网上生物医学信息介绍课件

网上生物医学信息介绍北京万方数据股份有限公司2002年5月系列培训教程（二）张秀梅杨春红网上生物医学信息介绍北京万方数据股份有限公司11.网上生物医学文献类型文摘型数据库全文型数据库事实型数据库生物医学专业网站生物医学整合知识平台1.网上生物医学文献类型文摘型数据库22.文摘型生物医学数据库pubMed数据库TOXNET数据库EMBase荷兰医学文摘CBMdisc中国生物医学文献光盘数据库OCLCFirstSearch检索系统BA&BP美国生物学文摘CA化学文摘ISIChemistry2.文摘型生物医学数据库pubMed数据库3

Medline1996——今70多国家4500余种生物医学期刊43种语言90%英文78%有英文摘要数据周更新37万条/年

Premedline未标引记录Medline

PublisherSuppliedCitations出版商Pubmed

2.1PubMed数据库(1)

(/PubMed)免费Mesh标引美国NCBI(NationalCenterofBiologicalInformation)研制,截止2001年2月28日,已与1724种期刊连接.2.1PubMed数据库(1)

(htt42.1PubMed数据库(2)

能指引检索者使用《医学主题词表》中规范的术语进行有效检索。MeSH(MedicalSubjectHeadlings)由美国国立医学图书馆编制，是对生物医学文献进行主题分析、标引和检索时使用的权威性词表。它以标准的术语描述生物医学概念，共收录18000个主题词，通过注释，参照系统和树状结构，表达了MeSH词的历史演变，揭示了MeSH词间的语义关系，成为指引检索者使用规范化生物医学术语进行有效检索的工具。

MeSHBrowser:2.1PubMed数据库(2)MeSHBro52.2TOXNET数据库(1)

()毒理学数据库毒理学文献有毒化学制品释放系统化学信息（术语、标识与结构）11种事实型书目型DB美国国立图书馆创建2.2TOXNET数据库(1)

(http://w62.2TOXNET数据库(2)表格内容后续2.2TOXNET数据库(2)表格内容后续72.2TOXNET数据库(2)2.2TOXNET数据库(2)82.3荷兰医学文摘(1)

Embase是荷兰ElsevierScienceB.V.出版商建立的书目文献数据库.1974年——今800多万条445000条/年增70余个国家的4000多种期刊EMBase突出药物文献和药物信息>40%药物方面副主题词多药物信息字段多1EMBase(ExcerptaMedicaDatabase)2.3荷兰医学文摘(1)

1EMBase(Excerpt92.3荷兰医学文摘(2)

2EMBase与MEDLINE数据库比较

2.3荷兰医学文摘(2)

2EMBase与MED10

1980——今千种期刊、汇编、会议论文总1816623条20万条/年增涵盖《中文科技资料目录(医药卫生)》CMCC《中文生物医学期刊目次数据库》

CBMdisc的词表Mesh及《中医药学主题词表》中国分类法2.4中国生物医学文献光盘数据库

(CBMdisc)中国医学科学院医学信息研究所研制2.4中国生物医学文献光盘数据库

11

1967年创建ohio州1992年推出FirstSearch70多个数据库30多个可检全文7500种期刊的联机全文3000中期刊的电子版900多万篇全文2.5OCLCFirstSearch检索系统(CBMdisc)

图书馆联机计算机中心创建（OnlineComputerLibraryCenter）2.5OCLCFirstSearch检索系统(CBM121926年两刊合并——《生物学文摘》美生物学会联合会负责编辑

生物学文摘公司出版1964年BA的编辑出版机构为“生物科学情报”

（BioScienceInformatiomService）

简称BIOSIS

主任：维特BIOSISPrevies2.6

BA&BP（1）

BA—美国《生物学文摘》BiologocalAbstracts前身是—美国细菌协会编辑出版社的《细菌学文摘》—美国植物学会《植物学文摘》2.6BA&BP（1）

BA—美国《生物学132.6

BA&BP（2）包括—生物学文摘BiologicalAbstracts,BA

—BiologicalAbstracts/RRM(Reports,Review,Meetings)收录—5500种生命科学期刊及非期刊文献10000条/周更新

BP—BiosisPreview2.6BA&BP（2）包括—生物学文摘Bi14周刊，2卷/年，26期/卷150个国家14000种科技期刊1/4与生物医学相关26个国家2个国际组织的专利资料学位论文、会议文献、科技报告、存档资料、图书56种语言占世界化学化工文献总量的98%2.7化学文摘(ChemicalAbstract)

