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文档简介

1、第二章 DNA重组,不同来源的DNA分子,通过磷酸二酯键连接而重新组合的过程。,第一节 天然DNA的制备,一、天然DNA的来源和用途,二、天然DNA的提取,准备生物材料,裂解细胞,分离和抽提DNA,(1)准备生物材料 选择生物种类; 选择DNA易提取和含量高的组织; 选择DNA得率最高的生长期。 如: 大肠杆菌质粒DNA:应在对数生长期后期。 植物DNA:选幼嫩植株或黄化幼苗(淀粉)。 肝脏DNA:要清除胆囊(酶)。,(2)裂解细胞 这步是关系到能否提取到DNA以及DNA得率高低和质量的关键步骤。 结构简单的原核细胞:用溶菌酶, NaOH和SDS ,煮沸,冰冻,超声波等方法; 结构复杂的动、植

2、物材料:首先必须粉碎(液氮冻结后研磨,或捣碎机、研钵直接粉碎),再参照裂解原核的方法。,液氮罐,正在倒出的液氮,(3)分离和抽提DNA 根据待提取的DNA的性质,使其与细胞内的其他组分分离,从中进一步抽提DNA。 提取总DNA:在裂解液中加适量酚氯仿异戊醇或氯仿异戊醇等有机溶液,使DNA与蛋白质分开,用乙醇或异丙醇处理水相,沉淀DNA,再离心。 提取叶绿体或线粒体等细胞器DNA以及病毒和噬菌体的DNA:须先从裂解液中分离完整细胞器、病毒和噬菌体,抽提前必须经DNase处理,水解附着于其表面的其它DNA。,提取质粒DNA:调节裂解液pH12.6,所有DNA都变性沉淀,再调节pH至中性,质粒DNA

3、复性后从沉淀物中释出。 除RNA:用RNase水解除RNA, 分离抽提DNA最有效的方法:氯化铯梯度离心(氯化铯(CsCl)溶液中加适量溴化乙锭,紫外灯下DNA带和RNA带都发荧光,但沉降系数明显不同而聚集于不同的氯化铯密度区),Flash1、视频1、2,举例 1、大肠杆菌源质粒DNA的提取 碱裂解法*: 原理:细菌悬浮液暴露在高pH值的强阴离子洗涤剂中,会使细胞壁破裂,染色体DNA和蛋白质变性,相互缠绕成大型复合物,被SDS包盖,当加入pH4.8的酸性乙酸钾降低溶液pH值,使溶液pH值恢复较低的近中性水平时,复合物会从溶液中有效地沉淀下来,离心去除后,就可从上清中回收质粒DNA。 (FLAS

4、H3),2、噬菌体DNA的提取 溶源周期 溶菌周期 提取DNA的原理: 先将溶源菌培养至一定密度,通过热诱导,使DNA从宿主染色体DNA上释放出来,再经过溶菌周期培养,获得大量噬菌体,从中提取线形的DNA。,提取过程: 溶源菌诱导培养 分离噬菌体 DNA的提取,3、氯化铯法制备植物基因组DNA 材料准备 细胞裂解 DNA分离抽取,三、DNA的纯化 1、氯化铯溴化乙锭连续梯度离心法 2、 离子交换层析法 3、琼脂糖凝胶电泳洗脱法 4、“基因纯”试剂纯化 5、从DNA样品中去掉EB 正丁醇(或异戊醇)抽提法 Dowex树脂层析法,四、DNA的浓缩 乙醇沉淀法 含一价阳离子的DNA溶液2体积无水乙醇

5、沉淀DNA离心溶于适量TE缓冲液或无菌水。 条件:-20,30 min以上;小于1kb或量较少时,于 - 70沉淀,或延长时间。,正丁醇抽提法 DNA溶液 1体积正丁醇混匀离心(1600 r/min 1min)弃上清重复至所需体积用水饱和乙醚抽提DNA溶液两次(除正丁醇)空气中蒸发乙醚。 聚乙二醇浓缩法 DNA溶液透析袋置高浓聚乙二醇溶液 4浓缩至所需体积。,视频3、4,谢谢,染色体DNA: 103 106kb 。是生物界含量最丰富的DNA资源,蕴藏着地球上极大部分的遗传信息。 用途:分离目的基因和基因表达调控因子;提供构建染色体载体和染色体基因整合平台系统。 病毒和噬菌体DNA: 种类很多,

6、可在原核和真核生物宿主内大量增殖。 用途:构建基因克隆载体,承载较大片段的外源DNA,经体外包装,导入受体细胞;其编码的结构基因可分离出目的基因及其表达调控因子。,质粒DNA: 存在于很多微生物细胞内,游离于胞质(即染色体外遗传物质), 1几百 kb。有复制起始位点,能自我复制。 用途:构建基因克隆载体;含结构基因的质粒可分离目的基因和表达调控因子。 线粒体和叶绿体DNA:真核生物特有的染色体外遗传物质,含有呼吸作用和光合作用相关基因。 用途:分离目的基因和基因表达调控因子;构建克隆载体。,密度梯度离心,用一定的介质在离心管内形成一连续或不连续的密度梯度,将细胞混悬液或匀浆置于介质的顶部,通过重力或离心力场的作用使细胞分层、分离。密度梯度离心常用的介质为氯化铯,蔗糖和多聚蔗糖。,单菌落,溶菌,阳离子交换剂 带负

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