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文档简介

生 物 化 学 李伟国 电话:Email: 二十一世纪二十一世纪 生命科学世纪生命科学世纪 一、生物化学的定义 二、生物化学的研究内容 三、生物化学的发展简史 四、 生物化学的成就 五、学习生物化学的必要性 六、生物化学课程与学习 一 、 什么是生物化学 (Biochemistry) ? 是研究生物体内化学分子与化学反应 (生命化学 )的科学 ,它运用化学原理和方法从分子水平探讨生命现象的本质 是介于生物与化学之间的边缘学科,是利用化学的理论和方法研究 生物的一门学科,其任务是阐述构成生物体的基本物质(生物大分子 糖类、脂类、蛋白质、核酸)的结构、性质及其在生命活动(如生长、 生殖、代谢、运动等)过程中的变化规律(物质代谢和能量代谢) 生物化学研究的方法: 主要采用化学的原理和方法,同时也与生物物理、生理 学、细胞学、 遗传学和免疫学相联系和交叉。 二 、 生物化学的主要研究内容 n 生物分子和结构与功能: 探讨生物体的物质组成 以及分子结构、性质和功能 n 物质代谢及其调节: 物质代谢的规律、能量转化 及其调节控制 n 基因信息传递规律及其调控: DNA复制、 RNA转录 、蛋白质翻译等 n 通常将生物大分子结构、功能及其代谢调控的研 究称为 分子生物学 n 从分子水平研究遗传学,并运用这些规律去改造 自然,称 基因工程 n 生物化学 (Biochemistry、 Biological Chemistry、 Chemistry of Life、 Physiological Chemistry) 研究生物体的化学组成和生命过程中的化学变化规律 n 分子生物学 (Molecular Biology) 研究生物大分子 (核酸 /蛋白 )结构功能及其之间的关系 , 对生物化学过程的调节控制结构与功能 (复制、转录、翻译 遗传信息 )之间的关系 生物化学与分子生物学生物化学与分子生物学 (Biochemistry & Molecular Biology) 生物分子: 无机小分子 ( H2O、 CO2、 Ca2+、 Mg2+等) 代谢中间物 (丙酮酸、柠檬酸、苹果酸等) 构件分子 (氨基酸、核苷酸、单糖等) 生物大分子 (核酸、蛋白质、 脂类、 多糖等) 超分子 (核糖体、酶复合体、微管等) 细胞器 (细胞核、线粒体、高尔基体等) 实验研究 /技术方法 n 生物化学是以实验技术为前提的 n 技术方法的新进展推动生物化学的 深入研究 生物化学的分类 n 根据对象 人、动物、植物、微生物 n 根据生物的进化程度 原核生物 (Prokaryote) 真核生物 (Eukaryote) n 根据应用目的 医学 (药学 )生化、营养生化等 三、生物化学的发展简史 起源于 18世纪晚期, 19世纪逐步发展,到 20 世纪初期发展成为一门独立学科, 20世纪 50年代 以后随着生物大分子结构与功能的研究及分子生 物学的兴起,生物化学进入了一个崭新的发展时 期。 三、生物化学的发展简史 生物化学的发展简史 n 起始阶段: 18世纪 20世纪初。 研究了脂类、糖 类及氨基酸;发现了核酸;酵母发酵中的 “ 可溶 性催化剂 ” -酶的概念 法国科学家 Lavoisier ( 1743-1794) 研究了动物的体温和 呼吸 德国 Neuberg (1877-1951) 于 1903年提出 “生物化学 ”这个 名词, 生物化学才成为一门独立的学科,在此之前,由有 机化学和生理学分别研究 20世纪的前 30年:生理学、化学 营养学 的真正的黄金时代 20年代: 1926年美国 Sumner从刀豆中得到 脲酶的结晶 30年代: 1933 1936年 Krebs提出了著名的 尿素循环和 三羧酸循环 40年代前后:能量代谢, 生物能学 20世纪中期生物化学成为一门独立和成熟的学科 快速发展阶段: 20世纪初 下叶。 