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文档简介
®ceRNA调控基础—microRNA与lncRNA解螺旋
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知识金牌解
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牌本期课程解
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长“经典”的ceRNA理论 知
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牌以microRNA为核心故事发生在胞浆中故事从MRE开始MRE即miRNA反应元件(miRNA
response
elements)
是各类RNA上可以被miRNA结合的一小段序列区域mRNA、lncRNA或者cricRNA竞争性地与microRNA结合发生ceRNA的RNA分子其表达趋势较一致解
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牌“经典”的ceRNA理论Leonardo
Salmena
et.al,2011,Cell右图X、Y分别为有ceRNA的两种RNA分子3种MRE分别显示Y分子表达量不同时的ceRNA关系Y高表达,使得X保留,XY表达趋势一致Y低表达,使得miR抑制X表达,XY表达趋势一致解
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牌miR海绵Thomson&Dinger,Nature
Reviw
Genetics,
2016解
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牌ceRNA机制中的lncRNA机制miRNA与lncRNA结合,形成miR-Sponge抑制miRNA对mRNA的结合从而上调mRNA的表达前提这一切发生在细胞质中知
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牌NGS/microarray功能研究选取候选lncRNA表达水平验证(qPCR等)机制研究miR生物信息学临床样本信息ceRNA网络干扰/敲除/过表达互作实验RIP/FISH等解
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长细胞实验组织实验动物实验ceRNA机制下lncRNA研究思路解
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牌lncRNA的定位查询目标lncRNA位于胞浆中文献:检索文献获取lncRNA定位信息数据库:RNALocate等实验验证:FISH等解
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牌lncRNA与miRNA结合计算获取TargetScanmiRanda……预测数据库LncBasestarBase……文献数据库LncBase其它文献检索实实验获取……解
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牌其它相关数据库exoRBase: /收录人源血液中的各种RNA,包括microRNA、mRNA、lncRNA与circRNA等miRSponge:/miRSponge/哈尔滨医科大学主办目前包括599项miR-Sponge纪录463种ceRNA关系11个物种
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