“开启化学文献宝库的钥匙”

1907年创刊，前身《美国化学研究评论》《美国化学会志》周刊，2卷/年，26期/卷2.7化学文摘(Chemical152.8ISIChemistry该库收集了公布在全球核心化学期刊和国际专利出版物上所有最新发现和改进的有机合成方法，提供翔实的化学反应综述和详尽的试验细节，以及新化合物的化学结构和相关性质(制备与合成方法、化学反应与生物活性)两个子库化学反应中心(ReactionCenter)1840年—今60多种化学反应2万多个专利反映42000个/年增化合物中心(CompoundCenter)1960年—今530万种有机化合物20万种/年增2.8ISIChemistry该库收集了公布在全163.全文型数据库PML数据库OVID数据库SDOS全文检索系统EBSCO数据库中国期刊网3.全文型数据库PML数据库173.1网上获取医学文献全文的途径访问免费电子期刊网站

http://www.health.library.mcgill.ca/ejournal/fulltext.htm/

/lists/freeart.dt通过作者的E—mail直接索取一些二次文献数据库提供原文连接服务(Pubmed)查全文数据库机构代查3.1网上获取医学文献全文的途径访问免费电子期刊网站18该公司1938年创建宗旨:为图书馆、政府、院校师生提供高质量信息业务范围:连续出版物、新闻报纸、图书、学位论文、学术性收藏品文献量:55亿条PML—光盘版—网络版3.2ProQuestMedicalLibrary数据库PML由Bell&HowellInformationandLearning(原UMI公司)出版该公司1938年创建3.2ProQuestMedic19从MEDLINE起家,目前包括人文、社会、科技近百DB一半为生物医学OvidWebGateway—数据库检索—400中期刊全文—100种电子期刊，回溯至1993年—HTML，实现Medline、生物医学全文期刊和循证医学DB之间的互链

3.3OVID数据库OVIDTechnologies.Inc由MarkNelson1984年创立从MEDLINE起家,目前包括人文、社会、科技近百DB3.320

SDOS原名为EES(ElsevierElectronicSubscriptions)SDOS系统提供1200多种电子期刊(包括PergamonNorth—Holland出版物)的订阅服务1200种电子期刊分为12类与生物医学相关的为—AgriculturalandBiologicalSciences—ClinicalMedicine—LifeScience3.4ElsevierScience公司

SDOS全文检索系统ElsevierScience是荷兰一家著名的出版公司ScienceDirectOnsite(SDOS)是该公司开发的系统,提供用户在本地访问其基于Web的全文电子期刊3.4ElsevierScience公司

21EBSCOPublishing—50多个电子文献数据库—近3000种期刊全文+文摘索引期刊4000种学术期刊全文数据库(AcademicSearchFullteztElite,ASFE)1530种期刊全文+近2700种期刊索引和文摘其中SCI收录的核心刊993种(含全文350种)生物医学期刊554种检索系统EBSCOhost3.5EBSCO数据库EBSCO公司是世界上最大的提供文献服务的专业公司之一EBSCOPublishing—50多个电子文献数据库3.22国内核心期刊1994年—今全文400多万篇专业特色期刊题录1000万余条网上数据日更新理工(3)、农业、医药卫生、文史哲、经济政治与法律、教育与社科、电子技术与信息科学9个专辑、126个数据库，其中医药卫生747种题录数据库摘要数据库全文数据库专题数据库3.6中国期刊网清华同方光盘股份有限公司光盘国家研究中心共同创建中国学术期刊(光盘版)电子杂志社1999年6月起上网5300种国内核心期刊1994年—今全文234.事实型数据库分子生物数据库药物三维结构数据库医学图谱病理切片库专利信息资源4.事实型数据库分子生物数据库244.1分子生物数据库基因序列数据库NCBI的GenBank蛋白序列数据库(Pro.aa.)日内瓦大学Swiss—Prot(6万余种Pro.2200个aa.)结构数据库:小分子结构数据库(CambridgeStructuralDB)大分子结构数据库(ProteinDataBank,PDB)分子疾病数据库OMIM

