bioknow 基于生物标本库的转化医学一体化信息平台

基于生物标本库的转化医学研究一体化信息平台北京百奥知信息科技有限公司 庄永龙 博士 marketbioknow.ne/纲数据服务技术平台方案 简介技术特色典型案例转化医学研究大数据平台生物标 本库诊断统计分析数据挖掘生物信息临床数据干预临床医学研究回顾性研究前瞻性研究大队列观察安全性研究.基础数据基础 医学研究发病机理疾病分型药理机制分子水平 .预测 治疗 生物 大数据管理系统 序列管理与分析系统 生物数据分析系统 分子网络功能注释系统实验室信息管理医学标本库平台 中央随机化系统 临床数据采集系统 随访管理系统 不良事件管理系统 药物 /器械管理系统 项目管理系统 在线统计分析系统临床研究信息 管理一体化平台基础 研究生物信息一体化 平台知识发现转化 医学整体方案标本采集标本分装标本质控标本出库 科研项目管理 经费全面管理 试剂耗材管理 仪器设备管理 实验数据管理大数据对信息平台的要求标准化规范化集成化网络化国际化灵活性 兼容性扩展性安全性稳定性标本库信息化管理的必要性 一台冰箱管理的 标本 数可以从几百个提高到几万个，几十万个，每次开冰箱门取标本，总是要找很久；特别 是在 寻找一批几年前收集的标本 时 更是无从下手。 在整理冰箱标本时，翻出一些标本不知道是什么，也不知道是谁存的，是否还有用。 将一批标本用皮筋和塑料袋包扎找个空位置放进去，感觉到冰箱空间利用率不高。 在急需 标本 时，不能确定具体存放位置，是否已经过期，是否还有剩余。 标本做了记号，但时间过长等致使标记模糊辨认不清。从几万个标本去取，稍不小心就搞错。整体解决方案o 百奥知 标本库建设信息管理一体化平台 （ BioKnow Sample Information Management System，简称 BioKnow-Sample） 包括 标本管理子 系统、 临床信息管理子系统、实验室管理子系统，技术平台采用具有自主知识产权的 BioKnow-UAP框架，该技术平台依据美国、欧洲、日本、中国的各种行业规范。o 百 奥知 标本管理信息解决 方案 ， 提供 基于互联网的多种疾病标本收集的信息平台。系统涵盖了研究中组织、血液、唾液等，以及 DNA、 RNA等标本管理所涉及到的各个方面，包括标本的来源情况、收集、储存、转运、多种实验室检查检验、病理检查、影像学检查资料和图片以及患者诊疗信息，使 标本 资料得到系统完善的保存。针对标本库管理的硬件实施（冰箱、液氮罐等）提供三维可视化管理，可以轻松快捷地查取标本的相关信息。一体化平台管理内容标本库 临床信 息库随访信息血液 组织 血清DNARNA 体液 干细 胞血浆研究病例 实验管理医院HISLIS实验室信息系统资源管理培训管理部署模式转化医学集成门户标本库子系统肝病治疗研究信息库HISLIS信息集成库门户介绍、研究进展数据分享、标本申请集成搜索、方便使用实验室管理子系统糖尿病队列研究信息库更多医学、药物临床研究库 医药临床研究一体化平台信息化管理的作用提高工作效率，系统规划工作降低生产成本，资源利用充分增加信息透明，避免 沟通不畅加强工作质控，追溯稽查防改一体化 信息 平台技术框架生物标本库 标本信息与入库 标本编码打印扫描 冻存设备管理 标本质控管理 标本运输管理 标本出库管理 温度监控集成 标本查询汇总统计临床信息库 全面病历信息管理 支持任意 CRF表设计 数据核查 随机化管理 HIS信息集成 智能化随访 电话语音集成 短信提醒实验室管理 实验数据管理 试剂耗材管理 设备管理 环境管理 人员管理 项目管理 费用管理用户管理 权限管理安全 管理 监控 