基因组序列诠释课件-002

基因组序列诠释（精选）51、山气日夕佳，飞鸟相与还。52、木欣欣以向荣，泉涓涓而始流。53、富贵非吾愿，帝乡不可期。54、雄发指危冠，猛气冲长缨。55、土地平旷，屋舍俨然，有良田美池桑竹之属，阡陌交通，鸡犬相闻。基因组序列诠释（精选）基因组序列诠释（精选）51、山气日夕佳，飞鸟相与还。52、木欣欣以向荣，泉涓涓而始流。53、富贵非吾愿，帝乡不可期。54、雄发指危冠，猛气冲长缨。55、土地平旷，屋舍俨然，有良田美池桑竹之属，阡陌交通，鸡犬相闻。第二讲基因组序列诠释5.转录物组6.蛋白质组问题细胞周期的不同时期个体发育不同阶段不同的器官和组织不同的外界环境下各种基因的表达与否、量的差异、表达部位如何创造性教学关注学生的发展,尤其是个性心理品质和创新能力的发展,为学生的未来发展奠定基础。实施创造性教学是以创造教育理论、现代教育学、心理学理论为指导,引导和帮助学生在接受、理解知识的基础上领悟前人获取知识的方法,经历创造性解决问题的过程,从而培养学生的创造性思维,塑造创造性人格,促使学生整体素质得到全面发展的一种教学模式。英语课是一门实践性很强的课程,应着重培养学生运用语言进行交际的能力。人的语言能力以他的思维为基础。因此,培养学生的语言能力应该从他们的思维能力入手。而初中生正好处在十一至十五岁之间,已具备了直觉思维和抽象思维的能力,这正是发展、培养创造思维能力的最佳时期。创造性教学要求教师教会学生获取、处理和加工信息,培养学生的实践能力和自我评价能力。培养学生的英语创造性思维可以通过比较法、联想法、创设情境、自由会话法、看图说话法、现行字、词造句法等发展。一、比较法它是就某词或谈话要点作为求异点,引导学生求异思维,如学生学了短语infrontof,引导学生比较它与inthefrontof之间的异同点,通过比较发展了学生的发散思维,加强鉴别力,提高了思维能力。二、联想法一词联想,群体记忆,以已学的词汇为基础,横向联系、扩展,引导学生进行求异思维,使之在一词联想中展开。如:学动词时就要由动词原形联想到一般现在时第三人称单数形式,联想到现在分词和过去式,过去分词;在学习国家、语言名称时就要将人民、首都、货币等联系在一起,丰富学生的知识,开阔视野,符合中学生求新求异的心理特点。三、创设情境,自由会话法在学习初中第二册Lesson21后,要求两位同学假设相互碰面,某A向某B提出某种活动的建议(说明活动的时间、地点)A:××,areyoufreetomorrow?B:Ithinkso,why?A:Wouldyouliketoplaybasketball?B:Oh,thankyou.I’dloveto.WhattimeshallIcome?A:Abouthalfpastthreetomorrowafternoon,OK?B:OK.Whereshallwemeet?A:Let’smeetoutsidetheschoolgate.B:Allright.Atthreethirtytomorrowafternoon,outsidetheschoolgate,seeyoulater.A:seeyou.通过这种训练学生会逐渐从单纯的方法模仿,发展到思维模仿,从而激发了学生的创造性思维。在教学中每学完一个对话除了让学生扮演外,还让学生根据所学对话和旧的知识创设情景,自编一个新对话,激发他们的学习兴趣和创造激情。四、看图说话法它不仅能巩固所学的语言知识,还能训练学生的想象力和语言表达能力,开发学生的发散思维能力。如初中第二册Lesson35课文中的图让学生看,根据所学问答的知识编一段对话。A:Excuseme,whereisNo.16MiddleSchool?B:Sorry,Idon’tknow.Askhim,hemayknow.A:Excuseme,whereisNo.16MiddleSchool?C:It’soverthere.Walkalongtheroad,andtakethesecondturningontheright.Thentakethefirstturningontheleft.It’sabout15kilometresaway.Youhadbettertakeabus.A:WhichnumberdoIneed,please?C:Ithinkyouneedanumber12.A:Thanksalot.C:Notatall.五、现行字、词造句法就是从某一词、词组或句型为求异点检查学生的理解和运用,引导学生进行求异思维,训练思维的变通性。