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文档简介
第二篇
并行算法的设计第四章并行算法的设计基础第五章并行算法的一般设计方法第六章并行算法的基本设计技术第七章并行算法的一般设计过程第四章
并行算法的设计基础1.
并行算法的基础知识并行算法的定义和分类1.2.3.4.并行算法的表达并行算法的复杂性度量并行算法中的同步和通讯2.
并行计算模型国家高性能计算中心(合肥)2014/3/12并行算法的定义和分类并行算法的定义算法:略并行算法:一些可同时执行的诸进程的集合,这些进程互相作用和协调动作从而达到给定问题的求解。并行算法的分类数值计算和非数值计算同步算法和异步算法分布算法确定算法和随机算法第四章
并行算法的设计基础并行算法的基础知识并行算法的定义和分类并行算法的表达3.4.并行算法的复杂性度量并行算法中的同步和通讯2.
并行计算模型国家高性能计算中心(合肥)2014/3/12并行算法的表达描述语言可以使用类Algol、类Pascal等;在描述语言中引入并行语句。并行语句示例Par-do语句for
i=1
to
n
par-do……end
forfor
all语句for
all
Pi,
where0≤i≤k
do……end
for第四章
并行算法的设计基础并行算法的基础知识并行算法的定义和分类并行算法的表达并行算法的复杂性度量4.并行算法中的同步和通讯2.
并行计算模型并行算法的复杂性度量串行算法的复杂性度量情况下的复杂度(Worst-Case
Complexity)期望复杂度(Expected
Complexity)并行算法的几个复杂性度量指标运行时间t(n):包含计算时间和通讯时间,分别用计算时间步和选路时间步作单位。n为问题实例的输入规模。处理器数p(n)并行算法成本c(n):c(n)=t(n)p(n)情形下串行算法所需要的时间,则成本最优性:若c(n)等于在并行算法是成本最优的。总运算量W(n):并行算法求解问题时所完成的总的操作步数。2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)并行算法的复杂性度量Brent定理令W(n)是某并行算法A在运行时间T(n)内所执行的运算量,则A使用p台处理器可在t(n)=O(W(n)/p+T(n))时间内执行完毕。注:(1)揭示了并行算法工作量和运行时间的关系;(2)提供了并行算法的WT(Work-Time)表示方法;(3)告诉
:设计并行算法时应尽可能将每个时间步的工作量均匀地分摊给p台处理器,使各处理器处于活跃状态。2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)第四章
并行算法的设计基础并行算法的基础知识并行算法的定义和分类并行算法的表达并行算法的复杂性度量并行算法中的同步和通讯并行计算模型国家高性能计算中心(合肥)2014/3/12并行算法的同步同步概念同步是在时间上强使各执行进程在某一点必须互相等待;可用
、硬件和固件的办法来实现。同步语句示例算法4.1
共享
多处理器上求和算法输入:A=(a0,…,an-1),处理器数p输出:S=ΣaiBeginS=0for
all
Pi
where
0≤i≤p-1
do(2.3)
lock(S)S=S+L(2.4)unlock(S)end
forEnd(2.1)
L=0(2.2)
for
j=i
to
n
step
p
doL=L+ajend
for并行算法的通讯(1)通讯共享
多处理器使用:global
read(X,Y)和global
write(X,Y)分布
多计算机使用:send(X,i)和receive(Y,j)通讯语句示例算法4.2
分布
多计算机上矩阵向量乘算法输入:处理器数p,A划分为B=A[1..n,(i-1)r+1..ir],r=n/p,
i=1~px划分为w=w[(i-1)r+1..ir]输出:P1保存乘积AXBeginCompute
z=Bwif
i=1
then
yi=0
else
receive(y,left)
endify=y+zsend(y,right)if
i=1
then
receive(y,left)End2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)并行算法的通讯(2)计算过程图示2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)第四章
并行算法的设计基础并行算法的基础知识并行计算模型PRAM模型1.2.3.4.异步APRAM模型BSP模型logP模型PRAM模型基本概念由Fortune和Wyllie1978年提出,又称SIMD-SM模型。有一个集中的共享 器和一个指令控制器,通过SM的R/W交换数据,隐式同步计算。结构图Control
UnitInterconnection
NetworkPLMPLMPLMPLMShared
Memory2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)PRAM模型TEREW
TCREW
TCRCW分类PRAM-CRCW并发读并发写CPRAM-CRCW(Common
PRAM-CRCW):仅允许写入相同数据PPRAM-CRCW(Priority
PRAM-CRCW):仅允许优先级最高的处理器写入APRAM-CRCW(Arbitrary
PRAM-CRCW):允许任意处理器
写入PRAM-CREW并发读互斥写PRAM-EREW互斥读互斥写计算能力比较PRAM-CRCW是最强的计算模型,PRAM-EREW可logp倍模拟PRAM-CREW和PRAM-CRCWTEREW
TCREW
TCRCWTEREW
O(TCREW
log
p)
O(TCRCW
log
p)2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)PRAM模型优点适合并行算法表示和复杂性分析,易于使用,隐藏了并行机的通讯、同步等细节。缺点不适合MIMD并行机,忽略了SM的竞争、通讯延迟等因素2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)第四章
并行算法的设计基础并行算法的基础知识并行计算模型PRAM模型异步APRAM模型3.4.BSP模型logP模型异步APRAM模型基本概念又称分相(Phase)PRAM或MIMD-SM。每个处理器有其局部
器、局部时钟、局部程序;无全局时钟,各处理器异步执行;处理器通过SM进行通讯;处理器间依赖关系,需在并行程序中显式地加入同步路障。指令类型(1)全局读(3)局部操作(2)全局写(4)同步2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)异步APRAM模型计算过程由同步障分开的全局相组成2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)异步APRAM模型优缺点易编程和分析算法的复杂度,但与现实相差较远,其上并行算法非常有限,也不适合MIMD-DM模型。2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)计算时间设局部操作为单位时间;全局读/写平均时间为d,d随着处理器数目的增加而增加;同步路障时间为B=B(p)非降函数。满足关系2
d
B
p
B
B(;p)
O(d
log
p)
O(d
log
p
/
log
d或)令t
ph时间为为全局相内各处理器执行时间最长者,则APRAM上的计算T
tph
B
同步障次数第四章
并行算法的设计基础并行算法的基础知识并行计算模型PRAM模型异步APRAM模型BSP模型4.logP模型BSP模型基本概念由Valiant(1990),“块”同步模型,是一种异步MIMD-DM模型,支持消息传递系统,块内异步并行,块间显式同步。模型参数p:处理器数(带有器)l:同步障时间(Barrier
synchronization
time)g:带宽因子(time
steps/packet)=1/bandwidth2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)BSP模型计算过程由若干超级步组成,每个超级步计算模式为左图优缺点强调了计算和通讯的分离,提供了一个编程环境,易于程序复杂性分析。但需要显式同步机制,限制至多h条消息的传递等。各处理器2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)局部计算全局通信路障同步图4.3第四章
并行算法的设计基础并行算法的基础知识并行计算模型PRAM模型异步APRAM模型BSP模型logP模型logP模型基本概念由Culler(1993)年,是一种分布的、点到点通讯的多处理机模型,其中通讯由一组参数描述,实行隐式同步。模型参数L:network
latencyo:communication
overheadg:gap=1/bandwidthP:#processors注:L和g反映了通讯网络的容量2014/3/12国家高性能计算中心(合肥)logP模型优缺点捕捉了MPC的通讯瓶颈,隐藏了并行机的网络拓扑、路由、协议,可以应用到共享、消息传递、数据并行的编程模型中;但难以进
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