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文档简介
ICS
CCS
团体标准
T/CVMAXXXXX—XXXX
犬猫细小病毒PCR检测方法
PCRDetectionMethodofCanineandFelineParvovirus
(征求意见稿)
在提交反馈意见时,请将您知道的相关专利连同支持性文件一并附上。
XXXX-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施
中国兽医协会 发布
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定
起草。
本文件由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所提出。
本文件由中国兽医协会归口。
本文件起草单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所、上海基灵生物科技有限公司、东莞博盛生
物科技有限公司、北京市动物疫病预防控制中心
本文件主要起草人:梁瑞英、崔尚金、梁琳、汤新明、朱旭、王弋、刘昕、张启龙
II
犬猫细小病毒PCR检测方法
1范围
本文件规定了PCR诊断技术,可以同时检测犬细小病毒、猫泛白细胞减少症病毒(又称猫细小病毒)
的通用PCR诊断技术。
本文件适用于检测犬猫细小病毒核酸,适用于临床样品中不同型犬细小病毒和猫细小病毒的快速检
测。
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,
仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本
文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB19289实验室生物安全通用要求
GB/T27401实验室质量控制规范动物检疫
NY/T541兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范。
3术语和定义
本文件没有需要界定的术语和定义。
4缩略语
CPV:犬细小病毒(CanineParvovirus);
FPV:猫细小病毒(FelineParvovirus);
PCR:聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction);
CPV-2、CPV-2a、CPV-2b、CPV-2c:不同的犬细小病毒分型
5主要仪器
冰箱、台式离心机、高速台式冷冻离心机、高压蒸汽灭菌器、PCR仪、单道微量移液器(0.1-2.5
μl,0.5-10μl,1-100μl,1-1000μl)、组织研磨器、水平电泳仪、紫外观察灯或凝胶成像仪。
6试剂和材料
试验用水均为灭菌超纯水,应符合GB/T6682中一级水的要求、医用棉签、枪头(10μl,200
μl,1000μl)、1.5mlEP管、0.2mlPCR管、dNTP(含dATP、dTTP、dCTP、dGTP各10mmol/L,
-20℃保存。)、PCR检测引物序列及反应液配方见附录B。10%十二烷基硫酸钠:配制参见附
录A.1、蛋白酶K贮备液:配制参见附录A.2、5×TBE电泳缓冲液:配制参见附录A.3。
1
7实验步骤
7.1样品的采集与处理
7.1.1血清样品采集
怀疑细小病毒感染的犬猫,使用非抗凝管采集全血,详细标记,登记,室温静置30min~1h,放入
离心机并配平,4000r/min,离心5min,用移液器取离心后的上层血清至做好标记的EP管,保存备用。
7.1.2粪便或肛拭子样品采集
使用粪便盒收集发生腹泻的犬猫新鲜粪便,或使用棉拭子肛门转圈采集粪便样品加适量PBS(pH7.0)
或灭菌超纯水,充分混匀后,10000r/min离心5min;取上层水加盖,编号,保存备用。
7.2核酸DNA提取
1)取样品处理液465μl,加人25μl10%十二烷基硫酸钠和10μl的20mg/mL蛋白酶K,56℃
水浴摇床上放置2h;
2)加入等量的饱和酚溶液500μl,振荡混匀20s,12000g离心5min,取上清液;
3)加入等量的酚:三氯甲烷:异戊醇(25:24:1),振荡混匀20s,12000r/min,离心5min,
取上清液;
4)再加入等量的三氯甲烷:异戊醇(24∶1),振荡混匀20s,12000r/min离心5min,取上
清液;
5)最后加入两倍体积的无水乙醇,上下颠倒混匀,12000r/min离心10min,弃上清;
6)室温于燥后,加人30μl灭菌双蒸水溶解沉淀,即得DNA模板,-20℃贮存备用。
7)另外,DNA抽提也可采用市售的商品化DNA抽提试剂盒进行。
7.3PCR检测
反应体系见附录B.2。按下述条件进行扩增:96℃预变性5min、(96℃30s、52℃30s、72℃45s,
重复此循环30次)72℃延伸10min。反应完毕,取PCR反应液进行1%的琼脂糖凝胶电泳。
7.4结果判定
若待检样品可扩增出大小为669bp的核酸片段(参考核酸序列见附录C),则判定细小病毒核酸
阳性;若待检样品未扩增出核酸片段,同时加入的阴性对照(即核酸模板用灭菌水替代)成立,则判定
核酸检测阴性。
2
附录A
(资料性)
溶液配方
A.110%十二烷基硫酸钠(SDS)
在45ml三蒸水溶解5g十二烷基硫酸钠(电泳级),加热至60℃溶解,用盐酸调pH值至7.8,
加三蒸水定容至50ml。
A.2蛋白酶K贮备液(20mg/mL)
每升三蒸水中加人三羟甲基氨基甲烷(Tris)1.21mg,乙二胺四乙酸(EDTA)1.86mg,十二
烷基硫酸钠(SDS)5g,用盐酸调pH值至7.8。取该溶液按每毫升加入20mg蛋白酶K,充分溶解后分装。
A.35×TBE电泳缓冲液
每升三蒸水中加入三羟甲基氨基甲烷(Tris)54.0g,乙二胺四乙酸(EDTA)2.9mg,硼酸27.5g,
用5mol/L的盐酸调pH值至8.0。
3
附录B
(资料性)
引物序列、PCR反应体系
B.1引物序列
B.1.1犬猫细小病毒核酸PCR检测方法通用引物序列见表B.1。
表B.1引物序列
引物引物序列(5’-3’)犬猫细小病毒扩增片段(bp)
上游GTAAGCTTCCAGGAGACTTT
669
下游GTAAGCTTCGTCGTGTTC
B.2PCR反应液配方
B.2.1犬猫细小病毒核酸PCR反应液配方见表B.2。
表B.2PCR反应液配方
PCR反应液组分反应体系
10×PCRBuffer(withMg2+)5μl
TaqDNAPolymerase(5U/μL)0.5μl
dNTP(2.5mMeach)4μl(终浓度0.2mMeach)
上游引物(100mM)0.2μl(终浓度0.2μM)
下游引物(100mM)0.2μl(终浓度0.2μM)
待检样品DNA模板2.0μl(推荐0.1~1μg)
灭菌超纯水(至终体积50μl)38.1μl
B.2.2注意事项
通常引物终浓度为0.2μM时可以获得良好的检测效果,可根据情况在0.1~1μM范围内调整引物的终
浓度。扩增效率不高时,可提高引物浓度,发生非特异性反应时,可降低引物浓度。
4
附录C
(资料性)
扩增核酸序列
AAGCTTCCAGGAGACTTTGGTTTGGTTGATAAAGAAGAATGGCCTTTAATATGTGCATGGTTAGT
TAAACATGGTTATGAATCAACCATGGCTAACTATACACATCATTGGGGAAAAGTACCAGAATGG
