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文档简介
1.氮源(1)生物固氮(微生物)NH3
a.与豆科植物共生的根瘤菌
b.自养固氮菌兰藻在固氮酶系作用下,将空气中的N2固定,产生NH3。
N2+6e-+12ATP+12H2O2NH4++12ADP+12Pi+4H+第27章
氨基酸生物合成代谢一、氨基酸合成中的原料:氮源和碳源生物固氮红色为固氮菌类菌体,蓝色为类菌体周膜,黄色和绿色为被感染细胞的细胞核。(3)各种脱氨基作用产生的NH3(所有生物)(2)硝酸盐和亚硝酸盐(植物、微生物)NO3-+NADPH+H+
→→→→NO2-+NADP++H2O硝酸还原酶NO2-+3NADPH+H+
→→→→NH3+3NADP++2H2O亚硝酸还原酶NH3的三种固定方式:1)形成氨甲酰磷酸(见尿素循环)2)形成Glu(谷氨酸脱氢酶)3)形成Gln(谷氨酰胺酶)
自然界的氮循环2.碳源
直接碳源是相应的α-酮酸。
主要来源:糖酵解、TCA、磷酸已糖支路
植物、微生物能合成20种氨基酸相应的全部碳架或前体。
人和动物只能直接合成部分氨基酸相应的α-酮酸。必需氨基酸:Ile、Leu、Lys、Met、Phe、Thr、Trp、Val、(Arg、His)。
GlcG-6-P
3-磷酸甘油醛③
4-磷酸赤藓糖5-磷酸核糖⑥
磷酸烯醇丙酮酸莽草酸⑤
丙酮酸④
②草酰乙酸柠檬酸α-酮戊二酸①Phe,Tyr,TrpHisGlu,Gln,Arg,Pro,(Lys)Asp,Asn,Met,Thr,Lys,IleAla,Val,LeuSer,Cys,Gly1.氨基酸合成分族二.氨基酸生物合成氨基酸合成分族
①α-酮戊二酸衍生类型(4)
Glu、Gln、Pro、Arg。
与氨基酸分解进入α-酮戊二酸的途径比较,少了一种氨基酸,即His。
Glnα-酮戊二酸Glu
Pro
Arg②草酰乙酸衍生类型(6)
Asp、Asn、Met、Thr、Ile(也可归入丙酮类)、Lys(植物、细菌)
Asn
草酰乙酸AspMetLysThrIle
经TCA中间产物(α-酮戊二酸、草酰乙酸)可合成10种氨基酸。即Glu、Gln、Pro、Arg、Asp、Asn、Met、Thr、Ile、Lys。③丙酮酸衍生类型(3)Ala、Val、Leu
Ala丙酮酸ValLeu④3-磷酸甘油酸衍生类型(3)Ser、Gly、CysGly
3-磷酸甘油酸SerCys
经酵解中间产物(3-磷酸甘油酸、丙酮酸),可合成Ala、Val、Leu、Ser、Cys、Gly等6种氨基酸。⑤酵解及磷酸戊糖中间产物(3)可合成Phe、Tyr、Trp等3种芳香族氨基酸。磷酸烯醇丙酮酸Phe
4-磷酸赤藓糖TyrTrp
⑥磷酸戊糖中间产物(1)
His有自己独特的合成途径,与其它氨基酸之间没有关系。5-磷酸核糖His2.氨基酸生物合成途径详解
(除Glu/Gln,Asp/Asn,Ala,其它反应过程不要求,只知道碳架来源即可)1)α-酮戊二酸衍生类型(Glu、Gln、Pro、Arg)(1)Glu的合成由α-酮戊二酸与游离氨,经L-Glu脱氢酸催化。对于植物和微生物,氨的来源是Gln的酰胺基。Glu脱氢酶/NADPHNH3+
-酮戊二酸Glu+H2OGlu合酶/NADPHGln+
-酮戊二酸2GluL-谷氨酸的生物合成(2)Gln的合成由α-酮戊二酸形成Glu,由Glu可以进一步生成Gln。Gln合成酶是催化氨转变为有机含氮物的主要酶,活性受9种含氮物反馈调控:氨基Glc-6-P、Trp、Ala、Gly、Ser、His和CTP、AMP、氨甲酰磷酸。谷氨酰胺合成酶Glu+NH4++ATPGln+ADP+Pi+H+L-谷氨酰胺的生物合成(3)Pro的合成(Glu-COOH的还原、环化)细菌合成鸟氨酸的途径(4)Arg合成(Glu鸟氨酸Arg)尿素循环鸟氨酸经过尿素循环生成瓜氨酸和精氨酸(5)Lys合成(蕈类和眼虫L-赖氨酸的生物合成途径)高柠檬酸顺-高乌头酸高异柠檬酸α-酮己二酸α-氨基己二酸6-腺苷基α-氨基己酸α-氨基己酸-δ-半醛酵母氨酸
