基因组与比较基因组学研究

1、会计学1基因组与比较基因组学研究基因组与比较基因组学研究第1页/共53页第1页/共53页第2页/共53页第2页/共53页第3页/共53页第3页/共53页第4页/共53页第4页/共53页第5页/共53页第5页/共53页第6页/共53页第6页/共53页第7页/共53页第7页/共53页第8页/共53页第8页/共53页第9页/共53页第9页/共53页第10页/共53页第10页/共53页第11页/共53页第11页/共53页第12页/共53页第12页/共53页第13页/共53页第13页/共53页第14页/共53页第14页/共53页第15页/共53页第15页/共53页第16页/共53页第16页/共53页第1

2、7页/共53页第17页/共53页第18页/共53页第18页/共53页第19页/共53页第19页/共53页第20页/共53页第20页/共53页第21页/共53页第21页/共53页第22页/共53页第22页/共53页第23页/共53页第23页/共53页第24页/共53页第24页/共53页第25页/共53页第25页/共53页第26页/共53页第26页/共53页第27页/共53页第27页/共53页第28页/共53页第28页/共53页第29页/共53页第29页/共53页第30页/共53页第30页/共53页第31页/共53页第31页/共53页第32页/共53页表6.6 E.coli, Haemophilu

3、s influenzae和Mycoplasma genitalium基因组中的基因分类分 类基 因 数E. coli H. influenzaeM. genitalium总ORF数42881727470氨基酸合成131681辅基等的合成103545核苷酸合成585319细胞膜合成与装配2378417能量代谢24311231中合物代谢188306脂肪代谢48256DNA复制、重组和修复 1158732蛋白质结构967调控蛋白178647转录552712翻译182141101吸收与转运42712334第32页/共53页第33页/共53页第33页/共53页第34页/共53页第34页/共53页第35页

4、/共53页第35页/共53页第36页/共53页第36页/共53页第37页/共53页第37页/共53页第38页/共53页第38页/共53页第39页/共53页第39页/共53页第40页/共53页第40页/共53页第41页/共53页第41页/共53页第42页/共53页第42页/共53页第43页/共53页第43页/共53页第44页/共53页第44页/共53页第45页/共53页46对鸟枪法的改进(1) Clone contig法。首先用稀有内切酶把待测基因组降解为数百kb以上的片段，再分别测序。(2) 靶标鸟枪法(direted shotgun)。首先根据染色体上已知基因和标记的位置来确定部分DNA片段

5、的相对位置，再逐步缩小各片段之间的缺口。第45页/共53页第46页/共53页第46页/共53页第47页/共53页第47页/共53页第48页/共53页第48页/共53页第49页/共53页表6.6 E.coli, Haemophilus influenzae和Mycoplasma genitalium基因组中的基因分类分 类基 因 数E. coli H. influenzaeM. genitalium总ORF数42881727470氨基酸合成131681辅基等的合成103545核苷酸合成585319细胞膜合成与装配2378417能量代谢24311231中合物代谢188306脂肪代谢48256DNA复制、重组和修复 1158732蛋白质结构967调控蛋白178647转录552712翻译182141101吸收与转