PubMed培训教程概述

PubMed一、PubMed简介二、认识PubMed文献三、PubMed检索特点（重点）四、PubMed检索功能（重点）五、PubMed特征栏功能介绍（重点）六、PubMed检索结果的处理七、PubMed主题词检索八、MyNCBI个性化服务一、PubMed简介

PubMed概况网址：(com;org;net)由美国国立医学图书馆（NationalLibraryofMedicine-

NLM）国家生物技术信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation-NCBI）向因特网用户提供免费MEDLINE检索服务（自1997年6月26日起）收录80多个国家5000多种生物医学期刊的题录与文摘，是世界上最权威的医学数据库。现有1948年以来的1900多万篇文献的记录(其中MEDLINE记录1760多万条)最近3年每年增加70多万条文献记录在全部记录中有78%的文献为英文；在2000年以来的记录中90%的文献为英文；收录中文刊60余种（我校学报被收录）。

PubMed概况PubMed的外部链接功能

提供NCBI开发的分子生物学数据库的链接，如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等。提供美国国立医学图书馆多种资源的链接提供其他外部资源的链接，如生物医学期刊网站全文链接、NCBI资源。外部链接二、认识PubMed文献

PubMed题录作者AU题名TI来源（出处）SOPubMed文献记录的类型（状态）

PubMed题录

PubMed记录类型（状态）PubMed除了1966年以前的OldMedline，其余文献记录按处理过程分4种类型（或状态）PubMed-assuppliedbypublisherPubMed-inprocessPubMedPubMed-indexedforMEDLINE

属于Medline收录范围，建立ti、au、ab等基本书目信息。不属于Medline收录范围，但也建立ti、au、ab等基本书目信息。赋予MeSH、PT等字段并被index。三、PubMed检索特点

PubMed检索算符逻辑运算符AND、NOT、OR必须大写。(vitamincORzinc)ANDcommoncold截词算符：*，但对词组无效。如bacter*,可以检出以bacter为词干的单词bacteria、bacterium等最多600个单词。截词检索时，系统的自动词语匹配功能和MeSH自动扩展功能将不再被执行，如：heartattack*将不映射到MeSH词MyocardialInfarction。PubMed检索特点强制检索：双引号""或限定字段

"endocrinedisruption"

endocrinedisruption注意：所有的"

"

、*、()

都必须是英文状态下输入。PubMed常用字段Affiliation[AD]

Author[AU]：姚开泰（yaokaitai-->yaokt,yaokaitai-->yaok）；

tanj[au]与"tanj"[au]不同

Language[LA]：chinese[la]或chi[la]（前3个字母）MeSHSubheadings[SH]：自动扩展下位副主题词；如需关闭该功能，使用[sh:noexp]MeSHTerms[MH]：自动扩展下位主题词；如需关闭该功能，使用[mh:noexp]

PubMed常用字段PublicationDate[DP]

：1998/03[dp];1998[dp];1996:1998[dp];1998/01:1998/04[dp]PublicationType[PT]：review[pt]Title[TI]

TextWords[TW]：包括Title,Abstract,MeSHTerms,MeSHSubheadings,ChemicalSubstanceNames,PersonalNameasSubject等字段Title/Abstract[TIAB]

四、PubMed检索功能自由词检索在检索框中键入一到多个单词，如键入：vitamincANDcommoncoldhepatitisbAND(diagnosisORtherapy)

检索词可出现于PubMed各记录中的标题、摘要等全部可检索字段。自由词检索自由词检索作者检索作者姓名书写格式1.西方人姓名书写格式：Firstname、MiddleName、Lastname。美国肯尼迪总统名为：JohnFrankKenedy，Kenedy为Lastname（姓）。Frank为Middlename，比较少看到，多看到JohnF.Kenedy，中间名缩写了。如果看到姓名中间有逗号，则逗号前一定是姓。如：Kenedy,JohnF.作者检索作者姓名书写格式2.中国人姓名格式：Lastname、Firstname。如：钟世镇，就有如下拼写形式可供检索：Shi-zhenZhong；ShizhenZhongZhongshi-zhen；Zhong，shizhenZhong，shi-zhen