必需氨基酸、 维生素的发现;酶的蛋白质本质揭示;多种激素 的发现;主要物质代谢途径的确定。 分子生物学的崛起阶段: 20世纪下叶 至今 分子生物学的出现 基因工程 与代谢调节 1950年 美国 Pauling等 蛋白质的二级结构 - 螺旋 1955年 英国 Sanger 胰岛素一级结构的测定 1953年 美国 Watson 和英国 Crick DNA双螺旋结构 DNA双螺旋结构的提出使生物化学发展到一个新的阶段 分子 生物学阶段 , 这以后,核酸的研究进展很快,在核酸一级结构测定和 核酸人工合成方面取得显著成果。 60年代 1961年法国 Jacob和 Monod 操纵子模型 70年代 进入生物工程的研究 基因工程、蛋白质工程、酶工程、细胞工程、发酵工程等。 第一个基因工程的产物为 somatostatin 90年代 1990年启动了人类基因组计划。 20世纪末和 21世纪初,随着人类基因组全序列测定的 基本完成,生命科学进入了后基因组时代,产生了功能 基因组学、蛋白质组学、结构基因组学等 分子生物学的重要事件 n 50年代: 蛋白质 -螺旋结构的发现 1953年 Watson 和 Crick提出了 DNA双 螺旋结构模型 分子生物学里程碑 分子遗传学中心法则的提出;遗传密 码的破译等 70年代: 建立了 DNA重组技术 基因工程 基因诊断和基因治疗的发展 80年代: 发现了核酶( ribozyme) PCR技术的发明 90年代: 开始了人类基因组计划 (human genome project, HGP),约 2.6109 碱基、 10万个基因 (实际 3-4 万个) 四、生物化学的成就 n 1953年, DNA双螺旋结构模式 n 1958年,分子遗传的中心法则 n 1970年,基因工程方法的建立 n 1981年,发现有催化功能的 RNA( Ribozyme ) n 1985年,人类基因组作图和测序计划 n 1997年,第一只克隆羊诞生 n 1999年,干细胞的研究位列当年科技重大突破 n 2002年, RNAi荣登重大科技突破榜首 DNA双螺旋结构模型 DNA分子结构是由美国生物学家沃森( James Dewey Watson,1926 ) 和 英国生物物理学家 克里克( Francis Harry Compton Crick,1916 ) 所确 定的。克里克于 1949年入剑桥大学卡文迪什实验室医学研究组。 1951年 沃森来到该研究所,克里克接受了他的观点:了解 DNA三维结构即可明 了它在遗传中所起的作用。 1953年,他们建立了 DNA双螺旋结构模式 ,并 跟已知的物理 化学性质相符合。这一发现成为分子生物学的里程碑, 后来他们分享了 1962年的诺贝尔生理医学奖。 返回 分子遗传的中心法则 中心法则 (central dogma)是指遗传信息的流向所遵循的法则。 Crick 提出,在 DNA分子可以自我复制( replication) 传给子代的基础上,遗 传信息可以从 DNA传递给 RNA( 称为转录 transcription) 再从 RNA传递 给蛋白质(称为翻译 translation), 这是遗产信息流所遵循的中心法则 。 Temin又证实 RNA也可以是遗传信息的携带者,即 DNA以 RNA为模 板反向转录合成,再推动 RNA的合成及蛋白质的合成。 返回 基因工程方法的建立 1970年, Temin和 Baltimore从鸡肉瘤病毒中发 现反转录酶。 