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某基因诊断电路模块SBML模型分析案例某基因诊断电路模块SBML模型分析案例 1 1 4根据多功能融合诊断电路的RTL图像结构,对其进行SBML模型的建立,由于基因电路元件的SBML模型较为复杂,使用了模块化方法对其模型进行简其中的绿色方框为三输入与门模块代替了图9中较为复杂的与门SBML模型,只保留了输入和输出信号。可以预想,当一个与门的输入端增加时,其SBML为G4模块的SBML模型,其余模块的SBML模型构建原理与之相同:f图2G4模块SBML模型图示为G4模块SBML模型,利用两个5输入或门和1个2输入或门替换原G4Verilog模块的10输入或门,并建立了三输入或门模块替换原Verilog中的三因此将该多指标融合诊断电路进行适度的简化,建立4种独立标志物和4种联合标志物的多指标融合诊断电路的SBML模型进行仿真。该简化融合诊断电路的Verilog模型和SBML模型如下图所示:图3简化融合诊断电路模型图4简化融合诊断电路SBML模型该模型与原模型相比结构大幅简化,但构建原理是一致的,实现的功能也是到的Verilog仿真结果如下图所示:wholemodulesisimulationrwholemodulesisimulationr图5iBiosim仿真结果1该模块输入信号为4种独立标志物控制信号SO~S4和检测基因电路信号真结果可知,输入信号为S=0000,C=0000;U=0100,B=0010。即4种独立标志物诊断模块输入信号均为0,4种联合标志物诊断电路模块,需进行检测的3种标志物组合的检测基因电路信号为低水平,即0。因此独立标志物模块和联合标志物模块输出为Z0、Z1和Z2均为0,最终输出结果Z也为0,即低水平输出。由于输入信号的输入时刻为10s,仿真结果曲线中输出信号在该时刻前存在冲激响应,输出水平较高。但当输入各信号后,输出水平降低至0,符合预期,能正确完成图6iBiosim仿真结果2该模块输入信号为S=0010,C=0010;U=0100,B=0100。即需进行检测的独志物为第三种,且其检测基因电路信号也为高水平。对于4种联合标志物诊断电路模块,需进行检测的3种标志物组合的检测信号为高水平。因此独立标志物模块和联合标志物模块输出为Z0=1、Z1=0和Z2水平输出。由于输入信号的输入时刻为10s,
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