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文档简介
1、补充资料一(Supplementarydata1)-SYN表征的齐聚物的生物信息学数据解析Ananalysisofbioinformaticsdatasetsrelatedto-SYNpositiveaggregatesi在-SYN进行纤维化齐聚过程中,病理性-SYN之间形成了完满的四级结构,即,-SYN纤维状齐聚物1在-SYN纤维状齐聚物,单个-SYN被称为基原纤维(proto-filament),它的五个-片层依次平行排列而且形成一个被称为-交织结构物(cross-structure)或-三明治(-sandwich)的结构域,组成-片层的每一个氨基酸残基将其侧链暴露于这个结构域的表面面2相
2、邻基原纤维像人左右手手指互补交织似地叉合interdigitate),而且形成了一个被称为“立体拉链”(stericzipper)的结构1,3在这个拉链样结构中,组成-片层的所有氨基酸残基将其侧链作为“拉链左右牙”,在相邻基原纤维交界面处形成了一个高度保守的共有基序(ahighlyconservedcommonmotif),这个共有基序的外形呈纤维状或梭形状,纤维轴向就是-SYN纤维状齐聚物的形成方向1,2一个-SYN纤维状齐聚物平时含有最少两个或几个基原纤维1依照基原纤维在形成-SYN四级结构过程中组合方式的微细差异,一些学者将-SYN纤维状齐聚物划分为直线带型straightribbon)
3、和麻花式带型(twistedribbon)2个种类2,4ii在-SYN进行非纤维化齐聚过程中,病理性-SYN之间没有形成完满的四级结构而不过经过共价、非共价结合随机性地聚拢;而且,非纤维化齐聚引诱的生理性-SYN甚至再生-SYN与病理性-SYN发生作用1因此,病理性-SYN、生理性-SYN和再生-SYN共同形成了-SYN寡聚物1,5显然,-SYN寡聚物的形状会陪同蛋白质齐聚时病理条件的不同样而有所差异在不同样本源的LBs中,-SYN寡聚物平时包括点状寡聚物(annularoligomersorannularprotofibrils)、球状寡聚物(spheroidicaloligomers)、链
4、状寡聚物(chainprotofibrils)、花环状寡聚物(wreath-likeoligomers)、原(或前)纤维状寡聚物(prefibrillaroligomersorprotofibrils)和纤维状寡聚物(fibrillaroligomers)等6个种类6-12而且,-SYN寡聚物在从任意形状结构向详尽形状结构转变过程中所表现的上述构象种类与-SYN的质和量存在必然的关系性13比方,比之于生理性-SYN在球状寡聚物中占有相对较高的数量而在原(或前)纤维状寡聚物中占有相对较低的数量,病理性-SYN在前者占有相对较低的数量而在后者占有相对较高的数量37参照文件BreydoL,WuJW,
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