如:ondutyWho’sondutytoday?I’m/She’sondutyAreyou/IsLiLei/Aren’tyouondutytoday?I’mnotondutyandyou’reondutytoday.经过实践与探索,学生在课堂上思路开阔,思维活跃,学习成绩明显提高。培养学生创造性思维的方法还有游戏法、竞赛法。做游戏能活跃课堂气氛,深受同学的欢迎。轻松、自由的气氛使学生消除了紧张,让学生在玩中学到知识由被动接受知识转化为开动脑筋主动探索知识,发展创造思维。通过竞赛,迅速联想来训练学生快速的发散思维和求同思维,同时激发学生学习英语的兴趣。创造性教学的重要任务是开发学生的潜能,教师不能独占整个教学活动时间,教师要结合学科教材内容的特点和学生已有知识储备和能力水平有效开展形式多样的课堂教学活动,对学生进行有效的思维方式训练,教师要创设问题情景、启发学习思路,鼓励学生独立思考相互讨论,大胆得出有独创性见解,培养学生的想象能力、发现能力、探索能力和知识迁移能力,使学生的思维有独创性、发散性、广阔性、变通性品质得到有效的训练,使学生了解知识发生、发展、变化的全过程,从而为学生能创造性解决问题奠定基础。互联网经济迅速发展，让信息技术教学本身所承担的责任逐渐加重，而受限于当前的教学体系和政策，初中信息技术教学又陷入了困境。如何有效地摆脱困境，探索出符合中学生性格特征的教学体系，是关系我国未来信息技术教育发展的重要因素。一、初中信息技术教育改革之困境从时间上来讲，我国和世界其他国家一样，是最早进行信息技术教育改革的国家之一，从重视程度上来说，在15年前在我国的大部分中学都获得国家教育资金扶持，建立了属于自己的计算机教育硬件系统。从政策上来讲，我国对于计算机教育的政策与文件系统比英国、苏联以及其他一些国家都更加主动与积极。但计算机教育开展20年来，国家计算机教育不仅没有取得实质性的成果，反而遭遇了严重的中学生网瘾问题和世界上最大的网络游戏玩家群。国家对于互联网教育改革的重视背后，却爆发了意想不到的危机。这不得不让人重新反思我国的信息技术教育改革的道路究竟出了什么问题。1985年美国提出了将计算机教育“工具化”的主张，但是局限于当时世界各国的计算机发展水平，这个主张并没有获得较大回响。进入21世纪之后，各国教育机构在国内普及计算机硬件，使得信息化教学体系的实践成为可能。而这种教学模式在我国的发展结果却相当单一，在中学教学系统中得到广泛普及的也只有技术层次很低的PPT教学。而在这个阶段，日本、俄罗斯、英国、美国等国家则开始系统地研究基于信息技术的教学方法，并将信息技术作为一种现代工具在教学中进行应用。当前世界信息技术教学系统建设已经相当完备，网络远程教学、计算机模拟课堂等多种新的教学模式也渐渐从发达国家流入我国，对我国的传统信息技术教学系统产生影响。而面对过去留下来的“烂摊子”，初中信息技术教学改革究竟何去何从，却仍然成为了一个大难题。二、造成当前初中信息技术教学困境的原因（一）重视程度不足世界各国从20世纪80年代起陆续将计算机教育引入到初中教育体系中，我国也早在1982年就在全国设立了计算机教育实验学校，并在1984年颁布了《中学电子计算机选修课教学纲要（试行）》，但是30年过去了，却没有出台相应的关于信息技术教学的考核与评价体系，使得初中信息技术发展至今仍然停留在一个辅助性专业层次。与中国不同，美国在1983年试行计算机教育之初，就将英语、数学、科学、社会研究和计算机科学定义为基础学科，制定了严格的教育技术和教育目标要求。（二）初中生好玩多动，控制力差初中生的价值观尚未成形，本身好玩多动，约束能力差，对于游戏、电影等娱乐性项目的兴趣浓厚程度要远远高于一些与计算机相关的实用知识。很多地区开设计算机课之后，学生进入教室打开电脑就开始玩游戏，教师下命令让游戏关掉，有些学生还在下面偷着玩。更为严重的是，有的学生因为在课堂上没有过完游戏瘾，下课之后偷偷溜去网吧，沉溺于电子游戏世界，并因此荒废学业，造成计算机教育上的一块“伤疤”。（三）教与学无系统与不同专业学生的信息技术教育专业的教师沟通交流时发现，因为国家统一监管体制不严格和应试教育压力的双重作用，学校和教师不愿意将时间放在一门没有要求、不知道教什么、学生不愿意学的课程上面。虽然学校按照国家规定每周会开设1～2节的信息技术课程，但课堂上随心所欲的现象还是居多。三、我国初中信息技术教学改革的对策（一）要提前打开互联网视野中学信息技术教学出于对中学生学习能力的考虑，所提供的教材和讲授的知识都是最基本的理论知识。