(OnlineMendelianInheritanceinMan)生物信息学算法基于Web的信息储存、查找与检索如：NCBI建立的Entrez系统欧洲分子生物实验室SRS系统分子可视化4.1分子生物数据库基因序列数据库NCBI的GenBan25PubMed—生物医学文献Neccleotide—核苷酸序列数据库Protein—蛋白质序列数据库Structure—大分子三维结构Genome—完整的基因组汇编Popset—以DNA和Pro.分析生物间的进化关系Taxonomy—分类学数据库OMIM—孟德尔人类遗传学数据库Books—生物医学网络版书Probeset—基因表达选集3DDomain—特定功能域三维结构4.2Entrez系统包含4.2Entrez系统包含264.3药物三维结构数据库美国国立癌症研究所药物信息系统三维数据库(NCIDrugInformationSystem3DDatabase)40多万种药物三维结构美国国立癌症研究所—三维数据库(NCI—3D)126554个化合物的三维结构信息艾滋病药物结构/aidsdrg4.htm/三维药物结构数据库(日本)具有药物活性的化学物质三维结构DB4.3药物三维结构数据库美国国立癌症研究所药物信息系统三维274.4医学图谱可视人计划(TheVisibleHumanProject)/research/visible/1986年NLM发起男女尸体详尽三维精细解剖图CT、MRI、冷冻切片三种技术目标：创造一个知识结构体系，可以方便地实现将可视的图像知识与文本知识链接成一个整体全脑图谱(theWholeBrainAtlas)哈佛医学院KeithA.Johnson麻省理工J.AlexBecker将人脑正常和病理结构图像与临床医学信息整合合作开发4.4医学图谱可视人计划(TheVisibleHuma281900多幅病理切片/WebPath/WebPath.hlm/4.5病理切片库WebPath美Utah大学医学院病理科EdwardC.Klatt博士创建4.5病理切片库WebPath美Uta295.生物医学专业网站介绍(1)美国国立卫生研究院(NationalInstitutesofHealth,NIH)

健康信息(出版物、数据库)科研基金申请情况美国国立医学图书馆(NationalLibraryofMedicine,NLM)

健康信息图书馆服务HealthAtoZ专业搜索引擎

美国医学会网站(AmericanMedicalAssociation)http://www.ama—5.生物医学专业网站介绍(1)美国国立卫生研究院(N305.生物医学专业网站介绍(2)HealthAtoZ搜索引擎

美国国立癌症研究所(NationalCancerInstitute,NCI)

美国疾病预防与控制中心(CentersforDiseaseControlandPrevention,CDC)

世界卫生组织(WorldHealthOrganization,WHO)

DrugInfoNethttp://www.drugInfoN5.生物医学专业网站介绍(2)HealthAto31FirstDataDrugDatabase

/misc/formdrugs.htm/美国食品药物管理局(FoodandDrugAdministration,FDA)

中国医药信息网国家药品监督管理局

中国中医药信息网

国家中医药管理局中医药文献检索中心5.生物医学专业网站介绍(3)FirstDataDrugDatabase5.326.生物医学整合知识平台(1)

ISIWebOFScienceISI(InstituteforScientificInformation)WebofKnowledge是一个基于Web整合ISIWebofScience,ISICurrentContentsConnect和其他重要信息资源的新一代信息体系以ISIWebofScience(ISI著名的三大引文索引ScienceCitationIndexExpanded,SocialScienceCitationIndex,Arts&HumanitiesCitationIndez)为核心交叉检索、整合学术期刊、技术专利、会议录、化学反应、研究基金、Internet资源

6.生物医学整合知识平台(1)

336.生物医学整合知识平台(2)

ISIWebOFScience6.生物医学整合知识平台(2)

34网上生物医学信息介绍北京万方数据股份有限公司2002年5月系列培训教程（二）张秀梅杨春红网上生物医学信息介绍北京万方数据股份有限公司351.网上生物医学文献类型文摘型数据库全文型数据库事实型数据库生物医学专业网站生物医学整合知识平台1.网上生物医学文献类型文摘型数据库362.文摘型生物医学数据库pubMed数据库TOXNET数据库EMBase荷兰医学文摘CBMdisc中国生物医学文献光盘数据库OCLCFirstSearch检索系统BA&BP美国生物学文摘CA化学文摘ISIChemistry2.文摘型生物医学数据库pubMed数据库37

Medline1996——今70多国家4500余种生物医学期刊43种语言90%英文78%有英文摘要数据周更新37万条/年

Premedline未标引记录Medline

PublisherSuppliedCitations出版商Pubmed

2.1PubMed数据库(1)

(/PubMed)免费Mesh标引美国NCBI(NationalCenterofBiologicalInformation)研制,截止2001年2月28日,已与1724种期刊连接.2.1PubMed数据库(1)

(htt382.1PubMed数据库(2)