-KG+乙酰-CoA高柠檬酸α-酮己二酸Lys
2)草酰乙酸衍生类型
Asp、Asn、Met、Thr、Ile、Lys(植物、细菌)(1)谷草转氨酶
谷草转氨酶草酰乙酸+GluAsp+
-酮戊二酸(2)Asn合成(转移酰胺基)哺乳动物:Asn合成酶/Mg2+Asp+Gln+ATPAsn+Glu+AMP+PPi细菌:Asp+NH4++ATPAsn+AMP+PPiAsn合成酶L-天冬酰胺的生物合成(3)Lys(植物、细菌)
(4)Met合成(5)Thr合成
Lys、Met、Thr合成中,有一段共同途径,生成Asp-β-半醛,是一个分枝点化合物。(6)Ile合成(与Val极为相似)
Ile的合成途径与Val极为相似。6个C中4个来自Asp(Asp→Thr),2个来自丙酮酸,所以也可归入丙酮酸衍生型。L-甲硫氨酸,L-苏氨酸和L-赖氨酸的生物合成途径胱硫醚琥珀酰二氨基庚二酸琥珀酰-2-氨基6酮庚二酸六氢吡啶-2,6-二羧酸二氢吡啶-二羧酸消旋二氨基庚二酸二氨基庚二酸AspThrMetLysAsp-β-半醛3)丙酮酸衍生型(Ala、Val(Ile)、Leu)a)Pyr+GluAla+-KG谷-丙转氨酶ValIleb)PyrValIleLueL-亮氨酸的生物合成异丙基苹果酸α-酮异己酸Val的碳骨架+乙酰-CoA脱氢脱羧Lue4)3-磷酸甘油酸衍生型(Ser、Gly、Cys)G-3-P脱氢3-P-Pyr转氨Ser3-P-SerL-甘氨酸的生物合成L-半胱氨酸的生物合成5)酵解及磷酸戊糖中间产物(3)可合成Phe、Tyr、Trp等3种芳香族氨基酸。共同前体:分枝酸,由2磷酸烯醇丙酮酸,1个赤藓糖4-P经6步反应合成,又称莽草酸途径
分支酸的生物合成
(2PEP+赤藓糖4-P分支酸)2-酮-3脱氧7-磷酸庚酮糖酸5-脱氧奎尼酸5-脱氧莽草酸莽草酸3-稀丙基莽草酸分支酸PEP赤藓糖4-P庚酮糖酸(7C)PEP苯丙氨酸、酪氨酸及色氨酸的生物合成(分支酸Phe,Tyr,Trp)预苯酸邻氨基苯甲酸N-(5′-磷酸核糖)-氨基苯甲酸稀醇式L-(O-羧基苯氨酸)-L-脱氧核酮糖-5-磷酸吲哚-3-甘油磷酸分支酸PheTyrTrp由苯丙氨酸亦可生成酪氨酸5′-磷酸核糖-4-酰胺-5-氨基咪唑核苷酸N1-5′-磷酸核酮糖亚氨甲基-5-氨基咪唑羧酰核苷酸N1-5′-磷酸核酮糖亚氨甲基-5-氨基咪唑-4-羧酰核苷酸咪唑甘油磷酸咪唑丙酮磷酸组氨醇磷酸组氨醇组氨酸N1-5′-磷酸核糖-ATPN1-5′-磷酸核糖-AMP6)磷酸戊糖中间产物:5-磷酸核糖-1-焦磷酸(PRPP)(His):
GlcG-6-P
3-磷酸甘油醛③
4-磷酸赤藓糖5-磷酸核糖⑥
磷酸烯醇丙酮酸莽草酸⑤
丙酮酸④草酰乙酸②
柠檬酸(TCA)α-酮戊二酸①
Phe,Tyr,TrpHisGlu,Gln,Arg,Pro,(Lys)Asp,Asn,Thr,MetLys,IleAla,Val,Leu,IleSer,Cys,Gly氨基酸合成总结尾巴-CH3苯环或吲哚环尾巴-CH2OH
-CH2SH
骨架
HOOC-C-C-CNH2骨架
HOOC-C-C-C-CNH2
最有效的调节是通过合成过程的终端产物,反馈抑制反应系列中第一个酶的活性,即通过别构效应调节第一个酶的活性。
1.通过终端产物对氨基酸合成的反馈抑制(1)简单的终端产物反馈抑制
三、氨基酸生物合成的调节(2)不同终端产物对共同合成途径的协同抑制
(3)不同分枝产物对多个同工酶的抑制(多重性抑制)
(4)连续产物抑制
终端产物E和H,只分别抑制分道后自己的分支途径中第一个酶的活性。2.通过酶量调节(参见基因表达调控章节) 理解别构调控(酶活性)与阻遏调控(酶的生成量)的主要区别四、几种重要的氨基酸衍生物的生物合成(了解)1.NO,信号传导的信息分子,精氨酸氧化氮合酶2.谷光苷肽:GSHGSSG,GSH解毒作用3.肌酸(由Arg,Gly,Met参与合成)4.卟啉
血红素、细胞色素、叶绿素。卟啉由Gly和琥珀酰CoA衍生5.短杆菌肽
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