动物育种学 -第6章－个体遗传评定之选择指数法ppt课件

1、遗传评定概述单性状育种值估计多性状综合遗传评定第三节 多性状综合遗传评定v多性状选择概述v综合选择指数的估计v选择指数运用的本卷须知多性状选择概述育种任务中，不仅希望单个性状得到改良，更育种任务中，不仅希望单个性状得到改良，更追求在多个性状上同时获得进展追求在多个性状上同时获得进展畜禽的育种目的涉及多个性状：畜禽的育种目的涉及多个性状：奶牛：产奶量、乳脂率、乳蛋白率奶牛：产奶量、乳脂率、乳蛋白率猪：日增重、瘦肉率和产仔数猪：日增重、瘦肉率和产仔数蛋鸡：产蛋数和蛋重蛋鸡：产蛋数和蛋重绵羊：剪毛量、毛长和细度绵羊：剪毛量、毛长和细度多性状选择概述多性状选择方法顺序选择法独立淘汰法综合选择法综合选择

2、指数综合选择指数综合遗传评定综合遗传评定顺序选择法tandem selection指对育种目的中待选择的几个性状逐一进展选择例如奶牛的育种目的：产奶量、乳脂率、乳蛋白率缺陷：花时太长、性状的选择顾此失彼，已不运用多性状选择概述产奶量产奶量乳脂率乳脂率乳蛋白率乳蛋白率2-3个世代个世代2-3个世代个世代2-3个世代个世代独立淘汰法independent culling指育种目的中包含的每个性状都有一个最低选择规范，各性状都超越相应规范的个体留作种畜改良：同时思索多个性状，优于顺序淘汰法缺陷：选择的个体能够在各性状上都表现平平多性状选择概述综合选择法index selection，I 根据育种目的

3、中各性状的遗传根底和经济重要性，分别给予各性状一个适当的加权系数，综合到一个指数中，根据指数的大小进展选择选择效果优于独立淘汰法和顺序选择法多性状选择概述独立淘汰法独立淘汰法顺序选择法顺序选择法综合选择法综合选择法综合选择指数的特征反映的个体种用价值较为全面不仅思索性状的遗传根底和经济重要性，而且还思索性状间的遗传相关选择效率较高，在BLUP之前被广泛运用综合选择指数v多性状选择概述v综合选择指数的估计v选择指数运用的本卷须知综合选择指数的根本公式：综合选择指数的估计iniiTAWAII、AT：综合选择指数：综合选择指数Wi：第：第 i 个性状的经济加权值个性状的经济加权值Ai：第：第 i 个

4、性状的育种值个性状的育种值根据各性状在育种根据各性状在育种和经济上的重要性，和经济上的重要性，给予相应的经济加给予相应的经济加权值权值I 的计算公式:综合选择指数的估计)(iiiiniiTppbAWAI 矩阵方式：)p(pbIb: 含遗传根底和经济意义的偏回归系数向量含遗传根底和经济意义的偏回归系数向量p : 为不同来源的信息性状表型值为不同来源的信息性状表型值p多元回归方法多元回归方法：与：与p对应的均数对应的均数综合选择指数的估计综合选择指数计算的关键步骤： 偏回归系数b的计算计算偏回归系数的正规方程组求极大值方法DAwVbDAwVb1则： V：信息性状表型值之间的方差协方差矩阵：信息性状

5、表型值之间的方差协方差矩阵D：被估个体与信息来源个体间的亲缘系数对角矩阵：被估个体与信息来源个体间的亲缘系数对角矩阵A：信息性状与目的性状间的遗传方差协方：信息性状与目的性状间的遗传方差协方 差矩阵差矩阵w：经济加权值向量：经济加权值向量6-16目的性状与信息性状目的性状：综合育种值所包含的性状，即育种目的中待改良的性状如：产奶量、乳脂量信息性状：育种值估计中提供信息资料的性状 如：产奶量、乳脂率信息性状与目的性状普通为一样性状，信息性状与目的性状普通为一样性状，也可以不同，但必需有较高的遗传相关也可以不同，但必需有较高的遗传相关估计综合选择指数的步骤：估计综合选择指数的步骤：综合选择指数的估

6、计DAwVb1)(ppbIwADVV1、)(例：例： 对某奶牛场的青年公牛进展综合选择指对某奶牛场的青年公牛进展综合选择指数计算，目的性状为乳脂量和日增重。数计算，目的性状为乳脂量和日增重。知一公牛现有如下信息性状记录：知一公牛现有如下信息性状记录： 母亲乳脂量母亲乳脂量PD1=170kg, 对应均数为对应均数为140kg 父亲日增重父亲日增重PS2=1180g, 对应均数为对应均数为1290g 本身日增重本身日增重PE2=0g, 对应均数为对应均数为1300g 综合选择指数的估计综合选择指数的估计性状性状wPA乳脂量乳脂量1 25元元25kg12.5kg0.10日增重日增重2 1.3元元80

7、g51g两性状的经济加权值和有关遗传参数为：两性状的经济加权值和有关遗传参数为：2, 1Ar两性状间的两性状间的遗传相关遗传相关解：先求矩阵解：先求矩阵 ， 结果如下：结果如下： 综合选择指数的估计222222221211),(),(),(PESPEDSDPsymPPCovPPCovPPCovV75.63515 .121 . 0),(212, 121AAArAACov0),(21SDPPCov5 .1300515 . 0),(),(22)(2222222APPAESESEsrAACovPPCov222, 1222, 12, 12)()()(1AAAAACovAACovAACovAwADV、88

8、.3175.635 . 0),(),(21)(2121AACovrPPCovEDPPAED两性状间的遗传相关两性状间的遗传相关信息个体间的亲缘相关信息个体间的亲缘相关综合选择指数的估计于是，于是，222808 .1300808 .318025symV2225175.635175.6375.635 .12A15 . 05 . 0)()()(221IPAIPAIPAESDrrrD3 . 12521www综合选择指数的估计712. 0244. 0115. 33 . 1255175.635175.6375.635 .1215 . 05 . 0808 .1300808 .3180252221222sym

9、DAwVb1偏回归系数为：综合选择指数的估计综合选择指数为：41.1831300135012901180140170712. 0244. 0115. 3)(yybI评价综合选择指数准确度的目的：真实育种值与选择指数间的相关系数rAI综合选择指数的估计GwwDAwbcb2TAAIrGww2TA其中，其中，G：各目的性状间的遗传方差：各目的性状间的遗传方差协方差矩阵协方差矩阵22121221),(),(AAAACovAACovG综合选择指数的估计本例的综合选择指数准确度为：69.1061953 . 1255175.6375.635 .123 . 125222GwwTA8 .104424975248

10、71995712. 0244. 0115. 3DAwbcb31. 088.32519.102AIrGwwDAwbcb2TAAIrv多性状选择概述v综合选择指数的估计v运用选择指数法的本卷须知运用选择指数法的前提不存在系统环境效应被估个体与表型观测值来源于同一总体遗传参数已估计出来选择指数运用的本卷须知满足上述条件时，估计育种值为最正确线性满足上述条件时，估计育种值为最正确线性无偏估计。无偏估计。I I 的运用遭到上述条件的制约的运用遭到上述条件的制约制定选择指数的本卷须知 1) 目的性状要突出。一个选择指数包括24个最重要的性状 例如：种公猪包括达100kg体重日龄和活体背膘 种母猪再添加总产仔数性状防止有高的负遗传相关性状。必需思索时，可合并为一个性状