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1、 生物化学习题解析一 名词解释、 蛋白质变性(denaturation)2、 Tm (熔点,熔解温度) 蛋白质受到某些理化因素的影响,其一级结构不变,但其空间结构发生改变,随之蛋白质的理化性质和生物学功能发生改变或丧失的现象叫变性作用。 1、蛋白质变性(denaturation) DNA 热变性中其双螺旋链50%被解开及紫外(260nm处)光吸收值达到最大值(完全变性)一半时的温度。2、 Tm (DNA熔解温度,熔点) 选择题、 有关著名科学家及重要的历史事件2009年全国硕士研究生统一考试生物化学试题 世界上首次人工合成具有生物活性酵母tRNAAla 的国家是: A 美国 B 中国 C 英国
2、 D 法国二 选择题2、 体现一定的知识扩展2009年全国硕士研究生统一考试生物化学试题 34、劳氏肉瘤病毒逆转录的产物是: A. DNA B. cDNA C. ccDNA D. Ts-DNA 还有cccDNA, ocDNA, Z-DNA, H-DNA等 (covalently closed circular DNA)2010年全国硕士研究生统一考试生物化学试题 生物体内氨基酸有D-型和L-型两种,其 中D-型氨基酸通常存在于 A. 胰岛素中 B. 抗菌肽中 C. 细胞色素C中 D. 血红蛋白中3 选择题的答案可能不是一个 ! 2 在蛋白质生物合成的下列步骤完成中,需要GTP参与的是 ( )
3、A:氨基酸的活化 B:氨酰-tRNA结合到核糖体的A位点上 C:起始复合物的形成 D:已合成的肽链从核糖体和tRNA上释放出来 不一定只有一种答案的选择 谷氨酸合酶属于第几大类酶?在氨同化成氨基酸的途径中 一种由Gln合成酶和Glu合酶协同催化途径 Gln合成酶(glutamine synthetase) Glu合酶(glutamate synthase) 后者又写成:GOGAT( glutamine-oxoglutarate amino transferase) ATP ADP+Pi Glu + NH3 Gln Gln 合成酶(GS) - (NADPH+H+) (NADP+) 2 Fdred
4、 2 Fdox Gln +-Ketog 2 Glu +) Glu 合酶(GOGAT)-Ketog+NH3+ATP+2 Fdred Glu+ADP+Pi+2Fdox+NADP+ 问: Glu 合酶(GOGAT)属于第几大类酶 ?同样不一定只有一种答案选择的柠檬酸合酶属于第几大类酶?三 问 答 题(一) 简答题: (-需要归纳总结) 37. 简述ATP在生物体内的主要作用。 (一) 简答题: (-需要归纳总结)39. 以丙二酸抑制琥珀酸脱氢酶为例,说明酶竞争性抑制作用的特点。39. (1) 竞争性抑制剂丙二酸的结构与底物琥珀酸结构相似。 (2) 丙二酸与底物琥珀酸竞争结合琥珀酸脱氢酶的活性中心。
5、(3) 丙二酸的抑制作用可以通过增加底物琥珀酸的浓度解除。 (4) 加入丙二酸后琥珀酸脱氢酶Km值增大,而Vmax不变。(一) 简答题: (需要一定的知识拓展)38. 简述蛋白质的一级结构及其与生物进化的 关系。38 (1) 蛋白质一级结构是指蛋白质多肽链中氨基酸残基的排列顺序及二硫键的位置。(2) 不同物种同源蛋白质一级结构存在差异,亲缘关系越远,其一级结构中氨基酸序列的差异越大;亲缘关系越近,其一级结构中氨基酸序列的差异越小。(3) 与功能密切相关的氨基酸残基是不变的,与生物进化相关的氨基酸残基是可变的。 需要对比分析题: 请说明RNA剪接与RNA编辑的异同。 剪接:指转录后精确切除内含子
6、序列,使外显子连接成为成熟的mRNA过程。 编辑:指转录后RNA编码区发生的碱基加入、缺失和转换等情况。相同点: 均是转录后的加工,基因调控的方式。不同点: 前者是切除RNA中内含子一段序列; 后者是发生在RNA的编码区,编辑后或者 对正常生物造成伤害,甚至死亡,但也增加 基因产物多样性,造成生物的进化。(二)综合论述题: (一章内容中的综合) 42. 试从遗传密码、tRNA结构和氨酰tRNA合成酶功能三个方面,阐述在蛋白质生物合成中,mRNA的遗传密码是如何准确翻译成多肽链中氨基酸排列顺序的。 mRNA上三个相邻的核苷酸组成密码子编码一种氨基酸。遗传密码具有简并性。(2) tRNA反密码子环
