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文档简介

CH4.GeneTranscriptionandPosttranscriptionalprocesses1/142

GENETICINFORMATION

1.REPLICATION (DNASYNTHESIS)2.TRANSCRIPTION (RNASYNTHESIS)3.TRANSLATION (PROTEINSYNTHESIS)DNARNAPROTEIN2/142RNApolynucleotidechain2’-OHmakes3’,5’phosphodiesterbondunstableDNApolynucleotidechain3/142基因转录特点:1.基因转录是基因表示第一步,也是基因表示调控中最主要步骤;2.部分遗传信息传递,只有部分作为模板,基因转录有时间和空间差异;3.转录中存在链选择、起点和终点选择。4/1424.基因转录只利用DNA双链中一条链作为模板,而另一条链不参加合成过程。模板链为无意义链,互补链为有意义链(编码链)。有意义链无意义链只针对已确定某一基因而言5/142原核生物基因转录1.转录调控因子基因转录控制关键——起始控制控制转录起始原因:起始调控序列(顺式调控元件)——开启子转录因子(反式调控元件)——RNA聚合酶6/142顺式调控元件cisactingelements位于基因周围能与特异转录因子结合而影响转录DNA序列,包含开启子、增强子等反式调控元件transactingfactors与DNA上特异序列结合蛋白因子,对转录起调控作用。如RNA聚合酶7/142RNA聚合酶E.coli中由一个RNA聚合酶催化全部RNA合成(mRNA、tRNA、rRNA和其它小分子RNA)E.coliRNA聚合酶全酶由关键酶(

2、、’、亚基)和亚基组成;关键酶功效:转录合成RNA,与DNA结合(非特异性、松弛),在帮助下识别起始序列。

8/142E.coli聚合酶亚基9/142ProkaryoticRNApolymerasestructureRNApolymeraseofE.coliisamultisubunitproteinSubunit

Number

Role

a 2 uncertainb 1 formsphosphodiesterbondsb’ 1 bindsDNAtemplate

s 1 recognizespromoterand facilitatesinitiationa2bb’sa2bb’+sholoenzymecorepolymerasesigmafactor10/14211/142亚基—催化磷酸二酯键合成

利福平rifampicin和利福酶素rifamycin能结合在亚基上抑制RNA链合成起始而不抑制链延长,阻止第一个磷酸二酯键合成。链酶溶菌素,结合在亚基上,抑制链延伸。’亚基——碱性极强,与DNA模板结合亚基;12/142RNA转录抑制剂13/142亚基——二聚体,可能与开启子识别相关;亚基——不能独立存在,本身无催化活性,当与关键酶结合,引发a2bb’构象改变,改变关键酶与DNA结合亲合性和特异性。(一旦起始识别后,

因子脱落,关键酶才能延伸)E.coli中有各种不一样亚基;亚基在决定RNA聚合酶起始转录中起关键作用

14/14215/142由含

70RNA多聚酶全酶识别经典大肠杆菌开启子16/142

另外,RNA聚合酶可能还有解旋酶和重新螺旋化及校正功效。——全功效酶(识别、解旋、螺旋、聚合延伸、校正等功效)17/1422.转录调控序列开启子promoter操纵基因operator开启子:RNA聚合酶全酶以很高亲合性结合在基因调控区特定位点。原核生物开启子序列-10区和-35区——必需序列18/142开启子结构19/142Promoterstructureinprokaryotes5’PuPuPuPuPuPuPuPuAUGPromoter+1+20-7-12-31-365’mRNAmRNATTGACAAACTGT-30regionTATAATATATTA-10region84795345%82TTG64ACA79T44T96%T95A59A51Aconsensussequences-30-10transcriptionstartsitePribnowbox+1[]20/142-10区:在-6~-13bp之间,共同序列为TATAAT,又称pribnow框,酶在此处与DNA结合成稳定复合物,在转录方向上解开双链形成开放型起始结构。-35区:共同序列为TTGACA,是RNA聚合酶起始识别区,这一识别过程与因子有关。

21/142-10区和-35区相距约20bp,大致是双螺旋绕两周长度,两个结合区在分子同一侧面,能感觉到沟底碱基特异形态。22/142上节回顾:1.DNA损伤修复

