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文档简介
1、1、菌株GS115 表达不出蛋白,换KM71H2、温度:283、pH6.0,pH6.8BMMY 的pH7.0-7.5国内外做的最好的rHSA,最适pH5-6pH3yeastpeptone的,可以用磷酸和磷酸二氢钾调,具体比例自己去试试。4、偏爱密码子codonbias30KD 以上,构造简单如一些蛋白酶,二硫键含量多的蛋白往往不能有效表达,尤其是分泌 Pichia29KD2 选用酵母偏好密码子全基因合成后,表达量没有什么提高。5、表达时间与空质粒转化比照 大。最好做一个空质粒转化的比照,这样就会比较确定到底是不是自身的蛋白分泌的结果。6、污染每个样品从G418102mlBMGY30mlLB81
2、ml,1ml2mlBMMY3,4 层纱布足够了。6100ml10ml827、不表达蛋白有没有表达就要看你的运气了,一般重复23 次试验都没有表达菌株,这个蛋白就放弃表达了。8、表达量30KD,10mg/L 表达量已经很高,最直接的方法是发酵,一般提高510 倍。大肠杆菌一样消灭大团的超表达蛋白。9、糖基化NN X S/TX为任意氨基酸,113KDOO10、表型与表达SalIBglIIMutMutsMutsMutMuts达的更好,只有试试才知道你的蛋白用那种菌株表达较好。11、培育基 YPD:最根本的培育用;BMGY:诱导表达前培育用;BMMY:诱导表达用;MD:电转化后筛选his用。YEPD
3、是不能代替BMGY 的,由于有葡萄糖,这样残留的葡萄糖会影响下一步的诱导表达。不过有一种方法是可行的,就是用YPGYEPD3%的甘油代替,也可以降低本钱。摇瓶到底不能和发酵罐比,甘油剩余会抑制甲醇利用。BMGY、BMMYBMMY5%过滤除菌的甲100%甲醇至你要的浓度。YNB 可以高压灭菌,没问题的,也可以 0.22um 过滤处理,天冬氨酸和苏氨酸要待培育基高压灭菌后参加;配 YPD 时可以参加 YPD 一起灭菌,但时间不能太长,温度不能太高,一般121-12512-15YPDglucose使用了。或者含有葡萄糖和/或YNB10835min小量发酵其实可以把培育基成分中的YNB以直接灭菌,效果
4、也很好效果不比含YNB。 实行添料来维持酵母对培育基的养分需要。用无机盐进展大规模发酵,更省钱。大规模发酵时,甲醇的流加速度增加不要太快。另外使用纯氧并不昂贵,在武汉买个钢瓶60020100h34TryptonePeptone1用培育E.coliTryptonePeptone对有酵母菌些确定不行.例如做双杂交的AH109,Y187 2TryptonePeptoneTryptonePeptonetryptone 和peptonepeptoneYNB。假设要求不高,一般使用也还凑合尽可能的用Peptone,difco 公司的,晶美公司代理的,甚至是其它国产的蛋白胨都可以很正常的培育绝大多数酵母菌用
5、含 Peptone 的培育基颜色很深,纯化表达蛋白时颜色要去掉,所以还要进展麻烦的后续处理。而改用Tryptone 后,培育基颜色变得很浅,和LB液体颜色差不多,后续处理要简洁些。invitrogen 说明书说 peptone 的作用是防止目的蛋白被一些酶类水解,参加peptone 的目的就是竞争性抑制目的蛋白的水解,由于peptone 是一些小的短肽,是一些酶作用的底物。培育毕赤酵母,书上说BIOTIN储液是水溶液,但事实上BIOTIN500BIOTIN stock solution0.023、懒人是将Biotin 直接溶在去离子水中,放过夜,根本就能溶;0.02NNaOH,就很简洁溶解了;
6、、水浴加热,温度不能高于 50 度。D生物素是具有生物活性的生物素,也就是vitaminH。在毕赤酵母代谢过程中,作为多种酶的辅基起作用。自然培育基中一般可以不单独添加,由于YNB有肯定量的生物素,但是做高密度发酵还是必需要添加的。MD、MM 属于根底培育基,没有哪种成分会含有微量生长因子如生物素。所以确定要加的。附:无机培育基配方BSM85% H3PO426.7ml/LCaSO4 2H2O0.93g/LK2SO418.2g/LMgSO42H2O14.9g/LKOH4.13g/L甘油40g/LPMT14.0ml/L100pH5.0(150ml800ul10g/LpH5.0pH廉价,便利。诱导表