GATGAAAACTGGGCGGAGCCTAAAATACAAGAAGGTATAAATTCACCAGGTTGCAAAGACTTAG
AGACACAAGCGGCAAGCAATCCTCAGAGTCAAGACCAAGTTCTAACTCCTCTGACTCCGGACGT
AGTGGACCTTGCACTGGAACCGTGGAGTACTCCAGATACGCCTATTGCAGAAACTGCAAATCAA
CAATCAAACCAACTTGGCGTTACTCACAAAGACGTACAAGCGAGTCCGACGTGGTCCGAAATAG
AGGCAGACCTGAGAGCCATCTTTACTTCTGAACAATTGGAAGAAGATTTTCGAGACGACTTGGAT
TAAGGTACGATGGCACCTCCGGCAAAGAGAGCCAGGAGAGGTAAGGGTGTGTTAGTAAAGTGGG
GGGAGGGGAAAGATTTAATAACTTAACTAAGTATGTGTTTTCTTATAGGACTTGTGCCTCCAGGT
TATAAATATCTTGGGCCTGGGAACAGTCTTGACCAAGGAGAACCAACTAACCCTTCTGACGCCGC
TGCAAAAGAACACGACGAAGCTTAC
_________________________________
5
目次
前言.......................................................................................................................................................................II
1范围...................................................................................................................................................................1
2规范性引用文件...............................................................................................................................................1
3术语和定义.......................................................................................................................................................1
4主要仪器...........................................................................................................................................................1
5试剂和材料.......................................................................................................................................................1
6实验步骤...........................................................................................................................................................2
附录A(资料性)溶液配方..............................................................................................................................3
附录B(资料性)引物序列、PCR反应体系..................................................................................................4
附录C(资料性)扩增核酸序列..........................................................................................................................5
I
犬猫细小病毒PCR检测方法
1范围
本文件规定了PCR诊断技术,可以同时检测犬细小病毒、猫泛白细胞减少症病毒(又称猫细小病毒)
的通用PCR诊断技术。
本文件适用于检测犬猫细小病毒核酸,适用于临床样品中不同型犬细小病毒和猫细小病毒的快速检
测。
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,
仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本
文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB19289实验室生物安全通用要求
GB/T27401实验室质量控制规范动物检疫
NY/T541兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范。
3术语和定义
本文件没有需要界定的术语和定义。
4缩略语
CPV:犬细小病毒(CanineParvovirus);
FPV:猫细小病毒(FelineParvovirus);
PCR:聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction);
CPV-2、CPV-2a、CPV-2b、CPV-2c:不同的犬细小病毒分型
5主要仪器
冰箱、台式离心机、高速台式冷冻离心机、高压蒸汽灭菌器、PCR仪、单道微量移液器(0.1-2.5
μl,0.5-10μl,1-100μl,1-1000μl)、组织研磨器、水平电泳仪、紫外观察灯或凝胶成像仪。
6试剂和材料
试验用水均为灭菌超纯水,应符合GB/T6682中一级水的要求、医用棉签、枪头(10μl,200
μl,1000μl)、1.5mlEP管、0.2mlPCR管、dNTP(含dATP、dTTP、dCTP、dGTP各10mmol/L,
-20℃保存。)、PCR检测引物序列及反应液配方见附录B。10%十二烷基硫酸钠:配制参见附
录A.1、蛋白酶K贮备液:配制参见附录A.2、5×TBE电泳缓冲液:配制参见附录A.3。
1
7实验步骤
7.1样品的采集与处理
7.1.1血清样品采集
怀疑细小病毒感染的犬猫,使用非抗凝管采集全血,详细标记,登记,室温静置30min~1h,放入
离心机并配平,4000r/min,离心5min,用移液器取离心后的上层血清至做好标记的EP管,保存备用。
7.1.2粪便或肛拭子样品采集
使用粪便盒收集发生腹泻的犬猫
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