Smith和 Wilcox 在 E.coli中发现芽豆类限制性内 切酶 ,由此为基因工程方法的建立打下了基础 。 返回 Ribozyme 1978年, Altman在提纯 RNAase时发现,此酶由蛋白质和 一个 RNA片段组成,单独的 RNA能完成对前体 tRNA的剪切, 而单独的蛋白质却无此能力。 1981年, Cech在研究四膜虫前 体 rRNA的加工过程中发现,在没有蛋白质存在的情况下,一 段 RNA序列( IVS) 能进行自动剪切,生成 L-19IVS。 后者在 离体条件下能催化五聚胞嘧啶核苷酸的合成。由此提出了具 有催化功能的核酸( Ribozyme) 的概念。 Ribozyme的 提出为解决人类的起源问题提供了一种新的 假说,为此, Cech与 Altman共同获得了 1989年化学诺贝尔奖 。 返回 “ 人类基因组作图和测序 ” 计划 1985年,美国科学家率先提出 “ 人类基因组测序和作图 ” 计划(简 称 HGP)。 国际合作始于 1990年 该计划的核心就是测定人类基因 组的全部 DNA序列,从整体上破译人 类遗传信息,以使人类能在分子水 平上全面地认识自我。 HGP的精神是:全球共有,国际 合作。即时公布,免费共享。 人类基因组计划顺利完成 2000年 6月 26日,参与人类基因组计划 的各国科学家,同时向全世界宣布人类基因 组 “ 工作框架图 ” 绘制完成。 2004年 10月 21日出版的 自然 杂志公 布了人类基因组最精确的序列(包含有 28.5 亿个碱基对),同时澄清人类基因组只有 2 到 2.5万个基因(而不是原来的 10万个基因 ) 这篇文章标志着人类基因组计划又迈出 了里程碑意义的一步。 人类基因组计划的应用前景 n 将揭示生命世界的一些重大奥秘 ,如生命起源,生物进化等 n 将应用于疾病的诊断和治疗,将 改变 21世纪的医学 n 将大大促进生命科学工业的发展 ,特别是基因制药工业的发展 1995 完成原核生物 Hemophilus luenzae的基因组测序 1996 完成啤酒酵母的基因组测序 1997 完成大肠杆菌的基因组测序 2000 人类基因组序列框架(中国完成 1%) 2000 拟南芥基因组序列(第一个高等植物) 2002 水稻 (日本粳米 )基因组 (中国完成 10%) 水稻 (籼稻 )基因组序列框架图 (中国独立完成 ) 2003 中国家蚕基因组框架图 (中国独立完成 ) 人类基因组计划实施以来的成就 2004 鸡基因组测序完成 (中、英、瑞典、荷兰、德、美 ) 2005 家猪基因组序列公布 (中国、丹麦 ) 犬基全因组测序 2007 葡萄全基因组测序完成 “炎黄一号 ”中国人基因组序列图谱 2008 玉米全基因组测序完成 2008 甲虫赤拟谷盗全基因组测序 2009 美国能源部联合基因组研究所群体测序项目继续支 持 44个 DNA测序计划,包括火炬松、浮萍、 棉花、木 质素退化真菌、产油微藻和几种纤维素退化细菌等 返回 克隆羊诞生 1997年 2月 23日,英国 罗斯林研究所宣布,他们 成功创造了世界上第一个 克隆羊 多莉。它的意义 在于,人类已能用高度分 化的乳腺细胞作为核供体 ,通过无性繁殖方法,复 制出与核供体完全一致的 新个体。 返回 1999年干细胞的研究工作位列年度科 学技术重大突破首位 干细胞( stem cell) 是一类既有自我更新 能力,又有多分化潜能的细胞。干细胞的研究 一方面可以揭示许多有关细胞生长和发育的基 础理论难题;另一方面可望将其用于创伤修复 ,神经再生和抗衰老等临床医学研究。 