液体活检参考教学课件

液体活检在肿瘤精准治疗中的研究进展郑秋红福建省肿瘤医院,福建省肿瘤研究所福建省肿瘤生物治疗重点实验室2016.4.21液体活检在肿瘤精准治疗中的研究进展1内容摘要液体活检1)cfDNA&ctDNA&CTC概念和最新研究进展2)液体活检应用和意义二.CTC/CTSC研究方法和进展三.我们的研究内容摘要2液态活检来源于肿瘤组织,存在于血液中循环肿瘤细胞(CTC)循环肿瘤DNA(ctDNA)肿瘤外泌体exosome·提示肿瘤发展进程及抗药性等信息,指导个体化精准治疗copyDiazLAJr,BardelliALiquidBiopsies:GenotypingCirculatingTumorDNA.JslinOncol.2014;32(6)579-586液态活检3cfDNAs·What:循环游离DNA,机体细胞释放入外周血循环后发生部分降解的内源性DNA。高度片段化,约170bp8·Source:正常细胞、异常细胞(如肿瘤细胞),病毒DNA等8·State:半衰期短,动态表达量,核小体以单个、双联或三联的形式进入血液,并逐步分解cfDNA4ctDNA·what:循环肿瘤DNA,是指肿瘤细胞DNA经脱落或细胞凋亡后释放进入循环系统。一种特征性的肿瘤生物标记物,可以被定性、定量和追踪。Source:来源于肿瘤细胞的cfDNA,属于cfDNA的83325种类型。不同患者的水平差异显著,受肿瘤负荷,分期等因素的影响ctDNA5cfdnactDNATumorHealthyinflamedtissueBiologyofreleasemacrakisTumorfractionLowtumorfraction*1%ofClDNAe10%HightumorfractiondPCR(Ref,es,e8DetectonofGIDNACapp-seq(RTAm-Seg(RefWholeMethylomeRef10nicalvalueDiagnosisTrotmanEllenHeitzer,PeterUlz,andJochenB.GeigCirculatingTumorDNAasaLiquidBiopsyforCancer.ClinicalChemistry.2015,112-123cfdnactDNA6ctDNA-高通量测序种种任神APP-Seg(cancerpersonalizedprofilingbydeepsequencing)癌症个体化深度测序分析方法:利用定制化的st目LaerblooddrawblooddrawsNimbleGenSegCapEZChoiceLibraryfE为”筛选器“对样本靶向捕获后再深度测序,灵敏度高,特异性强且经济可行。2:利用数字错误抑制(IDES)的方法和CAPP-SeqCAPP-seq(ctDNA测序方法),能够检测到频率低至0004%的突变等位基因genotyping→monitoringctDNA-高通量测序7cfDNA一片段谱系分析GenomE-wide,invivonucleosomemapfromcelI-freeDNAinplasmDeepsequencingotcirculatingcell-freeDNAyieldsadense,genome-WIdeqnucleosomeoccupancythatenablesidentificationchromatinofitscell-typesoforiginpotentiallyenablingtheIdentiytissues-of-criginofcell-reDNAusingnucleosomemapsnoninvasivemonitoringtissuecontribut△naaxtissuecontributinofabroadersetof□Lymphoid□Myeloid口Maow口■口■)CanceroustssuesMattheww.Snyder,MartinKircher,AndrewJ.Hilletal.Cell-reeDNAComprisesanInVivoNucleosomeFootprintthatInformsItsTissues-Of-Origincell2016Jan14:164(1-2):57-68.cfDNA一片段谱系分析8CTCWhat:循环肿瘤细胞,是指从实体瘤中脱离出来并进入外周血液循环的肿瘤细胞Source:原发肿瘤和转移灶都会释放CTC可检测到的CTC是肿瘤细胞在循环系统微环境下生存竞争的结果39CTC9液体活检应用价值(监测肿瘤特异性突变发现肿PrimarytumorTumorresectionbiopsyEllenHeitzer,PeterUIz,andJochenB.GeigCirculatingTumorDNAasaLiquidBiopsyforCancerClinicalChemistry.2015,112-123液体活检应用价值(监测肿瘤特异性突变发现肿10液体活检参考幻灯片课件11液体活检参考幻灯片课件12液体活检参考幻灯片课件13液体活检参考幻灯片课件14液体活检参考幻灯片课件15液体活检参考幻灯片课件16液体活检参考幻灯片课件17液体活检参考幻灯片课件18液体活检参考幻灯片课件19液体活检参考幻灯片课件20液体活检参考幻灯片课件21液体活检参考幻灯片课件22液体活检参考幻灯片课件23液体活检参考幻灯片课件24液体活检参考幻灯片课件25液体活检参考幻灯片课件26液体活检参考幻灯片课件27液体活检参考幻灯片课件28液体活检参考幻灯片课件29液体活检参考幻灯片课件30液体活检参考幻灯片课件31液体活检参考幻灯片课件32液体活检参考幻灯片课件33液体活检参考幻灯片课件34液体活检参考幻灯片课件35液体活检参考幻灯片课件36液体活检参考幻灯片课件37液体活检参考幻灯片课件38液体活检参考幻灯片课件39液体活检参考幻灯片课件40液体活检参考幻灯片课件41液体活检参考幻灯片课件42液体活检参考幻灯片课件43液体活检参考幻灯片课件44液体活检参考幻灯片课件45液体活检参考幻灯片课件46液体活检参考幻灯片课件47液体活检参考幻灯片课件48液体活检参考幻灯片课件49液体活检参考幻灯片课件50液体活检参考幻灯片课件51液体活检参考幻灯片课件52液体活检参考幻灯片课件53液体活检参考幻灯片课件54液体活检参考幻灯片课件55液体活检参考幻灯片课件56液体活检参考幻灯片课件57液体活检参考幻灯片课件58液体活检参考幻灯片课件59液体活检参考幻灯片课件60液体活检参考幻灯片课件61液体活检参考幻灯片课件62