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文档简介
分子生物学实验技术基因操作工具酶详解演示文稿当前1页,总共47页。优选分子生物学实验技术基因操作工具酶当前2页,总共47页。酶酶限制性核酸内切酶逆转录酶DNA连接酶末端转移酶大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ
S1核酸酶Klenow酶DNA酶Ⅰ
TaqDNA聚合酶RNA酶A多核苷酸激酶碱性磷酸酶基因工程操作中最常用的工具酶当前3页,总共47页。主要内容1限制性核酸内切酶2DNA连接酶3DNA聚合酶4修
饰
酶5小结当前4页,总共47页。酶主要用途限制性核酸内切酶识别DNA特定序列,切割DNA分子DNA连接酶连接两个DNA分子或片段大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ或Klenow酶1制作DNA探针;2合成cDNA第二链;3填补双链DNA3`凹端;4DNA测序。TaqDNA聚合酶聚合酶链式反应(PCR)多核苷酸激酶多核苷酸5`-OH磷酸化,制末端标记探针末端转移酶使3`-末端加同聚物尾S1核酸酶降解单链DNA或RNADNA酶Ⅰ在双链DNA上产生随机切口RNA酶A降解RNA逆转录酶补平反应,合成cDNA或制探针碱性磷酸酶切除核酸末端磷酸基SUMMARYHome当前5页,总共47页。1限制性核酸内切酶1.1引言1.2命名1.3分类1.4活性及影响因素Home当前6页,总共47页。核酸酶(Nuclease):通过切割相邻两个核苷酸残基间磷酸二酯键,导致核酸分子多核苷酸链水解断裂的蛋白酶。(1)按作用对象分:DNAase&RNAase(2)按断裂核酸分子不同方式分:
Endonuclease&Exonuclease1.1引言—两个概念当前7页,总共47页。限制性内切核酸酶(restrictionendonuclease):
指一类能识别双链DNA分子中特定核苷酸序列,并在识别序列内或附近特异切割双链DNA的核酸内切酶。限制酶与甲基化酶共同构成细菌的限制-修饰系统(Restriction-ModificationSystem)。Back当前8页,总共47页。1.2命名命名原则:第一个字母(大写,斜体):该酶来源的微生物属名;第二、三个字母(小写、斜体):微生物种名;若该微生物有不同的变种和品系,再加上该变种和品系的第一个字母(大写)若从同一微生物发现多种限制性内切酶,则依照发现和分离的先后顺序用罗马字母表示。例如:EcoRⅠ从大肠杆菌R株分离的第一种限制酶命名为EcoRⅠ,其中E代表属名(Escherichia),co代表种名(coli),R代表株系(RY13),Ⅰ代表该菌株中首次分离到。Back当前9页,总共47页。1.3分类1.3.1Ⅰ型限制性内切酶
Ⅱ型限制性内切酶1.3.3Ⅲ
型限制性内切酶Back当前10页,总共47页。1.3.1Ⅰ型限制性内切酶功能:限制、修饰特点:需Mg2+、ATP和S-腺苷蛋氨酸为辅助因子;识别位点和切割位点不一致,无固定切割位点;应用:不常用。Back当前11页,总共47页。1.3.2Ⅲ型限制性内切酶功能:限制、修饰特点:需Mg2+、ATP和S-腺苷蛋氨酸为辅助因子;特异切割,切割位点在距识别位点3`端24-26bp处。应用:数量很少,无实际作用。Back当前12页,总共47页。1.3.3Ⅱ型限制性内切酶功能:识别并特异切割DNA分子。
即通常所指DNA限制性核酸内切酶;反应特点:仅需Mg2+作催化反应辅助因子,能识别双链DNA特殊序列,并可特异切割DNA,产生特异片段;应用:种类繁多,分子克隆中最为常用当前13页,总共47页。(1)基本特性识别长度为4-8个核苷酸的特异序列;许多识别序列具回文结构,如HindⅢ的识别序列:5`AAGCTT3`3`TTCGAA5切割产生末端有粘端(cohesive/stickyend)如BamHI(G↓GATCC)和平端(bluntend)如SmaI(CCC↓GGG)当前14页,总共47页。EnzymeRecognitionseuqenceEnzymeRecognitionseuqenceBamHIG↓GATCCPstICTGCA↓GBglIIA↓GATCTSalIG↓TCGACEcoRIG↓AATTCSau3AI↓GATCHindIIGTPy↓PuACSfiIGGCCNNNN↓NGGCCHindIIIA↓AGCTTSmaICCC↓GGGKpnIGGTAC↓CXbaIT↓CTAGANotIGC↓GGCCGCXhoIC↓TCGAGRecognitionSequencesandCuttingsitesofRestrictionEndonucleases当前15页,总共47页。(2)同功异源酶(isoschizomer)
来源不同但能识别和切割同一位点的酶。又称同裂酶。如:BamHI(G↓GATCC)和BstI
(G↓GATCC)注:有一些同功异源酶对于切割位点上的甲基化碱基的敏感度有所不同。当前16页,总共47页。(3)同尾酶(isocaudamer)
识别序列不同,但产生相同粘性末端的限制酶。如:BamHI:G↓GATCC