→zhongszShizhenZhong，zhongshizhen→zhongs期刊检索检索时可输入期刊全名，如：molecularbiologyofthecell，系统自动转换为”molbiolcell”[JournalName]；也可输入期刊标准缩写形式（如：molbiolcell）或期刊的ISSN（国际标准出版物编号，如：1059-1524）。如果期刊名是一个单词或恰好是MeSH词表中的词，如GeneTherapy、Science、Cell等，则必须在刊名后加[ta]（期刊名称字段标识符）。期刊检索如果杂志全名中包括括弧或方括号，键入时应该予以取消，例如杂志名为：JHandSurg[Am]，检索时应转成：JHandSurgAm。中文期刊，用汉语拼音：NanfangyikedaxuexuebaoBeijingdaxuexuebaoZhonghuaneikexuezazhi五、PubMed特征栏功能介绍（一）Limits限定检索作者（Author）：系统有提示期刊（Journal）全文链接（FullText或FreeFullText）日期（Dates）人类或动物研究（HumansorAnimals）文献类型（TypeofArticle）性别（Gender）、语种（Languages）、年龄（Ages）、文献子集限定（Subsets）自由词可以结合以上各种限定进行。限定检索窗口全貌添加作者检索添加期刊检索限定检出记录有全文链接、免费全文链接或摘要限定检出记录有全文链接、免费全文链接或摘要文献发表时间限定记录添加到PubMed时间限定研究对象:人类与动物限定研究对象：性别限定文献语种限定文献子集限定文献类型限定研究对象年龄限定检索字段限定高级检索界面中的限定检索检索举例姚开泰院士2001年以前发表的有关鼻咽癌（nasopharyngealcancer）方面的文献分析

姚开泰，2001年以前，nasopharyngealcanceryaokaitaiYaokaitaiYaoktYaok

如果仅检索某个作者的文献，最好是这几种形式都用上；

如果还有其他检索条件，最好“Yaok”的形式也用上。注意：一次Limits检索结束后，将前面的√点击取消。（二）Preview/Index功能介绍Preview/Index显示最近3次检索史。Preview/Index只显示最近3次的检索史，而History可以查看最近100次的检索史。（三）History功能介绍各检索式之间可以进行逻辑组配。（四）Clipboard功能介绍将每次选中的检索结果暂时保存至此最后集中处理（下载存盘或发E-mail）最多500条记录断开连接后仍可保存8小时选取记录将记录发送到Clipboard记录保存到Clipboard后显示发生改变在Clipboard中查看保存的记录在Preview/Index中显示Clipboard操作历史点击“URL”（五）Details功能介绍/sites/entrez?Db=pubmed&Cmd=DetailsSearch&Term=(((%22severe+acute+respiratory+syndrome%22%5BTIAB%5D+NOT+Medline%5BSB%5D)+OR+%22severe+acute+respiratory+syndrome%22%5BMeSH+Terms%5D+OR+(%22sars+virus%22%5BTIAB%5D+NOT+Medline%5BSB%5D)+OR+%22sars+virus%22%5BMeSH+Terms%5D+OR+sars%5BText+Word%5D)+AND+(%22diagnosis%22%5BSubheading%5D+OR+%22diagnosis%22%5BMeSH+Terms%5D+OR+diagnosis%5BText+Word%5D))+AND+((%222005%22%5BPDAT%5D+%3A+%223000%22%5BPDAT%5D)+AND+Review%5Bptyp%5D)保存该检索式至收藏夹将检索式保存至收藏夹六、PubMed检索结果的处理检索结果的处理显示格式结果排序文本显示本地保存（最多10000篇）打印邮件发送题录格式：作者、题名、出处。显示格式（Summary格式）改变显示格式显示格式（Abstract格式）文本显示Sendto→Text文本显示（便于直接打印）Sendto→File将检索结果下载保存为文件Sendto→E-mail将检索结果发送到邮箱七、PubMed主题词检索MeSH(MedicalSubjectHeadings)

PubMed记录中的医学主题词(MeSH)是由标引员为PubMed中的Medline文献所人工指定的词。

例：ascorbicacid是MeSHTerms，而vitaminc则不是。标引员使用能恰当描述文章内容的最相关MeSH词。通常一篇文章可有多个MeSH词。PubMed能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH词用户利用一个MeSH词能找出所有有关该主题的文献

不同拼写：leukemia(s)/leukaemia(s)→leukemia同义词：tumor(s),tumour(s),cancer(s),neoplasm(s)→neoplasmsMeSH(MedicalSubjectHeadings)

MeSH词独有特征主要MeSH词(MAJORTOPIC):MeSHtermasmainsubjectofthearticle(*)次要MeSH词扩展(EXPLODE)：chosenMeSHtermandallmorespecificunderlyingMeSHterms副主题词(SUBHEADINGS)SubHeadings副主题词对一个主题词的多个方面进行修饰限定的词，又称限定词。目前有83个副主题词并非每个主题词都能和83个副主题词组配。主题词等级排列，检索时可以将包含其下位词的文献都检索出来。一个主题词可以同时处在不同类目下。可选用的副主题词进入主题词检索界面的两种途径。检索有关糖尿病（D