化学信息学(第四版)课件 谭凯 第1-5章 化学信息概论-特种信息资源_第1页
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文档简介

化学信息学课程要求课程内容学习策略课程考核课程大纲应用信息学方法及技术解决化学问题的课程学术搜索,文献数据,共享资源及文献分析管理,AI+化学基础主动性,有效性,实践性的案例教学考勤,上机,考试课程目的要求了解传统的化学文献检。掌握常用文摘数据库、全文数据库、电子期刊、特种信息资源和化学事实数据库的使用,主要是WebofScience、SciFinder、中国期刊网CNKI等的使用。掌握有关化学信息数据库搜索的基础知识。掌握文献管理与分析。了解AI+化学基础推动创新,助力科研。课程使用教材《化学信息学》(第四版),北京:化学工业出版社书号:978-7-122-51268-0,定价:49.80元。教学参考书《化学信息学》,邵学广、蔡文生编著,北京:科学出版社,2001年1月第一版。2005年4月第二版。化学信息学手册-从数据到知识《现代化学信息基础教程》,沈勇、张大经等编著,广州:中山大学出版社,2000年11月。《化学信息学教程》,约翰·加斯泰格尔等,梁逸曾等译,北京:化学工业出版社,2005年1月。Chemoinformatics–ATextbook,J.Gasteiger,T.Engel,WILY-VCH,Germany,2003.教学网站/第一章化学信息概论第一节化学信息与化学信息学

一、化学信息学的产生和发展

二、化学信息学的研究领域

三、信息资源检索的意义与作用

四、化学信息学的课程内容1minute2.5millionshares300Ktweets220KphotosInstagram50KAppsAppStore200millionemails$80Kamazonsales化学信息学的产生和发展化学是实验性学科,目前的理论化学研究无法处理复杂的化学问题,化学家要充分利用大量的化学信息和化学知识,经过实验、数据分析、建模、再实验、再验证的不断完善的过程,将化学实验信息提升为理性的化学知识。计算机与网络技术的发展,化学研究发展了许多新的实验方法,从而得到了大量的实验数据。目前已知的化合物超过4千多万。化学信息量的快速增长,信息的急剧膨胀与有限的学习时间及吸收能力形成了巨大的矛盾,反过来又要求使用计算机和网络对海量信息进行高速和精确的处理和利用,以达到产生和处理的相对平衡。化学信息的收集、处理、管理和利用,必不可少地要借助具有高效和共享性的计算机和网络。

化学物质的数据统计

截止1999年12月31日,美国化学文摘登记的分子、化合物和物相数目已超过2300万种,但有百年历史的MRCK数据库的印刷版MerckIndex,12thEd.(1996),收录的分子和化合物只有10330种,占0.05%,从最大的试剂商店和药房能买到的药品和试剂不超过1万种左右。所以目前在起作用(包括可为人类服务和为非作歹的)的分子和化合物不到0.05%,而其中有突出贡献的更不到0.001%。99.9%以上的分子深藏在文献库中。

化学信息学的定义K.Brown定义为:“化学信息学是将数据转化为信息和信息提升为知识的总称,其主要目的是在药物先导化合物的辨认及优化领域做出快速决定”。李梦龙等人认为:“化学信息学是利用计算机和计算机网络技术,对化学信息进行表示、管理、分析、模拟和传播,实现化学信息的提取、转化与共享,揭示化学信息的内在实质与内在联系的学科”。G.Paris的定义:“化学信息学是一个一般的术语,它包括化学信息的设计、建立、组织、管理、检索、分析、判别、可视化及使用”。J.Gasteiger的通用的定义:“化学信息学是应用信息学方法解决化学问题的学科”。化学信息学是信息科学与化学的交叉学科。化学信息学的研究领域

化学是研究化学物、化合物性质和化合物转换的学科。化合物和化学反应是化学的二个主要研究对象,对化合物的研究是静态,而对化学反应的研究是动态。化合物的性质与化学结构是密切相关的(构效关系),化学结构的研究也是至关重要的。

化学信息主要来自于由实验测量或理论计算的数据的组合。这些数据包括化合物的物理、化学性质、成分、结构信息和光谱图形等。化学信息经过收集、浓缩、提取和推论才能提升成为化学知识。化学信息学的研究领域(续)

化学信息学应用现代信息技术构建信息处理系统,用于处理大量的化学信息资源,帮助化学家组织、分析和理解已知的科学数据,正确地预测化学物质的性质,开发新化合物、材料和方法。化学信息学的研究,涉及分子模拟、化学结构的编码、检索、化学数据的可视化等研究领域。广义上说,使用信息学方法处理上述化学基本问题都是化学信息学研究领域。换言之,化学信息学所涉及的研究领域为:应用计算机科学方法或信息学解决化学问题,对化学信息进行有效的存储、操作和处理,使化学信息合理地提升为化学知识。

生物信息学的主要研究集中于基因和蛋白质。在传统上,化学信息学以小分子或中等分子(含数百或上千个原子)为研究对象,可用于开发出小分子的新药。生物信息学是研究更大的分子,它可为新药开发提供识别蛋白质目标。定量结构与活性关系分子模拟结构解析化学反应与合成设计化学信息课程的内容国外更多的是将化学信息学视为一个专业方向。除了学习专业化学知识外,还必须学习数据库设计、程序的编写、分子模拟等方面内容,加强其计算机和理论化学的知识水平,且大多属于计算机科学、化学计算和数据分析等领域。国内由于课时的限制,在教学内容和教科书的编写方面,较为狭义的化学信息学定义(化学文献学为主),应是更可接受的。化学信息学除了涉及化学信息的获取、管理、处理、推演和模拟外,近年来化学结构的可视化(以图形的方式对化学信息进行描述)是化学信息学最值得注意的成就之一。

信息资源检索的意义与作用启迪创新:科研工作具有继承和创新两重性,要求科研人员在探索未知进行创新之前,应该尽可能地继承和利用与之相关的信息。拓宽视野:21世纪信息与知识的积累日新月异,出现了大量的边缘科学和交叉科学。面对知识频繁更新的世界,需要接受终身教育,在不断的教育中更新知识,适应环境的变化。培养能力:现代教育不单纯是知识的传授,更重要是要大力进行各种能力的培养,其中包括自学能力、思维能力、研究能力、表达能力、创新能力、终生教育能力、组织管理能力和收集处理信息的能力。

