SCI写作课-杨林20141128报告.ppt

1、SCI论文写作基于实验结果总结、提炼、分析的升华,报告人：杨 林 博士,分析的重要性,Idea,Do research,Write paper,SCI论文的核心关键究竟是什么？,Idea,Do research,Write paper,Idea,Write paper,Do research,Forces us to be clear, focused Crystallises what we dont understand Opens the way to dialogue with others: reality check, critique, and collaboration,SCI

2、论文的核心关键究竟是什么？,SCI投稿前你必须知道的,每年新的SCI影响因子一出，都会有或多或少的期刊被剔除（Dropped）或被镇压（Suppressed）。 顾名思义，被踢除意即被除名，不再是SCI收录的杂志，一般被剔除的主要原因是自引率过高。而所谓被镇压，就是暂时不公布影响因子，如不整改有被踢除的风险。 因此，投稿前，你必须知道你的目标杂志是不是在被剔除或被镇压的行列，尽量避免这些杂志。,如何查询一个杂志是否SCI收录,登陆Web Of Science网站（网址链接http:/ip-science.thomsonreuters. com/mjl/），输入杂志名称，如“American J

3、ournal of Cancer Research”，点击search：,Science CitationIndex Expanded表明，该杂志仍然被SCI收录！,如何查询一个杂志最近是否被剔除或者被镇压,表明这个杂志已经被剔除了,表明这是一本新收录的SCI杂志,标题怎么写,SCI论文标题的价值占整个文章的一半,误区一：SCI标题与基金标题无区别 这是大错特错的做法。SCI文章是已经完成的实验，其标题着重于研究的结果（你发现了什么）；而基金是要表明你要研究课题的设计（你将要研究什么）。基金一般标题中会含有“的研究”，如“ACCP介导TGF-信号途径在结肠癌转移中的分子机制研究”。而SCI的题

4、目形式“Evidence of a role for the novel zinc-finger transcription factor ZKSCAN3 in modulating Cyclin D2 expression in multiple myeloma”，更倾向于给出一个结论。很多初学者把SCI论文的标题写成“The study of”、“The research on”等。这类标题在高分SCI论文中是很少见的。,标题怎么写,误区二：意思不准确，表达不完整 论文标题太大或太小，如论文题目“Transportation of corneal stem cells cultured o

5、n amniotic membrane for corneal burn: experimental and clinical study”太大。该论文主要研究了corneal stem cells的体外培养和体内对兔角膜灼烧的影响。因此，写成experimental and clinical study是不恰当的。用“in vitro and in vivo”来替代experimental and clinical study更合适。 论文标题表达不正确，如论文题目“Experimental study on mechanism and rarity of metastases in ske

6、letal muscle，这个标题就没有把研究的对象、问题和结果说清楚。,误区三：长篇大论，不够醒目 例如标题“Identification of human brain tumor initiating cells”，该论文题目特别醒目，一看就知道了他们发现了脑肿瘤干细胞。因此该论文具有突破性意义。如果将论文的标题改为“CD+133 brain tumor fraction contains cells that are capable of tumor initiation in non-obese diabetic severe combined immunodeficient mous

7、e brains ”就显得太长，而且不够醒目。,标题怎么写,摘要怎么写,与结论不重复，体现整个文章的结论和思想，包括研究工作的目的、方法、结果和应用等,摘要是以提供文献内容梗概为目的，不加评论和补充解释，简明、确切地记述文献重要内容的短文。其基本要素包括研究目的、方法、结果和结论。具体地讲，就是研究工作的主要对象和范围，采用的手段和方法，得出的结果和重要的结论，有时也包括具有情报价值的其它重要的信息。摘要应具有独立性和自明性，并且拥有与文献同等量的主要信息，即不阅读全文，就能获得必要的信息。 A英文摘要的时态：常用一般现在时、一般过去时，少用现在完成时、过去完成时，进行时态和其他复合时态基本不

8、用。 B. 英文摘要的语态：现在主张摘要中谓语动词尽量采用主动语态的越来越多，因其有助于文字清晰、简洁及表达有力。 C. 英文摘要的人称：原来摘要的首句多用第三人称 This paper等开头，现在倾向于采用更简洁的被动语态或原形动词开头。例如：To describe，To study，To investigate， To assess，To determine，行文时最好不用第一人称，以方便文摘刊物的编辑刊用。,引言怎么写,主要写研究进展，有代表性的同行研究工作，自己与他人工作对比的优势和不足 前言的参考文献选取代表性的、重要的文献。参考文献不要参考会议的文章，尤其那些不知名的会议文章。文献