7、上具有的反密码子,可以按照碱基配对原则反向识别mRNA上的密码子。但这种识别具有“摆动性”。tRNA的结构影响其结合氨基酸的特异性。(3) 氨酰tRNA合成酶具有专一性识别氨基酸和能携带该氨基酸tRNA的功能。氨酰tRNA合成酶还具有二次校对功能。(二) 综合论述题: 41、论述生物氧化的特点。 生物氧化的定义 有机物(糖、脂、蛋白质等)在生物细胞里氧化分解为CO2和H2O,并释放出能量的过程叫生物氧化。与非生物氧化相比的共同点:1 化学反应本质相同,都是失电子反应;2 同种物质不论以何种方式氧化,所释放的能量相同。 与非生物氧化相比的不同点: 生物氧化是酶促反应,反应条件温和(如常温、中性p
8、H) ;而体外氧化(燃烧)通常是剧烈的反应,要求在高温、高压等条件下进行。 生物氧化分阶段逐步缓慢地氧化,能量也逐步释放;而体外燃烧能量是爆发式释放出来的。生物氧化释放的能量有相当多的转换成ATP中活跃的化学能,用于各种生命活动。生物氧化反应的表现形式:加氧 被氧化物质分子中加入氧 生物体内, 以上有些反应实质是通过加水后再脱氢实现的。2 脱氢 RCHO + O2 RCOOH HRCHO +H2 O R-C-OH RCOOH OH NAD+ NADH+H+ RCH2OH RCHO3 失电子 - e Fe2+ Fe3+生物氧化中 CO2 和 H2O 的生成1、CO2的生成 直接脱羧: 如丙酮酸脱
9、羧酶催化丙酮酸脱羧 变成乙醛的反应 氧化脱羧: 如丙酮酸脱氢酶复合物催化丙酮 酸脱氢脱羧变成乙酰CoA的反应直接脱羧:CH3CCOOHOCH3CHO + CO2丙酮酸脱羧酶(-脱羧)( -脱羧) PEP羧激酶氧化脱羧: 在氧化过程(脱氢)过程中伴随着脱羧 H2O的生成在糖酵解第九步PEP的生成过程中:(Phosphoenol pyruvic acid)Mg2+ 水三羧酸循环中-柠檬酸异构化成异柠檬酸三羧酸循环中:琥珀酰CoA生成琥珀酸GDP + Pi GTP2 H2O的生成 在生物体内,主要是通过以脱氢酶、电子传递体及氧化酶组成生物氧化体系来生成水的。MH2M递氢体递氢体H2 NAD+、NAD
10、P+、FMN、FAD、COQ还原型氧化型Cyt递电子体 b, c1, c, aa32H+2e O2O2-H2O脱氢酶氧化酶答案:(1)生物氧化包括线粒体氧化体系和非线粒 体氧化体系。真核细胞生物氧化主要是 线粒体氧化体系,原核细胞生物氧化主 要是在细胞膜上进行。(2)生物氧化是在活细胞的温和条件下进行(3)是一系列酶、辅酶和中间传递体参与的 多步骤反应。(4)能量逐步释放,ATP是能量转换的 载体。(5)真核细胞在有氧条件下条件下, CO2 由TCA循环中酶催化脱羧产生, H2O 主要是由代谢物脱下的氢经呼吸链传给氧形成的。2009年考研生物化学试题 请用中文或者符号写出糖原(或淀粉)、脂肪酸
11、和蛋白质多肽链生物合成中的单体活化反应式。 -(几章内容的综合)37 UDPG焦磷酸化酶(1)G1P + UTP + H2O UDPG+ PPi ADPG焦磷酸化酶 或 G1P + ATP + H2O ADPG+ PPi 37 (2)乙酰CoA+HCO3- +H+ATP 丙二酸单酰CoA+ADP+Pi 乙酰CoA羧化酶 37 (3) 氨基酸 + tRNA + ATP 氨酰-tRNA + AMP + PPi 氨酰-tRNA合成酶 三 一定难度题 一个八肽的氨基酸序列为: Gln-Trp-His-Ser-Ile-Arg-Pro-Gly, 请回答: 在pH7时该肽所带净电荷性质和数量及等电点(pI)
12、大小。 已知: -COOH R(His)-咪唑 - NH3+ R(Arg)-NH3+ pK 2.34 6.0 9.67 12.48 一个八肽的氨基酸序列为: Gln-Trp-His-Ser-Arg-Ile-Pro-Gly, 请回答: 在pH7时该肽所带净电荷性质和数量及等电点(pI)大小。 已知: -COOH R-咪唑 - NH3+ R(Arg)-NH3+ pK 2.34 6.0 9.67 12.48 pH7时 Gly His Glu Arg -1 0 +1 +1答案: 所带的净电荷为:+1 等电点(pI) = 11 .1 9.67+12.48 pI = = 11 .075 = 11.1 2但