2.基因转录基本概念,特点

3.原核生物RNA聚合酶23/1423.转录过程起始:RNA聚合酶全酶识别-35区,再识别-10区,形成封闭型起始复合物转录起始位点处DNA解链,形成开放型起始复合物第一个核苷酸结合上去(多数是G/A、C)合成7-8个核苷酸,起始过程完成24/142RNApolymeraseholoenzyme(+sfactor)

closedpromotercomplex(moderatelystable)thesigmasubunitbindstothe-10regiononceinitiationtakesplace,RNApolymerasedoesnotneedveryhighaffinityforthepromotersigmafactordissociatesfromthecorepolymeraseafterafewelongationreactionselongationtakesplacewiththecoreRNApolymerase

openpromotercomplex(highlystable)theholoenzymehasveryhighaffinityforpromoterregionsbecauseofsigmafactorssigmacanre-bindothercoreenzymesThesigmacycless25/142TranscriptionRNApolymeraseclosedpromotercomplexopenpromotercomplexinitiationelongationterminationRNAproduct26/142延伸:起始结束后,因子脱落,由关键酶沿模板链移动,完成延伸过程。关键酶在DNA链上覆盖大约80bp,其中解链部分只有~18bp,RNA-DNA杂交链长度约12bp,当酶分子离开这一区域向前移动,DNA又形成双链,RNA游离出来。27/142RNA转录延伸期转录泡模型28/14229/142终止:终止序列—DNA上转录到一定位置后,转录停止,又叫终止子。特征:使转录产物产生一个颈环(发夹结构),富含嘌呤,使RNA聚合酶延伸速度减慢,甚至停顿。30/142终止子结构31/1421.不需要ρ因子转录终止——强终止子特点:DNA序列有双重对称,形成末端发夹结构,模板DNA上有一串A,RNA3’端有UUUU,使新合成RNA脱落。

32/142不依赖Rho因子转录终止33/1422.需要ρ因子转录终止终止子后无连续A,在ρ因子作用下,ATP酶水解,释放能量,使新生RNA与模板脱落。34/142依赖Rho因子转录终止35/142终止子:提供转录终止信号一段DNA序列。

终止因子:帮助RNA聚合酶识别终止子蛋白质辅助因子。

36/142转录调控原核生物基因表示调控模型——操纵子模型操纵子operon:由几个相关结构基因及其控制区组成,是基因表示协同单位。操纵子两个类型:诱导型阻遏型37/142诱导型:正常情况下基因不表示或表示水平低,在环境改变或诱导物存在时,才开放转录。(乳糖操纵子、半乳糖操纵子)阻遏型:正常情况下开放,当阻遏物出现时操纵子关闭。(色氨酸操纵子、组氨酸操纵子—组氨酸抑制了组氨酸操纵子表示,防止把原料用于无须要合成。)38/142大肠杆菌乳糖操纵子

由三个结构基因和一个调整基因组成。

Z基因——编码b-半乳糖苷酶Y基因——编码b-半乳糖苷透性酶A基因——编码b-半乳糖苷乙酰化酶调整基因I——编码阻遏蛋白操纵基因O39/142lacIPOpromoter-operatorlacrepressorlacZlacYlacAThelactoseoperoninE.colib-galactosidasepermeaseacetylaseLACTOSEGLUCOSE+GALACTOSEb-galactosidasethefunctionofthelactose(lac)operonistoproducetheenzymesrequiredtometabolizelactoseforenergywhenitisrequiredbythecellpromoterbindsCAPandRNApolymeraseoperatorbindsthelacrepressor40/142诱导表示:当培养基中无乳糖及其它诱导物时,抑制基因表示产生阻遏蛋白,与操纵基因结合,阻止结合在开启子上RNA聚合酶向前移动,转录不能进行;当培养基中有乳糖及其它诱导物时,诱导物与阻遏蛋白结合而不能与操纵基因结合,基因转录。41/14242/142葡萄糖效应:当细菌在含有葡萄糖和乳糖培养基中生长时,通常优先利用葡萄糖而不利用乳糖;只有当葡萄糖耗尽后,经一段停滞期,在乳糖诱导下b-半乳糖苷酶开始合成,细菌才能充分利用乳糖现象。大肠杆菌生长在含葡萄糖培养基上时,b-半乳糖苷酶等分解代谢活性很低,研究发觉cAMP能解除葡萄糖阻遏作用。43/142CAP-环腺苷酸受体蛋白cAMP-环腺苷酸环化酶当CAP与cAMP结合后酶被活化,作用于开启子前CAP结合位点上,使RNA聚合酶轻易结合到开启子上,促进转录进行。44/14245/142Regulationofthelactoseoperon-negativecontrollacIPOpromoter-operatorlacrepressorlacIPlacZlacYlacAtherepressortetramer

