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文档简介

1、系统发育树构建构建步骤主要目的：了解分子进化及系统发育分析掌握多序列比对方法熟悉系统发育树建立方法掌握用Mega软件进行构建系统发育树系统发生（phylogeny）是指生物形成或进化的历史 系统发生学(phylogenetics)研究物种之间的进化关系 系统发育树（phylogenetic tree）描述物种之间进化关系系统发育树（phylogenetic tree）又称evolutionary tree进化树)就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓扑结构。它可以用来研究不同物种间的进化关系，这一直是生物学的研究热点。 拓扑（Topology）将讨论范围内的事物之间的相互关系表示出来，将这些事

2、物之间的关系通过图表示出来。 两个临近的分支的连接处称为节点（node）,表示推断祖先的现存类群在树最底部的分支点成为根节（root node）, 一个单一的共同的祖先被定义为进化支（clade）或者单源群（monophyletic group） 树的分支模式被成为拓扑结构（tree topology）系统发育树建立方法NCBIBLAST输入序列对比记录好以下几方面： 名 称： Uncultured bacterium clone YU201H10序列号： FJ694683 /FJ694514文 献： TITLE Circumpolar synchrony in big river bacterioplankton 序列长度：353相 似 比： 99% 核酸序列分类地位 Mega下载地址没有一种方法能够保证一棵系统发育树一定代表了真实进化途径。然而，有些方法可以检测系统发育树检测的可靠性。第一，如果用不同方法构建树能得到同样的结果，这可

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