13、请注意: 蛋白质分子中氨基酸残基侧链基团的解离情况往往与游离氨基酸中的解离情况还是不一样 ! 请看一个例子: 甘氨酸与丙酸羧基的pK 值相差很大,前者羧基的解离强度约是后者的300倍 !( pK =2.35) (pK =4.87) 原因: Gly中的氨基对附近羧基中质子存 在的斥力而形起的。 2008年硕士统考农学联考(生物化学)分析论述题41. 磷a酸二羟丙酮是如何联系糖代谢与脂肪代谢途径的?糖代谢与脂代谢间的联系:磷酸二羟丙酮-磷酸甘油乙酰辅酶A 脂肪酸NADPH + H+-合成脂肪所需的能量 乙醛酸循环糖的异生作用(1) 磷酸二羟丙酮是糖代谢的中间产物,-磷酸甘油是脂肪代谢的中间产物;
14、因此,磷酸二羟丙酮与-磷酸甘油之间的转化是联系糖代谢与脂代谢的关键反应。 (2) 磷酸二羟丙酮有氧氧化产生的乙酰CoA可作为脂肪酸从头合成的原料,同时磷酸二羟丙酮可转化形成-磷酸甘油,脂肪酸和-磷酸甘油是合成脂肪的原料。(3) 磷酸二羟丙酮经糖异生途径转化为 6-磷酸葡萄糖,再经磷酸戊糖途径产生NADPH,该物质是从头合成脂肪酸的还原剂。(4) 脂肪分解产生的甘油可转化为磷酸二羟丙酮。可进入糖异生途径产生葡萄糖,也可以进入三羧酸循环彻底氧化分解。选择题: 某抑制剂在其浓度等于Ki时,对酶的抑制程度为50%,则这种抑制作用的类型是 。 某抑制剂对酶的抑制程度为(E0-I0)/E0,则这种抑制作用
15、的类型是 。(一)可逆抑制作用2. 非竞争性抑制作用Linerweaver-Burk plot of noncompetitive inhibitionV =Vmax S(1+I/Ki) (Km + S)几种抑制类型的抑制分数: Vi i = 1- V0 如非竞争性抑制: Vmax S Vi (Km+S)(1+I/Ki) Ki V0 Vmax S Ki+I Km+S i = I / (Ki+I)四 计 算 题1 NADH+H+ 在线粒体内进行氧化反应,请: (1) 写出NADH+H+氧化磷酸化中的化学方程式。 (2)计算生物化学标准条件下1分子NADH+H+氧化成水所释放的自由能。 (3)如果
16、温度为25oC,测得呼吸活跃时的线粒体膜内外电势差 =0.18V,线粒体内膜内的pH为7.41,膜外pH为6.66,计算此时线粒体的质子动力。解答:(1) NADH+11H+内+0.5O2 (+2.5ADP+2.5Pi) NAD+ +H2O+10H+外 (+2.5ATP+2.5H2O) 因为 ENAD+/NADH+H+ = -0.320V, EO2/H2O = 0.816 所以,G= - nFE = -2 x 96.5 x 0.816-(-0.320) = - 220 (kJ/mol) 因为质子动力势(自由能)变化 G= 2.3 RT pH +F = 2.3x0.00831x298x(7.41
17、-6.66) + 96.5x0.18 = 4.27 + 17.37 =21.64 (kJ/mol) 商品NADH+H+二钠试剂的相对分子量为709.41,现测得 1/ml 该样液的光吸收值A340为0.875;还已知: NADH+H+的摩尔消光系数340 = 6220,比色杯径为1cm, 请问该试剂的纯度如何? (说明:NAD+在340nm处无光吸收) 解: 设该试剂的纯度为 X ( g/ g) 而1/ml 样液的摩尔浓度为: (1x10-3) x (X) / 709.41 = 1.409x10-7 X 根据Lambert-beer 定律:A= C L 得:0.870=6220 x(1x10-
18、6) x (x%)/ 709.41 x1 =6220 x1.409x10-7 X 所以, X = 0.9923 2009年全国硕士研究生入学统一考试 农学门类联考(生物化学)试题 七、实验题: 分离纯化某蛋白酶的主要步骤和结果如下表: 分离步骤 分离液体积 总蛋白含量 总活力 (ml) (mg) (IU)1 离心 1,400 10,000 100,0002 硫酸铵沉淀 280 3,000 96,0003 离子交换 90 400 80,0004 亲和层析 6 3 45,000 请计算 2 、3 和4 步的回收率和纯化倍数。(四) 实验题 2008年硕士统考农学联考(生物化学)题 40. 从动植物
