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rna核质动态分布与蛋白质翻译
1impoin家族在真核细胞运在真核细胞中,核心和骨髓之间进行着强烈的物质运输,其中大部分是由需要蛋白质支撑的主动运输的。核心和核心之间的边界是核膜,在核膜上分布着核面颗粒配合物(nureme)。这是通过蛋白质运输蛋白质和传达个人信息以运输“商品”的方式。在真核细胞中,负责核质运输的蛋白质有许多不同的种类,其中最重要的是imperinimplinimplin根据家族中的代表性蛋白质implin命名为(imp-蛋白质后缀i),包括将目标分子运输到核粒中的implin和离开内核的explin。目标分子与rangdtal.(ras蛋白,24ku)形成化合物,并通过核孔与家族成员分离。此前,在人类细胞中发现了20多名成员,负责运送蛋白素、糖苷元、蛋白质和其他重要分子,如蛋白素。通过这种精确的组织行为,implin家族成员不仅可以通过捕获细胞周期的蛋白质cyclinh、cycline、cdc2等,而且可以干预细胞周期的过程。implin结合微管单体蛋白质,抑制微管的多聚化,限制微管的融合和锤体的形成,阻止微管和针的形成,并确定薄细胞的周期。implin和家人以及核质运输。2在发现tna中发现核质运输路径2.1tin家族的trna运出核tRNA在细胞核内被转录,需要穿越核膜进入细胞质参与蛋白质的翻译.理论上,小于40ku的蛋白质和RNA,如tRNA(25ku,直径6nm),能借助扩散作用自由进出核.1998年发现专一性负责运送tRNA出核的载体蛋白,并命名为exportin-t,“export”+蛋白质后缀“in”,“t”指靶分子为tRNA.Exportin-t是importinβ家族的一员,分子质量为110ku,pI为5.0,这是第一个被发现能直接结合RNA的importinβ家族成员.mRNA,rRNA都是和其他蛋白质形成复合物,被运出核外.exportin-t的作用机理如下:在细胞核内富含RanGTP,exportin-t和tRNA以及RanGTP形成复合物,穿过核孔,进入细胞质.细胞质中有RanGTP水解酶激活蛋白(RanGAP),将RanGTP水解为RanGDP,导致三元复合物解聚,释放出tRNA.Exportin-t最早在哺乳动物细胞中被发现,随后的序列分析在植物和酵母细胞中找到了exportin-t的同源蛋白,说明了这条途径的保守性.随后在高等动物中发现的另一条tRNA核质运输途径可能由exportin-5(136ku)介导.Exportin-5是importinβ家族的另一成员,其主要作用是运输含双螺旋区的miRNA出细胞核,因而也能结合同样含双螺旋区的tRNA,亲和能力远小于miRNA,因而在高等动物的tRNA核质运输途径中的作用很小.在爪蟾卵母细胞中,exportin-t的浓度是tRNA转运出核的限速步骤,说明在高等动物中exportin-t转运是tRNA出核的主要途径.2.2exquit引导tnna优质物质运输,调节蛋白质合成2.2.1trna的修饰和转导发现exportin-t后,德国研究小组深入研究exportin-t和tRNA的结合特性.在细胞核内,tRNA的产物由RNA聚合酶Ⅲ转录.最初的转录产物3′、5′端有多余的核苷酸,一些tRNA序列中间有内含子的存在.由前体tRNA转变为具有精确的5′端和3′CCA尾以及正确的空间结构的tRNA,需要对前体tRNA进行剪切,连接,修饰和3′端加CCA.显然,在核内存在着tRNA前体、tRNA中间体和成熟tRNA等多种tRNA分子.Exportin-t对具有正确三级结构成熟tRNA的结合能力远远大于其他tRNA中间体和前体tRNA,故能优先结合和转运成熟的tRNA出核.体外结合实验表明,和成熟tRNA相比,未修饰的tRNA、5′端有10个多余核苷酸的tRNA、3′端有10个多余核苷酸的tRNA以及5′和3′端各有10个多余核苷酸的tRNA,结合exportin-t的能力分别是成熟tRNA的18%,2.4%,7.2%,0.8%.正常生理条件下,有限的exportin-t在核内只能结合成熟的tRNA,保证了tRNA参与蛋白质翻译tRNA的效率.值得注意的是,在体外结合实验中,具有正确的5′和3′端,但有内含子的tRNA显示了与成熟tRNA相近的结合能力.在哺乳动物细胞核内,tRNA的内含子剪切步骤发生在tRNA末端成熟之前,在正常的环境中,带内含子的tRNA因没有正确的3′CCA末尾不能被运出核.2.2.2成熟trna分子的亲和能力和结合能力Exportin-t能区分成熟tRNA和tRNA中间体的不同.但对于一个真核动物细胞而言,其中存在着40~50种的tRNA分子,转运21种氨基酸进入核蛋白体.Exportin-t对这些不同成熟tRNA分子的亲和能力是否一致?Exportin-t介导的tRNA出核是一个简单的识别运输过程,还是一个可以调控蛋白质合成的途径?Li等用亲和层析方法研究了exportin-t对胎牛肝细胞中所有的tRNA分子的结合能力,实验表明,exportin-t对成熟tRNA分子的结合能力相近,但确实存在差异.