教育部顾问室生物及医学科技人才培育先导型计画课件

教育部顧問室生物及醫學科技人才培育先導型計畫

96年度成果檢討會暨教學觀摩會計畫重點領域：基因體與蛋白質體醫學國立陽明大學報告人：馮濟敏96年度計畫成果摘要1.學程整合:以基因體與蛋白質體為基礎，開設核心課程與六門實驗課程與已成立之『生物科技管理學程』、『生物技術學程』、『生物資訊學程』形成一個完整教育體系2.開設核心課程:開設後基因世代之生物醫學:由學術到產業2學分核心課程，由6名校內外教師12名產業界專家授課，有校內學生117人、校外學生5人、業界2人，共124人3.開設主題實驗室課程:開設六門一系列的實驗課程，計6學分

總計校內學生146人、校外學生4人及產業界5人，計155人修課96年度計畫成果摘要4.強化主題核心實驗室:配合校方資源強化『微陣列與基因表現分析研究室』、『細胞生物學研究室』及『蛋白質體研究中心』5.教材編撰:各課程編製專用教本及實驗手冊且電子化上網6.舉辦座談會:尖端生物技術產學座談會，參加人數共計120名7.推動產學合作:廣邀產學人士參與核心課程授課及產學座談會後基因世代之生物醫學：由學術到產業(蔡英傑)功能基因體學之應用(林奇宏)蛋白質體學之應用(蔡有光)標的基因/蛋白質基因/蛋白質功能性分析基因的轉錄調控(鄭子豪)細胞訊息傳遞之分析(馮濟敏)特殊基因對癌細胞生長影響之分析(簡靜香)蛋白質交互作用(陳芬芳、陳美瑜)生物資訊應用基因/蛋白質功能性分析基因功能性分析

基因轉錄調控

-基因結合蛋白(ChIP,EMSA) 基因的轉錄調控

-基因promoter(promoter-reporter

細胞訊息傳遞之分析

之建構,細胞轉染)

基因與細胞生長

-FlowCytometry(PIstaining、BrdU特殊基因對癌細胞生長影響incorporation、TUNEL)之分析

蛋白質功能性分析

蛋白質交互作用

-YeastTwo-Hybride、CoIP、Colocalization

蛋白質交互作用

蛋白質移位作用

-螢光蛋白載體之建構細胞訊息傳遞之分析

計畫整合方式

以核心課程「後基因世代之生物醫學：由學術到產業」建立一個學術與產業界溝通的橋樑，以產學座談會促進科技人才的跨領域，前瞻性之國際觀。六門一系列的實驗課程：由功能基因體學及蛋白質體學之應用(標的基因/蛋白質)開始到基因/蛋白質功能性分析之課程止，提供學生一完整且主題清楚之訓練課程。在這相輔相成課程中，學生不但學到了尖端生物技術，更重要的是學到了這些技術的應用以及在生技醫藥產業界開發的潛力。此外，這些課程將充分結合了陽明大學基因體、蛋白質體核心設施及師資，以及與陽明大學有密切研發合作關係的企業，組成教學策略聯盟，並編撰實用教材，推動產學合作。96年度開設課程與招生總表課程名稱學分數開課時間修課人數核心課程後基因世代之生物醫學:由學術到產業27/09-7/13124人實驗課程細胞訊息傳遞之分析17/16-7/2022人特殊基因對癌細胞生長影響之分析17/23-7/2730人功能基因體學之應用17/30-8/0318人蛋白質交互作用18/06-8/1028人基因的轉錄調控18/13-8/1730人蛋白質體學之應用18/20-8/2427人後基因世代之生物醫學：由學術到產業生物科技發展的現況與展望魏耀揮(校內)蛋白質體學研究林照雄(校內)蛋白質體學在生技產業的現在與未來吳啟裕(法蘭克威爾公司)

結構基因體學廖淑惠(校內)中草藥技術發展現況黃明章(鴻亞生技公司)

醣質生物科技楊玫君(台灣醣聯公司)

台灣發展生技產業的策略與省思張世忠(基亞生技公司)