提高素质:信息素质是信息社会中实现对知识的探索和发现的综合能力,它是进入信息社会赖以生存的通行证

。牛顿名言:“如果我比笛卡尔看得远些,那是因为我站在巨人们的肩上的缘故”。第二节电子信息和数据库一、电子信息二、数据库三、在线化学数据库电子信息联机信息资源:具有学科复盖面广,信息资源丰富,信息追溯年代长和查准率高的特点。通过网络享用联机信息资源,使用费用相当昂贵,要具有一定经济实力的单位才可承担。

光盘信息资源:信息量较少,更新周期较长,使用费用低。在网速较慢、经费有限之时,利用光盘数据库仍是一种获取信息的有效途径。

Internet信息资源:Internet可在网络上进行多媒体信息的收集、分类、存放、发布和交流,向网上的用户提供信息检索及其它交互式服务。在WWW页面设计上具有结构合理、可读性强、用户界面友好、及时性强和使用费用低的优点。

电子信息资源以电子数据的形式,将文字、声音、图像等形式的信息存储在光、磁等介质上。电子信息表现形式为文本、超文本、多媒体和超媒体。

记录型文献数据结构

数据库结构

记录的排序和索引

顺排文档:进行检索时,必须以完整的记录作为检索单元,从头至尾逐条查询,检索时间长。

倒排文档:使用标题字段进行倒排的文档,称为标题索引文档。索引是一种加快检索速度的有效手段。

化学信息数据库的类型文献数据库事实数据库结构数据库书目数据库全文数据库专利数据库数值数据库谱学数据库目录数据库计划数据库结构数据库反应数据库数据库的类型

文献数据库:书目数据库、全文数据库、专利数据库。事实数据库:数值数据库、光谱数据库、化合物目录数据库、研究计划数据库。结构数据库:化学结构数据库、化学反应数据库。按化学信息的方式分类:第三节信息检索的方法和步骤一、信息检索方法二、信息检索效果的评价三、信息检索技术四、信息检索步骤信息检索的方法普查法:选择正确的关键词,使用合适的逻辑算符组合检索表达式。阅读检索结果,从中选择符合要求的结果。由近及远进行检索。它是一般的通用方法。追溯法:检索现有的文献、专著、综述,再从其中提供的参考文献为线索进行查询。查阅原文,从中提供的参考文献再进行查询。分引用追溯和被引用追溯二种。追踪法:收集该研究领域专家的姓名,使用作者姓名为检索字段,检索该专家的所有文献,从中挑选需要的部分,并跟踪其最新研究成果。相关法:浏览检索系统的相关记录,从中选择中符合要求的文献。注意数据库自带的相关功能。信息检索效果的评价查全率(R):检索出的相关信息量(w)与该系统信息库中存储的相关信息量(x)的比率称为查全率,

R=w/x×100%

。查准率(P):检出的相关信息量(w)与检出信息总量(m)的比率称为查准率,

P=w/m×100%

。漏检率(O):O

=1–R=1-w/x×100%

。误检率(N):

N

=1-P=1-w/m×100%

。

如果一个检索系统中与某一课题相关的信息共250条。检索操作后,实际检出了400条信息,其中相关信息为200条,此次检索效率可计算为:R

=[200/250]×100%=80%

O

=

1-80%

=

20%P

=

[200/400]×100%=50%

N

=

1-50%

=

50%信息检索技术

逻辑算符检索:AND,OR,NOT。多数据库使用优先次序为NOT>AND>OR

信息检索技术(续)

位置检索:

With(W、nW),表示算符两侧的检索词按此前后衔接的顺序排列,词序不可颠倒。Near(N、nN)表示算符两侧的检索词必须紧密相连,两词词序可变。Subfield(S)表示算符两侧的检索词必须同时出现在文献记录的同一子字段(句子、短语)。Field(F)表示算符两侧的检索词必须同时出现在同一个字段中。Citation(C)表示算符两侧的检索词必须同时出现在一条文献的记录中。Link(L)表示算符两侧的检索词之间有一定的从属关系。截词检索:有限截断(?)和无限截断(*)。截词检索隐含着逻辑或的关系。分为:左截断(前截断)是指检索词与被检索词之间的后部相同(后方一致);中截断(前后截断)是指检索词与被检索词之间只需中间部分相同(词头、词尾都可变化);右截断(后截断)指检索词与被检索词间的前部相同(前方一致)。

信息检索技术(续)

限制检索:限制符的作用是限制检索词或检索表达式在数据库记录中出现的字段位置。数据库中可供检索的字段通常分为基本检索字段和辅助检索字段。基本检索字段主要有题名(TI)、文摘(AB)、主题词(DE)和标识词(ID),适用于各种数据库。辅助检索字段主要有作者(AU)、语种(LA)、出版年代(PY)、期刊名称(JN)和文献类型(DT)等字段。一般说来,数据库的提供的字段越多,其检索方式就越多,可以使用多字段构建复杂的检索表达式,进行高级检索。信息检索步骤流程图信息检索步骤

检索课题分析:检索目的和要求的分析;检索类型的确定(普查型、特定型和探索型)。制定检索策略:选择检索数据库;确定检索词;编写检索表达式。检索策略的实施和调整:实施检索操作,获取检索信息;评估检索结果。为了减少滥检、漏检和缺检,可进行检索策略的调整,主要分为缩检和扩检二种。缩检主要方法有:主题细化;选择更专指的检索词;运用逻辑算符AND、NOT;运用位置算符WITH、NEAR;减少字段检索;对检索结果进行二次检索。扩检主要方法有:对己确定的检索词进行其同义词、同义的相关词、缩写和全称检索;利用数据库提供的词表输入规范词;使用运算符OR等。检索结果的筛选、整理和原始信息的获取。数据库的选择数据库的类型。例如,书目数据库、事实数据库或结构数据库;文摘数据库或全文数据库。数据库所收集的数据内容所涵盖的学科领域和收录范围。数据库的现状,包括数据库收录的文件类型、数据量、存储年限、更新周期、语种、媒体介质和辅助工具。数据库的检索质量、权威性和检索速度。数据库提供的系统功能和检索方式。数据库的使用权和检索费用。原文信息的获取

