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文档简介
中国医学科学院《临床生物样本库建设与管理指南(试行)》一、总则1.目的与依据为规范中国医学科学院体系内各级临床生物样本库的建设、运行与管理,保障生物样本质量,保护受试者权益,支撑精准医学、转化医学、新药研发等生命科学研究,根据《中华人民共和国生物安全法》《人类遗传资源管理条例》《医疗机构临床样本库管理办法(试行)》等法律法规,制定本指南。本指南所指临床生物样本库,是指标准化开展人类临床生物样本的收集、处理、存储、分发、共享,整合关联临床诊疗、随访等信息的公益性科研基础设施,主要服务于医学研究与疾病防控。2.适用范围本指南适用于中国医学科学院及所属院所、合作网络内各级医疗机构、科研机构建设的人类临床生物样本库,也可为国内其他机构建设临床生物样本库提供参考。3.基本原则(1)标准化原则:全流程遵循统一技术标准与管理规范,保障样本质量可比、信息互通可共享;(2)伦理优先原则:严格落实伦理审查与知情同意要求,保护受试者隐私与合法权益;(3)开放共享原则:统筹资源配置,避免重复建设,推动样本资源合规开放,提升利用效率;(4)安全可控原则:严格遵守生物安全、信息安全相关规定,防范安全风险,保障样本与信息安全。二、基础设施与硬件建设要求1.选址与功能布局(1)选址要求:样本库选址应远离工业污染源、放射性污染源、化学危险源,场地抗震、防洪、消防符合国家相关安全标准,满足生物安全防护二级以上要求。(2)功能分区:样本库应按功能独立分区,实现人流、物流、污流分流,避免交叉污染,核心功能分区包括:①办公与接待区:用于行政办公与人员接待,与核心操作区物理隔离;②样本预处理区:用于样本接收、分装、处理,洁净度要求达到整体万级、核心操作区局部百级,感染性样本预处理应设置独立的负压操作区;③样本存储区:按存储温度独立分区,设置门禁与权限管控,感染性、高致病性病原微生物样本应设置隔离存储区;④质量控制区:用于样本质检、质量控制实验,配备相应实验空间;⑤信息管理区:用于信息系统运维与数据管理;⑥废弃物处理区:用于医疗废弃物暂存与预处理,符合医疗废物管理要求。2.核心硬件配置要求(1)样本处理设备:配备不同规格的低速离心机、高速冷冻离心机、超高速离心机,以及无酶无菌移液器、生物安全柜、超净工作台、组织匀浆器、石蜡包埋机、冰冻切片机、程序性降温仪等,所有设备应满足生物样本处理的精度要求。(2)存储设备:根据样本类型与存储规模配置对应存储设备:常温存储配置密闭避光存储柜;2-8℃配置医用冷藏箱;-20℃配置低温冰箱;-80℃配置双压缩机超低温冰箱,温度控制精度为±1℃;活细胞样本配置气相液氮罐,存储温度稳定维持在-190℃以下。所有存储设备应具备独立的温度监控模块。(3)环境保障设备:配备双回路供电系统,额定功率满足满负荷运行要求,配置备用柴油发电机与不间断电源(UPS),发电机可在停电后15分钟内启动,满负荷运行时间不低于72小时;存储区配备气体灭火系统,禁止采用水喷淋系统,避免样本损毁;配备24小时不间断温度监控系统,温度采集频率不低于每15分钟1次,温度偏差超过设定阈值±5℃时,同步触发光声、短信、平台推送三种报警方式。3.生物安全防护要求常规临床样本处理与存储应达到二级生物安全防护水平,高致病性病原微生物样本应达到三级生物安全防护水平,配备个人防护装备与消毒设施,定期开展环境消毒与生物安全监测。三、样本采集与前处理标准化规范1.采集前准备(1)样本采集项目必须通过本单位伦理委员会审查,完成所有受试者知情同意签署,提前准备无DNA酶、无RNA酶、无内毒素的一次性无菌采集耗材,根据检测目的选择对应抗凝剂:基因组学研究采用EDTA抗凝,细胞功能研究采用肝素抗凝,血清学研究采用无抗凝剂的真空采血管。(2)提前对采集人员开展标准化培训,明确采集流程与质量要求,提前预冷处理耗材与保存液,保障转运过程温度符合要求。2.常见样本采集与前处理标准(1)血液样本:要求受试者空腹采集外周静脉血,采集后30分钟内送至样本处理区进行分离;全血分离血浆/血清的离心条件为1800g、4℃离心10分钟,分离后的样本按100μl-1ml的体积分装冻存,单管分装体积不超过冻存管容积的90%,避免冻胀破裂,同一来源样本应分装为2-3管,减少反复冻融对样本质量的影响。