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文档简介
EB病毒(EBV)核酸检测原则操作规程
(荧光PCR法)
1.目
规范EB病毒核酸DNA(荧光PCR法)检测操作流程,精确进行EB病毒DNA分析。
2.应用范畴
使用中山大学达安基因股份有限公司EB病毒核酸扩增(PCR)荧光定量检测试剂盒(荧光
PCR法)和Mx3000P荧光定量PCR仪、Roche480荧光定量PCR仪进行EB病毒DNA检测。
3.职责
由PCR实验室制定程序文献,专业技术人员负责执行,实验室主管负责监督实行。
4.内容
4.1实验原理及其临床应用
本试剂盒用一对EB病毒(EBV)特异性引物和一条EB病毒(EBV)特异性荧光探针,配以
PCR反映液、耐热DNA聚合酶(Taq酶)、核甘酸单体(dNTPs)等成分,用PCR体外扩增法检测EB
病毒(EBV)DNAo用于人血中EB病毒DNA测定,为临床提供参照,
4.2标本采集
4.2.1使用标本类型:全血。
4.2.2标本采集;由合伙单位按照如下规定进行采集。
4.2.2.1全血:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注入EDTA(乙二胺四乙酸二钠)
或枸檬酸钠抗凝剂玻璃管,及时轻轻颠倒玻璃管混合5-10次,使抗凝剂与静脉血充分混匀,
密闭送检。
4.2.3标本保存和运送:标本可及时用于测试,也可以保存于-20C待测,保存期为6个月。
标本运送采用0(冰壶。
4.3试剂准备
4.3.1供应商:中山大学达安基囚股份有限公司。
4.3.2此实验试剂应放在冰箱-20C保存,在实验前5分钟取出备用,实验后应及时放回冰
箱-20℃。
4.3.3如果试剂浮现了封口蜡破损导致液体外漏以及过期试剂,应及时更换。
4.4质控品
4.4.1质控品来源:随试剂盒,由厂家提供。
4.4.2质控品保存条件:置于-20℃冰箱中保存。
4.4.3质控频度:每次实验均需做质控。
4.5操作过程阐明
4.5.1DNA提取
4.5.1.1质控品解决:取出阴性质控品、临界阳性质控品、强阳性质控品。8000rpm离心数
秒,吸50ul至0.5ml灭菌离心管中,加入50U1DNA提取液充分混匀,10CTC恒温解决
10±1分钟;1rpm离心5分钟,备用。
4.5.1.2样本解决
4.5.1.2.1取全血500ul至干燥玻璃试管中,加入生理盐水500ul轻摇混匀;
4.5.1.2.2取干燥玻璃试管加入1ml淋巴细胞分离液;
4.5.1.2.3将稀释好全血用移液器缓慢加入加有淋巴细胞分离液试管中(注意沿着管壁,速
度要慢);
4.5.1.2.4rpm离心20分钟(建议用水平离心机);
4.5.1.2.5吸取白细胞层(从上往下第二层),加入1.5ml离心管,Irpm离心5分钟;
4.5.1.2.6去上清,沉淀中加入50ulDNA提取液充分混匀,1001恒温解决10±1分钟;Irpm
离心5分钟,上清备用。
4.5.2.1加样:取PCR反映管若干,加入解决后样品(标本、阴性质控品、临界或强阳性质
控品)上清液5ul,800Drpm离心数秒,放入仪器样品槽。
4.5.3PCR扩增
将准备好PCR反映管放置于PCR仪上,编辑样本信息并按下列循环参数进行扩增反
映:37℃-2min;94℃-2min;(94℃-15ses;55℃-45ses)X40cyclics;
EBV检测荧光素:FAV;反映体系:50ul;荧光信号收集:55℃-45ses,末端收集。
4.5.3Mx3000P荧光定量PCR仪设立及成果分析
4.5.3.1打开计算机电源。
4.5.3.2将Mx3000P电源开关打开,在大概1分钟时间内,仪器将会自检并且能听到滤镜轮
转动声音。打开电脑上Mx3000P软件,拟定软件界面右下面联机标志呈现绿色
这时只需要继续稍等半晌,待仪器自检完毕,会自动连接计算机。
$dec<W
RMHWE
•Asie”PCA魅s
「£ov<>«aBv«QurM4icnfCdbatal
「StBR?G»h*[«MomCw)
「£va6*M»^(w*tC^nacwtanC«TM|
「AMeCMomtor./$«*»RM»Tm
广MatocUtffiMcmM<noCuw
n
「Qj
「R^eRMI/XMDtomtor.
