荧光定量PCR技术原理与结果分析

1、荧光定量荧光定量PCR技术技术原理与结果原理与结果分析分析罗喜鹏v一、含义v二、优越性v三、应用v四、定量方法 v五、荧光材料 v六、结果分析一、含义v实时荧光定量实时荧光定量PCR技术技术(Real-Time Quantitative PCR)是指在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。 二、优越性v特异性 荧光定量PCR具有引物和探针的双重特异性，故与传统的PCR相比，特异性大为提高。 v敏感性 荧光定量PCR的敏感度通常达E2拷贝/ml，对数期分析，线性范围很宽，为0-E11拷贝/ml。一般来讲临床标本中病原体

2、的数目为0-E10/拷贝，在此范围内荧光定量PCR定量较为准确，标本不需稀释。 v重复性 荧光定量PCR结果相当稳定，因为域值设置在指数扩增期.在此阶段，各反应组分浓度相对稳定，没有副作用，CT与荧光信号的对数呈线性关系。与终点法相比CT值能更稳定，更精确地反映起始模板的拷贝数。 v自动化 无PCR后续操作步骤，降低产物污染的风险性。三、应用v用于核酸的定量如RNA、DNA的定量 v用于核酸定性分析如SNP分析，基因型分析，RNA变异分析，溶解曲线分析等。四、定量方法定量方法v1. 标准曲线法的绝对定量 v2. 标准曲线法的相对定量 v3. 比较CT法的相对定量 五、荧光材料荧光材料v荧光探针

3、和荧光染料 v SYBR green Iv 水解探针TaqManv 分子信标v 杂交探针SYBR green I未结合的SYBR green I水解探针TaqMan荧光素淬灭剂 与目标序列互补FAMTETJOEHEXVIC TAMRA DABCYL 探针与目标序列配对时 ，发生荧光共振能量转移 (FRET)能量转移Taq游离的探针荧光基团 淬灭剂 延伸时，Taq酶水解探针，使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离而发出荧光，形成荧光信号 Taq发出荧光光另一波长的荧光分子信标荧光基团茎由互补配对的序列组成环与目标序列互补 (5-7bp)环（15-30bp）FAM Texas Red 探针杂交到DNA模

4、板光发出荧光DNA 模板环光淬灭杂交探针555发出荧光5555六、结果分析v基线（Baseline）指在指在PCR扩增反应的最初数个循环里，荧光信号变化扩增反应的最初数个循环里，荧光信号变化不大，接近一条直线，这样的直线即基线。不大，接近一条直线，这样的直线即基线。v光域值光域值threshold的设定的设定一般将一般将PCR反应前反应前15个循环的荧光信号作为荧光本底个循环的荧光信号作为荧光本底信号，荧光域值是信号，荧光域值是PCR3-15个循环荧光信号标准差个循环荧光信号标准差的的10倍，荧光域值设定在倍，荧光域值设定在PCR扩增的指数期。扩增的指数期。vCT值 表示每个PCR反应管内荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。研究表明，各模板的CT值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系，起始拷贝数越多，CT值越小，反之亦然。 基线期指数期线性期平台期荧光阈值线CT值融解曲线分析融解温度TM非特异扩增产物目的基因产物比较CT法的相对定量表达差异计算假设目的基因与看家基因扩增效率相同，数学推导得出目的基因的量=2-C