9、要尽量全面客观：不要对相似文献避而不引，或者只引别人早期的工作，这会让人感到你对该领域了解不够，甚至是有意回避，就有学风问题的嫌疑。 不能过份贬低别人的研究工作，要考虑自己和别人工作的时间差，不在一个时代的研究当然不能说自己比前人好，所以英语用词要注意些，客观些。,好的引言相当于文章成功一半，最重要是保持鲜明的层次感和极强的逻辑性，层层递进关系 阐述自己研究领域的基本内容，要尽量简洁明了。一些显而易见的知识要用概括性的而不是叙述性的语言来描述； 文献的总结回顾。要特别着重笔墨来描写。一方面要把该领域内的过去和现在的状况全面的概括总结出来，不能有丝毫的遗漏，特别是最新的进展和过去经典文献的引用。

10、这是两个最容易出现的问题，应该是我们要极力避免的。 然后就是分析过去研究的局限性并且阐明自己研究的创新点，这是整个引言的高潮所在，所以更是要慎之又慎。阐明局限要客观。在阐述自己的创新点时，要仅仅围绕过去研究的缺陷性来描述，完整而清晰的描述自己的解决思路，并且文章摊子不要铺的太大。创新性描述的越多越大，越容易被审稿人抓住把柄。 就是总结性的描述论文的研究内容，可以分为一二三四等几个方面来描述，为引言做最后的收尾工作。最后对引言检查。,引言怎么写,结果怎么写,假设我们要写一篇来自临床研究的论文：临床的优势是组织标本，通过标本进行各类芯片检测是家常便饭，然而拿到一把差异表达基因该怎么办呢？因为不知道

11、怎么研究基因功能，大多数医生只是在细胞中粗浅地检测一下功能表型便草草投稿低分杂志，浪费了许多优秀基因资源。芯片检测可以让你从无到有，获得大量差异表达基因，然而这些基因大多为草根基因，以往甚少研究，其功能研究更是无从下手。怎么办呢？,结果怎么写,举例来说，当我们通过筛选发现一个在肿瘤组织中异常高表达的差异基因A，我们可以为其组织一场相亲会通过一系列的筛选手段（如下表），获得其可能的相互作用蛋白B（B1、B2、B3Bn）。N的数量取决于A的实力，功能强的分子，往往能通过与一系列的蛋白分子相互作用而发挥功能，如p53。如同相亲一样，你选择的另一半会带给你一种新的生活空间，包括她（他）的社交圈，蛋白B

12、也会为基因A推开一扇功能调控的大门。门内的空间如何就取决于B有多重要了，如果B是p53、c-myc或者EGFR等大牌基因，那A的身价立马陡增，从草根变为贵族。所以说，当你拿到酵母双杂交或蛋白质组筛选结果后，首要做的就是通过文献分析筛选出的n个B基因，从中挑选出几个名门之后做为备选。,任何筛选都存在假阳性，因此，挑选好备选Bx基因后，就进入验证环节了，通过GST-Pull down、Co-IP、CHIP、RNA免疫共沉淀等实验进行相互作用的验证。如果验证也阳性，那就可以“下聘迎娶”进行A基因调控Bx基因的机制研究：比如，如果Bx是调控基因转录的，如雄激素受体、雌激素受体，那就进行转录调控研究；如

13、果Bx是激酶，如PKC，那就进行激酶活性检测，和下游基因调控探索；如果Bx是调控细胞骨架蛋白的关键基因，如Rho蛋白，那就进行细胞形态学、细胞运动能力等方面的研究。 最后，再配套一些组织标本检测、裸鼠成瘤实验等“房、车”事项，就可以开始写文章准备投稿了。这样一来，你的文章也从23分的无味嚼头提升到令人另眼相看的高层次SCI啦。,结果怎么写,怎样写5分以上的文章,如上图框架所示，文中在组织和细胞水平检测了分子A与分子B的表达并得知存在相关性；随后通过分子手段干扰分子A来检测其对分子B的影响并分析细胞增殖，迁移及形态学方面的差异。可以看到，3-4分文章所采用的实验手段都比较常见。,怎样写5分以上的