4.5.3.3在软件弹出框中选取您要进行实验类型,普通选取第一项
uQuantitivePCR(MultipleStandards)”进行绝对定量分析。
4.5.3.4拟定卤鸨灯已经打开。9(绿色)则阐明卤铝灯已经打开;4J(黄色)则阐明卤
铝灯正在预热;91(红色)则阐明卤鸨灯没有被打开,这时需要用鼠标点击这
个标志将光源打开。在卤鸨灯已经被打开状况下,软件界面右下方会显示
——■(绿色)0
4.5.3.5最佳在仪器与光源预热20分钟后开始实验。
4.5.3.6在JPlateSetup」里,对所选孔进行设定,在Welltype中设定Standard
(原则品)、NTC(阴性对照)、unkown(样品)等,并选取对的荧光通道(FAM,
HEX,ROX,Cy5),参比荧光(Referencedye)选None。对于原则品,在We11type
中设定为“Standard”后,再设定其模板浓度。办法为:点击
Standardquantity:|jHW°0e+0U7,10倍浓度梯度可以直接点击.ato-Increment:10
在下拉菜单中选取不同系数关系后,依次点击设定为原则品此外几种孔,浓度将实
时显示。也可以直接点击原则品各个孔位,在Standardquantity:|FAM二]14e+0007―一
栏,手工输入浓度。若要对不同样品进行编号,则双击所选孔,在name框中输入样
品号,点击就能显示样品编号。或者点击版面右上方Import,导入
此前使用96孔板设定。
01:00;
4.5.3.7点击ThermalProfileSetup,进行PCR循环设定,可以直接点击温度、时间
化各项温度、时间、循环数等。在选定大环节之后添加环节可选定该大环节后,
Segment],或点击鼠标右键,在弹出对话框中,选取AddSegment,
扩增曲线,6田熊:谢/逅藏Ct值列表,钎西涵向凰谴原则曲线,
1•述近通圆亚城样本起始浓度,6斤面嬴T成果excel表格输出,
616ns茶茴;扇。混合并面板,涉及设立、程序设定、样本Ct值、扩增曲线四个面
板。
Options
OpticsConfiguration...
AnalysisTernSettings...
4.5.3.11分析曲线时,如果曲线不够光滑,还能用IEreferewces;___________^Smoothing
对曲线进行调节,普通Amplificationaverage是3,可按需要将其调至较大数值,
Amplxfxcatxonaveraging修三]如5、7、9,调节后曲线将更光滑,但是Ct值会稍微
靠后一点,使数据失真,普通状况下,不建议这样做。
Options
OpticsConfiguration...
AnalysisTernSettings...
4.5.3.12如果需要对每条曲线进行单独基线设立,点击L"eferences.^_______________|中
BaselineCorrection,点击Adaptivebaseline,在下面相应各孔,单独进行基
线起始和终结位置调节。
4.5.3.13关于Mx3000P调用前一次实验原则曲线补充阐明。点击桌面Mx3000P软件图标,
弹出话框:选取MultipleExperimentAnalysis(多项实验成果分析)选项,
点击“0K”,浮现如下对话框,建议选取"Usecommonthreshold”进行分析
进算,然后点击Experiments.」,导入需要一起分析上机文献,点击“Finish”
即可。
4.5.3.14这里选取时要注意:1.两个或者各种实验成果要有相似实验程序;2.每次程序
中循环数应当一致。在分析栏可以选取不同实验不同反映孔进行同步分析。
4.5.3.15分析质控成果:
阴性质控品:EBV(FAM)Ct值=40或“NoCt”.