某些tRNA分子结合能力强于其他.核蛋白体对不同的tRNA需求强度不同(需求强度可近似为tRNA的浓度与基因组密码子频率的比值),需求强度大的tRNA可能被优先运出.哺乳动物细胞中exportin-t介导的tRNA核质运输途径可能是细胞内调控蛋白质合成的步骤.2.3酵母细胞中trna的转运对tRNA核质运输研究最初集中在爪蟾卵母细胞和哺乳动物细胞.因为酵母体系易于遗传学研究操作,酿酒酵母(Saccharomycescerevisia)很快成为研究tRNA出核转运的重要模式生物.在酵母细胞中,发现了两种转运tRNA出核的途径,一种是氨酰化依赖型的tRNA出核转运途径,tRNA必需结合氨基酸,才能被运出细胞核,这是酵母中主要的转运途径;另一种氨酰化非依赖型的tRNA出核转运途径,成熟的tRNA无需结合氨基酸,被运进细胞质,这条途径由exportin-t同源蛋白Los1p介导,在酵母中敲除los1基因,细胞仍能存活.酵母细胞和高等动物中的tRNA核质运输途径既有共同之处,也存在显著不同.酵母遗传学分析指出,多种蛋白质,包括Cca1p(向tRNA3′端加CCA尾的蛋白质)和Cex1p、Utp8p(目前功能未知)等都参与酵母tRNA核质运输.3trna的核质运输过程长期以来,人们认为tRNA核质运输是从细胞核到细胞质的单向运动.tRNA只是遗传信息由mRNA向蛋白质传递过程中的中间体.然而,近年来,tRNA核质运输领域内的最新研究结果颠覆了这两个传统的观念.3.1trna的逆向转运入核2005年,加拿大和日本的研究小组分别报道了一个令人震惊的发现,在酵母细胞中,tRNA不但被运出细胞核,还以主动运输的方式被运入细胞核内.酵母tRNA剪切去除内含子的步骤发生在细胞质中,而剪切过的成熟tRNA出现在细胞核内.酵母异核体(两个不同的细胞核存在一个细胞中)实验表明,这些tRNA是从细胞质中被逆向运进细胞核.被运回细胞核的tRNA可以是缺陷的tRNA,比如没有3′CCA尾,说明对tRNA的三级结构没有严苛要求.tRNA逆向入核(tRNAretrogradetransport)不需要Ran,说明它和tRNA转运出核为两条不同的途径.进一步的实验表明,tRNA逆向入核是一个需要能量的过程.高等动物和酵母不同,tRNA内含子的剪切发生在细胞核内,似乎没有必要将tRNA从细胞质逆向运回核内.2007年,Shaheen等在大鼠肝细胞中发现了tRNA的逆向转运入核途径.尤其是当氨基酸缺乏时,tRNA被转运入核的现象尤其明显.在高等动物细胞中,营养条件不足以保证正常的蛋白质合成,为了防止错误的翻译,将tRNA转运入核,是细胞调控蛋白质合成的一种手段.保证tRNA分子在适宜的条件下出现在细胞质中参与蛋白质翻译,是一个受到exportin-t及未知tRNA转运入核蛋白精细调控的过程.3.2trna在细胞内累积2007年11月,加拿大学者Ghavidel等在《细胞》杂志(Cell)上发表文章,第一次将酵母细胞中的tRNA核质运输和细胞周期联系在一起.核内DNA损伤后,激活的信号通路蛋白Mec1、Rad53阻止Los1蛋白(酵母中的exportin-t同源蛋白)进入细胞核,导致未剪切的tRNA在核内累积.核内tRNA中间体浓度的上升通过信号传导途径下调细胞周期调控蛋白Gln4,将细胞锁定在G1期.已知G1期是细胞蛋白质合成最活跃的时期,为细胞进入S期开始有丝分裂作准备,G1期的长短与蛋白质合成速率密切偶联.tRNA核内累积下调蛋白质合成速率,延长G1期,避免过早启动有丝分裂.这是一个再次震惊学术界的发现,虽然目前tRNA的核质浓度变化与细胞周期的关系只在酵母细胞中发现,且具体分子机制不明,但其中蕴含的意义极为重要:tRNA在细胞内可能不只是蛋白质合成的参与者,还是细胞命运的调控者.3.3trna的概念曾被认为是简单地运送tRNA进入细胞质的tRNA核质运输(tRNAnuclear-cytoplasmictransport)已经不能描述tRNA核质浓度变化在细胞中所起的作用.2008年,美国Hopper等在《tRNA核质动态分布研究之十年惊奇》综述文章中第一次提出了tRNA核质动态分布(tRNAnuclear-cytoplasmicdynamics)的概念,即“Inthepastdecade,therehavebeenmanyparadigm-shiftingdiscoveriesregardingtRNAnuclear-cytoplasmicdynamics,whichhaveoverturnedlong-heldmodels”.虽然tRNA的生物合成与tRNA的工作地点被分隔在细胞核、细胞质两个区域,但这种分区化并不是死板的,tRNA在细胞核、质间的流动主动地调控蛋白质合成,影响细胞周期,以帮助细胞应对不同的环境压力.4trna核质运输的途径tRNA核质运输领域已有许多重大的发现,但彻底阐明tRNA在细胞内的生活史,有待于进一步地研究回答目前仍悬而未决的问题.a.tRNA逆
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