14、文章,如图所示，和34分一样思路简单且相似，也是在组织和细胞水平检测了分子A的表达水平，然后采用分子工具使基因A过表达或被抑制，检测细胞相关表型如增殖、迁移、黏附等。然后将分子A的表达水平与癌症诊断的临床相关参数进行关联分析。只是为了说明基因A的重要性或者丰富数据量，除了检测需要研究的癌症，也可在其它癌症细胞与组织中进行相关检测，以增加数据量。,怎样写5分以上的文章,然而，5分以上的文章会给我们相对3-4分文章一种飞跃的感觉。其组织细胞人群方面的研究只是文章结构的一个起点，精彩及核心的不仅在于机制的充分论证，并且以机制能够解释现象收尾。无论是文章内容充实性还是其数据堆砌的逻辑性，都比3分4分文

15、章更胜一筹。,Discussion写法分析,Discussion是科学论文的精髓部分，写得好画龙点睛，写的不好画蛇添足。很多同学在写作的时候，前面哀梨并剪，行云流水，一气呵成。可是一到Discussion，便如泰山压顶，窒碍难行，把好好一篇冲5分的文章拖垮至3分！文章Discussion怎么写才能三分变五分？ 在写作之前，必须要理清思路，合理设计讨论内容和架构。Discussion结构包括陈述主要发现，本研究的长处和短处、同其它研究比较的长处和短处；特别要讨论结果中的差别、研究的意义、未解答的问题及今后的研究方向。,Discussion写法分析,Discussion一开始要重新说明主要发现，用

16、一个句子表示较为理想，太长就有重复Result内容的嫌疑，也显得累赘。接着全面说明本研究的长处和短处，两者不可偏废。实际上，编辑和读者最注意研究的短处，这是所有医学研究不可避免的。编辑和读者一旦发现研究的短处，而作者未加讨论，他们对文章的信任会发生动摇，心生疑窦：是否还有他们和作者都未发现的其它弱点呢？,Discussion写法分析,其次，将该研究与以前的工作联系起来，不是炫耀自己的工作比以前的工作如何好，而是比较其优劣。与其它研究进行对照，切忌将自己的缺陷掩盖起来。重要的是应该讨论为什么会得出不同于别人的结论，作者可以放开去推测；但是如果弄不清自己的研究结果为什么与别人的结果有差别，就不便作

17、这种推测，也不该断言自已的研究结果正确，而别人是错误的。,Discussion写法分析,接着应该讨论自己的研究“表明”什么，如何解释自己的研究发现，以及对临床医生或决策者有什么意义？此刻，作者的境地是危险的，多数编辑和读者能够理解作者的谨慎，不逾实证界限。由读者自己去判断研究的意义：他们是会做到的。作者甚至可以指出研究结果证明不了什么，防止读者得出过度、不实的结论。最后，应点明哪些问题尚未解答，以及要继续做的工作。显然，编辑和读者不喜欢夸大的作法。事实上，很多作者对论文的这一部分常常写得乱糟糟的。虽然无法阻止作者写一篇充满推测的文章，但切不可因推测而毁了证据。 写好之后回顾一下，保证思路理顺，

18、逻辑清晰。若没有信心，可以给讨论部分加一些小标题，不但重点突出，也能够帮助读者迅速把握Discussion的思路。,SCI作图,1. 分辨率 大多期刊对不同的图会有不一样的要求：一般情况下，line artwork（纯的黑白图，没有中间颜色）要求最高，1200dpi以上；halftone artwork（有颜色深浅差别的灰度图，我们最常用的形式）最低，300dpi以上就可以了；combiantion artwork（前两者的混合图，或彩色图与line artwork的组合）居中，600dpi以上。建议大家在实验阶段就注意保存高分辨率的原始图，一般600dpi就够用了（line artwork很