微陣列技術在醫療診斷之應用林如華(中國醫藥大學)後基因時代藥物開發陳華鍵（長庚大學）生醫研究之智慧財產葛介正(基律科技智財)

幹細胞科技及其應用張南驥(校內)轉殖基因小鼠在生物醫學上之應用陳俊銘(校內)酵素分子演化楊運博(駿瀚生化公司)生醫應用上之程序處理晶片姚南光（工研院醫療器材科技中心）從投資看生技產業之競爭與價值何志煌(新揚管理顧問公司)中草藥芳香醫療之研發蔡英傑(校內)課程內容及師資後基因時代之生物醫學：由學術到產業

學生成績分佈圖分數組距曠考50以下51-6061-7071-8081-9091-99人數8001246526人數分數成績評定標準:筆試100%出席率參考

後基因時代之生物醫學：由學術到產業

學生課程學習反應調查表5.希望此課程改進項目課程過於緊湊56%課程過多，無法吸收27%課程內容重複6%課程內容過深8%課程內容過淺4%教師講課速度過快21%希望提供講義大綱及參考資料13%希望能準時上下課8%幻燈片清晰度不佳1%教師表達能力9%教室過小6.對未來升學或就業是否有幫助是84%不清楚16%7.綜合意見老師上課生動活潑，教學內容深度適宜，對於學生未來規劃有不小的參考價值，也讓我對於學術外，對生技產業更有瞭解。日期講題講員8/20實驗及理論講解:(1)次細胞蛋白質體之製備;(2)差異性二維電泳—等電位聚焦電泳蔡有光8/21實驗及理論講解:差異性二維電泳—SDS多丙烯醯胺梯度膠電泳蔡有光8/22實驗及理論講解:(1)差異性二維電泳—影像處理

(2)銀染法蔡有光8/23實驗及理論講解:(1)蛋白身份鑑定分析—樣本處理;(2)蛋白身份鑑定分析—質譜儀上機示範(3)後轉譯修飾定位分析—樣本處理;(4)後轉譯修飾定位分析—質譜儀上機示範蔡有光8/24實驗及理論講解:(1)蛋白身份鑑定分析—分析報告;(2)後轉譯修飾定位分析—分析報告蔡有光蛋白質體學之應用課程內容及師資學生實驗成果

蛋白質體學之應用蛋白質體學之應用--實驗課程

學生成績分佈圖分數組距曠課70-8081-9091-99人數101115

人數分數成績評定標準：口頭報告40%實驗參與度及出席率30%實驗結果及期末報告30%96年度開設課程(實驗課程)課程:功能基因體學之應用學分:1學分報名/上課人數18人/17人組別數/每組人數18組/1人負責教師林奇宏授課時數40小時上課學生來源(人)校內校外產業界教師17100日期講題講員7/30講解：1.功能基因體學概論2.分子遺傳技術原理及其在功能性基因體學上之應用3.RNA樣品之品質及定量分析實驗：1.微陣列基因表現分析所需檢體RNA之品質檢測林奇宏(校內)7/31講解：微陣列基因表現分析的操作原理與在功能性基因體學上的應用實驗：2-1.微陣列樣品標定操作林奇宏(校內)8/01講解：單核酸多型性的原理與在功能性基因體學上的應用實驗：2-2.進行微陣列晶片雜交反應和操作林奇宏(校內)8/02講解：微陣列晶片影像及數據之基礎分析實驗：3.微陣列晶片影像分析與資料擷取與分析林奇宏(校內)8/03講解：即時定量聚合酶連鎖反應的基因定量原理及在功能性基因體學上的應用實驗：4.即時定量聚合酶連鎖反應機ABI7900HT的基本介紹與資料判讀分析林奇宏(校內)功能基因體學之應用課程內容及師資學生實驗成果

