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文档简介
第六章DNA的损伤与修复DNA的复制是高保真的,但在有少量错误;理化因素损害。如不纠正,可导致突变/死亡。第一节DNA损伤的来源(包括碱基脱落、碱基改变、碱基错配、链交联及断裂等)
一、碱基脱落
1、酸和热→糖苷键→碱基脱落,
2、变异的碱基被DNA糖基化酶切除去,产生无嘌呤/嘧啶的位点(AP位点);
3、生理情况碱基会自发性脱落。6章DNA的损伤与修复二、碱基改变理化因素导致嘧啶间替换,或嘌呤间替换1、烷化剂:硫酸二甲酯、甲烷磺酸甲酯等烷化剂与碱基中的亲核基团作用生成烷基化碱基,使链内或链间的胞嘧啶交联,阻断复制、转录等过程。2、亚硝酸:甲基化的胞嘧啶→脱氨→T,与A配胞嘧啶→脱氨→U,与A配3、碱基类似物:5-溴尿嘧啶(Br-U)的酮式与T相似,可与A配对;变为醇时则与C相似,也能与G配对,结果使A:T→G:C2-氨基嘌呤为A的类似物,正常时与T配,但也可与C配,使原AT对转换为GC对6章DNA的损伤与修复----------A------------------G--------------------T------------------U------------------------A-------------------------U--------------------------G--------------------------C---------------------G-------------------A-------------------C-------------------U----------亚硝酸亚硝酸:GC对变AT对6章DNA的损伤与修复:G5-BrU(B)的醇式,与G配BrOHHO5-BrU的酮式,与A配:ABrHOAGCTBCCTATCGAGGGATAGCTTCCTATCGAAGGAT1stroundofreplicationAGCTBCCTATCGAAGGATAGCTCCCTATCGAGGGAT2nd碱基类似物:AT对变GC对AGCTTCCTATCGAAGGATAGCTBCCTATCGAAGGATBaseanalogincorporation6章DNA的损伤与修复:G5-BrU的醇式,与G配BrOHHO5-BrU的酮式,与A配:ABrHO6章DNA的损伤与修复三、碱基的错配:由突变基因编码有缺陷的聚合酶,核酸酶或其它蛋白质,易导致碱基发生错配。1、碱基的缺失、插入:吖啶类、溴乙锭等为扁平分子,易嵌入DNA的碱基平面间,致使复制、重组过程中碱基的缺失或插入。原因:使聚合酶在复制过程中发生滑移,如在模板链滑移(打滑)易造成缺失,在生长链上易造成插入。6章DNA的损伤与修复6章DNA的损伤与修复2、胸腺嘧啶二聚体:紫外线照射使一条链上相邻的嘧啶,尤其是胸腺嘧啶形成环丁基二聚体,阻碍链间的正常碱基配对。6章DNA的损伤与修复6章DNA的损伤与修复四、链的断裂:辐射、博莱霉素等,使单股或双股DNA的磷酸二酯键断裂、脱氧核糖裂解;机体代谢产生氧自由基,使链断裂6章DNA的损伤与修复五、DNA链的交联:烷化剂、丝裂霉素、光活化补骨脂素等,使DNA链间交联氮芥使二条链间的鸟嘌呤形成共价键光敏植物(芹菜、芫荽、莴苣等)产“呋喃香亚素”,最有名的“补骨脂素”。分子量很小,可穿透皮肤到达DNA。紫外线照射后与DNA结合6章DNA的损伤与修复第二节、DNA的修复系统一、直接修复:1、二聚T:几乎所有生物都有光复活酶(DNA光解酶),使嘧啶二聚体在可见光(300-600nm)存在下分解为单体。机制:酶先与二聚T结合成复合物,复合物吸收可见光切断胸腺嘧啶二聚体之间的两个C-C键,使二聚T变为单体,酶释放。
(二聚T)光复活酶6章DNA的损伤与修复2、烷基化的碱基:在O6-甲基鸟嘌吟转甲基酶的作用下将O6-甲基鸟嘌吟上的甲基转移到酶分子上的半胱氨酸残基而修复。6章DNA的损伤与修复
包括2种:
碱基的切除修复
片段的切除修复(二)切除修复6章DNA的损伤与修复BaseexcisionrepairDNAglycosylasescleavesN-glycosylicbondAPendonucleasecleavesapurinicor apyrimidinicsiteDNApolymeraseI5’3’exonucleaseactivity &polymeraseactivityDNAligase1、碱基的切除修复6章DNA的损伤与修复片段的切除修复步骤多,先切除含错配碱基在内的片段,再以另一条链为模板,合成新的DNA
大肠杆菌主要有核酸内切酶(UvrABC)、PolI、连接酶等步骤:UvrABC:在错配的碱基(包括二聚T)的两侧各做一个切口,切下含损伤在内的12bp单链片段,留下的缺口由PolI修补,由DNA连接酶连接。6章DNA的损伤与修复据模板的遗传信息修复错配的碱基。关键——区分模板链和新生链。大肠杆菌中由错配修复系统,识别子代链,依据是甲基化。
E.coli中DNA的GATC序列中A的N6都是甲基化的(DAM甲基化催化),复制后短时间内子代链DNA未来得及甲基化,可区分模板链和新合成链,并将新生链上错配的碱基切除。(三)错配修复-CH3N-糖苷键6章DNA的损伤与修复包括多种酶:Dam甲化酶,MutH,MutL,MutS(矫正酶,错配修复酶),解旋酶III,SSB,PolIII,核酸外切酶,连接酶等。错配修复发生在GATC的邻近处(如GAmTC1kb以内)MutH酶于子链GATC中G的5`外侧切,成为待修复的标志,1)当错配位点于切割点的5`-侧时(右图),未甲基链按3`→5`方向由核酸外切酶降解直至错配碱基在内,再由PolIII以模板链为据合成新链;2)当错配位点于切割点的3`-侧时,由核酸外切酶VII或RecJ蛋白按5`→3`方向降解未甲基链,直至包含错配碱基在内。6章DNA的损伤与修复TGTCTGCGCCCATCGATCCCTTTGTCTATCCTCGACCATGGCGACAGACGCGGGTAGCTAGGGAAACAGATAGGGGCTGGTACCGCTGTCTGCGCCCATCCATGGCGACAGACGCGGGTAGCTAGGGAAACAGATAGGGGCTGGTACCGCGATCCCTTTGTCTATCCTCGACTGTCTGCGCCCATCGATCCCTTTGTCTATCCTCGACCATGGCGACAGACGCGGGTAGCTAGGGAAACAGATAGGGGCTGGTACCGC6章DNA的损伤与修复DNA复制的模板如有损伤,则复制受抑制。要用重组修复系统。作用机制:先复制后修复。当复制到损伤部位时,此时复制跨越损伤部位,继续在其下游约1Kb重新开始复制。新生子链的缺少部分,由互补链的相应片段转移到缺口处,损伤部位随后由切除修复修复。重组修复涉及多种酶,其中最重要的是RecA蛋白。创伤重组重组的亲代DNA修复后的亲代DNA修复(四)重组修复6章DNA的损伤与修复6章DNA的损伤与修复此修复为旁路
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