19、少，特殊处理），也不要太高，分辨率太高会导致图片很大，投稿时上传困难。 2. 图片格式 大多期刊要求图片为TIFF格式或EPS矢量图，并存为独立文件。很多同学可能更喜欢使用bmp或者jpg，但是一般不推荐大家养成这种习惯，因为这些格式包含的信息量比较少，即使可以转换为TIFF，质量也会有所下降（部分图像信息会丢失）。有些同学会认为用矢量图更清楚些，其实和TIFF没有太大的区别，关键是满足分辨率就行。,SCI作图,3. 物理大小 这个也很重要。虽然在投稿阶段，这个没有严格要求。但在印刷排版时会比较讲究。一般只规定宽度，半幅（单栏）在7.5 cm左右，全幅（双栏）在15 cm左右。不同期刊的要求会

20、有些许差异，如Neurosci Lett规定半幅（单栏）为8.3 cm，全幅（双栏）为17.6 cm。 4. 色彩要求（仅对彩色图适用） 这个问题大家很少注意到，一般有2种：RGB色彩，用于数码设备上；CMYK为印刷业通用标准，两者存在差异。大多期刊在Manuscripts Accepted for Publication阶段都要求图片为CMYK色彩。但由于现在很多期刊都有网络版，RGB图比CMYK图显示更好，色彩更漂亮，更适合网络上用。而由RGB转变为CMYK模式容易，但是由CMYK模式转变为RGB模式，图象的表现力下降，因此，现在已经有些期刊开始要求提供RGB的图。所以建议大家平时也尽量保

21、存RGB的图，除了发表论文，也会需要制作PPT报告，RGB的图更适合。,SCI作图,一定要保存质量足够好的原始图片，后面才有修改的余地。,SCI修稿攻略,有过投稿经验的同学们都深有体会，一篇SCI文章从选题到成型，经历的是一个艰辛的过程。好不容易写好了投出去，漫长的等待后，可能是审稿人不留情面体无完肤的批判和修稿意见。心情一落千丈无比沮丧的你可能会认为审稿人的意见不对，欲加倍还回去。千万别！你应该庆幸，这是修稿而不是拒稿，调节心情后，认真阅读修稿意见，拟定修稿策略。回复得好，下一次就是你期待的接收函，回复不好，可能就是你不愿面对的拒稿。,SCI修稿攻略,一、拟定修稿策略，合理掌握修稿和Argu

22、e的分寸 修稿一般分为写作修改和实验补充。收到修稿意见后，首先要理清思路，哪些是动动笔就可以的，哪些是要设计实验弥补研究证据的。 写作修改包括语法、拼写、专业术语、缩写词错误，图表格式、分辨率以及图表说明的补充，结构不匀（如讨论写得太少，背景介绍不充分等），实验方法描述不够清楚等等。这些修改虽然比较繁琐，但是毕竟动动指头就可以完成，不需要花费太大的代价。因此，写作修改部分一定要按照审稿人的意见，不要怕麻烦，逐一修改，尽善尽美。 比起写作修改，补实验是修稿的大头，不但要花心思，还要花钱花时间。因此这部分可以根据自己的实际情况，跟审稿人Argue一下。Argue要有技巧！首先要肯定审稿人的意见是对

23、的，建议也很好，但是你研究的重点其实在于，委婉表示这个实验可以不必做，也可以引用别人报道的结果支持你的观点绕过补实验。,SCI修稿攻略,二、精明的掌握修稿回执的时间 当你拿到只有写作修改意见要求的审稿意见时，心里无比高兴，三下两除二弄完就直接回过去了，这种做法其实很危险。第一，由于时间仓促，你心里的兴奋也会导致你不会那么谨慎，可能不能十分完整的理解审稿人的要求，不能把所有问题整理清楚并进行完善的修改；第二，这么迅速的回复会让审稿人觉得你态度敷衍，对他的意见不尊重。因此，哪怕你只花了几个小时就完成了修改，也要放上2-3个星期，待心情平静下来，然后再次把审稿意见和稿子拿出来一一核对，保证没有错漏，

24、再投出去。,SCI修稿攻略,三、对编辑的意见给予十二分的重视 一般编辑接到稿件会进行初选，过滤掉一些明显不符合该杂志要求的稿子，剩下的则分别送到相应的领域权威专家那里进行审稿。在规定的时间里审稿人会把稿件进行审查，然后把意见反馈给编辑。一般来说杂志社都会尊重审稿人的意见，编辑不会在这个时候提出相应的意见。但是如果他提出意见了，则是你的文章有重大缺陷，所以这个时候一定要重视编辑的意见，谨慎处理，毕竟决定权在他的手里。,没有投不出的稿件，预祝大家投稿顺利！,SCI写作中的常见问题,1、汉式英语（Chinglish） 按着中文翻译是汉式英语出现的最主要原因，汉语与英语的习惯不同，写作时很多地方，如断