功能基因體學應用-實驗設計藉由實驗室自己設計的Coronin1B抗體觀察Coronin1B在小鼠心臟的表現情形，發現Coronin1B於小鼠胚胎時期E時主要表現在心房及心室間形成瓣膜的部分(如下圖)，此部分為心臟形成時參與EMT(epithelialmesenchymaltransition)的重要部位。綜合上述發現，我們認為Coronin1B應在心臟發育過程扮演重要角色，希望能了解此調控此基因表現的機制為何

Aims以microarray及luciferaseassay研究心臟發育相關基因Coronin1B的交互作用蛋白，找尋可能調控Coronin1B表現的transcriptionfactors。功能基因體學之應用

學生實驗課程學習反應調查表5.希望授課部分改進項目課程過於緊湊6%內容過多12%希望提供講義大綱及參考資料47%課程內容過深6%6.希望實驗課程改進項目各組器材數量24%實驗桌操作寬擠29%7.對未來升學或就業是否有幫助是94%不清楚6%8.綜合意見學到許多microarray的相關知識，對以後學業跟實驗有所幫助。授課老師及實驗助教的教學態度認真，感覺用心，很喜歡老師的教學方式，覺得很充實，也學到不少東西。希望原理和基礎部分可以講慢點，因為對沒有基礎的人來說會比較吃力。課程中提及實驗器材及分析的許多名詞不容易瞭解，沒有講義很難複習。希望上課問題可以多加討論，增加學習注意力。96年度開設課程(實驗課程)課程:基因的轉錄調控學分:1學分報名/上課人數30人/30人組別數/每組人數15組/2人負責教師鄭子豪授課時數40小時上課學生來源(人)校內校外產業界教師29010基因的轉錄調控--實驗課程

學生成績分佈圖分數組距曠課70-8081-9091-99人數00291

人數分數成績評定標準：課堂表現:10%實驗參與度及出席率40%實驗結果及期末報告50%基因的轉錄調控

學生實驗課程學習反應調查表5.希望授課部分改進項目課程過於緊湊3%希望提供講義大綱及參考資料3%課程內容過淺7%6.希望實驗課程改進項目親自操作實驗或儀器7%各組器材數量3%實驗桌操作寬擠3%實驗室流程安排規劃7%7.對未來升學或就業是否有幫助是100%8.綜合意見Lecture對於實驗的理解很有幫助，老師及助教的講解相當仔細。五天的課程收穫很多。實驗流程順暢，且在等實驗的過程中還會上課，不會讓時間浪費掉。可以感受到課程規劃的用心，這星期的課頗具收獲，是很愉快的學習經驗。感謝助教耐心的指導和幫忙。96年度開設課程(實驗課程)課程:細胞訊息傳遞之分析學分:1學分報名/上課人數22人/22人組別數/每組人數11組/2人負責教師馮濟敏授課時數40小時上課學生來源(人)校內校外產業界教師21100日期講題講員7/16

講解：癌細胞因應環境改變導致葡萄糖運送增加之簡介實驗：(I)製備含有GLUT1promoter之Luciferasereporter載體(pLuc-GT1/E1/E2)(II)製備含有EGFP-conjugatedGLUT1載體(pGT1-EGFP)馮濟敏(校內)7/17

講解：細胞培養之操作及轉染實驗：(I)培養MCF-7乳癌(II)利用電穿孔共同轉染pLuc-GT1/E1/E2及pCMV

或pGT1-EGFP及pCMV

馮濟敏7/18講解：GLUT1細胞內移位作用之分析實驗：(I)使用CoCl2及sodiumazide處理轉染乳癌細胞(II)製備樣本-以供螢光及共軛焦顯微鏡分析馮濟敏7/19講解：GLUT1基因轉錄之分析實驗：(I)製備樣本-以供luciferase分析(II)Luciferase分析(III)-galactosidase分析馮濟敏7/20講解：螢光顯微鏡與共軛焦顯微鏡之比較與數據分析實驗：螢光顯微鏡與共軛焦顯微鏡分析短期處理之樣本馮濟敏細胞訊息傳遞之分析課程內容及師資學生實驗成果