(2)新鲜组织样本:手术切除或活检获取的组织样本,应在30分钟内送至处理区,切取大小约0.5cm×0.5cm×0.5cm的组织块,放入预冷的RNAlater或其他样本保护液中,标记后迅速转移至液氮或干冰中降温,24小时内转入-80℃超低温冰箱或液氮罐长期存储;用于冰冻切片的样本采用OCT包埋,置于异戊烷-干冰混合液中速冻后存储。(3)石蜡包埋组织样本:样本离体后1小时内放入10%中性福尔马林固定液,固定液体积不低于样本体积的10倍,固定时间控制在12-24小时,避免固定过度或固定不足,固定后按常规流程脱水、包埋,常温避光存储。(4)尿液、脑脊液等体液样本:清洁中段尿采集后2小时内送至处理区,4℃条件下1500g离心5分钟,弃上清保留沉渣,分装后-80℃冻存;脑脊液样本采集后30分钟内处理,去除细胞碎片后分装冻存。(5)活细胞样本:外周血单核细胞(PBMC)分离后,检测细胞活率,活率不低于90%方可冻存,冻存液采用90%胎牛血清+10%二甲基亚砜(DMSO),采用程序性降温法降温后转入液氮罐存储。3.转运规范短距离转运(2小时以内)采用填充干冰的保温箱,长距离转运采用带实时温度监控的冷链箱,全程维持转运温度要求(新鲜活性样本转运温度不高于-70℃),全程记录温度数据,温度异常的样本单独标注,评估质量后决定是否入库。四、存储与出入库管理1.存储分类与标识所有样本按样本类型、疾病类型、供者人群、存储温度分区存放,每个样本赋予唯一的永久性识别编码,编码采用去标识化设计,不直接包含供者个人身份信息,实现样本可追溯。不同存储温度的存储要求:①福尔马林固定石蜡包埋组织:10-25℃避光存储,有效期不低于10年;②石蜡切片:-20℃密封存储,有效期不低于5年;③核酸、血浆、血清、冰冻组织:-80℃存储,有效期不低于10年;④活细胞、干细胞:-196℃气相液氮存储,有效期不低于20年。2.出入库管理规范(1)入库:样本处理完成后,核对样本编码、数量、质量检测结果,确认无误后录入样本信息管理系统,分配具体存储位置,记录入库时间、操作人员信息,完成入库。(2)出库:样本利用必须提交正式申请,明确研究用途、研究方案与伦理审查批件,经样本库管理部门与学术委员会审批通过后方可出库,出库时核对样本信息,记录领用单位、领用人、出库时间、样本数量,剩余未使用样本不得重新入库长期存储,避免反复冻融影响质量。(3)盘点管理:每半年开展一次全样本库存盘点,每月抽查不低于10%的在库样本,核对样本数量、存储位置、温度记录,形成盘点报告,对盘亏、位置错误的样本及时追溯原因,更新记录。3.异常事件处理发生停电、设备故障导致温度异常时,第一时间转移样本至备用存储设备,记录超温起止时间与最高温度,对样本质量进行评估:-80℃存储样本超温时间不超过4小时、最高温度不高于-60℃的,可继续存储,标注超温记录;超温时间超过4小时或最高温度高于-60℃的,样本予以销毁,按生物医疗废弃物规范处理,记录销毁信息。五、全流程质量控制体系1.入库存质控所有样本入库前必须完成质量检测,合格后方可入库:①RNA样本:检测RNA完整性数值(RIN),RIN≥7.0、浓度不低于20ng/μl为合格;②DNA样本:检测OD260/280比值,比值在1.8-2.0之间、浓度不低于50ng/μl为合格;③肿瘤组织样本:必须经病理医师复核,确认肿瘤细胞占比不低于60%,明确病变类型与分化程度,记录相关信息后方可入库;④活细胞样本:活率不低于90%为合格。2.过程质控(1)设备校准:所有关键设备定期校准,超低温冰箱、液氮罐温度每6个月校准一次,离心机转速每12个月校准一次,移液器精度每6个月校准一次,校准记录留存10年以上。(2)温度监控:每日人工复核温度记录,确认报警系统功能正常,年度温度记录完整率不低于99%。(3)在库样本质控:每年随机抽取不低于1%的在库样本开展质量检测,样本整体合格率不低于95%,不合格率超过5%时,全面排查存储环境与流程,查找原因整改。3.质量记录管理所有操作记录、质控记录、异常处理记录都应纸质或电子存档,保存期限不低于样本存储期限,样本销毁后记录继续保存10年。