转录酶逆转录酶 由一个亚基和一个亚基组成,含有zn2+,具有三种酶活力。 1 1、rna指导的dna聚合酶活力(以rna为模板,合成
12、一条互补 的dna,形成rnadna杂种分子)。 2 2、rnase h酶活力,水解rnadna杂种分子中的rna,可沿 35和53两个方向起外切酶作用。 3 3、dna指导的dna聚合酶活力。 模板:模板:rnarna或或dnadna 以自身病毒类型的rna为模板时,该酶的反转录活力最大,但是带有适当引物的任何种类的rna都能作为合成dna的模板。 引物:引物:rnarna或或dnadna 底物:底物:dntp 二价阳离子:二价阳离子:mg2+或mn2+ 真核mrna3端有polya,加入oligo dt后,可以作为逆转录酶的模板,合成cdna。 三、三、 dna的损伤及修复的损伤及修复 1
13、、dna的损伤 一些物理化学因子如紫外线、电离辐射和化学诱变剂均可引起dna损伤,破坏其结构与功能。然而在一定条件下,生物机体能使这种损伤得到修复。 紫外线可使dna分子中同一条链上两个相邻的胸腺嘧啶碱基之间形成二聚体(tt),两个t以共价键形成环丁烷结构。ct、cc间也可形成少量二聚体(ct、cc),使复制、转录受阻。 2、dna的修复 细胞内具有一系列起修复作用的酶系统,可以除去dna上的损伤,恢复dna的双螺旋结构。目前已知有4种酶修复系统:光复活、切除修复、重组修复、sos反应诱导的修复,后三种不需要光,又称为暗修复。(1 1)光修复)光修复 1949年已发现光复活现象,可见光(最有效
14、400nm)可激活光复活酶,此酶能分解由于紫外线形成的嘧啶二聚体。高等哺乳动物没有此酶。 (2 2)切除修复)切除修复 在一系列酶的作用下,将dna分子中受损伤部分切除,并以完整的那一条链为模板,合成出切去部分,dna恢复正常结构。 特异性核酸内切酶识别嘧啶二聚体嘧啶二聚体部位,在嘧啶二聚体嘧啶二聚体55端邻近处切开,在端邻近处切开,在dna单链上形成一缺口。 dna聚合酶以未损伤链为模板,按53方向进行修补。 dna聚合酶发挥发挥外切酶作用,按53方向切除嘧啶二聚体嘧啶二聚体损伤处。 dna连接酶连接。 第二节第二节 rnarna的转录的转录* * rnarna转录转录: :以一段dna的遗
15、传信息为模板,在rna聚合酶作用下,合成出对应的rna的过程,或在dna指导下合成rna。 转录产物:转录产物:mrna 、rrna、 trna、小rna 除某些病毒基因组rna外,绝大多数rna分子都来自dna转录的产物。 dnadna正链:正链:与mrna序列相同的dna链。 dnadna负链:负链:与正链互补的dna链。 转录是基因表达的第一步,也是最关键的一步。一、催化一、催化rnarna合成的酶合成的酶1 1、rnarna聚合酶聚合酶rna合成的基本特征底物:ntp(atp、gtp、ctp、utp)rna链生长方向:53不需引物需dna模板 (1) (1) 原核细胞聚合酶原核细胞聚合
16、酶 e.coli和其它原核细胞一样,只有一种rna聚合酶,合成各种rna(mrna、trna、rrna)。 e.coli rna聚合酶全酶由六个亚基组成,2 ,另有两个zn2+。 无亚基的酶叫核心酶,核心酶只能使已开始合成的rna链延长,而不具备起始合成活性,加入亚基后,全酶才具有起始合成rna的能力,因此,亚基称为起始因子。e.coli rna聚合酶各亚基的大小与功能:(2)(2)真核细胞真核细胞rnarna聚合酶聚合酶 真核生物的转录机制要复杂得多,有三种细胞核内的rna聚合酶: 除了细胞核rna聚合酶外,还分离到线粒体和叶绿体rna聚合酶,它们的结构简单,能转录所有种类的rna,类似于细
17、菌rna聚合酶。二、转录的过程二、转录的过程 1 1、转录的、转录的起始起始 转录是从dna模板上特定的部位开始的,这一部位称为启动子.rna聚合酶结合到dna双链的启动子上,局部解开双螺旋,第一个核苷酸(通常为gtp或atp )结合到转录起始位点,即开始rna链的延伸。 起始过程中,因子起关键作用,它能使聚合酶迅速地与dna的启动子结合,亚基与结合时,亚基的构象有利于核心酶与启动子紧密结合,转录起始后,亚基便从全酶中解离出来。然后nusa亚基结合到核心酶上,由nusa亚基识别序列序列。 转录起点是+1,上游是-1。 2 2、链的、链的延伸延伸 转录起始后,亚基释放,离开核心酶, nusa亚基
18、结合到核心酶上,使核心酶的亚基构象变化,与dna模板亲和力下降,在dna上移动速度加快,由nusa亚基识别序列序列,使rna链不断延长。 3 3、转录的、转录的终止终止 rna聚合酶到达转录终止点时,在终止辅助因子的作用下下,聚合反应停止,rna链和聚合酶脱离dna模板链,nusa又被亚基所取代。 由此形成rna聚合酶起始复合物与终止复合物两种形式的循环。 三、三、rnarna转录后的加工修饰转录后的加工修饰 rna聚合酶合成的原初转录产物,要经过剪切、修 饰、拼接等过程,才能转变成成熟的rna分子,此过程 称rnarna转录后的加工转录后的加工。 1 1、真核生物真核生物mrnamrna前体
19、的加工前体的加工 mrna原初转录物是分子量很大的前体,在核内加工过程中形成分子大小不等的中间产物,它们被称为核内不均一rna(hn rna)。其中,约有25%可转变成成熟的mrna。 hnrna半寿期很短,比细胞质中的mrna更不稳定,一般在几分钟至1小时。而细胞质mrna的半寿期为1-10小时,神经细胞mrna最长可达数年。 hnrna转变成mrna的加工过程主要包括: a. 5末端形成帽子结构 b. 3末端切断并加上polya c. 剪接除去内含子对应的序列,拼接外显子. (1)戴帽加尾)戴帽加尾 参与的酶: rna三磷酸酶,mrna鸟苷酰转移酶,mrna(鸟嘌呤-7)甲基转移酶,mrna(核苷-2)甲基转移酶。 5帽子的功能 a.保护mrna,避免5端受核酸外切酶的降解 b.在翻译过程中起信号识别作用,协助核糖体与mrna结合,使翻译从aug开始。 加尾尾:hnrna链由rnaase切断,由多聚腺苷酸聚合酶催化,加上polya,atp为供体。 加尾信号:aataaa、ygtgtgyy(y为嘧啶)。 核内hnrna的3端也有多聚腺苷酸,表明加尾过程早在核内已经完成。hnrna中的poly(a)比mrna略长,平均150-200nt。 polya的功能: a. 防止核酸外切酶对mrna信息序列的降解,起缓冲作用。 b. 与mrna从细胞核转移到细胞质
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