返回 2002年 RNAi荣登重大科技突破榜首 RNA曾被认为是一种缺乏活力的生物分子, 但最近一系列发现表明,一种称作小 RNA的 RNA分子参与着多项细胞控制工作,能够关闭 基因或改变它们的表达水平。这一现象称为核 糖核酸介入( RNAi), 它是体内抵御外在感染 的一种重要保护机制。小 RNA的这种功能有可 能使 21世纪的医药研究产生革命性的变化。 2006年诺贝尔生理学或医学奖 我国生物化学发展 20世纪 20年代后期建立了制备血滤液的方法以及测定血糖的 方法( Folin-Wu法) 20世纪 30年代, 1931年蛋白质变性理论 1965年全合成结晶牛胰岛素;是世界上公认的第一 个具有全部生物活性的蛋白质人工合成 1981年又首先人工合成了具有生物活性的酵母丙氨 酸转移核糖核酸 (tRNAAla) 80年代后的生物工程 吴宪教授的工作 五、为什么要学习生物化学? n 化学与生命科学的交叉 化学生物学的内涵: 采用化学手段研究生物问题 采用生物手段研究化学问题 Bio-X研究中心 n 生物化学与生活息息相关 营养生化:保健品 医学生化:疾病诊断 n 培养复合型人才的需要 既懂化学又懂生物 切入点:样品制备 、 生物分析等 n 生物化学是学习生命科学的基础 生物化学 、 分子生物学 、 细胞生物学 、 微生物学 、 神经生物学 、 生理学、医 学、药学等 为什么要学习生物化学? 我们能做什么? n 生命科学研究中的化学问题 生物大分子结构与功能的关系 代谢途径及中间产物 n 生命科学研究的分析方法 新的方法往往会带来生命科学的飞跃式 发展 1929年 年 A. 哈登(英),冯哈登(英),冯 奥伊勒奥伊勒 歇尔平(瑞典)歇尔平(瑞典) 阐明糖发酵过程和酶的作用阐明糖发酵过程和酶的作用 1946年 年 J. B. 萨姆纳(美)、萨姆纳(美)、 J. H. 诺思罗普,诺思罗普, W. M. 斯坦斯坦 利(美)利(美) 分离提纯酶和病毒蛋白质分离提纯酶和病毒蛋白质 1958年 年 F. 桑格(英) 桑格(英) 胰岛素结构研究胰岛素结构研究 1981年 福井谦一(日)、年 福井谦一(日)、 R. 霍夫曼(英)霍夫曼(英) 确定核酸碱基排列顺序确定核酸碱基排列顺序 1984年 年 R.B. 梅里菲尔德(美) 梅里菲尔德(美) 开发了极简便的肽合成法开发了极简便的肽合成法 与生物化学相关的 诺贝尔化学奖诺贝尔化学奖 1989年 S. 奥尔特曼, T.R. 切赫 (美) RNA自身具有酶的催化功能 1993年 K.B. 穆利斯(美) 发明 “聚合酶链式反应 ”法 M. 史密斯(加拿大) 开创 “寡聚核苷酸基定点诱变 ”法 1997年 P.B.博耶(美)、 J.E.沃克尔(英)、 J.C.斯科(丹 麦 ) 发现人体细胞内负责储藏转移能量的离子传输酶 “ 据统计 ,90年代的化学以及医学 /生理学诺贝尔 奖获得者的工作 40%都可以归属于生物化学的范畴 ” 2002年 约翰 芬恩(美)、田中耕一(日) 发明了生物大分 子的质谱分析法 库尔特 维特里希(瑞士) 发明了对生物大分子进行确认和结构分析的方 法 2003年 彼得 阿格雷(美)、罗德里克 麦金农(美) 在细胞膜通道方面 做出的开创性贡献。 2004年 阿龙 -西查诺瓦、阿弗拉姆 -赫尔什科(以)和 伊尔 温 -罗斯(美) 泛素调节的蛋白质降解 2006年 罗杰 科恩伯格 (美 ) 阐明了真核细胞转录的具体机理 2008年诺贝尔化学奖 “ 在发现和研究绿色荧光蛋白方面做出贡献 ” 下村修 (日本 ) 马丁 沙尔菲 (美国 ) 哥伦比亚大学 钱永健 (美国

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