25、句、语序等需要进行改动。因此小伙伴们平时看文献就要注意积累，不要把文献翻译成中文看，而要培养自己用英语思维去读，去思考。当然这需要长期修行，若是眼前紧急，那就只好求助别人了。可以找英语国家的人帮自己编辑，或者找专业的编译公司润色一下。 2、句式繁杂，结构冗余 “简洁，再简洁”是美国作家梭罗的名言，也是英语写作的一个重要原则。比如：很多人喜欢用“bring all this to a conclusion”，用“conclude”更简洁。 3、缺乏连贯性，逻辑混乱 中文里很少或几乎不用形式连接手段，只是将句与句排列起来，依赖语义让读者去了解其内在关系，所以中国人写的英文常给人以条理不清，逻辑混乱

26、的印象。英文写作比较注重形式连接，其表现形式就是使用关联词、标志性词汇，它们是把散落的“珍珠”串起来的细线，比如however，as，since，therefore，accordingly等。 4、内容重复 很多人喜欢讨论部分重复Results部分的内容。明明在结果部分已经把研究的数据描述了一遍了，在讨论部分仍然重新描述一遍。这种情况往往是讨论不知道怎么写，为了凑篇幅。讨论是把研究的结果进行分析、综合、探讨，使感性的认识提高到理性的认识，是通过科学研究进行探索的过程，所以讨论就是一篇论文的最精华部分，当然也就是最难写的部分。因此，讨论要重点放在结果分析上，切忌单纯重复结果。 总而言之，他山之石

27、，可以攻玉。关键还是要多读优秀的文献，再转为己用，写作时才能顺手拈来。,给临床研究生的建议,1、Case Report（病理报告） Case Report是医学论文的一种常见体裁，通过对一两个生动的病例进行记录和描述，试图在疾病的表现、机理以及诊断治疗等方面提供第一手感性资料的医学报告，或在已知疾病的特殊临床表现、影像学及检验学等诊断手段的新发现、疾病的特殊临床转归、临床诊断治疗过程中的特殊的经验和教训等。Case Report字数少，工作量小，写起来简单，轻松。只要你平时工作的时候的多加关注，关注到一个新例或者特例，机会就来了！ 2、Meta分析（荟萃分析） Meta分析指的是一个科学的临床

28、研究活动，指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析，再用定量合成的方法对资料进行统计学处理,得出综合结论的整个过程。要写Meta分析，首先你要定一个主题，然后查阅该主题下的相关文献，汇总别人的数据，结合自己的分析，整理出新的结论。,给临床研究生的建议,3、Review（综述） Review是指对大量原始研究论文中的的数据、资料和主要观点进行归纳整理、分析提炼而写成的论文。不同于Meta分析，Review只要归纳某个主题的研究现状，不需要二次统计分析。对于没有统计基础的小伙伴们更合适。发表高分Review能体现你在该领域的深厚积累，对于申请课题也是很有利的！ 4、临床试验研究计划（Stud

29、y Protocol） Study Protocol报道的是即将进行（或者正在进行）的临床试验，因此只需要报道相关研究计划内容（试验目的、试验方案等详细内容），不需要研究结果。简单点就是报道你的idea,最后：学会讲故事,这篇论文看题目就有这么两组关键词：膀胱癌、转移、EMT；TGF-、malat1、suz12。为了节约大家时间，简单总结下：作者研究的是TGF-介导膀胱癌转移过程EMT转化（这一现象是已知的）的调节机制，TGF-可以上调LncRNA malat1表达，并在suz12蛋白协助下改变EMT标志物，抑制E-cadherin，上调N-cadherin和fibronectin的表达水平。,最后：学会讲故事,原文是这么讲故事的 在膀胱癌细胞株RT4中重现了TGF-刺激下细胞发生EMT的表型，表现为上皮标志物E-cadherin下降，间质标志物N-cadherin、fibronectin增强。有趣的是，malat1表达也与TGF-处理剂量正相关（抛出现象