全文链接服务:有的数据库系统提供了全文链接服务,例如WebofScience、Beilstein/Gmelin。(要有使用权)电子期刊:可根据检索到的文献信息(如出版商和期刊名),链接出版商和电子期刊网站,下载文献的原文的PDF文件。(要有使用权)印刷品原文:查找所在图书馆的馆藏,要获取印刷品原文,进行复印。(要有订阅)馆际互借服务:许多图书馆开设了此项服务。

原文传递服务:利用各种通信手段、从各种文献服务中心购买文献信息。(付费)

向作者索取原文:根据检索到的文献信息(作者姓名和地址),用户可直接发信或发送电子邮件向作者索取原文。可使用多种方法取得作者的电子邮件地址。(免费)思考与实践1、本节总结了几种类型的检索方法,你还能找到其他类型的检索方法吗?2、信息、事实、情报、知识、文献分别从不同角度理解数据,你能结合亲身经历举例说明它们之间的不同吗?3、本节介绍了文献检索的步骤,普通的搜索引擎是不是都具备了这些步骤?请举例说明。4、利用所学的知识,对你所了解的学术门户网站进行评价,并相互交流。36第二章

印刷类化学文献信息第一节图书分类法简介第二节重要工具书、专著和大全第三节重要化学期刊简介第四节化学文摘37

重要化学期刊简介

科技期刊科技文献的主要来源特点:信息量大、专业性强、信息及时和有连续性是文献索引等检索工具摘录的主要对象。零次文献:书信、论文手稿、笔记、实验记录、会议记录。•一次文献:期刊论文、研究报告、会议论文、专利说明书、学位论文、技术标准等,亦称原始文献。•二次文献:通过科学的方法,将分散无序的一次文献进行加工、整理,使之成为系统有序的信息。例如题录、书目、文摘、索引等。具有浓缩性。•三次文献:对零次、一次和二次文献进行综合分析而编写出来的成果。例如述评、综论、进展报告、数据手册、年鉴等。具有综合性。38

化学期刊的学科分类

一.综合性自然科学期刊二.化学学科综合性期刊三.专业性化学期刊四.综论类期刊39

期刊的分类

40化学文摘(CA)

•CA的概况•CA的文摘•CA的索引•CA的索引途径•CA的检索实例41

CA的概况

美国《化学文摘》(ChemicalAbstracts)是“KeytotheWorld’sChemicalLiterature”。摘录广泛:收录了136个国家用56种语言出版的14000文献,包括期刊、图书、学位论文、科技报告、会议论文、专利等,占化学文献总量98%。内容以化学化工为主,涉及生物、医学、轻工、冶金、物理等领域,最常用的检索工具。•出版迅速:印刷版为周刊,两卷/每年。•索引完备:由CA文摘和CA索引组成。•历史悠久:1907年创刊。•文摘质量高:兼并了德国化学文摘。42

CA的文摘

CA以报道性为主,其内容包括研究的目的和范围、新的化学反应、化合物、材料、工艺、操作、设备、性质机器理论,新知识的应用,以及研究结果和作者的判断、结论等。CA的编排方式按内容分成五大部分,80类目。1.生物化学(Biochemistry)。2.有机化学(OrganicChemistry)。3.高分子化学(MacromolecularChemistry)。4.应用化学和化学工程(AppliedChemistryandChemicalEngineering)。5.物理化学、无机化学与分析化学(Physical,InorganicandAnalyticalChemistry)。43

CA文摘的信息

标题(篇名)来源(出处)作者姓名作者单位联系地址其他:文种、出版商、价钱不同类型的文献略有不同46

CA的索引

期索引每期都带有关键词索引;作者索引;专利索引和专利号对照等四种索引。卷索引①卷文摘索引(直接给出文摘号):主题索引(化学物质索引、普通主题索引),分子式索引,作者索引,专利索引(专利号索引、专利对照索引)。②卷辅助索引(不直接给出文摘号):环系索引,杂原子索引(75卷起停刊)。③卷指导性索引:索引指南,索引指南增刊,登记号索引。累积索引10卷(5、10年),性质同卷索引。47

主题索引(SubjectIndex)

(一)1907-1915年初级阶段(二)1916-1966年发展阶段(三)1967-1971年成熟阶段(四)1972-至今分成普通主题索引和化学物质索引,还出版了索引指南作为辅助工具。48普通主题索引(GeneralSubjectIndex)普通主题简单地说,除具体化学物质之外的概念性名称和非特定化学物质名。普通主题索引是CA最主要的索引之一。它可检索除化学物质名称外的所有名称。

普通主题索引

GeneralSubjectIndex

50

化学物质索引(ChemicalSubstanceIndex)

化学成分确定、结构明确、价键清楚的化学物质作为索引的标题,按字母顺序排列,它是CA索引中使用最广泛的索引之一。化学物质包括:已知的元素、化合物及衍生物、特种金属的合金、矿物、特殊化合物的混合物和聚合物、各种抗菌素、酶、激素、蛋白质、多糖及基本粒子等。化学物质索引以化学物名称为主题词,按字母顺序排列,基本格式如下:主题词(登记号),副标题说明语,文摘号54

D.检索实例

检索有关“发酵法L-赖氨酸”的文献一.选择主题词:L-赖氨酸(L-lysine)二.选择副标题:制备(preparation)三.根据选定的标题、副标题查阅化学物质索引:以105卷为例,查得:L-Lysine[56-87-1],preparationmanuf.ofbyfermn.,R113473m四.查阅文摘,决定是否需要获取原始文献55作者索引(AuthorIndex)

将作者、合作者、团体名称(企业、研究机构等)按字母顺序混合编排。个人作者以姓在前,名在后方式显示。期作者索引的格式:MassonA246438sMassonCR246008bMatsushitaR249135bMatsushitaElectricIndustrialCo.Ltd.P238230c56AuthorIndexLastName(alphabetically)5758专利索引(PatentIndex)

专利号索引(NumericalPatentIndex)59专利索引(PatentIndex)

1981年起,由专利号索引和专利对照索引合并。

已知某个与课题有关的专利,利用专利索引就能查到与发明内容基本相同的所有专利文献。60

专利索引的格式

JP(Japan)