BglII:A↓GATCTBack当前17页,总共47页。1.4
活性及影响因素(1)活性大小:酶对DNA水解程度不同。(2)酶的活性单位:
指1μg纯的指定DNA在指定缓冲液中,于37℃(最适温度更准确)酶解1h完全酶解DNA中所有同一限制性内切酶位点所需的酶量。当前18页,总共47页。(3)影响因素①DNA模板的纯度②DNA的甲基化程度③酶切反应温度④DNA的分子结构⑤缓冲液Back当前19页,总共47页。2DNA连接酶2.1定义及功能2.2种类及作用机理2.3使用时的注意事项Home当前20页,总共47页。2.1定义及功能DNA连接酶(DNAligase):可使一段DNA3`-OH末端和5`-P末端形成3`,5`-磷酸二酯键,把两DNA片段连在一起封闭双链上形成的切口的酶。当前21页,总共47页。OHP5`3`3`5`5`3`3`5`DNAligaseDNAligase连接缺刻(nick)Back当前22页,总共47页。两类:
◆T4DNA连接酶(ATP提供能量)
◆大肠杆菌DNA连接酶(NAD+提供能量)2.2种类及作用机理当前23页,总共47页。T4DNAligase的作用机理Back当前24页,总共47页。1)不能催化两单链DNA分子连接;2)只能连双链DNA分子的单链缺刻(nick);不能连接双链中一个或多个核苷酸缺失所致缺口(gap)。2.3使用时的注意事项当前25页,总共47页。DNAligase的活性Back当前26页,总共47页。3DNA聚合酶(DNApolymerase)3.1DNA聚合酶I3.2Klenow聚合酶3.3TaqDNA聚合酶3.4逆转录酶3.5T4DNA聚合酶3.6T7DNA聚合酶Home当前27页,总共47页。3.1DNA聚合酶Ⅰ活性:5`→3`聚合活性,5`→3`外切和3`→5`外切活性。发挥生物学活性的条件:(1)DNA模板(可以是单链或双链)(2)带有3`-端游离羟基的引物链(3)底物和激活剂注:对双链DNA,当有dNTP存在时,3`→5`降解活性会被5`→3`方向的聚合活性所抑制。应用:缺口平移法制备DNA分子杂交探针当前28页,总共47页。缺口DNaseIDNA聚合酶IDNA聚合酶IdNTP*缺口缺口平移法制备DNA分子探针Back当前29页,总共47页。活性:
5`→3`聚合活性,3`→5`外切酶活性,无5`→3`外切酶活性。用途:(1)填补或标记DNA的3`隐蔽末端;(2)催化合成cDNA第二链;(3)DNA序列测定3.2Klenow聚合酶当前30页,总共47页。EcoRI酶切末端同位素标记的EcoRI酶切末端α-32P-dATPBack当前31页,总共47页。显著特点:热稳定性。70℃反应2h残留活性90%;93℃反应2h残留活性60%;94℃反应2h残留活性40%。应用:(1)对DNA的特定片段进行体外扩增;(2)DNA序列测定。3.3TaqDNA聚合酶Back当前32页,总共47页。逆转录酶(reversetranscriptase):又称RNA指导下的DNA聚合酶。活性:
5`→3`聚合酶活性和RNaseH活性。聚合作用所需模板可以是RNA或DNA,引物是带3`-OH的RNA或DNA。3.4逆转录酶当前33页,总共47页。逆转录酶的活性当前34页,总共47页。用途:(1)在体外以mRNA为模板合成cDNA;(2)对有5`突出末端的DNA片段作末端标记(补平);(3)双脱氧法测序;(4)以DNA或RNA为模板合成核酸探针。Back当前35页,总共47页。活性:
5`→3`聚合酶活性和3`→5`外切酶活性,且3`→5`外切酶活性对单链DNA的作用比对双链DNA强。
高浓度dNTP环竟下前者活性更强。应用:标记DNA平末端或隐蔽3`末端3.5T4DNA聚合酶Back当前36页,总共47页。活性:5`→3`聚合酶活性;有单链及双链的3`→5`外切酶活性,但无5`→3`外切酶活性;特点:极佳的连续合成能力应用:(1)用于长模板DNA的引物延伸反应;(2)通过单纯延伸或取代合成途径标记DNA3`末端;(3)使双链DNA5`或3`突出末端变平末端。3.6T7DNA聚合酶Back当前37页,总共47页。4修饰酶4.1碱性磷酸酶4.2末端转移酶4.3T4多核苷酸激酶4.4S1核酸酶
Home当前38页,总共47页。4.1碱性磷酸酶功能:催化核酸脱5`-磷酸基团,使DNA或RNA片段5`-P末端转换成5`-OH末端。来源:大肠杆菌:bacterialalkalinephosphatase(BAP);小牛肠道:calfintestinalalkalinephosphatase
(CIP)。当前39页,总共47页。碱性磷酸酶的活性当前40页,总共47页。注意:CIP的比活性比BAP高出10-20倍,且CIP在SDS中68℃就可完全失活,而BAP却是热抗性酶。Back当前41页,总共47页。来源:前淋巴细胞和分化早期的类淋巴细胞。功能:催化DNA进行5`→3`方向的聚合作用,逐个将dNTP分子加到线性DNA分子3`-OH端。4.2末端转移酶(terminaltransferase)当前42页,总共47页。末端转移酶的催化作用当前43页,总共47页
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