細胞訊息傳遞之分析【圖一】為帶有insert的DNA片段經過PCR反應後，進行膠體電泳測試之實驗結果。

【圖二】電穿孔的cuvette經electroporation的溶液會有氣泡的產生，電穿孔法其原理係將細胞暴露於瞬間的高壓放電，造成細胞膜上出現一些暫時性開放的小孔洞，使得質體DNA可以藉者這些小孔洞進入細胞中，達到基因轉殖目的。【圖三】

A:為control，不加任何藥物；B:加入CoCl2；C:加入azide（NaN3）【圖一】【圖二】【圖三】Analysisof

EGFP-GLUT1localizationundervarioustreatment細胞訊息傳遞之分析--實驗課程

學生成績分佈圖分數組距曠課70-8081-9091-99人數11173

人數分數成績評定標準:書面報告65%課堂表現及出席率35%

細胞訊息傳遞之分析

學生實驗課程學習反應調查表5.希望授課部分改進項目課程過於緊湊5%課程內容過淺5%教師表達能力10%6.希望實驗課程改進項目親自操作實驗或儀器14%各組器材數量19%各組器材品質14%實驗流程安排規劃10%7.對未來升學或就業是否有幫助是72%否14%不清楚14%8.綜合意見學到很多東西，問助教們問題也都得到助教們清楚又熱心的回答，真的辦得非常棒。實驗結果及流程一切都算順利，也知道很多操作的基本原理，對於之後碩士生涯有很大的助益。96年度開設課程(實驗課程)課程:蛋白質交互作用學分:1學分報名/上課人數28人/28人組別數/每組人數14組/2人負責教師陳美瑜、陳芬芳授課時數40小時上課學生來源(人)校內校外產業界教師27010日期講題講員8/06講解：簡介蛋白質間交互作用研究方法、簡介本實驗課程、酵母菌模型生物介紹、酵母菌雙雜合系統之原理實驗：酵母菌雙雜合系統(1)：酵母菌培養、轉型免疫共同定位分析(1)：細胞轉染免疫共沉澱(1)：細胞轉染陳美瑜陳芬芳（校內）8/07講解：共軛螢光顯微鏡技術實驗：酵母菌雙雜合系統(2)：酵母菌DNA萃取、大腸桿菌電轉型免疫共同定位分析(2)：細胞培養免疫共沉澱(2)：細胞蛋白質萃取物製備陳美瑜陳芬芳8/08講解：蛋白質交互作用免疫分析方法實驗：酵母菌雙雜合系統(3)：大腸桿菌轉型菌落PCR免疫共同定位分析(3)：免疫螢光染色、共軛螢光顯微鏡觀察共同定位分析p53及MDM2的結合陳美瑜陳芬芳8/09講解：SDS電泳與Western轉漬分析原理實驗：酵母菌雙雜合系統(4)：PCR產物凝膠電泳分析回收質體結果免疫共同定位分析(4)：顯微呈像結果電腦共同定位分析免疫共沉澱(3)：免疫沉澱、製備SDS凝膠分析p53及MDM2交互作用陳美瑜陳芬芳8/10講解：實驗結果解說與討論實驗：酵母菌雙雜合系統(5)：以報告洋菜膠上之生長情形與β-galactosidase酵素反應呈色方法分析p53及MDM2蛋白質交互作用啟動報告基因表現之結果免疫共沉澱(4)：SDS蛋白質電泳、Western轉漬分析免疫共沉澱結果陳美瑜陳芬芳

蛋白質交互作用課程內容及師資學生實驗成果

蛋白質交互作用圖二:(利用共軛焦螢光顯微鏡觀察)32℃(操作組)p53大部分都在細胞質然而部份進入細胞核的可以成功的活化MDM2圖一:38℃(negativecontrol)p53(紅)沒有入核，沒辦法activateMDM2(綠)。藍色為DAPI染的DNA代表核的位置圖三:可以看到綠色箭頭指的就是經由p53Ab免疫沉澱下來，後來用MDM2Abdetect的MDM2。圖一圖二圖三蛋白質交互作用--實驗課程