59/074288A2[8474288],101:160176u

US4483748A

US4545863A(Continuation-in-part)

104:98148t

59/078527A2seeEP107356A2

59/074288A2[8493055],101:210764g

AU560016B(Related)

部分连续专利相关专利相同专利61分子式索引(FormulaIndex)

按分子式符号的英文字母顺序排列,相同分子式下又按化学物质名称的字母顺序排列。

分子式按Hill系统排列

含碳化合物碳在前、氢在后,其他按字母顺序;不含碳化合物按分子式内元素字母顺序。62

分子式索引的格式

C8H8O3

Benzaldehyde,2-hydroxy-3-methoxy- [148-53-8],74791w Benzeneaceticacid,-hydroxy-[90-64-2],

SeeChemicalSubstanceIndex monopotassiumsalt[101244-60-4],P14855r C11H18N2

Compd.,b1292-3o,1520p C14H10

9H-Fluorene,9-methylene-[4425-82-2],51046u

ForGeneralderivs,See

ChemicalSubstanceIndex

取代基母体化合物名称修饰项63环系索引(IndexofRingSystems)

环系索引需与化学物质索引或主题索引配合使用。

3-RINGSYSTEMS

6,6,6,

C5N—C6—

C6 Benzo[f]quinoline Benzo[h]quinoline 1,4-Ethenoisoquinoline 2,6-Methano-3-benzazocine环的数目环的大小环上元素组成化合物名称64索引指南(IndexGuide)

1968年起开始使用,它是查找化学物质索引和普通主题索引必不可少的辅助索引。

内容主要包括:

see(见)

Seealso(参见)

Headingnotes(标题注释)

Illustrativestructuraldiagrams(结构式图解)

Hierarchiesofgeneralsubjectheadings(普通主题层次表)65see(见)

CA对化合物命名有自己的原则,同一化合物在不同命名法中有不同表现方式,CA的检索只取CA命名法,其他名称如习惯名、商品名等通过指南查CA选用名。

例如:

ethylene(乙烯)

Seeethene VitaminC SeeL-Ascorbicacid(抗坏血酸)

EDTA(乙二胺四乙酸)

SeeGlycine,N,N’-1,2-ethanediybis[N-(carboxymethyl)]- 66Seealso(参见)

为扩大检索范围,以获得更多相关资料,索引指南用“参见”形式引出一系列与标题有关,但不完全同义的标题词,以供参考,可提高查全率。

例如:

Proteins(蛋白质)

Seealso Aminoacid(氨基酸)

Peptides(肽)

67

Headingnotes(标题注释)

标题注释主要说明索引标题的含义、范围及标题之间的区别和联系。

例如:

Halogens(卤素)

StudiesoftheclassofcompoundscomprisingPeriodicGroupVIIAareindexedatthisheading.Forstudiesofspecifichalogens,seethosespecificheadings.

68Hierarchiesofgeneralsubjectheadings (普通主题层次等级表

)

普通主题索引的主题词按学科内容分58各大类,排列成层次表,用点数表示主题级别,其格式:

54. TECHNOLOGICALPROCESSESANDPRODUCTS (大类名)

Environmentalpollution (一级主题)

Airpollution Wastes (二级主题)

Wastegases Wastesolid (三级主题)

Exhaustgases Dust (四级主题)69检索实例

检索有关“食物中维生素C测定方法”的文献 先查索引指南,得

VitaminC seeL-Ascorbicacid[50-81-7]

根据索引指南提供的名字查化学物质索引

L-Ascorbicacid[50-81-7],analysis detn.of infood,R138205w infruitandvegetablejuice,bymicromethod withdichloroindophenolindicator,4171y

70检索“合成氨生产中的有关安全问题”的文献

以Ammonia(氨)作标题查化学物质索引,查得

Ammonia[7664-41-7],Preparation safetyin,54524j safetyindesignandoperationof,39480y ...

以88卷为例,共4篇。71

若以Safety(安全)为主题词先查索引指南,查得与安全有关的相关主题词如下:

Safety Seealso Accidents Disease Healthhazard Againstfire See CombustiblesFire

以88卷为例,共十几篇,可提高查全率。72登记号索引(RegisteryNumberIndex)

化学文摘中化学成分、结构及化学键性质确定的每一种化学物质都有唯一的CA登记号。

1969年起出版登记号索引(71、72-73、74-75卷)

1974年起改出登记号手册(CASRegistryHandbookNumberSection)登记号由三部分组成,用短线联接,第一部分最六位数,第二部分两位数,第三部分为一位数。73

登记号索引(或手册)按号码由小到大顺序排列其格式如下:

1585-07-5Benzene,1-bromo-4-ethyl-C8H9Br

登记号索引提供CA命名的主题词和分子式,不提供文摘号,必须与化学物质索引或分子式索引连用。登记号CA选用名分子式74登记号索引的主要用途由登记号查出化合物CA选用名,再转查化学物质索引。

文摘中原料及产品都有登记号,越来越多的检索工具、专利说明书、期刊和数据库采用通用的CA登记号。获得主题索引中的化合物名称。

对苯二甲酸

1,4-Benzenedicarboxylicacid[100-21-0]

terephthalicacid(76卷以前) (化合物名称的变化)75

由登记号查某些天然化合物、商品牌号等的分子式,转查分子式索引。

4--葡糖麦芽糖(Panose)的名称及登记号

D-Glucose,O--D-glucopyranosyl-(16)-O--D-glucopyranosyl-(14)-[33401-87-5]

由登记号查得分子式为C18H32O16

查分子式索引一种化合物,不管有几个名称,只有一个CA登记号。同分异构体,组成相同,结构不同,登记号也不同。76资料来源索引(CASSourceIndex)

资料来源索引是CA摘用刊物的全称及其他有关内容的辅助工具。内容包括:刊名缩写、刊名全称、出版文种、刊物历史,编辑和出版地点及收藏单位等。

1907-1969年来源索引

1907-1974年来源索引

1907-1979年来源索引

1974年起同时出季度增刊,第四季度增刊相当于年卷本。77

检索方法

资料来源索引按出版物缩写的字顺编排,查阅时讲文摘中的刊名缩写看成一个整体,就能找到刊名的全称及其有关内容。

如 ChemEngNews Chemical&EngineeringNews

对于非英文刊物,查得全称后,再将其还原成刊物原文种的刊名。78CA的索引途径主题途径索引:关键词索引、主题索引(化学物质索引、普通主题索引)。其它途径索引:作者索引、专利索引、分子式索引、环系索引。辅助途径索引:索引指南、登记号索引、资料来源索引。

