生物信息学专业毕业实习学术型实践教学大纲

1、生物信息学专业毕业实习学术型实践教学大纲课程代码：BIOI1041课程名称：毕业实习 英文名称：Graduation Practice 实验室名称：生物信息实验室（404#4221）课程学时：9周实验学时：9周一、本课程实践教学目的与要求能够根据给定的生物学问题，首先通过自主查阅相关生物学文献资料，并结合所学的生物信息学知识和技能，从生物信息学的角度给出解决方案或思路；能够灵活运用各种生物信息学工具软件和分析平台，对该问题所涉及的生物信息学领域的数据资源进行计算分析和数据挖掘，并能够结合生物学知识，解释其中可能隐含的生物学意义，最后，能够自主查阅生物学实验技术资料，提出实验验证的方案或思路。通

2、过该实践环节的训练，使学生能够把生物学传统实验与生物信息学实验相结合，提高学生独立自主地分析问题和解决问题的能力。二、主要仪器设备及现有台套数专业服务器1台教师用台式计算机2台学生用台式计算机30台教学示范用投影仪1台三、实施办法：收集我院各个学科科研中碰到的与生物信息学相关的问题，从中提炼出侧重于学术型的题目，并向学生公开。由学生根据自身的兴趣爱好来自主选择题目，同时也鼓励学生自己提出问题，有专业指导老师评价认可后，也可实施。范例1：某研究组使用基因芯片技术来研究某个生物学问题的分子机制，获得了高通量的基因表达谱数据。=接下来该怎么办？范例2：某课题组计划研究肺癌发生的分子机理，经调研发现，

3、已有大量公开的肺癌相关的基因表达谱数据。=接下来该怎么办？范例3：某研究室通过EST消减法得到两组样本之间的差异表达ESTs，他们想知道这些ESTs中，哪些是新基因，哪些是已知基因？这些已知基因的生物学功能、相关作用关系如何？=接下来该怎么办？四、考核方式1、实验报告电子版实验报告。2、考核方式（1）平时成绩10%计入总成绩。（2）每周小结报告成绩20%计入总成绩。（3）最终的总结报告成绩70%计入总成绩。生物信息学专业毕业实习（应用型）实践教学大纲课程代码：BIOI1043课程名称：毕业实习 英文名称：Graduation Practice 实验室名称：生物信息实验室（404#4221）课程

4、学时：9周实验学时：9周一、本课程实践教学目的与要求能够根据给定的生物信息应用开发问题，首先通过自主查阅相关程序应用开发文献资料，并结合所学生物信息学知识和技能、以及现有的生物信息学开源模块，提出整个应用开发的框架和流程，并能够实用自身所掌握的编程语言，将其实现，而后使用现有的公开数据源对其进行测试，并成功通过。通过该实践环节的训练，使学生能够灵活地运用各种开源代码和软件模块，开发一些比较简单的应用程序，提高学生独立自主地分析问题和解决问题的能力。二、主要仪器设备及现有台套数专业服务器1台教师用台式计算机2台学生用台式计算机30台教学示范用投影仪1台三、实施办法收集我院各个学科科研中碰到的与生物信息学相关的问题，从中提炼出侧重于学术型的题目，并向学生公开。由学生根据自身的兴趣爱好来自主选择题目，同时也鼓励学生自己提出问题，有专业指导老师评价认可后，也可实施。范例1：某个课题组建立了一个物种的EST文库，他们想鉴别其中的新基因。=接下来该怎么办？范例2：某研究小组通过得到两个样本组的EST/cDNA序列库，现在他们想知道这两组样本之间的差异。=接下来该怎么办？范例3：通过高通量测序，某课题组得到大量的转录本序列，现在他们想根据给定的特定序列，对其进行筛选，并向指导这些筛选出来的序列在基因组上的定位，是否来自于某个已知基因等信息。=接下来该怎么办？四、考核方