六、生物样本信息管理1.信息分类与标准临床生物样本库信息分为五类:①供者基础信息:人口学信息、既往史、家族史等;②临床诊疗信息:诊断、分期、治疗方案、病理结果、影像报告等;③样本信息:样本类型、采集时间、处理方法、存储位置、质控结果等;④随访信息:预后、复发、生存、不良反应等随访数据;⑤研究利用信息:利用样本开展的研究结果、产出信息。所有信息采用统一编码标准:疾病分类采用ICD-10编码,肿瘤分期采用AJCC第8版标准,变量命名符合国家人口健康科学数据共享平台的统一标准,保障信息互通。2.信息系统要求样本库应建立专门的信息管理系统,具备样本出入库管理、信息查询、权限管控、统计分析、对接接口等功能,支持条形码、RFID射频识别等自动化管理,可对接国家人类遗传资源共享服务平台、区域生物样本库平台,实现数据共享。3.信息安全管理(1)所有供者个人信息实行去标识化处理,唯一编码与个人身份信息的对应关系采用加密存储,仅授权人员可访问,符合《中华人民共和国个人信息保护法》要求;(2)信息系统应达到网络安全等级保护2.0三级及以上要求,定期开展漏洞扫描与安全测评,建立操作日志,所有操作留痕可追溯;(3)数据实行每日本地备份加每周异地灾备,灾备地址距离本单位不低于50公里,避免自然灾害导致数据丢失。七、伦理与合规管理1.伦理审查样本库建设、所有样本采集与利用项目必须通过本单位伦理委员会审查,审查通过后方可实施,研究方案变更时重新提交审查。2.知情同意严格落实知情同意要求,充分告知供者样本用途、可能的风险与权益,供者可自主选择知情同意范围:可同意样本用于所有非商业医学研究,或仅同意用于特定疾病研究,或不同意用于商业用途,供者有权随时撤回知情同意,撤回同意不影响供者后续常规治疗,撤回后按要求销毁样本、删除对应可识别信息。未成年人、精神障碍患者等无完全民事行为能力的供者,必须获得监护人的书面知情同意。3.合规管理(1)严格遵守《中华人民共和国生物安全法》《病原微生物实验室生物安全管理条例》,高致病性病原微生物样本的采集、存储、利用按规定报批,落实专人专管要求;(2)严格遵守《人类遗传资源管理条例》,采集、利用、对外提供我国人类遗传资源,按要求向科技部报批,外方单位不得私自获取、利用我国人类遗传资源;(3)临床样本库坚持公益属性,不得用于商业牟利,仅可收取样本采集、处理、存储的合理成本费用。八、人员配置与培训1.人员配置样本库实行负责人负责制,设置核心岗位:①样本库负责人:由副高级及以上职称、具有5年以上医学或生物学研究背景的人员担任,负责样本库整体规划、运行管理;②质量负责人:专职负责质量体系建立与运行监督;③样本管理员:负责样本采集、处理、存储日常管理,存储规模5万份以下的样本库至少配备1名专职管理员,5-10万份配备至少2名专职管理员,10万份以上配备至少3名专职管理员;④信息管理员:专职负责信息系统维护与数据管理。2.培训与考核新上岗人员必须完成不少于40学时的岗位培训,培训内容包括标准化操作流程、伦理规范、生物安全、信息安全,考核合格后方可独立上岗;在岗人员每年完成不少于20学时的继续教育,及时更新知识与规范;每2年开展一次全员岗位考核,考核不合格的重新培训,仍不合格的调整岗位。九、样本共享与利用1.共享原则遵循“公益为主、统筹共享、权益保护、互利共赢”的原则,鼓励打破单位壁垒,推动样本资源开放共享,避免重复采集造成的资源浪费与供者负担,优先支持国家重大科技专项、罕见病研究、公共卫生防控研究等项目。2.共享流程(1)需求申请:利用单位提交正式申请,附研究方案、本单位伦理审查批件、经费证明;(2)审批:样本库学术委员会对申请进行审核,重点审核研究的科学性、合规性;(3)提供样本:审核通过后,按协议提供样本,收取合理的成本费用;(4)成果回馈:利用样本产生的研究成果,应标注样本来源,鼓励将研究原始数据回馈样本库,丰富样本信息。3.知识产权管理利用共享样本产生的知识产权,由供需双方提前约定归属,利用单位享有研究成果的知识产权,样本库享有资源贡献署名权,涉及转化应用的,按约定分配收益。十、监督评估与持续改进1.
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