bindstotheoperatorandpreventsRNApolymerasefrombindingtothepromoterlacZlacYlacANOTRANSCRIPTIONRNApolRNApolymeraseisblockedfromthepromoter46/142NOTRANSCRIPTIONwhenlactosebecomesavailable,itistakenupbythecellallolactose(anintermediateinthehydrolysisoflactose)isproducedonemoleculeofallolactosebindstoeachoftherepressorsubunitsbindingofallolactoseresultsinaconformationalchangeintherepressortheconformationalchangeresultsindecreasedaffinityoftherepressorfortheoperatoranddissociationoftherepressorfromtheDNAAlleviationofnegativecontrol-actionoftheinducerofthelacoperonallolactoselacIPlacZlacYlacAlacIPlacZlacYlacAIPTG(isopropylthiogalactoside)isalsousedasa(non-physiological)inducer47/142lacIPlacZlacYlacANOTRANSCRIPTIONRNApolOrepressor(withboundallolactose)dissociatesfromtheoperatornegativecontrol(repression)isalleviated,however...RNApolymerasecannotformastablecomplexwiththepromoter48/142lacIPOlacZlacYlacARegulationofthelactoseoperon-positivecontrolinthepresenceofbothlactoseandglucoseitisnotnecessaryforthecelltometabolizelactoseforenergyintheabsenceofglucoseandinthepresenceoflactoseitbecomesadvantageoustomakeuseoftheavailablelactoseforenergyintheabsenceofglucosecellssynthesizecyclicAMP(cAMP)cAMP1servesasapositiveregulatorofcataboliteoperons(lacoperon)cAMPbindsthedimericcAMPbindingprotein(CAP)2bindingofcAMPincreasestheaffinityofCAPforthepromoterbindingofCAPtothepromoterfacilitatesthebindingofRNApolymerase

1

cAMP=3’,5’cyclicadenosinemonophosphateactiveCAPinactiveCAPcAMP+NOTRANSCRIPTION2

alsotermedcataboliteactivatorprotein49/142lacIlacrepressorlacZlacYlacAb-galactosidasepermeaseacetylaseRNApolTRANSCRIPTIONANDTRANSLATIONOCCURinactiverepressorActivationoflacoperontranscriptionthefunctionofthelactose(lac)operonistoproducetheenzymesrequiredtometabolizelactoseforenergywhenitisrequiredbythecell50/14251/142半乳糖苷酶基因表示条件:CAP结合位点——CAP与cAMP结合,使RNA聚合酶识别-35和-10区;开启子识别——RNA聚合酶识别开启子序列;操纵基因——阻遏蛋白结合乳糖或类似物52/142结构基因转录调控方式:负调控——没有调整蛋白时操纵子内结构基因表示,加入调整蛋白后操纵子内结构基因活性被关闭。(阻遏蛋白对乳糖操纵子负调控)正调控——没有调整蛋白时结构基因活性关闭,加入调整蛋白后结构基因活性被开启。(cAMP-CAP是一个正调整因子)53/142调控序列:转录调控因子:开启子:-10、-35区RNA聚合酶(