學生成績分佈圖分數組距曠課70-8081-90人數3223

人數分數成績評定標準：課堂表現15%實驗課參與度及出席率25%書面報告60%蛋白質交互作用

學生實驗課程學習反應調查表5.希望授課部分改進項目課程過於緊湊4%希望提供講義大綱及參考資料16%課程內容過淺8%教師表達能力4%6.希望實驗課程改進項目各組器材數量4%各組器材品質8%實驗桌操作寬擠8%實驗流程安排規劃20%7.對未來升學或就業是否有幫助是88%不清楚12%8.綜合意見可增加實驗項目:例如confocal助教們講解清楚，人都很nice。實驗上的討論很有幫助學到很多東西，是個感覺很棒的課程，在這一個禮拜內受益良多。96年度開設課程(實驗課程)課程:特殊基因對癌細胞生長影響之分析學分:1學分報名/上課人數30人/30人組別數/每組人數15組/2人負責教師簡靜香授課時數40小時上課學生來源(人)校內校外產業界教師27120特殊基因對癌細胞生長影響之分析課程內容及師資日期講題講員7/237/247/257/267/27講解:流式細胞儀之分析原理及應用，細胞週期頻譜之圈選。實驗：培養肝癌細胞之前處理，進行PIstaining及流式細胞儀之分析.講解:雙染散射光圖譜分析與圈選、流式數據分析與註釋、不同分析軟體之比較實驗:特定基因之RNAi未剔降之癌細胞(一)，進行BrdU標定DNA含量及PIstaining，細胞流式圖譜分析與圈選，數據分析與歸類(控制組)講解:特定基因之RNAi剔降之癌細胞(一)進行BrdU標定DNA含量及PIstaining，

WinMD及Modfit兩種分析軟體分析結果之比較。實驗:a.癌細胞(一)以BrdU標定DNA,PI及BrdU抗體雙染,其流式數據之分析與註釋.(實驗組)b.WinMD及Modfit兩種分析軟體分析,與未剔降之癌細胞結果比較.

講解：特定基因RNAi轉染癌細胞(二)，細胞週期改變及TUNEL反應之流式數據之分析與註釋.實驗：特定基因RNAi轉染之癌細胞(二)細胞週期改變之分析,進行TUNEL反應及PIstaining,流式數據之分析(控制組).講解:特定基因RNAi剔降之癌細胞(二)，凋亡細胞之標記.散射圖譜分析與註釋

實驗:a.特定基因之RNAi剔降之癌細胞(二)，以藥物誘導凋亡,進行TUNEL反應及PIstaining,流式數據之分析與註釋(實驗組).b.各組分別上台報告5天之實驗結果。簡靜香簡靜香簡靜香簡靜香簡靜香學生實驗成果

特殊基因對癌細胞生長影響之分析以FL1-H作直方圖:

實驗組(圖七)

相較於控制組(圖八)，分布趨於較零散，而不集中。作markers，可以看到，實驗組有部分細胞的螢光量大為增加，根據統計，實驗組螢光變強的細胞佔30.22％，而控制組的只有12.20％。將兩個圖merge，得到(圖九)。由圖九可看出，相對於控制組，實驗組向左偏移了，也就是螢光量普遍下降。圖七ParamnameMLow,HigEvents%Total%GatedGMeanCVPeak,ValueFL1-00,102310000100.00100.0015.8065.18293,11339,1023302230.2230.22

123.7137.1729,29.1638圖八Paramname

MLow,HigEvents%Total%GatedGMeanCVPeak,ValueFL1-00,102310000100.00100.0011.7223.22116,8.42911336,1023122012.2012.20