能指引检索者使用《医学主题词表》中规范的术语进行有效检索。MeSH(MedicalSubjectHeadlings)由美国国立医学图书馆编制，是对生物医学文献进行主题分析、标引和检索时使用的权威性词表。它以标准的术语描述生物医学概念，共收录18000个主题词，通过注释，参照系统和树状结构，表达了MeSH词的历史演变，揭示了MeSH词间的语义关系，成为指引检索者使用规范化生物医学术语进行有效检索的工具。

MeSHBrowser:2.1PubMed数据库(2)MeSHBro392.2TOXNET数据库(1)

()毒理学数据库毒理学文献有毒化学制品释放系统化学信息（术语、标识与结构）11种事实型书目型DB美国国立图书馆创建2.2TOXNET数据库(1)

(http://w402.2TOXNET数据库(2)表格内容后续2.2TOXNET数据库(2)表格内容后续412.2TOXNET数据库(2)2.2TOXNET数据库(2)422.3荷兰医学文摘(1)

Embase是荷兰ElsevierScienceB.V.出版商建立的书目文献数据库.1974年——今800多万条445000条/年增70余个国家的4000多种期刊EMBase突出药物文献和药物信息>40%药物方面副主题词多药物信息字段多1EMBase(ExcerptaMedicaDatabase)2.3荷兰医学文摘(1)

1EMBase(Excerpt432.3荷兰医学文摘(2)

2EMBase与MEDLINE数据库比较

2.3荷兰医学文摘(2)

2EMBase与MED44

1980——今千种期刊、汇编、会议论文总1816623条20万条/年增涵盖《中文科技资料目录(医药卫生)》CMCC《中文生物医学期刊目次数据库》

CBMdisc的词表Mesh及《中医药学主题词表》中国分类法2.4中国生物医学文献光盘数据库

(CBMdisc)中国医学科学院医学信息研究所研制2.4中国生物医学文献光盘数据库

45

1967年创建ohio州1992年推出FirstSearch70多个数据库30多个可检全文7500种期刊的联机全文3000中期刊的电子版900多万篇全文2.5OCLCFirstSearch检索系统(CBMdisc)

图书馆联机计算机中心创建（OnlineComputerLibraryCenter）2.5OCLCFirstSearch检索系统(CBM461926年两刊合并——《生物学文摘》美生物学会联合会负责编辑

生物学文摘公司出版1964年BA的编辑出版机构为“生物科学情报”

（BioScienceInformatiomService）

简称BIOSIS

主任：维特BIOSISPrevies2.6

BA&BP（1）

BA—美国《生物学文摘》BiologocalAbstracts前身是—美国细菌协会编辑出版社的《细菌学文摘》—美国植物学会《植物学文摘》2.6BA&BP（1）

BA—美国《生物学472.6

BA&BP（2）包括—生物学文摘BiologicalAbstracts,BA

—BiologicalAbstracts/RRM(Reports,Review,Meetings)收录—5500种生命科学期刊及非期刊文献10000条/周更新

BP—BiosisPreview2.6BA&BP（2）包括—生物学文摘Bi48周刊，2卷/年，26期/卷150个国家14000种科技期刊1/4与生物医学相关26个国家2个国际组织的专利资料学位论文、会议文献、科技报告、存档资料、图书56种语言占世界化学化工文献总量的98%2.7化学文摘(ChemicalAbstract)

“开启化学文献宝库的钥匙”

1907年创刊，前身《美国化学研究评论》《美国化学会志》周刊，2卷/年，26期/卷2.7化学文摘(Chemical492.8ISIChemistry该库收集了公布在全球核心化学期刊和国际专利出版物上所有最新发现和改进的有机合成方法，提供翔实的化学反应综述和详尽的试验细节，以及新化合物的化学结构和相关性质(制备与合成方法、化学反应与生物活性)两个子库化学反应中心(ReactionCenter)1840年—今60多种化学反应2万多个专利反映42000个/年增化合物中心(CompoundCenter)1960年—今530万种有机化合物20万种/年增2.8ISIChemistry该库收集了公布在全503.全文型数据库PML数据库OVID数据库SDOS全文检索系统EBSCO数据库中国期刊网3.全文型数据库PML数据库513.1网上获取医学文献全文的途径访问免费电子期刊网站