例如关于桌面的一些认识，这些知识在学生未来的计算机生涯中是最基本的，但放在课堂上讲，却显得枯燥乏味，所以初中信息技术教学课堂的趣味性就十分重要。互联网所呈现的是一个大世界，在不接触网络游戏这个不安全因素的基础上，我们依然有很多东西可以导入，例如GIF动画设计、艺术字设计、电脑绘画等。这些东西既能够发散学生思维，又有助于学习，而更重要的是能够引起学生的兴趣。在指导大家学习计算机硬件基础知识的时候，笔者给每个小组分配了制作电子板报的任务，学生完成得很好，现在，班上仍然有一些学生在使用这些基本的画图工具，甚至还有一个学生学会了PS软件。所以说，对于互联网教学来说，教学思维要开阔，教学模式要多样。（二）建立考核机制美国、日本、英国是最早将计算机教学列入必修课程的国家，随着计算机技术在世界经济发展中的地位不断上升，丹麦、比利时、卢森堡、希腊、印度、澳大利亚等国家纷纷将计算机列入必修课程。列为必修课程的一个重要的标志就是毕业要考试，因为会影响学生的成绩，所以学校和教师就不得不重视，并竭尽全力来对待。近几年，我国互联网发展迅速，而国内以智能手机行业为主导的信息产业的持续发展，也助推了市场对信息技术人才的持续需求。这也标志着信息技术已经成为影响我国经济未来发展的决定性因素。如果说美国、日本重视信息技术教育是一种经济发展的刚性需要的话，那么中国如今也到了这个时间点。将信息技术列为必修课程是趋势也是需要。（三）建立游戏激励机制中国不是最早遭受网络游戏伤害的国家，在美国推行信息技术教育之初也经历了严重的青少年网游上瘾问题。但在如今的美国信息技术意识中，更多的人只是将计算机当成为一种工具。从进入21世纪开始，美国的Game2Train、微软等公司巨头响应国家关于信息技术教育游戏结合的呼唤，开始教学游戏模型的设计开发。2002年美国麻省理工学院与微软公司开发的“games-to-teach”项目，建立了10个优秀的教学模型，而像Game2Train公司则是长期专注于游戏教育模式的开发，另外还有德克萨斯大学的IC2学院的学子媒体实验室开发的EnterTeach项目等，英国、韩国、日本等也都有类似的项目开展。而在这个领域的设计中，我国的游戏教学工具开发却仍然较为空白，在近些年的儿童教育中才有了初步的发展。游戏教学工具的好处在于通过游戏能够让学生学习到相应的知识，缓解其对游戏的痴迷，减少网瘾的几率，对于初中信息教学改革来说都可谓意义重大。在未来的信息技术改革中，我们应该积极打开视野，以学生兴趣为导向，通过考核机制对学生形成约束，并积极借鉴发达国家的游戏与教学系统的开发，推进我国的初中信息技术教育改革。第二讲基因组序列诠释5.转录物组6.蛋白质组问题细胞周期的不同时期个体发育不同阶段不同的器官和组织不同的外界环境下各种基因的表达与否、量的差异、表达部位如何5.转录物组5.1Northern杂交杂交主要步骤提取总RNA(不同组织、不同器官)变性电泳制备目的基因探针转移尼龙膜(放射性或化学标记法)杂交扫描或放射自显影依据杂交信号的强弱、有无判断基因的表达部位、表达量、表达时期等5.2SAGESAGE(serialsanalysisofgeneexpression基因表达系列分析1995Ve|culescu及其同事年创立SAGE特点:进行转录物组研究,也就是转录水平的研究通过快速和详细分析成千上万个EST来寻找出表达丰度不同的SAG标签序列,从而接近完整地获得基因组的表达信SAGE区别于差异显示、消减杂交等其它技术的主要特点是可用于寻找那些较低丰度的转录物,最大限度地收集基因组的基因表达信息,这使之成为从总体上全面研究基因表达、构建基因表达图谱的首选策略SAGE可用于在不同环境、不同生理状态及不同生长阶段的细胞和组织表达图谱构建,对不同状态下基因表达水平的定量或定性比较,特别是对疾病组织与正常组织的比较发展迅速;SAGE技术的主要理论依据◆来自转录物内特定位置的一小段寡核苷酸序列(911bp)含有鉴定一个转录物特异性的足够信息,可作为区别转录物的标签(tag)令通过简单的方法将这些标签串联在一起,形成大量多联体(concatemer),对每个克隆到载体的多联体进行测序,并应用SAG软件分析,可确定表达的基因种类,并可根据标签出现的频率确定基因的表达风度(abundance)。SAGE步骤叠O1.将5g含有ogd(引物)的磁珠与叠学O2.合成双链CDNA3.用NaI酶消化形成一条链末端有标签的产物4.将样品分成两份,连接成含有识别序cTG仝叠列的产物,以备用BsmF1消化5.用MmeI切割每一个样品形