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文档简介
ImageLab™
中文操作手册
Bio-RadLaboratodes.Inc.
2000AlfredNoMDrive
HecU8S.CA94547BIO-MD
C2009BiO>RadLaoorator«.m.
FastandReliable
ImageLab全自动图像获取和分析软件用
于MolecularImagerChemiDoc™XRS+、
MolecularImagerGelDocTV1XR+和
CriterionStainFree™成像系统,可应用于
凝胶电泳和转印膜的数字成像和分析,而自
动化的工作流程能加速图像获取步廉及参数优化,并针对调整好的凝胶或转印膜影像进行系
统性分析,进而得到所需的分析数据结果。
一、软件操作界面
U03a-,2al由iuij苴।0的
•l*«oc<4Op«<»labeureM4Mard3eMcv^b
>分析数据ResultsData
Crtwionr*MYewjM▼X:Yw_--
«AaalysisO♦M
[\AuWAnaMisj
设小度色诡
3.兖析工具列赞彩里
(1)囱像工具(Imageloots)像
(2)泳道及条带工具(LaneandBandTools)
(3)分子量工具(MWMolecularWeight)
(4)自动定量工具(QuantityTools)
(5)注释工具(Annotationfools)
(6)手动定量工具(VolumeTools)
3.MVZAnalyseTods
二、使用ImageLab软件进行化学发光图像获取流程
1.建立图像获取程序:
在凝胶成像(GelImaging)对话框中选择Chemi(化学发光)应用程
5.AnnctotwTods
ROO、物。8€。1】・CbemiDocXR-
⑴在成像区域(ImagingArea)对话框中的下拉式选单中选择合适的样品大小(非必需,可
之后通过PositionGel选择)
⑵选择成像曝光(ImageExposure)方法,可以人为评估曝光时间并以手动设定(Manual
Exposure),或是使用信号累积模式(SignalAccumulationMode,SAM)来进行操作。
在建立一个化学发光的程序时最难的任务就是图像喙光的确定,因为您想获得一个充分
利用了相机大的动态范围的图像。过短的图像曝光时间可能使高于膜背景的微弱信号不能被
识别:过长的图像曝光时间能够使得某些条带饱和(也就是说,超出了相机准确报告信号的
能力)。如果这是您第一次用ChemiDocXRS+分析化学发光样品,您需要在使用手控或信号
累积模式(SAM)之前决定一个合适的成像时间框架。获得这个信息的最好的方式是取得一
个相对短的手工曝光并利用ImageLab里的工具估计最适的曝光时间。
2.手动曝光
ImagtExposure
⑴选择手动设定曝光时间(Manuallysetexposure
0SignalAccumulationMode(Setup}
time)并在读秒框中输入10秒。
hd]尔
AManuallysetexposuretime:
(2)选择Highlightsaturatedpixels。
⑶把胶置于透射箱的中心位置。DHptayOp00m
MHighlightsaturatedpixels
,、人,PositionGel,..
⑷在程序衙口中点击____________)按钮。
⑸观察显示器中样品的实时图像,打开照胶系统的门并移动样品直到位于视野的中心区域。
(6)可利用照相机的变焦滑板口"*"Zoom00O调节成像区域的大小。
RunProtocol
⑺选择按钮获得你的第一个图像。
若所需的图像出现在计算机的显示器上,确认图像中是否包含红色的饱和区域。若有饱
和区域存在,请重新以较短的曝光时间来获取图像。若无饱和区域存在,则可移动鼠标置于
最暗的条带之上,在较低的右下角ImageLab窗口中观察信号的强度数值。如图中显示强度
为1994,照相机能记录的最大值的32分之一(最X290Y513Value1994Int
大值为65,535)o用你的最初的10秒曝光再乘以30就可在照相机的最大动态范围附近成像
你的样品。若你只需针对单一图像的成像时间进行评估,可直接在手动曝光区域中输入300。
3.信号累积模式(SignalAccumulationMode,SAM)
如果预估方法不足以精确满足您的目的,请选择
SAM按钮,然后按Setup按钮。一个新的对话框会跳出
来,其包含有可输入细分的成像时间的领域。
在这个例子中,我们已经输入了小于和大于我们原始
的300秒曝光估计时间,因为我们有理由相信准确的成像
时间将会在这些时间之中。我们总共想要5个成像,推测AccumulationSetup
其中一个将会与最佳成像极为接近。一个您的SAM设定Thesoftwarewillacquire<hcimagesandsumup
thesigzl.