35.6916.2622,24.8045實驗組(圖七)控制組(圖八)兩個圖merge(圖九)特殊基因對癌細胞生長影響之分析--

實驗課程學生成績分佈圖分數組距曠課71-8081-90人數3324

人數分數成績評定標準：課堂表現及出席率15%實驗課參與度5%口頭報告20%書面報告60%特殊基因對癌細胞生長影響之分析

學生實驗課程學習反應調查表5.希望授課部分改進項目課程內容過於緊湊8%希望提供講義大綱及參考資料28%課程內容過深8%課程內容過淺12%教師表達能力16%6.希望實驗課程改進項目親自操作實驗或儀器4%各組器材品質8%各組器材數量4%實驗桌操作寬擠20%實驗流程安排規劃12%助教專業能力12%助教人數16%7.對未來升學或就業是否有幫助是80%●否8%●不清楚12%8.綜合意見等待時間長，許多前置作業已完成，能操作部分少，無法親自操作。整體來說，對Flow的功能及應用有初步的認識。希望可以增加FRET的實驗操作希望能在實驗教學專用的實驗室上課，且把各組的實驗時間錯開主題尖端生物技術產學座談會

主持人蔡英傑

(陽明大學生化所教授)座談人蕭欽應(膠原科技研發中心技術長)

林祖泰

(三晃生技公司副總經理)

96年7月13日下午1:30~5:30

第二教學大樓211教室

產學座談會

題綱生技產業公司招募的人才需具備何種條件和能力?想進入管理階層又需具備何種特質？生技相關科系的畢業生逐年增加，產業界對人才的需求及工作機會是否減少，出路又如何?台灣掛名生技產業的公司很多，對於一個將要踏入產業界的學生來說，該如何評估與選擇?產業界對於聘用學生，當作暑期實習的意願如何?進入產業界是否需具備高學歷（PhD）才能有較好的發展？抑或碩士畢業馬上進公司卡位？現今中國的生技產業市場如何？想要踏入的注意事項又為何？96年度經費額度：經常費教育部補助款1,536,597元學校自籌款學校：307,316元業界：0元設備費教育部補助款1,197,516元學校自籌款學校：240,484元業界：0元使用儀器或設備名稱數量經費來源聚合酶連鎖反應儀目的：放大DNA1共180,000元教育部補助:

180,000元細胞培養箱目的：細胞培養1共215,000元教育部補助:

215,000元落地型變頻式泛用冷凍離心機目的：收集細胞、核酸沉澱物1共298,000元教育部補助:

298,000元高速離心機目的：細胞樣品離心與收集1共262,000元教育部補助:

262,000元倒立位相差螢光顯微鏡目的：觀察基因(GFP)在andriamycin刺激下光強度的變化1共268,000元教育部補助:242,516元學校自籌款:25,484元-30℃冷凍櫃目的：實驗樣本之儲存1共99,000元學校自籌款:

99,000元96年度計畫編列之儀器使用儀器或設備名稱數量經費來源恆溫水槽目的：-galactosidase分析1共17,000元學校自籌款:17,000元高通量等電點聚焦槽組目的：Run12stripssimultaneously1共99,000元學校自籌款:99,000元96年度計畫成效(質的效益)1.開設2學分「後基因世代之生物醫學:由學術到產業」之核心課程2.開設6門共6學分之主題實驗課程，由功能基因體學及蛋白質體學之應用(標的基因/蛋白質)開始到基因/蛋白質功能性分析，提供學生一完整且主題清楚之訓練課程，學生不但學到尖端生物技術，更重要是學到這些技術的應用以及在生技醫藥產業界開發的潛力3.編製各課程之教材且完成電子化4.經由產學合作，舉辦「後基因世代之生物醫學:由學術到產業」產學座談會，建構堅實之產學交流管道5.以上課程充分結合陽明大學基因體與蛋白質體研究中心之核心設施及師資，以及與與陽明大學有密切合作關係的企業，組成教學策略聯盟，推動產學合作