7、达前调pH6.0。pH5.0BSMpH6.0HSApH。BSM4.0ml/L 过滤除菌的PTM1(微量元素)4.0ml/L 。100500ml6ml PMT1,用于补加甲醇诱导表达目的融合蛋白。PMT11L配方:CuSO45H2O6.0g/LKI0.088g/LMnSO4H2O3.0g/LNa2MoO42H2O0.2g/LH3BO30.02g/LCoCl26H2O0.5g/LZnCl220.0g/LFeSO47H2O65.0g/LBiotin0.2g/LH2SO45.0ml12、蛋白降解分泌表达的目标蛋白比胞内蛋白确实简洁被降解。可以尝试以下几种方法:1、尽可能降低培育液的pHpH472、多试
8、几种蛋白添加剂,充当酶解底物比方酵母酸;3、摸索最适下罐摇瓶也一样,宁可少表达点也pcr固然不能影响表达和蛋白活性。Several strategies have been reported aseffective in minimizing the proteolytic instabilityofspecificforeignproteinssecretedintotheP.pastorisculturemedium. 1、The firstis adding to the culture medium of amino-acid rich supplement such aspepton
9、e or casamino acid, which reduce product degradation possibly byacting asexecess substrates for one or more problem proteases.、The second strategy to minimize proteolytic degradation is to optimize theculture pH between pH 3.0 and pH7.0.、Thethirdstrategyinvolveselevatingthelevelofammoniuminthecultur
10、ebroth adequately, which is explained by the hypothesis thatportease activity is inducedunder nitrogen starvation.The forth strategy is let the culture temperature 28 deg instead of 30 deg.切断,产生偏小的多肽。13、换液BMGYBMMYBMGY加甲醇诱导就行了。GS1154有时反而会使表达量提高,10ml250 三角瓶,装量25mlBMGY20.5mlBMMY25025ml)中诱导发酵.BMGY 和 BMM
11、Y 的换液方式有 2 种: 1一种是离心换液,即在生长培育完毕后,转移到灭菌大离心管中,4000rpm 室温离心 5分钟后,用 BMMY2一种4液,再参加诱导培育基,此种方法的缺点有少量生长培育基残留。从防治污染的角度来说,静止换液也好一些,由于操作到底少一些,速度也快。 固然,微量的如 200ul,还是用移液器加快而准确,可以在瓶口处往瓶内参加100甲醇接用灭菌TIP 吸取参加摇瓶就可以了。试验室里也有人试过用膜过滤,结果膜都溶解了。14、上罐表达放罐时OD400OD500300-400mg/L。30g/L 甘油初始培育OD40420g/L500。开头35hOD,一般是原来的90%左右,每次
12、都是这样,准确缘由我们也还不清楚,估量是酵母从高速 生长转向养分饥饿过程中,菌体形态发生很大变化,比方大小、含水量、折光率等。随酵母渐渐适应利用甲醇为碳源,mut型酵母的诱导可以将甲醇的流速逐步提高,此时仍旧能发 现OD40% 的7L10LOD 值约为最高OD80增加约 1/7。其实,这和毕赤酵母代谢甲醇途径也是全都的,甲醇首先被氧化成甲醛,一局部连续氧化成甲酸进而生成CO2,产生菌体所需的能量,另一局部可以被菌体同化,进入 小分子碳架的合成途径,供给菌体生长所需的碳源。15、菌体密度:菌体是在BMMY 中培育的,可以不用BMMY600nmOD 值,培育基和PBS都很低,PBS麦芽浸提液培育酵