的图像显示出现在对话框里。Firsttime($«).250
lastImageTime(see)ISO
而SAM设定的影像显示对话窗口,在您选择按
Totalnumberofimages.|S
钮后再点选巴四校钮,窗口会显示相关进度图标来
说明整体图像获取的时间。在250秒获取第一个图像,同
时一个小的缩略图会出现在窗口的下方,以此类推整个过程将持续到获取所有的图像。
HO."MXN15mo•(JUS•
就像前面做过的那样,通过移动鼠标在图像上,您能判定强度值。您也可以通过使用位
于程序窗口左边的图像转换窗口(ImageTransform)中的调节划片改变图像的表观。在SAM
程序中的任何地方您都能通过点击缩略图查看图像。若确定调整到符合您要求的图像时,点
•SelectImageI
击按钮舍弃其它不适合的图像来完成获取图像的程序。也可在SAM获取图像的过
程中或之后来保存需要的所有图像,直接点选右键单点缩图窗口内的图像即可进行存盘保留
下来。在决定获取图像的数量时,记住增加SAM图像会导致背景信号的平均。当较多的图
像被获得时,在背景强度水平附近的弱的信号将会变得难以识别。如果辨别最弱的信号很重
要,我们推荐在合适的时间下获得单一的成像。
三、建立全自动图像获取及分析程序(CreatingProtocols)
1.启动分析精灵窗口-STEP1.GELIMAGING
(1)按照应用(NucleicAcid/Protein/Blots)选择相关的程序(Chooseanapplication)
Appk«bcn
NucEAodSls♦
FVotenGek♦CoomassieHue
EloUCopperStan
CustomZincStan
Hamhgo
SikerSUin
CoomasiteRuorOanqs
SYPRORuby
(2)选择成像区域(ChoosetheImagingArea)
ImajbgArea
©Selectgdtype:Bk)-RadPROTEANl£xiGd
OErttcrimo^oorcat]K<6Q|cm(WxL)□
(3)选择成像曝光时间(ChooseImageExposureTime)
tnvjQeExposure
(•)ThesoftwarewJoptnizetheexposuretirefor
OsetexposureOw:|o.5OQsec
(4)选择显示设定(ChooseDisplayOptions,HighlightsaturatedpixelsandImageColor)
2.图像自动分析(AnalyzeImage)・・STEP2.DETECTLANESANDBANDS
+殳定DETECTLANESANDBANDS的参数(LowBandDetectionSensitivity(Low
sensitivity=25)>HighBandDetectionSensitivity(Highsensitivity=75)或自行设定灵敏
度。
3.分子量分析(AnalyzeMolecularWeight)-STEP3.ANALYZEMOLECULARWEIGHT
CMmlDocXRS.二但rx
设定AnalyzeMolecularWeightSettings的分子量标准品(MolecularWeight
Standard)类型,所有Bio-Rad的各类标准品(包括核酸、蛋勺)均已预存。当然,您也可以
根据您的实脸设置您自定义的分子量标准品。并同时设定分子量标准品的泳道及回归方式,
4.报告输出设定(ReportSettings)--STEP4.SPECIFYCONTENTOFREPORTS
E
5.结果(ResultsOverview)及报告(Report)Report
■BroadRangeDilution(ReadOnly)*Mfnfx
Annotation
LaneLabels
Molecular
WeiqM一
Labeb
LaneFrarrn
Stdndard_
Lane-
(1)数据显示信息(DisplayingData)
AnalysisTableLaneProfileStandardCurve七
(2)分析表格设定(Analysis侣bleOptions)居妇
3360573313f2a123O.7516697
SABBAT妣AWtumTaSe_2
回
(3)Lane信息(LaneProfile)n。/
StandardCurveIone1C3叵区)
ELabels□LOQY-AXJS
—Regression▲SCandbds
1
250-▲
四、建立图像分析程序(CreatingImagesAnalyzingProtocols)
1.图像分析(AnalyzingImages)
(1)分析〕其AnalysisToolBox