http://www.health.library.mcgill.ca/ejournal/fulltext.htm/

/lists/freeart.dt通过作者的E—mail直接索取一些二次文献数据库提供原文连接服务(Pubmed)查全文数据库机构代查3.1网上获取医学文献全文的途径访问免费电子期刊网站52该公司1938年创建宗旨:为图书馆、政府、院校师生提供高质量信息业务范围:连续出版物、新闻报纸、图书、学位论文、学术性收藏品文献量:55亿条PML—光盘版—网络版3.2ProQuestMedicalLibrary数据库PML由Bell&HowellInformationandLearning(原UMI公司)出版该公司1938年创建3.2ProQuestMedic53从MEDLINE起家,目前包括人文、社会、科技近百DB一半为生物医学OvidWebGateway—数据库检索—400中期刊全文—100种电子期刊，回溯至1993年—HTML，实现Medline、生物医学全文期刊和循证医学DB之间的互链

3.3OVID数据库OVIDTechnologies.Inc由MarkNelson1984年创立从MEDLINE起家,目前包括人文、社会、科技近百DB3.354

SDOS原名为EES(ElsevierElectronicSubscriptions)SDOS系统提供1200多种电子期刊(包括PergamonNorth—Holland出版物)的订阅服务1200种电子期刊分为12类与生物医学相关的为—AgriculturalandBiologicalSciences—ClinicalMedicine—LifeScience3.4ElsevierScience公司

SDOS全文检索系统ElsevierScience是荷兰一家著名的出版公司ScienceDirectOnsite(SDOS)是该公司开发的系统,提供用户在本地访问其基于Web的全文电子期刊3.4ElsevierScience公司

55EBSCOPublishing—50多个电子文献数据库—近3000种期刊全文+文摘索引期刊4000种学术期刊全文数据库(AcademicSearchFullteztElite,ASFE)1530种期刊全文+近2700种期刊索引和文摘其中SCI收录的核心刊993种(含全文350种)生物医学期刊554种检索系统EBSCOhost3.5EBSCO数据库EBSCO公司是世界上最大的提供文献服务的专业公司之一EBSCOPublishing—50多个电子文献数据库3.56国内核心期刊1994年—今全文400多万篇专业特色期刊题录1000万余条网上数据日更新理工(3)、农业、医药卫生、文史哲、经济政治与法律、教育与社科、电子技术与信息科学9个专辑、126个数据库，其中医药卫生747种题录数据库摘要数据库全文数据库专题数据库3.6中国期刊网清华同方光盘股份有限公司光盘国家研究中心共同创建中国学术期刊(光盘版)电子杂志社1999年6月起上网5300种国内核心期刊1994年—今全文574.事实型数据库分子生物数据库药物三维结构数据库医学图谱病理切片库专利信息资源4.事实型数据库分子生物数据库584.1分子生物数据库基因序列数据库NCBI的GenBank蛋白序列数据库(Pro.aa.)日内瓦大学Swiss—Prot(6万余种Pro.2200个aa.)结构数据库:小分子结构数据库(CambridgeStructuralDB)大分子结构数据库(ProteinDataBank,PDB)分子疾病数据库OMIM

(OnlineMendelianInheritanceinMan)生物信息学算法基于Web的信息储存、查找与检索如：NCBI建立的Entrez系统欧洲分子生物实验室SRS系统分子可视化4.1分子生物数据库基因序列数据库NCBI的GenBan59PubMed—生物医学文献Neccleotide—核苷酸序列数据库Protein—蛋白质序列数据库Structure—大分子三维结构Genome—完整的基因组汇编Popset—以DNA和Pro.分析生物间的进化关系Taxonomy—分类学数据库OMIM—孟德尔人类遗传学数据库Books—生物医学网络版书Probeset—基因表达选集3DDomain—特定功能域三维结构4.2Entrez系统包含4.2Entrez系统包含604.3药物三维结构数据库美国国立癌症研究所药物信息系统三维数据库(NCIDrugInformationSystem3DDatabase)40多万种药物三维结构美国国立癌症研究所—三维数据库(NCI—3D)126554个化合物的三维结构信息艾滋病药物结构/aidsdrg4.htm/三维药物结构数据库(日本)具有药物活性的化学物质三维结构DB4.3药物三维结构数据库美国国立癌症研究所药物信息系统三维614.4医学图谱可视人计划(TheVisibleHumanProject)/research/visible/1986年NLM发起男女尸体详尽三维精细解剖图CT、MRI、冷冻切片三种技术目标：创造一个知识结构体系，可以方便地实现将可视的图像知识与文本知识链接成一个整体全脑图谱(theWholeBrainAtlas)哈佛医学院