CA的索引途径如下:79索引指南登记号索引化学物质索引普通主题索引分子式索引环系索引化学文摘环系索引资料来源索引关键词索引作者索引专利索引80各种索引的相互关系和查阅方法已知所查对象的名称,要用“化学物质索引”或“普通主题索引”。已知所查对象为化学物质的学名,要用“化学物质索引”。已知所查对象为习惯名、俗名、商品名或累属性的集合名(如聚合物、橡胶等),要用“普通主题索引”。CA索引类型很多,每一种都有自己特定的作用,查阅文献时必须了解用什么索引,从什么地方入手。81要查化工过程、性能、分析方法、应用等,需用“普通主题索引”。根据已知名称在上述两种索引都查不到时,询问“索引指南”,确定统一主题词。已知化学式,不知道英文名称,需查“分子式索引”。结构比较复杂的环化物,可先用“环系索引”,确定统一主题词,在查“化学物质索引”。已知物质登记号,查“登记号索引”,确定统一主题词和分子式,再查“化学物质索引”或“分子式索引”。82常用的CA的索引关键词索引:关键词选择比较自由,不受命名规则的约束,关键词索引一般是根据原始文摘中作者所用的名词汇集起来的,有的关键词与主题词一致,有的则不能做主题词。主题索引:主题词可以选择元素和化合物名称、反应名称、用途名称、化工过程名称、物理和化学名称等。副题起限制主题范围的作用,副题分两大类,第一类是普通名词,第二类是化学名词、取代基团和官能团等。索引指南:为压缩主题索引的篇幅和便于使用,将其中的常参见同义词、说明语、结构式抽出。凡在主题索引中找不到的名称,用索引指南可以找到统一主题词。它还指出相关主题,避免遗漏。

83累积索引是否可以代替全部卷索引?

从理论上说,累积索引应该是代替全部卷索引因为累积索引是各卷索引的累积,但实际上并不如此。累积索引的优点只是省时间,一下子可以解决十年内的文献,但相当不全面,累积索引选录的并不很多,有时只有卷索引大40%。读者如果不是急于求成,而要求齐全的话,还是多化一点时间,查卷索引为好。84文摘号前B、P、Pc和R表示什么意思?B是Book的缩写,表示原始文献为图书;P是Patent的缩写,表示文摘根据专利实验部分摘录;Pc是PatentClaim的缩写,表示文摘根据申请项目摘录;R是Review的缩写,表示原始文献为综述。85文摘中缩写字何处可查?

CA中每年第一期卷首均附有常用词缩写表,可供查阅。CA的期索引有何作用?

如果查最近期动向,还没有卷索引,则必须查每期后附的关键词索引、作者索引或专利索引。

86CA检索实例(1)

检索有关“处理汽车尾气的催化转换器”。(一)选择主题词(以94卷为例) 可供选择的有:exhaustgas;catalysis;catalyticconverter等。查阅索引指南中的“普通主题等级索引”发现只有exhaustgas,catalystsandcatalysis

两词可作为普通主题索引中的标题词。(二)查普通主题索引87CatalystsandCatalysis

forexhaustgastreatment convertercontg.,P108523c converterscontg.,overheatingof,preventionof,

devicefor,P144700s ...... Inexhaustgastreatment converterscontg.,P108517dExhaustgascatalyticconverterfor,P108517dtreamentof catalyticconverterfor,P108522b,P108523c88(三)阅读文摘,筛选与课题密切相关的文献 例如,从上述检索得到文献号108517d。

94:108517dAcatalyticconverterfortreatmentofautomobileexhaust.MitsubishiMetalCorp.Jpn.Tokkyokoho8026289(cl.F01N3),12Jul1980,Appl.72/68712,11Jul1972;3pp.(四)查阅原始文献 日本公开专利,JP8026289。89CA检索实例(2)

检索有关“香料沉香醇的不对称合成”(一)沉香醇的英文名称为Linalool或Coriandrol,查索引指南得:

Linalool See/1,6-Octadien-3-ol,3,7-dimethyl-[78-70-6] Coriandrol See/1,6-Octadien-3-ol,3,7-dimethyl-(S)-[126-90-9]90(二)查化学物质索引(以105卷为例)

1,6-Octadien-3-ol —,3,7-dimethyl-(linalool)[78-70-6] ofbergamotoil,102315k ...... (S)-(coriandrol)[126-90-9] asym.Synthesisof,43100m91(三)查文摘,进一步获取原文

105:43100mAnasymmertricsynthesisofenantiomericallypure(S)-(+)-linalool(3,7-dimethyl-1,6-Octadien-3-ol)andaformalsynthesisof(R)-(-)-linalool.Ohwa,Masaki(Dep.Chem.Univ.NorthCarolina).J.Org.Chem.1986,51(13),2599-601(Eng).第三章常用文摘与全文数据库化学信息学WebofScience

数据库科技信息研究所(InstituteforScientificInformation,简称ISI)简介科学引文索引(ScienceCitationIndex,简称SCI)WebofKnowledge(万维网知识平台)

科学引文索引名称

科学引文索引(ScienceCitationIndex,简称SCI)。内容

主要摘录科技期刊和专利,涉及生命科学、临床医学、物理、化学、农业、生物、工程技术等。印刷版出版情况

1961年创刊,1965年起改为月刊,1979年双月刊,出年刊、5年和10年累积本。UniqueData独特Dr.EugeneGarfieldFounder&ChairmanEmeritus