)操纵基因阻遏蛋白CAP结合位点CAP+cAMP终止序列ρ因子54/142真核生物基因转录特点:1.转录开启子结构复杂,不一样类型RNA有不一样开启序列;2.各种RNA聚合酶转录不一样RNA产物;3.多个调整因子参加转录调整;4.转录和翻译在时间和空间上分隔,转录后存在广泛加工。55/142RNA聚合酶1.种类真核生物中有三种RNA聚合酶(RNA聚合酶I、II、III),每一个RNA聚合酶转录不一样RNA产物。酶酶活产物RNA聚合酶I50-70%rRANRNA聚合酶II20-40%hnRNA(mRNA前体)RNA聚合酶III~10%tRNA和snRNA56/142真核生物三种RNA聚合酶比较57/1422.RNA聚合酶没有全能性,必需有转录因子参加才有活性。3.特异性不一样RNA聚合酶所识别开启子结构不一样。RNA聚合酶I——类型IRNA聚合酶II——类型IIRNA聚合酶III——类型III

58/142RNA聚合酶I:由2~13个亚基组成,其中最大亚基约1670个氨基酸组成,含有结合模板-RNA链和转录延伸作用,位于核仁,转录rRNA,反抗生素a-鹅膏蕈碱不敏感。RNA聚合酶II:约550~650KD,8~11个亚基,对低浓度a-鹅膏蕈碱敏感。RNA聚合酶III:含锌蛋白质,由9~15种亚基组成。59/142真核生物基因转录调控区1.类型I基因调控区RNA聚合酶I作用区域,产物rRNARNA聚合酶I只合成一个产物(40sRNA—未经加工rRNA初始转录产物),只识别一个开启子区和一个终止信号,能有效转录有活性rRNA基因,其活性是三种RNA聚合酶中最高。

rDNA40sRNA18s、5.8、28srRNA加工RNApolI转录60/142研究发觉,不一样真核生物rRNA转录起始位点邻近序列完全不一样——RNA聚合酶I开启子区有较大变异。rRNA基因含有转录种属特异性。61/142rRNA基因特点:以基因家族、基因簇形式串联排列,外显子较为保守,内含子长度和序列有较大差异。18S、28S,5.8SrRNA拷贝区ETS区ITS区NTS(IGS)——开启子区rRNA前体62/14263/142NTS区作用:转录起始识别含开启子序列——关键元件人位于-45~+20小鼠-39~+9

3’端含增强子——-150~-170bp间上游调控区(UCE)5’端转录终止序列包含了起始位点,决定转录起始显著增强关键开启子转录活性,决定转录强弱64/14265/142非洲爪蟾非转录区结构66/142类型II基因调控区:由三部分组成关键元件区:——决定是否转录由-30bp左右TATAbox和起始位点(INR)组成上游调控区UPE:具各种调控元件CCAAT框、GC框、GCCACACCC框等,含其中一个或各种,决定转录强弱(转录活化和转录起始频率),开启子强弱起决于UPE类型。决定转录起始选择,绝大多数真核基因正确表示所必需确定真正起始位点67/14268/142Sequenceelementswithinatypicaleukaryoticgene1GCTATACAATGC-25-50-80-95-1301

basedonthethymidinekinasegeneoctamertranscriptionelementpromoterTATAbox(TATAAAA)

locatedapproximately25-30bpupstreamofthe+1startsitedeterminestheexactstartsite(notinallpromoters)bindstheTATAbindingprotein(TBP)whichisasubunitofTFIIDGCbox(CCGCCC)

bindsSp1(Specificityfactor1)CAATbox(GGCCAATCT)

bindsCTF(CAATboxtranscriptionfactor)Octamer(ATTTGCAT)

bindsOTF(Octamertranscriptionfactor)+1ATTTGCAT69/142调控区模块模型(调控因子模块)调控区由一些独立功效元件组成,每个单元约7~20bp小段,这些序列又称模块(元件)。每个元件能够与一个或各种转录调控因子结合,多个元件组合组成某个基因调控区。开启子:多个元件,从特定位点以一定方向指导RNA合成;增强子:若干元件作为整体促进远端转录。70/142RNA聚合酶II开启子71/142远端调控区:位于转录起始位点更上游;如β–珠蛋白基因远端调控区在-1300—-3300间增强子:使与它连锁基因转录频率显著增强DNA序列,作为基因表示主要调整元件。特点:1.增强效应显著(10–200倍);2.增强效应与其位置和取向无关;3.大多为重复序列,普通50bp;

