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文档简介

1、第二章DNA损伤与修复第二节DNA 损伤一、DNA损伤因素(一)内源性损伤(体内因素)1、DNA复制错误:碱基配对从A-T转换成G-C。2、碱基自身互变异构体:C的异构体与A错误配对。3、自发的化学变化4、氧化损伤(二)外源性损伤(体外因素)1、物理因素2、化学因素(化学试剂)二、多种化学或物理因素可诱发突变1、大量的突变属于自发突变,发生频率只不过在10-9左右。但由于生物基因组庞大,细胞繁殖速度快,因此它的作用是不可低估的。2、实验室用来诱发突变,也是生活环境中导致突变的因素,主要有物理和化学因素。 物理因素: 紫外线(ultra violet, UV)、各种辐射 UV三、突变在生物界普遍

2、存在(一)突变是进化、分化的分子基础1、DNA突变具体指个别dNMP残基以至片段DNA在构成、复制或表型功能的异常变化,也称为DNA损伤(DNA damage)。2、从分子水平来看,突变就是DNA分子上碱基的改变。 3、从长远的生物史看,进化过程是突变的不 断发生所造成的。4、大量的突变都是属于这种类型,只是目前还未能认识其发生的真正原因,因而名为自发突变或自然突变(spontaneous mutation)。(三)致死性的突变可导致个体、细胞的死亡 (四)突变是某些疾病的发病基础四、引起突变的分子改变类型有多种错配 (mismatch)缺失 (deletion)插入 (insertion)重

3、排 (rearrangement) 框移(frame-shift) DNA分子上的碱基错配称点突变(point mutation)。自发突变和不少化学诱变都能引起DNA上某一碱基的置换。点突变发生在基因的编码区,可导致氨基酸改变。 (一)错配可导致编码氨基酸的改变(二)缺失、插入和框移突变造成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变1、缺失:一个碱基或一段核苷酸链从DNA大分子上 消失。2、插入:原来没有的一个碱基或一段核苷酸链插 入到DNA大分子中间。 缺失或插入都可导致框移突变 。3、框移突变是指三联体密码的阅读方式改变,造 成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变。 谷 酪 蛋 丝5 G C A G U A

4、C A U G U C 丙 缬 组 缬正常5 G A G U A C A U G U C 缺失C缺失引起框移突变:DNA损伤(突变)可能造成两种结果:其一是导致复制或转录障碍(如胸腺嘧啶二聚体,DNA骨架中产生切口或断裂);其二是导致复制后基因突变(如胞嘧啶自发脱氨基转变为尿嘧啶),使DNA 序列发生永久性改变。所以,必须通过进化使细胞拥有灵敏的机制,以识别和修复这些损伤,否则细胞无法维持正常代谢。 第三节 DNA 损伤修复 DNA损伤修复(repair) : 是对已发生分子改变的补偿措施,使其尽可能回复为原有的天然状态。修复的意义: 保证DNA携带的遗传信息能完全地忠实转给子代、维持生物特征

5、的稳定性和完整性。一、DNA损伤的修复有多种类型错配修复(mismatch repair)直接修复(direct repair)光修复(light repairing)切除修复(excision repairing)重组修复(recombination repairing)SOS修复 1、嘧啶二聚体的直接修复(light repair) 这是一种广泛存在的修复作用,能够修复任何嘧啶二聚体的损伤。修复过程由光修复酶(photolyase)催化完成。一、有些DNA损伤可以直接修复(一)直接修复系统利用酶简单地逆转DNA损伤光修复酶(photolyase) UV二、切除修复是最普遍的DNA损伤修复方

6、式1、碱基切除修复2、核苷酸切除修复3、碱基错配修复 碱基切除修复依赖于生物体内存在的一类特异的DNA糖基化酶。切除修复过程: (1)识别水解 (2)切除 (3)合成 (4)连接1、碱基切除修复(base excision repair)(二)核苷酸切除修复系统识别DNA双螺旋变形这是细胞内最重要和有效的修复方式。其过程包括去除损伤的DNA,填补空隙和连接。主要由DNA-pol和连接酶完成。这也是一种广泛存在的修复机制,可适用于多种DNA损伤的修复。切除修复机制的基本过程是将受损的DNA片段切除,然后再以对侧链为模板,重新合成新链进行修复。由核苷酸切除修复系统负责进行修复。切除修复系统步骤 核

7、酸内切酶UvrA、UvrB和UvrC蛋白识别损伤部位 UvrC将受损片段切除 DNA pol 填补缺口 连接酶封口UvrAUvrBUvrCOHPDNA聚合酶OHPDNA连接酶ATP碱基丢失碱基缺陷或错配结构缺陷切开核酸内切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶DNA连接酶AP核酸内切酶核酸外切酶切开切除修复连接糖苷酶插入酶碱基取代 核苷酸切除修复不仅能够修复整个基因组中的损伤,而且能拯救因转录模板链损伤而暂停转录的RNA聚合酶,即参与转录偶联修复(transcription-coupled repair)。 转录偶联修复的意义在于,将修复酶集中于正在转录的DNA,使该区域的损伤尽快得以修复。 错配修复对

8、DNA复制忠实性的贡献力达102-103,DNA子链中的错配几乎完全都被修正,充分反映了母链的重要性。错误的碱基配对可以通过母链中识别标记区分;标记是GATC(回文结构)中A甲基化,E.coli中的3个蛋白质(MutS、MutH和MutL)校正。该修复系统只校正新合成的DNA,因为新合成DNA链的GATC序列中的A(腺苷酸残基)开始未被甲基化。GATC中A甲基化与否常用来区别新合成的链(未甲基化)和模板链(甲基化)。3、碱基错配修复错配修复系统作用机制:MutS蛋白识别错配的碱基;并吸引MutL 蛋白到这个位置,新生链的GATC序列未甲基化; MutL 蛋白激活MutH蛋白,在新链的未甲基化的

9、GATC打开缺口;外切核酸酶切除3到5方向错配碱基与GATC序列之间的间隔的DNA序列,聚合酶填补空缺;DNA连接酶封闭缺口,甲基化酶在新链甲基化。新复制DNA的新旧链区别E.Coli错配修复系统作用机制重组修复(recombination repair)这是DNA的复制过程中所采用的一种有差错的修复方式。 修复时,利用重组蛋白RecA的核酸酶活性,将另一股健康亲链与损伤缺口相互交换。某些DNA修复发生在跨越损伤DNA的复制事件之后(了解)重组修复步骤:将正常母链上一段与损伤子链缺口同源片 段转移进行重组,使母链上带有缺口;DNA聚合酶填补母链上的缺口;DNA连接酶封口。损伤的DNA经过数代复制可得到稀释,从而对细胞的影响减至最小。重组修复SOS 修 复1、当DNA损伤广泛难以继续复制时,由此而诱 发出一系列复杂的反应。2、在E. coli,各种与修复有关的基因,组成 一个称为调节子(regulon)的网络式调控系统。3、这种修复特异性低,对碱基识别、选择能力差。 通过SOS修复,复制如能继续,细胞是可存活的。 但DNA保留的错误较多,导致较广泛、长期突变。 SOS反应的机制(大肠杆菌应急修复系统)

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