96年度計畫成效(量的效益)課程:後基因世代之生物醫學:由學術到產業校內學生校外學生業界、教師總人數博士生碩士生大學生博士生碩士生大學生業界人士教師10951204120124校內學生校外學生業界、教師總人數博士生碩士生大學生博士生碩士生大學生業界人士教師32200101027校內學生校外學生業界、教師總人數博士生碩士生大學生博士生碩士生大學生業界人士教師01520010018課程:蛋白質體學之應用課程:功能基因體學之應用課程:基因的轉錄調控校內學生校外學生業界、教師總人數博士生碩士生大學生博士生碩士生大學生業界人士教師52400001030校內學生校外學生業界、教師總人數博士生碩士生大學生博士生碩士生大學生業界人士教師02100010022校內學生校外學生業界、教師總人數博士生碩士生大學生博士生碩士生大學生業界人士教師12600001028課程:細胞訊息傳遞之分析課程:蛋白質交互作用課程:特殊基因對癌細胞生長影響之分析校內學生校外學生業界、教師總人數博士生碩士生大學生博士生碩士生大學生業界人士教師126001020302006年生物技術相關學程及核心研究所

畢業生對國內生技產業貢獻調查學校國內國外服役待業升學就業升學就業學研界生技相關產業非生技相關產業學研界生技相關產業非生技相關產業陽明大學68002000142合計68002000142九十七年度計畫內容97年度擬開設課程課程名稱後基因世代之生物醫學:由學術到產業

核心課程蛋白質體學之應用

實驗課程功能基因體學之應用

實驗課程蛋白質交互作用

實驗課程負責老師蔡英傑蔡有光林奇宏陳美瑜、陳芬芳開課對象碩博士班、大學部、產業界人士碩博士班、大學部、產業界人士碩博士班、大學部、產業界人士碩博士班、大學部、產業界人士預估修課人數100241620開課學期暑期暑期暑期暑期學分數211197年度擬開設課程課程名稱基因的轉錄調控

實驗課程細胞訊息傳遞之分析

實驗課程特殊基因對癌細胞生長影響之分析實驗課程蛋白質體分析的程式設計

實驗課程(新設)負責老師鄭子豪馮濟敏簡靜香蔡有光、巫坤品開課對象碩博士班、大學部、產業界人士碩博士班、大學部、產業界人士碩博士班、大學部、產業界人士碩博士班、產業界人士預估修課人數20202012開課學期暑期暑期暑期暑期學分數111197年計畫之增進內容後基因世代之生物醫學:由學術到產業核心課程蛋白質體學之應用功能基因體學之應用基因的轉錄調控細胞訊息傳遞之分析蛋白質交互作用特殊基因對癌細胞生長影響之分析跨領域整合課程蛋白質體分析的程式設計(蔡有光、巫坤品)蛋白質體資訊分析(蔡有光、巫坤品)實驗技術課程「生物資訊與系統生物學」領域負責增進課程名稱:蛋白質體分析的程式設計內容:

利用中心開發的軟體做為實例，說明如何運用微軟公司Excel程式內建的VisualBasic程式，協助蛋白質與胜肽質譜分析工作的進行，如初始資料的轉換、蛋白質身分鑑定、蛋白質後轉譯修飾定位、胜肽碎片圖譜繪製、資料庫建立與整理、影像處理等。

實驗課程內容課程:蛋白質分析之程式設計

1學分項目講題講員1一般LC-MS/MS資料的特性

ThestructuringofaLC-MS/MSdata蔡有光(生化所)巫坤品(生資所)2如何使用ExcelVB自LC-MS/MS資料取得質譜資訊

ExtractionofthemassspectraldatausingExcelVB蔡有光(生化所)巫坤品(生資所)3如何使用ExcelVB將LC-MS/MS資料轉成適合的格式

TransformationoftheLC-MS/MSdatausingExcelVB蔡有光(生化所)巫坤品(生資所)41.如何使用ExcelVB自LC-MS/MS資料找尋蛋白質後轉譯修飾

ComprehensivescreeningofproteinPTMsthroughanalysesofLC-MS/MSdatausingExcelVB2.如何使用ExcelVB標示後轉譯修飾化胜肽的碎片質譜

VerificationandannotationofthepeaksintandemmassspectraofmodifiedpeptidesusingExcelVB蔡有光(生化所)巫坤品(生資所)5如何使用ExcelVB做影像分析處理

ImageprocessingusingExcelVB蔡有光(生化所)巫坤品(生資所)97年擬購儀器實習/實驗項目及內容使用儀器或設備名稱規格數量經費來源蛋白質