72/1424.增强效应有严密组织和细胞特异性,只有特定蛋白质(转录因子)参加才能发挥其功效;5.没有基因专一性。作用机制:经过改变模板DNA整体结构(影响DNA-Pro复合物结构或改变DNA超螺旋密度)eg.形成Z-DNA,增强子才有功效。一个增强子并不限于促进某一特殊开启子转录,它能刺激附近任一开启子。73/14274/14275/142类型III——tRNA、5srRNA、小分子RNARNA聚合酶III转录产物都是短RNA,不编码蛋白质,以RNA形式执行生物学功效,多数作为蛋白质合成机器组分(tRNA)tRNA基因结构特点:串联重复排列,多拷贝。开启子有三种类型:基因内开启子基因外开启子混合开启子76/142基因内开启子:转录起始识别区位于转录区域内部,转录起始频率由转录起始位点负责。5srRNA基因开启子(A、C框)位于+55~+80bp之间非洲爪蟾tRNA基因开启子位于+8~+72间,其中A框+8~+30,B框+51~+72。77/14278/1425SrRNA基因开启子在转录区内79/142基因外开启子:位于转录序列上游TATA结构——类似于类型ⅡTATA框近端序列元件PSE–60bp远端序列元件DSE–250bp(增强子)混合开启子:含有基因内和基因外混合开启子元件。如:海胆硒代半胱氨酸tRNA基因80/142真核生物基因转录因子真核生物RNA聚合酶不含有全能性,需严格依赖一些蛋白因子才能识别并结合到开启子特定序列上,开启转录反应(调控区模块模型—每一个元件都是一个或各种蛋白因子特异识别序列——一个元件叫一个模块,很多模块组成一个调控区)。81/142转录因子通用转录因子/普遍性转录因子主要与开启子关键元件TATA框结合,是同类基因转录都必须转录因子,如TFⅡA、B、D、E等。转录调控因子与上游调控区和远端调控区(增强子)结合,影响转录水平,在一些特定基因转录中起作用。(不一样基因特殊转录调控因子)转录因子:以反式作用影响转录因子。82/142

转录因子普通有两种结构域,一个是与DNA特异序列结合结构域;一个是与相邻蛋白质结合结构域。如:亮氨酸拉链结构、锌指结构有蛋白因子只含有蛋白质相互作用结构域,在两种不一样蛋白质间起桥梁作用。83/142亮氨酸拉链模型及它在转录因子两个分子二聚体化中作用84/142二聚体化转录因子C/EBP亮氨酸拉链和DNA结合结构域结构模型85/142三类基因转录因子1.类型IrRNAUBF上游结合因子与上游调控元件UCE结合SL1与关键元件结合,含有种属特异性,能使RNA聚合酶I正确与起始位点结合,作用类似于σ因子,又叫“定位因子”TFIARNA聚合酶I激活因子86/14287/142UBF与UCE结合,SL1与UBF结合,使UBF向前移动改进UBF与关键元件结合,形成一个跨越关键元件—UCE蛋白质-DNA复合体RNA聚合酶I结合上去,形成开放性起始复合物转录开始88/142类型Ⅲ基因转录因子tRNA、5sRNA、SnRNA

普遍性转录因子:TFⅢB、C转录调控因子:TFⅢA——卵母细胞5sRNA特异蛋白因子A框TFⅢBTFⅢCTFⅢARNApolⅢ

激活因子增强子结合因子使RNApolⅢ正确定位于起始位点89/14290/142类型Ⅱ基因转录因子TFⅡA、B、D、E等91/142类型Ⅱ基因调控区域与各种转录因子结合位置92/14293/142类型Ⅱ基因转录起始94/14295/14296/142转录终止:当前对真核基因转录了解较少,RNApolⅠ转录产物是大分子RNA,经剪切加工成成熟rRNA;RNApolⅡ初级转录产物经加工后为mRNA;RNApolⅢ体外转录与体内转录产物含有相同末端,所以是研究真核基因转录终止很好对象。

