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Mothur使用介绍（1） OTU的确定 杨海水 （浙江大学） QQ：544834661 E-mail: yanghaishui 2010-11-17 浙江大学生命科学学院农业生态与工程研究所 1 第一步：进入主页面，点“Manual” 2010-11-17 浙江大学生命科学学院农业生态与工程研究所 2 第二步：OTU-based approach 2010-11-17 浙江大学生命科学学院农业生态与工程研究所 3 对于初学者，必须对照 Manual一步步进行操 作，因为mothur所运行 的Dos系统对大多数生物 学科研工作者都很陌 生，需慢慢掌握 2010-11-17 浙江大学生命科学学院农业生态与工程研究所 4 (3 打开 mothur:2010-11-17浙江大学生命科学学院农业生态与工程研究所 6 (7 输出OTU的分类结果，用bin.seqs指令 在cutoff为0.03水平上（序列相似性为97%）进行的OTU划分结果，竖杠后面 的数字为对应的OTU序号 2010-11-17 浙江大学生命科学学院农业生态与工程研究所 11 (8选择OUT的代表性序列，用get.oturep 表示OTU1有4条序列，代表性序列为A773AUCvPO，后面为相应序列 2010-11-17 浙江大学生命科学学院农业生态与工程研究所 12 2010

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