分子诊断与精准医疗

关于分子诊断与精准医疗第1页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三精准医疗2015年3月11日，国家首次精准医学战略专家会议，提出中国精准医疗计划卫计委表示，将其列入国家“十三五”科技发展重大专项3月，国家卫计委公布了第一批肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床试点单位

第2页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三精确诊断第一步：明确患者的基因突变状态

精准医学是精确诊断和靶向治疗的结合第3页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三什么是分子诊断？分子诊断（moleculardiagnosis）：应用分子生物学方法检测患者体内遗传物质的结构或表达水平的变化而做出诊断的技术，称为分子诊断。包括DNA、RNA和蛋白质所有疾病(除外伤)的发生均与基因检测技术：测序(Sequence)原位杂交(Hybridization)聚合酶链式反应(PCR)第4页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三与遗传有关的DNA结构是由硷基连接而成的双股双螺旋结构。一些硷基片段即为基因

基因：DNA的结构第5页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三

当基因丢失，或易位，或插入外来基因即可发生肿瘤免疫监控功能失效—不能识别和清除基因突变的细胞第6页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三肿瘤药物的发展趋势第7页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三肿瘤患者的个体差异、肿瘤的异质性决定了单一模式的“OneSizeFitsAll”的粗放医疗时代将被以分子检测手段为基础的个体化医疗所取代。第8页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三第9页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三EGFR突变检测的意义1、吉非替尼-Gefitinib，商品名:易瑞沙-Iressa，2015，FDA批准一线药，生产商:阿斯利康（AstraZeneca）。2、厄洛替尼-Erlotinib，商品名:特罗凯-Tarceva，2013年，FDA批准一线药，生产商：罗氏（Roche）。3、埃克替尼-Icotinib，商品名：凯美纳-Conmana，2011，CFDA批准的二线药，生产厂家：贝达药业股份有限公司。4、19缺失或外显子21(L858R)取代突变，阿法替尼-Afatinib，商品名：Gilotrif，2013，FDA批准的一线药，2015年8月在华上市，生产厂家：德国勃林格殷格翰公司。5、T790M突变：AZD9291(阿斯利康)，Rociletinib第10页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三EGFR基因突变状态是EGFR酪氨酸酶抑制剂(EGFR-TKI)治疗晚期NSCLC最重要的疗效预测因子。EGFR信号通路及靶向治疗机制第11页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三4.肺癌EGFR通路靶向分子病理检测EGFR突变较易发生于亚洲人、女性、腺癌、不吸烟患者。最有效的是E19/E21突变，占总突变90%，E20为耐药突变。EGFR突变患者使用吉非替尼反应率可达到71.2%，而野生型患者只有1.1%。EGFR野生型患者使用吉非替尼死亡风险增加185%。1.EGFR第12页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三2.K-RASK-ras信号通路K-RAS基因属Ras基因家族，正常时能调控细胞生长路径；异常时，导致细胞持续生长。K-RAS蛋白是EGFR信号传导中关键下游调节因子。K-RAS基因突变使结直肠癌患者对西妥昔单抗治疗产生耐药性。第13页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三K-RAS基因突变检测第14页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三K-RAS基因突变检测第15页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三3.B-RAFBRAF是MAPK的最强激活剂，40多种突变，15外显子1799T/A最常见；多见于黑色素瘤（突变率40-60%）、结直肠癌、甲状腺乳头状癌、NSCLC（突变率0.5-4.9%，女性、肺腺癌患者）；第16页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三4.ALK融合基因ALK激酶抑制剂：克唑替尼、色瑞替尼第17页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三EML4-ALK融合基因可见于多种肿瘤，如间变性大细胞淋巴瘤、炎性成肌纤维细胞瘤、成神经细胞瘤和NSCLC等；在NSCLC人群中，EML4-ALK阳性率约为3%～7%左右；主要存在于腺癌中、轻度吸烟、年轻男性；33%非EGFR、KRAS突变的NSCLC患者出现EML-4-ALK突变，排他性强；EML4-ALK阳性者并不能从EGFR-TKI靶向治疗中获益，而Crizotinib对EML4-ALK突变型晚期NSCLC患者的疾病控制率可达90%，接受Crizotinib治疗可使患者获得明显的生存获益第18页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三临床意义：