(A)自动分析(AutoAnalysis)
,」r\Auto-AnaiysislI,一
点选1----1'七人DetectionSettings'面口
设定Detectlanesandbands的参数(LowBandDetectionSensitivity(Low
sensitivity=25)、HighBandDetectionSensitivity(Highsensitivity=75)或自行设定灵敏
度),接着再设定MolecularWeightAnalysisSettings的MolecularWeightStandard>
StandardLanes及RegressionMethod参数。
2.图像工具(ImageTools)
可进行水平或垂直翻转、左右旋转90℃或自由旋转
(Rotate)、裁剪(Crop)、反转(InvertData)及迭合(Merge)。
LaneandB5ds
IsesBands
LaneFinder
3.Lanes及Bands工具(LaneandBandTools)Automatk
(1)LanelabManual...
使用自动(Automatic)或手动(Manual)搜寻Lane功能Allanes
(A)针对所有的Lanes(AllLanes)进行大小调整(Resize)s(Adjust)及删\Resize
除(Delete)等参数调整。
(B)针对单一Lane(SingleLane)进行增加(Add)、弯曲(Bend)、移动
(Move)>宽度(Width)及删除(Delete)等参数调整。srijleLene
(C)利用LaneBackgroundSubtraction进行背景值的扣抵,并可点选(Apply,UAdd
toselectedLane)针对单一Lane进行调整。DDelae
-可以藉由RollingDisk参数设定(1-99mm)来去除背景值。ffBend
OMove
(2)BandsTabLaneandBands
通过DetectBands进行自动搜寻Bands功能或手动进行增加
(Add)、删除(Delete)及(Adjust)等参数调整。
4.分子量分析工具(MolecularWeightAnalysisIdols)
此工具可由已知的标准品测算相对的分子量或碱基对(basepairs)o
5.定量工具(QuantityIdols)
(1)相对定量(RelativeQuantitylab)Quantitylook
从图像中选择已知的标准品(referenceband)及其标准品浓度RelabveAbsolute
(以绿色R表示),其分析结果可从Analysistable观察。Quen«y
Sefectareferencebandon
the8
S-fect
SelectBandstoaddto
calbfattoncuve
I-ect|
StvxiafdRand$:
1«言
代
年*
*2
«*)£
仔
)»M
)
(2)绝对定量(AbsoluteQuantitylab)
通过选择已知标准品浓度的bands(至少两个以上,以R表示),
并设定合适的回归参数计算所得之标准曲线来推算目标bands的绝对浓
度(回归参数设定如Linear(较常用)、Point-to-Point或Cubicspline)。
RegressionMinimumnumberMinimumnumberv/ithRegression
MethodofstandardForceThroughOptionMethod:
LEV
Linear21□Forcethroughor0n
Point-to-Point21
/Ockonbandtoselecta
CubicSpline54/starridedbard
■StandardCurve-1ane1
(3Sho”Sbeblog.Axt;
A
I
H
=
U
=
O
3
三
一
o
s
q
4
05001,0001,5002,000
BandVolumex1000
RegressonMethod:linear
Formula:y=0.006.*x+1.54
R-SquaredVahe0.953908
LMoLWeghtStandardCure7\Ab$.QuanbtySUndardCurve八枕lumeSt*正
Algrmert
6.注释工具(AnnotationIdols)㈤画固也也画
可以通过AddAnnotations工具增加文字批注及箭头批注并TextPfoperbes
可调萃批注相对位雷(Alignment)x文字属性、颜色及旋转方向等参数]
Size:二二J
Cdor
Foreground:
Back^cxjnd:
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