97/142

SV40终止有类似与大肠杆菌转录终止子(不依赖于p因子),转录产物形成发夹结构,末端有一串U,终止序列产物中有特定剪切和修饰信号。98/142真核基因转录后加工

1.真核基因转录产物特点:含内含子,需经剪接去除;需要修饰(加帽、加尾,稀有碱基);转录和翻译是两个相对独立过程。

2.加工类型:加帽、加尾修饰——甲基化、酰基化剪接RNA编辑99/1423.RNA加工意义:活化——使无活性前体RNA加工成有活性成熟RNA;(rRNA、tRNA剪接、修饰)改变基因编码产物——同一转录产物,不一样剪接方式,编辑方式,蛋白产物不一样;调整方式——加工会影响RNA活性、半衰期、运输等,影响RNA功效发挥;100/142StepsinmRNAprocessing(hnRNAistheprecursorofmRNA)capping(occursco-transcriptionally)cleavageandpolyadenylation(formsthe3’end)splicing(occursinthenucleuspriortotransport)exon1intron1exon2capcapcappoly(A)cappoly(A)Transcriptionofpre-mRNAandcappingatthe5’endCleavageofthe3’endandpolyadenylationSplicingtoremoveintronsequencesTransportofmaturemRNAtothecytoplasm101/142加帽(Cap0、CapI、CapII三种帽子结构)在细胞核中进行,hnRNA5’端常为GTP,帽子化过程后,形成m7G5’ppp5’Np结构。5’帽子功效:保护mRNA免受5’-核酸外切酶降解;使mRNA进入细胞质;对翻译起识别作用(m7G5’ppp5’Np优先与核糖体结合)。102/142三种帽结构103/142三种帽结构104/142初级转录物切除与多聚腺苷酸化105/142Cappingoccursco-transcriptionallyshortlyafterinitiationguanylyltransferase(nuclear)transfersGresidueto5’endmethyltransferases(nuclearandcytoplasmic)addmethyl groupsto5’terminalGandattwo2’ribosepositionson thenexttwonucleotidescappinginvolvesformationofa5’-5’triphosphatebondcapfunctionprotects5’endofmRNA(increasesmRNAstability)requiredforinitiationofproteinsynthesispppNpNmGpppNmpNm106/142Polyadenylationcleavageoftheprimarytranscriptoccursapproximately10-30nucleotides3’-wardoftheAAUAAAconsensussitepolyadenylationcatalyzedby

poly(A)polymeraseapproximately200adenylateresiduesareaddedpoly(A)isassociatedwithpoly(A)bindingprotein(PBP)functionofpoly(A)tailistostabilizemRNAmGpppNmpNmAAUAAAmGpppNmpNmAAUAAAAAAAAA3’cleavagepolyadenylation107/142编码蛋白质结构基因在核浆中被转录,RNA分子很大,且很不稳定,因为大小很不一致,称为核内不均一RNA(hnRNA),其中mRNA是由hnRNA加工成。hnRNA25%——mRNA75%——在核内降解hnRNA先加帽,hnRNA尾端被切去一段后,加poly(A)尾,切除内含子成为mRNA,进入细胞浆内。108/142剪接——把断裂基因转录本中内含子除去真核生物基因是断裂基因(splitgene)外显子(exon)与内含子(intron)内含子剪接方式自我剪接(由RNA分子本身完成):Ⅰ型Ⅱ型剪接体SnRNP参加——mRNA酶蛋白参加剪接——tRNA109/142-珠蛋白mRNA与基因杂交-珠蛋白pre-mRNA与基因杂交110/142鸡卵清蛋白mRNA与基因杂交图111/142自我剪接Ⅰ型内含子rRNA特点:需要鸟苷酸参加(GTP、GMP、GDP),G2’或3’-OH对5’端剪接点亲核攻击,经过构象上拉力或电子丢失,使剪接点上链减弱和断裂。此反应不需要ATP,由GTP提供能量,RNA有自行剪接能力,又称本身催化作用。

