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文档简介
R语言分段回归数据数据分析案例报告
#读取数据
data=read.csv("artificial-cover.csv")
#查看部分数据
head(data)##tree.covershurb.grass.cover
##113.216.8
##217.221.8
##345.448.8
##453.658.7
##558.555.5
##663.347.2#######先调用spline包
library(splines)
###########用lm拟合,主要注意部分是bs(age,knots=c(...))这部分把自变量分成不同部分
fit=lm(tree.cover~bs(shurb.grass.cover,knots=c(25,40,60)),data=data)
############进行预测,预测数据也要分区
pred=predict(fit,newdata=list(shurb.grass.cover=data$shurb.grass.cover),se=T)
#############然后画图
plot(fit)#可以构造一个相对复杂的LOWESS模型(span参数取小一些),然后和一个简单的模型比较,如:
x<-data$shurb.grass.cover
y<-data$tree.cover
plot(x,y,type="l",col=2)fit3=loess(y~x,span=0.2)
fit4=loess(y~1+x+I(x>30)+I((x-30)*(x>30)),
span=1,degree=1)
par(mar=c(4,4,0,0),family="serif",mgp=c(2,1,0))
plot(x,y,pch=20,col="darkgray")
lines(x,fitted(fit3),lwd=2,col=2)
lines(x,fitted(fit4),lwd=2,lty=2)
library(ggplot2)##Warning:package'ggplot2'wasbuiltunderRversion3.3.3qplot(x,y)+geom_smooth()#总趋势##`geom_smooth()`usingmethod='loess'qplot(x,y,group=x>30)+geom_smooth()+theme(panel.background=element_rect(fill='white',colour='black'))#按30前后分组##`geom_smooth()`usingmethod='loess'#其他数据
#读取数据
data=read.csv("其他数据.csv")
#查看部分数据
data=data[,1:4]
head(data)##yearSoilvegetationSEM
##11999-3.483724-2.5288362.681003
##21999-3.452582-2.4180492.348640
##31999-3.350827-2.5905522.696037
##41999-3.740395-2.9338483.627112
##51999-3.465906-2.6942112.333755
##61999-3.381802-2.7881542.656276#####因变量Soil
#######先调用spline包
library(splines)
###########用lm拟合,主要注意部分是bs(age,knots=c(...))这部分把自变量分成不同部分
fit=lm(Soil~bs(vegetation,knots=c(-2,0,1)),data=data)
############进行预测,预测数据也要分区
pred=predict(fit,newdata=list(vegetation=data$vegetation),se=T)
#############然后画图
plot(fit)#可以构造一个相对复杂的LOWESS模型(span参数取小一些),然后和一个简单的模型比较,如:
x<-data$vegetation
y<-data$Soil
plot(x,y,type="l",col=2)fit3=loess(y~x,span=0.2)
fit4=loess(y~1+x+I(x>0)+I((x-0)*(x>0)),
span=1,degree=1)
par(mar=c(4,4,0,0),family="serif",mgp=c(2,1,0))
plot(x,y,pch=20,col="darkgray")
lines(x,fitted(fit3),lwd=2,col=2)
lines(x,fitted(fit4),lwd=2,lty=2)library(ggplot2)
qplot(x,y)+geom_smooth()+theme(panel.background=element_rect(fill='white',colour='black'))#按30前后分组##`geom_smooth()`usingmethod='loess'#总趋势
qplot(x,y,group=x>0)+geom_smooth()+theme(panel.background=element_rect(fill='white',colour='black'))#按30前后分组##`geom_smooth()`usingmethod='loess'#按0前后分组
#####因变量SEM
#######先调用spline包
library(splines)
###########用lm拟合,主要注意部分是bs(age,knots=c(...))这部分把自变量分成不同部分
fit=lm(SEM~bs(vegetation,knots=c(-2,0,1)),data=data)
############进行预测,预测数据也要分区
pred=predict(fit,newdata=list(vegetation=data$vegetation),se=T)
#############然后画图
plot(fit)#可以构造一个相对复杂的LOWESS模型(span参数取小一些),然后和一个简单的模型比较,如:
x<-data$vegetation
y<-data$SEM
plot(x,y,type="l",col=2)fit3=loess(y~x,span=0.2)
fit4=loess(y~1+x+I(x>0)+I((x-0)*(x>0)),
span=1,degree=1)
par(mar=c(4,4,0,0),family="serif",mgp=c(2,1,0))
plot(x,y,pch=20,col="darkgray")
lines(x,fitted(fit3),lwd=2,col=2)
lines(x,fitted(fit4),lwd=2,lty=2)library(ggplot2)
qplot(x,y)+geom_smooth()+theme(panel.background=element_rect(fill='white',colour='black'))#按30前后分组##`geom_smooth()`usingmethod='
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