linux集群登陆及投算作业-改2014830

1、一、登陆到linux集群（1）登录管理节点登陆linux集群分为shell字符界面登陆和vnc图形界面登陆。首先在个人电脑安装Xmanage和 RealVNC软件，见群共享。字符界面登陆用到xshell工具，双击打开xshell工具，输入ssh 99回车然后输入用户名和密码，登陆到linux集群的管理节点mu01。（2）修改登录密码普通用户更改密码，在登录服务器mu01管理节点后，输入ssh cu01，进入cu01节点，然后输入yppasswd命令来修改密码，这样所有节点密码都会自动修改。（注：需输入两次新密码，输入时不会显示）（3）上传、下载文件点击绿色的new fil

2、e transfer按钮打开xftp工具左侧为本地硬盘，右侧为linux用户目录。打开本地硬盘，右键单击需要上传的文件或文件夹，选择upload即可把文件上传到linux用户目录下。 下载文件与上传相反，在linux用户目录下选择要下载的文件或文件夹，右键选择download即可下载文件到本地硬盘。（4）启动VNC由于comsol，fluent，matlab，abaqus软件都是图形界面软件，所以建议用以下vnc图形界面方式登陆cu01-cu04计算节点。在第一次用vnc图形界面登陆时，先用xshell 登陆到字符界面下设置本账户的vnc图形界面，xshell登陆后先直接运行vncserver

3、开启vnc功能，此时会提示输入密码，输入将要设置的密码，注意此密码是vnc的密码，与账户密码无关（建议设置与账户相同的密码），注意输入密码时没有显示。用vncserver list查看分配到的vnc号，如下记住 :1然后打开VNC viewer工具输入ip地址56加“:1”的格式来登陆vnc图形。提示输入VNC密码，打开用户桌面若VNC号有两个及以上，或VNC连接不上，或登录错误，需要杀掉VNC号，用kill命令，例如杀掉“:1”然后，再起VNC，输入vncserver回车，再输入vncserver list 回车，查看重新分配的VNC号，注意只能存在1个VNC号。备注：

4、vnc更改密码，输入vncpasswd，按提示输入两次密码即可。二、软件计算由于集群资源很少，除去管理节点不参与计算外，就剩余4个计算节点，而软件和用户相对校多，所以不建议跨节点跑作业，即每个作业使用核数不要超过16核。在要跑软件之前，先登陆到计算节点上用top命令查看目前是否有程序在运行。在用户桌面，单击右键，选择Open in Terminal例如在cu01上投算作业，输入ssh X cu01，回车，转到cu01节点 输入top回车，再按“1”查看cu01节点CPU使用情况若是0代表目前该核心空闲，可以运算作业。100代表cpu核心满负荷运算。若某个节点16个CPU负荷已很高，换至其余空闲

5、节点运算作业。建议一个计算节点核心数最多使用15核。按“Q”键返回，输入fluent 即可打开FLUENT 14.0软件同理，输入matlab、comsol、abq6101 cae即可打开MATLAB R2009b、COMSOL 4.3、ABAQUS 6.10软件。三、退出linux系统（1）若软件正在运行，需要临时退出Linux系统，点击用户桌面右上角的“×”，关闭VNC，在Xshell中连续输入exit命令关闭Xshell，这样即使退出Linux系统，软件仍在计算。（2）若软件计算完成或没有计算，在terminal中连续输入exit命令退出，点击用户桌面右上角的“×”，关闭VNC，再在Xshell中连续输入exit命令退出Xshell。注意：（1）投算作业需先登录管理节点mu01，再转到计算节点cu01cu04（2）mu01为管理节点，仅有1颗C