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文档简介
1、DNA的结构,廖露,2,DNA的结构,1. DNA的一级结构 2. DNA的二级结构 3. DNA的三级结构 4. 真核生物DNA的三级结构 5. DNA的性质,DNA的一级结构,3, DNA分子中各脱氧核苷酸之间的连接方式(3 -5 磷酸二酯键)和排列顺序叫做DNA的一级结构,简称为碱基序列。 一级结构的走向规定为5 3 。,DNA一级结构的表示法,4,DNA一级结构的基本特点,5,1、双链反向平行配对而成 2、脱氧核糖和磷酸交替连接,构成DNA骨架, 碱基排在内侧 3、内侧碱基通过氢键互补形成碱基对(A:T,C:G) 4、DNA在碱性条件下稳定性强,不断裂。pH=11.5时仍稳定,而RNA
2、易被碱水解,2. DNA的二级结构,6,1953沃森和克里克根据DNA纤维X射线晶体衍射图,提出了DNA分子结构的双螺旋模型。,Francis Crick and James Watson (获1962年诺贝尔生理学医学奖),DNA双螺旋的基本特征,7,两条链反向平行,围绕同一中心轴构成右手双螺旋。 相临碱基对间距离为0.34nm,每周螺距为3.4nm (10bp), d为 2nm。 双螺旋有两种不同的沟(大沟和小沟)。大沟携带分子可识别信息,是蛋白质识别DNA碱基序列产生相互作用的基础。,DNA双螺旋结构稳定因素,8,1. 碱基对间的氢键 2. 碱基堆积力 (1)相邻碱基对间的范德华力 (2
3、)碱基对间的疏水作用力 3. 磷酸基上负电荷被胞内组蛋白或正离子中和,降低静电张力,DNA双螺旋类型,9,A-DNA 20 0.26 2.6 11 右 B-DNA 6 0.34 2.0 10 右 Z-DNA 7 0.37 1.8 12 左,双螺旋 碱基倾角/(。) 碱基间距/nm 螺旋直径/nm 每轮碱基数 螺旋方向,3. DNA三级结构,10,DNA在细胞内以双螺旋为基础进一步旋转折叠成超螺旋结构。,DNA超螺旋结构,11,DNA超螺旋是由DNA拓扑异构酶(拓扑异构酶)产生的。环状DNA分子常以超螺旋结构存在,并以负超螺旋为主,有利于转录的起始。,4. 真核生物DNA的三级结构,12,真核生
4、物DNA与蛋白质形成非常致密的复合物存在于细胞核内,基本结构式核小体。,核小体的结构,核小体链( 11nm,每个核小体200bp),纤丝( 30nm,每圈6个核小体),突环( 150nm,每个突环大约75000bp),玫瑰花结( 300nm ,6个突环),螺旋圈( 700nm,每圈30个玫瑰花),染色体( 1400nm,每个染色体含10个玫瑰花200bp)-人的染色体压缩8000-10000,DNA (2nm),核小体盘绕及染色体示意图,15,DNA的性质,16,DNA的变性 定义:某些理化因素会导致DNA双链互补碱基之间的氢键发生断裂,使双链DNA解离为单链。只改变DNA的二级结构,不改变它
5、的核苷酸序列。 变性因素:过量酸、碱,加热,离子强度改变等。 变性后理化性质的主要改变: 粘度下降 比旋光度下降 OD260增色(增色效应),17,DNA变性的本质是双链间氢键的断裂,18,DNA的增色效应 DNA变性时其溶液OD260值增高,19,解链曲线(melting curve),解链温度(溶解温度,Tm) 在解链过程中,UV吸收值的变化达到最大变化值一半时对应的温度,此温度时,50%DNA双链打开。 Tm值与DNA均一性和长短、碱基GC含量、溶液离子强度、相关,GC含量越高,Tm值越高。,20,Tm值的计算及应用 Tm=69.3+0.41 (G+C)/(G+C+A+T) 100% 小于20bp的寡核苷酸片段 Tm=4(G+C)+2(A+T),PCR退火温度比Tm值低46,21,DNA的复性 定义:DNA回复成双链结构,称为复性。 影响复性的因素: 样品的性质、DNA片段的大
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