13、母不换液,补料,生长阶段完毕后,密度可到达10-12,诱导培育完毕181 体积的BMGY,在生长阶段完毕后,换液时,参加1/101/2 体积的BMMY进展诱导培育即浓缩培育,细胞密度也可到达20通常,真正的高密度发酵只有在发酵罐里才能实现,OD60040-60瓶很难到达那样的密度,不过可以实行浓缩培育的方式实现高密度。摇瓶不能像发酵罐那样保证通气量,但可以通过装量降临时替代这个指标。17、菌种保存用 15%甘油做保护剂,-70 度长期保存,-20 度短期保存使用。不过要留意冻存前肯定充分混匀,酵母菌体很简洁沉降到EPOD2-6YPD300ul度保存长的话最好放度冰箱。重组菌株传代次数太多,确实
14、可能存在菌株退化的现象。这在用动物细胞表达系统如CHO, NS0 系统更为明显,所以肯定要保存好最原始的重组菌株,每次从中划板,挑单克隆表达,尽量削减菌株传代次数。不行的话再用一样的方法重转化筛选高表达菌株。GS115GS1155mlYPD,30,200rpmYPD,3048YNB 根本培育基和含His长而在根本培育基上不生长的单菌落划YPD,4GS115his4YPDYNB根本氮源,GS115YPD 上挑菌落,在YNB 和补充了HIS应的点一下,在HIS 上长而YNBGS115,这样能挑到纯的,以防突变。附:TCAELISA protocol;原位双膜法快速检测阳性表达株:TCATCA少有直
15、接考染能看得到条带的,1ml表达上清浓缩到20ul1mg/ml可以看到明显条带,但重复性不好。具体步骤:10000g5500-1000ulEP1/9100TCA100.54.15000g1020EP几下,除去剩余在管口的液体。5EP3710206.15000g102020ul简洁散开,降低蛋白回收率,一般最多几ulEP3752050ul Loadingbuffer,9510nim,一般沉淀会自动溶解,假设不溶,用20ul 枪头轻轻吸打,留意整个操作尽量不要遇到管壁,由于管壁可能沾有剩余TCALoadingbufferTCA一般不影响电泳。此方法连丙酮洗这一步都省了,而且不影响电泳效果。5652
16、00ulEPTCA。6.15000g1020EP口的液体。样品是酵母细胞超声后离心获得的上清,用Loadingbuffer 溶解蛋白沉淀,始终不能溶解,10TyptoneTCAPeptone很可能是TCAELISA protocol:BMMY12ELISA510ul BMMY0.05M NaHCO3100ulELISA,37大于 1 小时。留意肯定要做一个 GS115 空菌株表达上清作为阴性比照,最好还找一个带有histagTPBS3TPBS加封闭液TPBS1脱脂奶粉350ml/孔,室温下放置401TPBS3加封闭液稀释的histag100ul/孔,ELISA0.51TPBS3很多公司都有 h
17、istagQiagen 和 Pharmacia 单抗较好,Invitrogen 和Labvision1:10005000加封闭液稀释的HRP标记的羊抗鼠二抗100ulELISA板于室温振荡0.131:5001000HRPhistag抗体,不加二抗直接显色。参加OPD100ul/10301mg/mlOPD0.1M 柠檬酸钠,PH5.5,0.1%H2O2,20DAB7.1M H2SO4 100ul/孔终止反响,酶标仪测OD490nm。TCA 沉淀考染看不到条带,可以打算作ELISA,但可能上清里面杂蛋白太多,抗原目的蛋白不行能包被到板子上,所以几乎不行能检测到的。他们建议作点杂交PVDF 膜上,以后就依据westernblotELISA很不明显,一抗是自己制备的多抗,空白值在 0.2 左右,阴性比照(即空白宿主自身表达的上清)OD 值大约在 0.35-0.4 之间,目的蛋白测的值却在 0.6-0.65.可见效果还是比较明显的.由于是多抗阴性比照难免会对结果产生影响.没有单抗也只能这样了.原位双膜法快速检测阳性表达株:1 将醋酸纤维素薄膜置于MD/His -平板的His + 转化子菌落上,用涂布棒轻压使醋酸纤维素薄膜完全潮湿并赶尽气泡, 使全部菌落转移
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