ISI,ThomsonScientificDr.Garfield1955年在

Science

发表论文提出将引文索引作为一种新的文献检索与分类工具:将一篇文献作为检索字段从而跟踪一个Idea的发展过程及学科之间的交叉渗透的关系。SCI独特的检索体系引文是学术论文中所引用的参考文献。引文索引是论文后所附参考文献的作者、标题和期刊等项目,按照引用与被引用的关系进行排列而编制的索引。文献之间的相互引用的关系反映了科学文献之间的内在联系。引文索引检索是传统检索的一种补充和改革,它从参考文献之间引用与被引用的关系,提供新的检索途径。引文索引的纵向联系可将同一学科过去、现在和将来的相关文献信息连接起来,在一定程度上显示了学科研究的发展过程。引文索引的横向联系可将不同学科、不同领域的相关研究连接起来。利用科学研究的内在逻辑联系,可能发现许多隐藏的重要信息,从而产生许多新的构思与创新。引文索引在检索过程中大大提高了检索结果的相关性。目前,越来越多的数据库也提供了引文索引的检索方法。独一无二的引文索引引文索引却是从另一角度,即从文献之间相互引证的关系角度,提供新的检索途径。其优点为:检索的高效率检索结果的高度相关性发掘文献之间的内在关联,新的连接与创见可将过去、现在以至将来的相关文献讯息连接起来;具有“越查越新”、“越查越旧”和“越查越深”的功能。将不同学科、不同领域的相关研究连接起来,可发现“科技发展的生长点”和进行有效的“创新”。研究人员由此可以发现许多过去不知道却又非常重要的信息,从而产生许多新的创见与发现。这也正是引文索引数据库作为科学研究数据库的巨大价值所在。相关记录2004200820021994引用

越查越广20142013施引文献20112015越查越新2010参考文献2001200719982000越查越深引文索引系统打破了传统的学科分类界限,既能揭示某一学科的继承与发展关系,又能反映学科之间的交叉渗透的关系WebofScience智能检索(SmartSearch)输入字段自动判断是TOPIC(主题)、期刊或AUTHOR(作者)高级检索TS=(fullereneANDnano)ANDCU=(china)NOTAu=(zheng)被引参考文献检索输入被引用作者信息CitedAuthor:ErtlG输入被引用著作名CitedWork:Science化学结构检索检索结果文献记录的输出检索结果文献记录的输出在检索结果中,给需要输出的记录做上标记。添加到标记结果列表。选记录字段(默认字段为标题、著者、出处)选择相应的输出形式:Endnoteonline、纯文本文件、RIS等或使用E-mail发送。106

作者E-mail联系或作者主页SciFinderWeb108美国化学文摘社创建于1907年ACS的分支机构密切关注,索引和提炼着全球化学相关的文献和专利最早创立了《化学文摘》总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市SciFinder数据库的创建源于大批量的信息的摄取109U.S.PatentOfficePatents,journals,web,catalogs,etc.CASScientists110SciFinder登录界面/111SciFinder中的文献记录112一篇完整的文献界面包括:1.题录信息2.摘要信息3.文献中重要的概念4.文献中重要的物质5.书目信息6.获得文献中的物质,反应,引文等7.文献中的引文信息SciFinder中的KMP113KMP是SciFinder提供的自动提醒功能,能及时将最新资讯,推送到用户的邮箱中检索Tips:可以根据根据研究的进度,设置定题检索频率,每周,每月建议将Excludepreviouslyretrievedreferences前面的勾,勾掉,SciFinder中的知识图谱114SciFinderWeb中的物质结果及物质检索115SciFinder中的物质结果界面116一个完整的物质结果界面包含:物质详情连接文献连接反应连接商品信息连接管制品信息连接谱图连接实验性质连接117SciFinder中的物质详情界面功能方面物质名称,CASNo分子式结构式理化性质推荐的物质检索功能有机物,天然产物及衍生物

结构比较方便无机物

分子式比较方便高分子化合物

首先分子式,其次结构118SciFinder中的物质检索方法物质名称检索119检索Tips:直接输入物质的名称,CASNo,俗名,都能检索一次最多检索25个物质,用换行换开建议一次最多检索3-5个,因为给出结果的顺序和输入的顺序是不一样的。理化性质检索120分子式检索121检索Tips:分子式的检索,需要按照HILL排序进行,简单的说CH写前面,其他的按照字母顺序排序多组分物质,需要用“.”分开结构式检索—精确检索122123SciFinder中的检索结果检索Tips:SciFinder中的亚结构检索,获得的是包含所绘制结构片段的所有化合物与所绘制结构不同的可能是原子上面的取代会不同,又或者环系发生稠环等可以使用结构的Analyze/Refine功能对检索到的结果进行处理124SciFinder中的结构结果后处理—Analyze检索Tips:分析方面,提供6种分析手段提供靶点标记,生物活性分析,帮助快速对检索到的物质进行筛选SubstanceRole分析,帮助获得物质研究角色的文献125SciFinder中的结构结果后处理—Refine检索Tips:限定方面,提供7种限定手段Isotope-Containing,用于获得是否包含同位素的物质PropertyValue,用于通过理化性质的数值对物质进行限定AtomAttachment,用于通过对结构取代的限定,帮助获得某位点的不同取代基团分布。精确结构,亚结构,相似结构检索区别126精确结构检索亚结构检索相似结构检索127SciFinder反应检索检索要求:1:吡啶环2,3,4位上存在一个硝基还原成氨基2:吡啶环5,6位上存在一个卤素128SciFinder中的检索结果工程索引(EngineeringIndex

)美国《工程索引》(TheEngineeringIndex,简称Ei),1884年由美国工程信息公司(EngineeringInformationInc.)创办,是一个主要收录工程技术期刊文献和会议文献的大型国际权威检索系统。◆世界三大检索工具:SCI(ScienceCitationIndex)、EI(TheEngineeringIndex)

、ISTP(IndextoScientificandTechnicalProceedings)/EngineeringVillage快速检索输入检索词通过二次检索和精炼结果列表进一步优化检索全文链接检索结果处理中国知网即中国知识基础设施工程,简称:CNKI(ChinaNationalKnowledgeInfrastructure)是教育部主管、清华大学主办,创立于1995年,由中国学术期刊电子杂志社、同方知网技术有限公司研发的世界上全文信息量规模最大的“数字图书馆”。是以实现全社会知识信息资源共享为目标的国家信息化重点工程,被国家科技部等五部委确定为“国家级重点新产品重中之重”项目。我国数字出版行业领军企业;合法拥有我国90%以上公开出版资源的数字版权。中国知网全球学术快报手机APP端网页端平

