基因检测案例5-Stargardt

1、基因检测案例5|Stargardt疾病简介Stargardt病和眼底黄色斑点症是同一种病的不同表现，其特点是眼底可见有散在的黄色斑点，位于视网膜色素上皮层。当特征性的黄色斑点散布在眼底时，称眼底黄色斑点症。当斑点局限于后极部并伴有黄斑萎缩时称为Stargardt病。中心视力在疾病初期即有明显下降,色觉障碍出现较早并逐渐加重。Stargardt病呈常显遗传和常隐遗传。ABCA4基因简介及遗传方式ABCA4基因位于lp22，全长约8kb，含50个外显子，cDNA长度为6705bp，编码2235个氨基酸，存在于视网膜视杆细胞外段的视盘膜中。ABCA4基因编码由2273个氨基酸组成的视网膜感光细胞特异

2、性ATP结合转运蛋白（Rmp），携带该基因突变的患者RPE细胞中脂褐质（A2E）聚集，推测ABCA4可能参与视黄醇类分子在视杆细胞和RPE间转运，但具体机制尚不清楚OABCA4基因突变可致常染色体隐性遗传性RP、targardt病和锥杆细胞营养不良等。ABCA4基因变异类型MutationtypeTotalnumberofmutationsMissense/nonsense836Splicingsubstitutions206Requlatorysubstitutions4Smalldeletions174Smallinsertions/duplications39Smallindels12G

3、rossdeletions16Grossiusertions/duplications5Complexrearrangements4Repeatvariations0TOTAL1356HGMD数据库中收录的ABCA4基因变异有1356余种，其中66%为错义突变，15%为剪切突变，小片段插入缺失突变占16%，错义突变占的比列较高。ABCA4基因导致的其他疾病除了引起STGD1之外，ABCA4基因突变还与其它一系列视网膜变性疾病有关，如视网膜色素变性（RP）、视锥视杆细胞萎缩（CRD）以及老年性黄斑变性（AMD）。案例分享临床症状先证者，男，24岁，临床诊断为Stargardt病，先证者姐姐也有相

4、同症状。检测项目眼科遗传病基因检测（441个基因）。检测方法从受检者外周血中提取基因组DNA，构建基因组文库，通过探针杂交捕获相关的目的基因外显子及相邻内含子部分区域，进行富集。富集的目的基因片段通过高通量测序平台测序，对明确的致病性变异，采用Sanger测序进行验证。检测结果检出一个与受检者临床表型匹配的致病性基因变异。基因名称参考序列檢苔醱改变氨基酸改娈纯合榇合致情性分析遗恃方式变异来源ABCA4c.2063dupApAsnfiBBfs杂合Pathagetiic未知仁至4C.5DKSOAp.Serl6?6.Ar杂合Pathogenic未知备注：按照美国医学遗传学与基因组学学会ACMG）制定

5、的遗传变异分类标准，变异分为以下5种类型,Pathogenic表示致病的变异Likelypathogenic表示可能致病的变异Benign表示良性的变异；Likelybenign表示可能良性的变异；Uncertainsignificance表示意义不明确的变异。AD表示常染色体显性遗传;AR表示常染色体隐性遗传；X-linked表示X连锁遗传。遗传解析ABCA4（OMIM601691）基因突变常引起视网膜色素变性或锥杆细胞营养不良CORD3或Stargard病，以常染色体隐性的方式遗传。2被检先证者携带下列杂合突变：（1）.ABCA4c.2063dupA;p.Asn688fs,此突变已被HGM

6、D数据库收录，已有文献报道【见参考文献1-2】为致病突变.（2）.ABCA4c.5088CA;p.Ser1696Arg,此突变已被HGMD数据库收录，已有文献报道【见参考文献3】为致病突变3.受检者基因诊断与临床表型相符，为致病变异。遗传咨询建议1）受检父母未进行该变异位点的验证。建议家系遗传咨询。(2)受检者及家系内其他患者将来生育，与携带ABCA4基因变异的配偶与不携带ABCA4基因变异的配偶进行婚配，后代携带该基因的情况不一致，建议进行遗传咨询。金标准验证Xu(2014)HumGenet133,1255Jiang(2016)InvestOphthalmolVisSci57:145AdditionalphenotypeFujinami（2013）InvestOphthalmolVisSci54,6662C