核酸酶Ribozyme——含有催化活性RNA分子。112/142GroupI内含子剪接113/142四膜虫rRNA自我剪接114/142Ⅱ型内含子剪接过程:离下游外显子7~8bp处有一分支点A,A3’-OH进攻外显子5’端磷酸,使剪接点上链断裂。此反应不需要鸟苷酸参加115/142ChemistryofmRNAsplicingtwocleavage-ligationreactionstransesterificationreactions-exchangeofone phosphodiesterbondforanother-notcatalyzedby traditionalenzymesbranchsiteadenosineforms2’,5’phosphodiesterbond withguanosineat5’endofintronG-p-G-UA-G-p-G2’OH-A-5’3’intron1exon1exon2Pre-mRNAFirstclevage-ligation(transesterification)reactionbranchsiteadenosine116/142G-OH3’A-G-p-GU-G-5’-p-2’-A5’3’AAO-G-p-G5’3’U-G-5’-p-2’-AA3’G-ASplicingintermediateLariatexon1exon1exon2exon2intron1intron1Secondclevage-ligationreactionSplicedmRNAligationofexonsreleaseslariatRNA(intron)117/142GroupII内含子剪接118/142剪接体剪接——真核mRNA前体内含子剪接

hnRNA3’和5’剪接点含有保守结构序列,提供了正确剪接信号。哺乳动物或酵母mRNA剪接只有形成剪接体后才能进行。剪接体——包含mRNA前体、细胞核小分子RNA(snRNA)和蛋白因子组成复合体。细胞核小分子核糖核蛋白snRNP

119/142真核生物内含子5’剪接位点和3’剪接位点保守次序120/142snRNP最少有五种:U1——与5’剪接点结合U2——与内含子分支点结合U4/U6

U5——与3’剪接点结合121/142剪接过程:U1与5’剪接点结合,U2与分支点结合,U4/U6复合物结合,形成完整“剪接体”

5’剪接点被切开,形成5’-外显子和套索中间产物U4离开剪接体,3’剪接点切开两个外显子共价连接,形成成熟mRNA和套索状内含子122/142RecognitionofsplicesitesinvariantGUandAGdinucleotidesatintronendsdonor(upstream)andacceptor(downstream)splicesites arewithinconservedconsensussequencessmallnuclearRNA(snRNA)U1recognizesthe donorsplicesitesequence(base-pairinginteraction)U2snRNAbindstothebranchsite(base-pairinginteraction) Y=UorCforpyrimidine;N=anynucleotideG/GUAAGU..................…A.......…YYYYYNYAG/Gdonor(5’)splicesiteacceptor(3’)splicesitebranchsiteU1U2123/142Spliceosome-assemblyofthesplicingapparatussnRNAsareassociatedwithproteins(snRNPsor“snurps”)splicingsnRNAs-U1,U2,U4,U5,U6antibodiestosnRNPsareseenintheautoimmune diseasesystemiclupuserythematosus(SLE)G-p-G-UA-G-p-G2’OH-A-5’3’intron1exon1exon2SpliceosomeassemblyStep1:bindingofU1andU2snRNPsU1=hnRNPproteinsU2124/142G-p-G-UA-G-p-G2’OH-A-5’3’intron1exon1exon2Step2:bindingofU4,U5,U6U1U5U2U4U6G-p-G-UA-G-p-G2’OH-A-5’3’intron1exon1exon2Step3:U1isreleased,thenU4isreleasedU5U2U6125/142G-p-G5’3’U-G-5’-p-2’-AA3’G-Aintron1mRNA2’OH-AU5U2U6Step4:U6bindsthe5’splicesiteandthetwosplicingreactionsoccur,catalyzedbyU2andU6snRNPs126/142SnRNA参加mRNA前体剪接127/142自我剪接与剪接体催化剪接比较128/142酶蛋白参加——tRNA前体剪接tRNA前体内含子中有一段与tRNA反密码子互补序列,因而使反密码臂构象发生了改变——反密码臂伸长了很多;tRNA前体剪接中需要核酸内切酶和RNA连接酶

129/142tRNA前体加工130/142剪接过程:

特异性RNA内切酶识别内含子二级结构,将两侧磷酸二酯键切开,形成5’-OH和3’-P;(不需ATP)两个tRNA半分子碱基互补配对,形成成熟tRNA构象,RNA连接酶形成磷酸二酯键(需要ATP)131/142132/142mRNA不一样剪接产物在一些生物中,在不一样分化时期,RNA种类无区分,基因表示差异靠加工实现,如海胆卵母细胞。不一样剪接方式:产物中少一个外显子;产物中外显子不一样;内含子保留;5’剪接点改变;

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