阳性质控品:EBV(FAM)Ct值<33,且有较好对数增长曲线。
以上规定需在同一次实验中同步满足,否则本次实验无效,需重新检测。
4.5.3.16记录实验数据。
4.5.3.17取出结束后扩增仪内扩增产物需用一次性手套包好、封口后,丢入医疗废物垃圾
桶内,以防止扩增管破裂而导致污染。
4.5.4Roche480荧光定量PCR仪设立及成果分析
4.5.4.1先打开电脑,再打开荧光定量PCR仪器,然后双击图标“伞”,打开仪器数据库。
4.5.4.2双击图标“7”,启动罗氏480软件。
4.5.4.3在弹出对话框中,输入顾客名和密码,进入软件设立界面。
4.5.4.4在弹出界面中,点击____z〜—poMEH______・",进入新实验设立界面:
・l.ithtC,clrr7480SoftwarerolaaaeI.b.0
Mrument-VirtualtiqbtCycUf180%SytfemI/NaConn«cl>4DAUbMe:MyComfMH”(T,wbl-)
Wlndwr|N*WfrperianenlSyviemA4mln
JUnPretocelRu«Nos
mi.例口皿
4.5.4.5在“1.”菜单栏里,“厂RWH一子菜单下。
4.5.4.6将“DetectionFormatM选取为Daul或3color探针杂交类型。
4.5.4.7将“ReactionVolumew设立为“50ul”。
4.5.4.8在“Programs”下:通过“⑥”来增长总循环阶段及阶段循环数,并在“变
性-*延伸f退火"循环阶段"AnalysisModev下选取Quantification。
4.5.4.9在“TemperatureTargets"下:通过“⑥I”来增长每个循环阶段里小环
节,并在采集荧光小环节AcquisitionModeM里选取"single”,采集荧光。
4.5.4.10在“三1”菜单栏下,通过“画)◎”增长或者减少实验项目类型,通过右边孔
位选取,设立不同项目区域,然后点击“Apply”保存。
4.5.4.11在“罔”菜单栏下,Step1处,选取“AbsQuant";Step2处,编辑原则品及
样本。
4.5.4.12原则品设立:在Step2下96孔面板中,选中原则品反映孔,然后选取右侧模板
检测通道,如“483-533”,然后将下方孔位uQuantificationStunpleType"
选取为"Standard",并在wConcentrationv处输入其浓度即可。
4.5.4.13样本设立:类似于原则品设立,但仅需要编辑其"SampleName”即可。
4.5.4.14返回“三”菜单,在“厂。〃。2―1”子菜单右下角点击
,,:*ERun卜,,运营实验。
4.5.4.15实验结束后,在"臼”菜单下,选取"AbsQucint/FitPointsM,进入成果分
析界面:
〔.r?r/x:•,1^,,T7rm^m::・
Instrument:NoactiveinstrumentDatabase:MyComputer(Research)等〉
Window:|2O1O.11.27CT-PM2Us«r:SystemAdmin
Exoed-Analyses|Abs^ant/FitPoincaforAllSaxpies(2)3@©@0由
Information
Su*@003
CycleRang«No3BandAz附
111,31,5l・l7IQ9limX
A•・soooOo
kk:B••oooOo
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F••soooOo
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Hn•nnnHn
1920力2223找252£〃2829303132的343639»第男4041,2434445
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尸湍吗3—既能»[您T忖"三
[Analysis]:在此菜单下对阈值线进行调子;
[NoiseBand]:对实验信噪比进行调节;
[FilterComb]:对不同荧光通道进行选取;
[StdCurve]:对定量参照品进行选取,涉及实验中参照品、导入原则品等;
4.5.4.16在上述操作完毕后,点
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