台首页首页展示输入检索词选择检索范围将检索功能浓缩至“一框”中,根据不同检索项的需求特点采用不同的检索机制和匹配方式,体现智能检索优势,操作便捷,检索结果兼顾检全和检准。知网文献检索技巧—一框式检索保持传统分类,可收起功能说明及功能引导区内容检索检索控制检索结果区知网文献检索技巧—高级检索通过条件筛选、时间选择等,对检索结果进行范围控制。可同时输入多个检索项进行查找,不同检索项之间关系:AND、OR、NOT,并可通过选择精确或模糊的匹配方式,提高查准率知网文献检索技巧—高级检索知网文献检索技巧—出版物检索知网文献检索技巧—出版物检索知网文献检索技巧—出版物检索检索结果分析点击“中文”或“外文”,查看检索结果中的中文文献或外文文献。点击“总库”回到中外文混检结果。左侧分组从多个维度揭示内容分布,注重主题揭示,权威性推荐,体现全球性,支持跨项组合;主题、作者、机构分组细化;期刊CI指数排序、作者h指数排序;帮助读者快速精准挑选优质文献。检索结果分析横向展示所有资源类型文献,各资源类型下显示符合检索条件的文献量,突显总库各资源的文献分布情况,可点击切换查看不同资源类型下的文献。突出中外文文献整合。检索结果分析第四章常用期刊数据库化学信息学ScienceDirect数据库爱思唯尔是全球最大的学术出版商,总部位于荷兰。

ScienceDirect数据库世界上公认的高品质数据库,拥有全球超过四分之一的科学、技术、医学和社会科学全文,以及同行评审文章。

爱思唯尔拥有丰富的图书资源,目前已出版有6大类30000多册图书,涉及科学、技术、医学、社会科学等领域的24个学科。

内容

ScienceDirect是什么浏览ScienceDirect期刊和图书查找与研究主题相关的文章实时跟踪研究领域最新进展随手可用的小工具管理您的个人信息如何给Elsevier期刊投稿提高稿件接受率的技巧主页()ScienceDirect是什么?Elsevier公司的核心产品全学科的全文数据库集世界领先的科技和医学信息之大成得到130多个国家1100万科研人员的认可中国用量最高的外文数据库2000多种期刊4000种电子图书24个学科参考工具书手册系列丛书800多万篇全文在编文章最早回溯至1823年免费在线注册自动生成用户名浏览ScienceDirect期刊和图书按字顺浏览期刊跨学科浏览期刊期刊内容HTML/PDF全文文章全文检索界面高级检索选择查询字段检索结果检索结果发送文章与引文输出链接至Scopus检索保存Pre-SubmissionPeerReviewProduc-tionPublicationPostPublicationAutomaticHandoverEarlywebpresencePrepareyourarticleELSEVIEREditorial-ProductionFullycitablepaper出版流程-以Elsevier为例OnlineSubmissionEES出版流程编辑部/编辑检查稿件的学科方向邀请2-3位审稿专家审稿专家评估稿件学术质量给出审稿意见编辑部/编辑

依据审稿专家意见接收退修或退稿作者投递稿件至编辑部Elsevier期刊投稿平台ElsevierEditorialSystem(EES),集在线投稿、评审和编辑功能于一体的电子平台。EES支持:作者在线投稿并追踪稿件状态投稿步骤操作指南编辑部/编辑在线邀请审稿专家审稿专家在线审稿编辑部管理稿件信息详细数据报告无需安装,即可使用。投稿开始-选择期刊期刊主页

&作者指南作者指南在线投稿编辑/编委会学科范围期刊EES主页/acronym/

作者指南在线客服期刊简介常用电子期刊出版社SpringerLinkWileyInterScienceAmericanChemicalSocietyRoyalSocietyofChemistryAmericanInstituteofPhysicsSpringerLink主页SpringerVerlag于1842年在德国柏林创立,目前是全球第一大科技图书出版公司和第二大科技期刊出版公司,每年出版5,000余种科技图书和1,700余种科技期刊。SpringerLink全新整合平台电子期刊电子丛书电子工具书电子书回溯期刊回溯丛书Springer出版物学科分类

主学科分学科1社科Architecture,Design&Arts(图书)2&BehavioralScience3人文Business&Economics4

Humanities,SocialScience,&Law5科技

&

工程Chemistry&MaterialScience6ComputerScience7Earth&EnvironmentalScience8Engineering9Mathematics10

ProfessionalComputingandWebDesign11Physics&Astronomy12医学

&

生命科学Biomedical&LifeScience13MedicineSpringerLink平台基本使用方法概要1浏览方式

学科浏览2检索方式2.1简单检索2.2高级检索3查询结果4其他小功能5个性化功能6特别提示SpringerLink学科浏览界面输入期刊名起始字母名称浏览结果名称浏览-卷期目录页1,跨出版物类型检索目标是解决您的特定问题,无论答案是在期刊、图书等任何一种类型的出版物中;2,Google风格的检索方式用户可以先进行模糊检索或浏览,得到一个较宽泛的检索结果,然后结合自己的检索需求,按照主题、著者、出版时间等检索条件进行进一步限定3,参考文献提供CrossRef链接在线即可浏览参考文献全文,即使该参考文献由其他出版社出版SpringerLink检索优势简单检索 AndNotOrNEARoperators

构建检索式—词组检索系统中使用英文双引号“”作为词组检索算符,在检索时将英文双引号内的几个词当作一个词组来看待。例如:检索“polymerstructure”,只检索到polymerstructure这个词组,检索不到polymerporousstructure这个短语例子:plasticbottlesORwaterpollution

等同于plasticAND(bottlesORwater)ANDpollution

如果表达为两个词组则为

"plasticbottles"OR"waterpollution"高级检索

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著者联系方式文献被引用情况全文格式HTMLPDF检索结果的输出标记过的记录,可以暂时保存在系统中,也可以通过个性化服务功能,进行永久保存检索结果可以通过多种方式输出:下载,RSS,Email,保存Springer学术期刊投稿一、选定一个合适的期刊1,读者对象/Audience; 2,声誉/PrestigeFactor;3,关注点/Focus; 4,发行量/Circulation二、准备你的稿件