19、细胞匀浆中提取基因组DNA时,常用EDTA、氯仿-异戊醇混合液和95%乙醇试剂。请根据蛋白质和核酸的理化性质回答:(1) 该实验中这些试剂各起什么作用?(2) 举出一种可以鉴定所提取基因组的DNA中是否残留有RNA的方法。(1)试剂的作用 EDTA可螯合金属离子,抑制DNA酶的活性。 氯仿-异戊醇混合液使蛋白质变性沉淀,并能去除脂类物质。 95%乙醇可使DNA沉淀。(2)鉴别方法 采用地衣酚试剂检测RNA分子中的核糖。如果反应液呈绿色,说明残留有RNA。 采用紫外吸收法检测A260/A280的比值。如果比值大于1.8,说明残留有RNA。 采用琼脂糖凝胶电泳法检测是否有小分子量的RNA条带存在。
20、2009年硕士统考农学联考(生物化学)题 40、酶纯化实验中,通常先用(NH4)2SO4作为分级沉淀剂,再用Sephadex G-25凝胶柱层析法从沉淀酶液中除去(NH4)2SO4。请问: (1)与其他中性盐沉淀剂相比,用(NH4)2SO4做沉淀剂有何优点 (2)如发现柱层析后酶的总活性较纯化前明显升高,可能的原因是什么? (3)柱层析时,湿法装柱的注意事项主要有哪些?选用(NH4)2SO4的理由(1)溶解度大,且对温度不敏感;(2)有稳定蛋白质结构的作用;(3)可用离心法得到蛋白质沉淀,因为: 饱和硫酸铵溶液密度为:1.235g/cm3 结合蛋白质密度为: 1.29 g/ cm3 3mol/
21、L磷酸钾密度为: 1.33 g/ cm3(4)有抑菌和抑制蛋白酶的作用;(5)分离、纯化蛋白质效果比较好(6)价格低,废液能够作肥料优点: 硫酸铵溶解度大, 温度系数小, 对酶活力影响小 有利于分离等优点。可能的原因: 纯化前酶液中可能含有酶的抑制剂操作凝胶溶涨凝胶脱气3 凝胶装柱 柱子下部出口处先要赶去气泡, 柱子要安装垂直, 凝胶倒入柱内最好一次完成 (不能够一次完成,怎么办?) 标准凝胶柱应该是:无气泡、无节痕、床面平整等 可用兰色葡聚糖进行检查。注意事项:1 层析柱应于水平面垂直2 柱床体积至少是上样体积的3倍以上3 层析介质中不能出现气泡和断层4 柱床表面要平整,并保持有一定的水位
22、最后预祝大家: 考试顺利! 读研成功! 简答题:38、在体外蛋白质合成体系中,一条有CAU重复序列的多聚核甘酸链,经翻译后发现其产物有三种,即多聚组氨酸,多聚异亮氨酸和多聚丝氨酸。如果组氨酸的密码子是CAU,异亮氨酸的密码子是AUC,那么丝氨酸的密码子是什么?为什么? CAUCAUCAUCAUCAUCAUCAUCAU (1) 丝氨酸的密码子是UCA (2) CAU 重复序列的多聚核苷酸链的阅读起点可以有3个,从而阅读密码子可能有3种,即CAU、AUC和UCA。 糖酵解的过程 第一阶段第四步:1,6-二磷酸果糖的裂解 1个己糖分裂成2个丙糖 丙酮糖和丙醛糖,它们为同分异构体。DHAPGAPGly
23、ceraldehyde-3-phosphate Dihydroxy acetone phosphate 糖酵解的过程 第二阶段第八步:3-磷酸甘油酸异构Mg2+3PGA2PGA 糖酵解的过程 第二阶段第九步:PEP的生成 这一步其实是分子内的氧化还原,使分子中的能量重新分布,使能量集中,第二次产生了高能磷酸键。2PGAPEP(Phosphoenol pyruvic acid)Mg2+ 糖酵解的过程 第二阶段第十步:丙酮酸的生成糖酵解途径过程中第二次产生了 ATP。 Mg2+ , K+PEPPyr (Pyruvic acid)(一)可逆抑制作用2. 非竞争性抑制作用Linerweaver-Bur
24、k plot of noncompetitive inhibitionV =Vmax S(1+I/Ki)(Km + S)几种抑制类型的抑制分数: Vi i = 1- V0 如非竞争性抑制: Vmax S Vi (Km+S)(1+I/Ki) Ki V0 Vmax S Ki+I Km+S i = I / (Ki+I)精氨琥珀酸 合成酶精氨琥珀酸 裂解酶胞液鸟氨酸氨甲酰 转移酶精氨酸酶(2ADP+Pi)NH3+CO2+2ATPGluATPAspAMP+PPiP线粒体鸟氨酸精氨酸瓜氨酸Gln尿素循环1. 丙酮酸羧化 回补反应的途径:丙酮酸羧化酶需要生物素作为其辅酶。这是动物中最重要的回补反应,在线粒体中进行。TCA的回补反应 脂肪酸从头合成的过程 丙二酸单酰CoA的形成1
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