EML4-ALK基因融合或ALK基因断裂呈阳性的患者可以从克唑替尼/色瑞替尼的治疗中获得最大化的生存效益。

在克唑替尼上市时，FISH被美国食品药品监督管理局（FDA)批准为EML4-ALK阳性NSCLC的伴随诊断方法，是ALK融合基因检测的金标准。

第19页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三■关于阳性率：→西方肺腺癌患者EGFR突变阳性率约为10%，亚裔腺癌患者为50%左右，亚裔鳞癌约为2.7%；→不吸烟、女性、肺腺癌患者EGFR突变阳性率更高；→KRAS突变在非亚裔、吸烟及黏液癌中最常见；50%结直肠癌患者中；→EML4-ALK融合阳性率约为3%-11%。■关于互斥性：→EGFR和KRAS突变重叠在肺癌患者的发生率<1%；→EML4-ALK融合和EGFR突变大多数情况下不同时存在。第20页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三5.PIK3CAPIK3CA是一种癌基因，编码I类磷脂酰肌醇-3激酶的p110催化亚单位，PI3Kp110a；该基因可以发生体细胞突变而致癌的基因。突变热点均能增强PI3K的脂质激酶活性。已发现多种癌症，如结直肠癌（10－32%）、乳腺癌、非小细胞肺癌等存在PIK3CA基因突变。PIK3CA存在两个热点突变区：9号外显子（E542K、E545K、E545G突变）；20号外显子（H1047R、H1047L突变）；

第21页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三PIK3CA基因突变导致PI3K/Akt信号通路持续性活化，PI3K作为EGFR下游信号分子被激活，导致肿瘤细胞对EGFR-TKI等药物的耐药。第22页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三

临床意义

检测PIK3CA基因突变可以预测肿瘤患者对EGFR-TKI等药物的耐药性，用于临床辅助诊断，为临床医生选择靶向药物提供参考。PIK3CA与K-RAS同时突变，具有很高的耐西妥昔单抗特性。第23页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三6.KIT和PDGFRa第24页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三GISTs中KIT基因突变率约为90%，且突变形式多样。主要集中于11号外显子（Lys550-Val560）约占70-80%、9号外显子（Ala502-Tyr503）约占5%-10%。第25页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三临床意义伊马替尼(Glivec，格列卫)是一种特殊的酪氨酸激酶抑制剂，经FDA批准可应用于c-Kit阳性、不能手术切除和/或转移性的恶性GISTs的治疗。检测KIT基因突变对于指导GISTs患者的合理用药，具有重要的参考价值。第26页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三靶向治疗提高药物有效性、安全性、减少毒副作用；同时会产生耐药耐药原发耐药：KRAS获得性耐药：T790M和C-MET第27页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三动态监测NSCLC患者（经EGFR-TKI治疗）血浆DNA的EGFR突变状态，由初始检测到实时检测；三代EGFR-TKIAZD9291，对于EGFR敏感突变和T790M耐药突变的患者均有效；已初步确立临床疗效；二代ALK抑制剂Alectinib治疗克唑替尼耐药患者，已初见临床疗效；免疫疗法，MEDI4736、Pembrolizumab、Nivolumab，在NSCLC中显示出有效性；以C-MET过表达为靶点，克服EGFR-TKI获得性耐药；2015ASCO最新进展第28页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三7.HER-2基因扩增第29页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三第30页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三第31页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三各肿瘤的分子病理诊断方案第32页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三13肺癌第33页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三14.结直肠癌分子诊断项目13结直肠癌分子诊断项目第34页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三乳腺癌分子诊断项目第35页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三17.白血病分子诊断项目胃肠道间质瘤分子诊断项目第36页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三肿瘤化疗分子诊断项目第37页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三分子病理临床价值案例-小结(I)第38页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三分子病理临床价值案例-小结(II)第39页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三铂类ERCC1mRNA，BRCA1mRNAERCC1(118)、ERCC2(312)XRCC1(194/399)、GSTP1(105)顺铂卡铂抗微管类TUBB3mRNA，STMN1mRNAMDR1(2677/3435)紫杉醇白蛋白结合型紫杉醇长春瑞滨长春花碱多西他赛氟尿嘧啶类TYMSmRNA，TYMPmRNATYMS(3'-/5'-UTR)MTHFR(677/1298)DPYD(2A/5A/9A)培美曲塞吉西他滨RRM1mRNA，RRM1(37)依托泊苷TOP2AmRNA伊立替康UGT1A1(*6/*28)丝裂霉素NQO1(465/609)异环磷酰胺CYP2C9(*3)，CYP2C19(*2/*3)基因表达/多态性检测能有效预测患者化疗的药物敏感性及毒副作用强弱!8、化疗类化疗类分子诊断项目第40页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三临床常见的几种化疗药物蒽环类、伊立替康、甲氨蝶呤、依托泊苷、巯嘌呤类、丝裂霉素、培美曲塞、环磷酰胺、替莫唑胺等第41页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三1.ERCC1与铂类第42页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三2.RRM1与吉西他滨第43页，讲稿共47页，2023年5月2日，星期三3.TUBB3