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文档简介
蛋白质有关计算预期目标:
(1)加深理解:氨基酸间的脱水缩合
(2)逆向思维:理解蛋白质的水解过程
(3)知识迁移:单糖缩合成多糖
(4)铺垫:核苷酸缩合成核酸H2N-C-
C
-OHHR1ON-C-COOHHR4HHC
-OHON-C-HR2HHC
-OHON-C-HR3HHH2N–C-CHR1OCON-C-HR2HCON-C-HR3HN-C-COOHHR4HH2OH2OH2O蛋白质合成蛋白质水解1.核心依据(1)每形成1个肽键,就失去1分子水(失去2个H+1个O)(2)每打断1个肽键,消耗1分子水H2N--COOHH2OH2O2.建立模型N个氨基酸肽键数(失水数)游离氨基(或羧基)至少氨基总数羧基总数1条链3.肽键数(失水数)、游离氨基酸(或羧基)至少数、氨基(或羧基)总数N-11R氨+1R羧
+1N个氨基酸肽键数(失水数)游离氨基(或羧基)至少氨基总数羧基总数m条链3.肽键数(失水数)、游离氨基酸(或羧基)至少数、氨基(或羧基)总数H2NCOOH肽链1H2NCOOH肽链2H2NCOOH肽链m…x1个氨基酸x2个氨基酸xm个氨基酸N个氨基酸建立模型蛋白质总肽键数:N–m肽链1中肽键数:x1-1肽链2中肽键数:x2-1肽链m中肽键数:xm-1……+推理过程N–mmR氨+mR羧+m例1:绿色荧光蛋白(GFP)的相关数据如下图所示,下列有关叙述正确的是A.GFP有2条肽链B.GFP中含有125个肽键C.GFP的R基上的氨基有16个D.经高温处理后,GFP仍能发出绿色荧光C游离羧基总数16=R基上的羧基15+肽链数氨基酸数126-肽链数2=肽键数游离氨基总数18=R基上的羧基
+肽链数2高温使GFP变性例2:如图是由820个氨基酸组成的某蛋白质的结构图,下列相关叙述正确的是A.该蛋白质的功能仅由氨基酸的种类、数量、排列顺序三方面决定B.水解该蛋白质的过程中需要817个水分子C.该蛋白质至少有2个游离的羧基和2个游离的氨基D.该蛋白质至少含有820个肽键Cx个氨基酸y个氨基酸820-x-y个氨基酸(x-1)+y+(820-x-y1)=8184.蛋白质相对分子质量氨基酸N个平均相对分子质量为a蛋白质M条肽链失去(N-m)分子水每个-S-S-失去2H蛋白质相对分子质量=N×a–(N-M)×18–
二硫键数×2
☆若肽链间有肽键,也失去水例3:下图为某种蛋白质分子的结构示意图,其中的★▲■●等表示不同氨基酸,数字表示氨基酸的序号,“-S-S-”是蛋白质加工过程中由两个“-SH”脱下2个H形成,“-”代表化学键。这些氨基酸合成此蛋白质过程,相对分子质量减少了______。686A.该分子中含有200个肽键B.这200个氨基酸中至少有200个游离氨基C.合成该蛋白质时相对分子质量减少了3600D.该蛋白质分子中至少含有4个游离的羧基例4:下图表示一个由200个氨基酸构成的蛋白质分子,下列叙述正确的是A所有氨基酸中C(N、S)原子数
=蛋白质中C(N、S)原子数所有氨基酸中H原子数
-失去的水分子数×2-二硫键数×2=蛋白质中H原子数所有氨基酸中O原子数
-失去的水分子数=蛋白质中O原子数5.蛋白质合成过程中,原子数的变化例5:由820个氨基酸组成的某蛋白质的结构图。该蛋白质分子至少有_______个N原子,至少有_____个S原子,至少有______个O原子,至少有_________个H原子。8204820例5:由820个氨基酸组成的某蛋白质的结构图。82016406.特殊氨基酸个数的推算例6:有一个十肽链,分子式为CxHyOpNqS,将它彻底水解后,只得到下列4种氨基酸。水解后得到的半胱氨酸个数、赖氨酸个数分别为______,其中p=______。10-q111例7:一条肽链分子式为C79H97N15O24S。这条多肽链经水解后的产物中有4种氨基酸:
半胱氨酸(C3H7NO2S)丙氨酸(C3H7NO2)天冬氨酸(C4H7NO4)苯丙氨酸(C9H11NO2)则水解产物中,天冬氨酸有_______个。先判断是十五肽再根据O原子算天冬氨酸47.蛋白质水解的计算核心思想:建立肽链水解模型例8:某条肽链由89个氨基酸缩合而成,其中共有游离氨基6个,5个甲硫氨酸在肽链中的位置为13、25、56、78、89,甲硫氨酸的分子式为C5H11O2NS。下列叙述正确的是
A.合成该多肽的氨基酸共有N原子数目94个
B.该肽链脱掉甲硫氨酸后形成的短肽中,肽键数目会减少10个
C.该肽链脱掉甲硫氨酸后形成的短肽中,氨基和羧基均分别增加5个
D.该肽链脱掉甲硫氨酸后形成的短肽中,氧原子数目增加9个H2N-COOH1325567889R基5个-NH2A例9:蛋白质内切酶作用于肽链内部特定区域,若蛋白酶1作用于苯丙氨酸(C9H11NO2)两侧的肽键,蛋白酶2作用于赖氨酸(C6H14N2O2)氨基端构成的肽键,某四十九肽经酶1和酶2作用后的情况如图。(1)短肽A、B、C比四十九肽的氧原子数减少_____个,氢原子数目减少______个。(2)在该四十九肽中,苯丙氨酸存在于第_________________号位上,而第_________________号位为赖氨酸。H2NCOOH116183033491212348酶1酶2ABCDE12317、31、3222、23、49例10:蛋白酶3作用于苯丙氨酸(C9H11NO2)两侧的肽键。某四十九肽经酶3作用后的情况如图。CH2NCOOH11618263348酶2831ABD获得的4条肽链,与原四十九肽相比;(1)肽键数目的改变:__________个;(2)游离的氨基数目的改变:_________个;(3)H原子数目的改变:__________个;(4)O原子数目的改变:__________个。
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