要投稿期刊的相关信息科技期刊的在线投稿和同行评议系统--EditorialManager/homepage/home.htm该系统支持科技期刊的编辑组织同行评议的审稿过程录用的文章将自动进入Springer的生产系统三、提交JohnWileyJohnWiley&SonsInc公司是一家有200多年历史的国际知名跨国专业出版机构,也是全球最主要的服务于自然科学、工程技术、生命科学和医学科研人员的出版商之一。期刊出版的学科强势主要在生命科学、化学和化工、统计学和数学、电子工程和通讯及商业类等。JohnWiley目前约有22700种书目和400多种期刊,每年出版2000种各类印刷和电子形式的新书。电子期刊的学科分类:Business,Finance&Management(35种)、Chemistry(110种)、ComputerScience(16种)、EarthScience(32种)、Education(18种)、Engineering(48种)、Law(5种)、LifeandMedicalSciences(132种)、MathematicsandStatistics(20种)、Physics(27种)、Psychology(24种),此外,还可访问约100个Titles的书目记录。部分的PDF文件可免费使用。/

WileyInterScience首页面用户登录按学科分类浏览按产品类型浏览期刊出版信息最近期次期刊介绍投稿相关特别专题特殊检索:所有范围按出版名称在本期刊内(所有期次)按引文(部分期刊支持)相关信息合作出版Wiley期刊主页(Journalhome)189通过小锁图标区分可访问的内容您的机构已经订购的内容开放获取(OpenAccess)内容所有用户均可免费访问的内容特殊检索:所有范围按出版名称在本期刊内(所有期次)在本期次内按引文(部分期刊支持)Wiley期刊:期次界面(Issue)文摘\HTML全文\引文\被引用191出版信息Wiley期刊:文章界面(Article)-

StandardHTMLWiley期刊亮点

1600种:超过600万篇高质量文章

1200种*:拥有影响因子

27个类别*:排名第一

240种*:排名前十位

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217/232个类别*:收录了Wiley期刊192193一般检索earthscience高级检索检索输入检索限定界面高级检索指定检索范围所有范围期刊/图书名称文章/章节名称全文文摘作者供职单位关键词赞助机构ISBNISSN文章DOI引用使用布尔逻辑符,扩大或缩小检索范围指定出版时间了解更多检索技巧增加检索条件单词自动衍生形态匹配支持通配符*和?195检索结果标记记录全文下载论文摘要参考文献高级检索“气候变化对我国水资源的影响”支持的参考文献管理器:PlainTextEndNoteReferenceManagerRefWorksProCiteBibTex*暂不支持NoteExpress存储检索表达式任一文章页面最下方发现更多查看更多相近研究内容查看更多该作者撰写的文章199200资源中心培训/指南研究人员图书馆员学协会作者开放获取更多在线资源:WileyC在线培训与讲座201Wiley科技论文语言编辑服务202英语语言编辑稿件翻译文章格式排版文章图表编排增加成功发表科研成果的机会http://wileyeditingservices.com/cn/AmericanChemicalSociety美国化学学会(ACS)成立于1876年,现已成为世界上最大的科技协会之一,其会员数超过16.3万。ACS在科学、教育、政策等领域提供了多方位的专业支持,成为享誉全球的科技出版机构。ACS的文献类型有:图书、期刊、会议论文集、新闻。ACS出版34种期刊,内容涵盖以下领域:生化研究方法、药物化学、有机化学、普通化学、环境科学、材料学、植物学、毒物学、食品科学、物理化学、环境工程学、工程化学、应用化学、分子生物化学、分析化学、无机与原子能化学、资料系统计算机科学、学科应用、科学训练、燃料与能源、药理与制药学、微生物应用生物科技、聚合物、农业学。/。ACS简介美国化学学会(AmericanChemicalSociety)成立于1876年,是世界上最大的科技学会之一,其权威性和影响力受到全球化学界人士认可和推崇。

iGroup独家代理ACS出版的期刊、电子书和会议录,及其下属美国化学文摘社(CAS)数据库。

目前有150多所中国高校订购ACS期刊。ACS及其出版物介绍ACS构成16000+化学从业者、教师、学生、社会机构ERP教育和参考内容会议录41种期刊会员ACS出版物CAS1200+本电子书ACS及其出版物介绍ACS期刊目前,ACS出版41种高品质的期刊。近年来,新增的期刊更多着眼于新兴学科,如《化学神经科学》(ChemicalNeuroscience)、《ACS纳米》(ACSNano)。ACS及其出版物介绍ACS期刊品质被ISI的期刊引用报告

(JCR)评为“化学领域最具影响力的期刊”。23本期刊影响因子(IF)超过4.0。在12个学科领域达到过单本期刊总引用或IF第一,包括跨学科化学、分析化学、物理化学、高分子科学、环境工程与环境科学、农业学、有机化学、医药化学等。投稿来源丰富,但绝大多数文章需经过严格的同行审阅方可出版。投稿的文章体裁不限于研究论文,还有实验报告、原创观点、快报、概要等等。

ACS及其出版物介绍期刊名称学科分类期刊地位ChemicalReviews跨学科化学化学多学科期刊(154种)影响因子第1名JournaloftheAmericanChemicalSociety跨学科化学化学多学科期刊(154种)引用量第1名AnalyticalChemistry分析化学分析化学期刊(73种)影响因子第3名、引用量第1名JournalofAgriculturalandFoodChemistry农业学食品科学和技术农业学期刊(57种)引用量第1名食品科学和技术期刊(128种)引用量第1名JournalofChemicalInformationandModeling信息系统计算机科学计算机科学期刊(135种)影响因子第2名JournalofMedicinalChemistry医药化学医药化学期刊(59种)影响因子第3名Langmuir物理化学材料学材料学期刊(232种)引用量第1名Macromolecules高分子科学高分子科学期刊(79种)引用量第1名ACSChemicalNeuroscience医药化学2010年创刊医药化学期刊(59种)影响因子第9名ACSNano化学多学科纳米科学和纳米技术2007年创刊,2010年引用量9477次化学多学科期刊(154种)影响因子第9名ACS期刊地位(数据来源:2011JCR)ACS及其出版物介绍ACS2013年新刊2013年新刊——《ACS可持续化学和化工》(ACSS

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