管理数据备份 异地容灾人员备份 标准管理全面支持各种复杂情况 标本信息库支持任意多个冰箱 /液氮罐等存贮 设备 支持 血样、组织、细胞等任意 标本 库 类型 支持 多中心、 多科室 分权限管理各自 标本库 支持 中国医药生物技术协会生物样本库器官 及 样本规范生物标本库 支持 任意 多 个科研 项目 支持 任意复杂临床 方案设计 支持 与医院现有 HIS、 LIS系统集成 支持 CDISC符合 FDA Part11电子数据 标准临床信息库 实验室的 “人、资源、环境、实验过程 ”的全面规范化 管理 支持 ISO9001及 ISO17025国际标准规范实验室大纲数据服务技术平台方案简介技术特色典型案例实验室管理临床信息库生物标本库整体方案信息管理平台整体方案标本快速分装低温存贮设备打印标签耗材数据存储备份温度监控系统 标本信息库支持任意多个冰箱 /液氮罐等存贮 设备 支持 血样、组织、细胞等任意 标本 库 类型 支持 多中心、 多科室 分权限管理各自 标本库 支持 中国医药生物技术协会生物样本库器官 及 样本规范标本采集分装使用流程系统主界面用户基于 Web登录登陆界面标本库基本管理标本信息标本 入库标本保存可视化 3D浏览条码扫描录入批量导入提供基于互联网的多种标本收集的信息平台 ， 系统涵盖了 科研中 标本管理所涉及到的各个方面，包括标本的来源情况、收集、领用、储存 等。2D管批量 扫描批量标本采集单条录入封装标本出库智能保存提醒规范化标本信息A、个体流水编号B、个体基本信息：如住院号，病理号，手术科室，手术医生，病人姓名，性别等C、样本特征信息：如脏器名称，样本类型（肿瘤，癌旁，正常，淋巴结，息肉，囊壁），样本性质（原发 /复发 /转移）等D、样本采集信息：如样本份量，体积，分管数，术前 /术后等E、诊断信息：如临床诊断，病理诊断，分化程度， UICC 分期， ICD10/ICDO-3代码等F、治疗信息：如放疗，化疗，手术等G、生物安全信息：有 /无传染性H、时间信息：采集时间，样本离体时间，低温时间等I、工作人员信息：取材员，记录员 等备注信息。规范化的标本信息采集是标本库建设的重要基础，没有规范化的标本对应信息，标本库将毫无利用价值。遵循标本编码规范o 遵循中国医药生物技术协会生物样本库标准中代码表编码及 名称 。o 人体器官：包括 神经系统 、运动系统、感觉器 等 。o 标本 类型 ：n 一级 编码 如：大体标本、组织、血液、分泌物、细胞混悬液、排泄物、干细胞等 ；n 二 级编码如：正常、病理、新鲜组织、冷冻切片、冷冻组织、石蜡组织、全血、血清、血浆等 ；n 三级 编码如：细胞系、原代细胞系、转化细胞系、 DNA、基因组 DNA、线粒体 DNA、 cDNA、 RNA、组织总 RNA等。批量标本采集按特定研究类型模板，自动添加研究标本种类，如肿瘤标本、癌旁、正常、血液等。批量标本采集规范化标本编码单条录入封装标本编码条码扫描录入条码扫描录入可与条码打印机集成，批量打印、扫描相应标本信息。 批量标本导入批量 Excel导 入2D管批量扫描录入2D管批量扫描条码编码规则灵活o 支持 一 维、二维条形码、 RFID标签 。o 支持 年份 、科研项目、组织机构、患者、器官、样本类型、流水号、份 数 等字段任意组合为标本条码 。支持 用户自定义 规则。o 支持 Brady、斑马打印机。2010 05 12345 D08 T F 1年份 月 流水号 取材 脏 器 取材部位 保存方式 分管号支持任意冻存设备o 支持 立式 冰箱、卧式冰箱、液氮 罐 、冰柜 等 各种冻存设备，制定统一的编码管理体系 。o 标本 位置信息会用 AA-BB