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文档简介
医学图像格式转换及读取与显示 1. 医学图像格式转换 通常从机器拷贝出来的医学图像数据为 DICOM 格式,如果是多种模态图像混合,则 需要使用 Dcm2AsiszImg.exe 工具把多模态图像分类出来,软件如下图所示: Dcm2AsiszImg 是一个接收、发送 DICOM 图像、把 DICOM 图像进行分类、 把 DICOM 转化为安科 Img 图像格式的软件工具。 用法: “输出目 录” 选择待转 化的图像保存路径, “DICOM 图像分类”选择要转化的原始图像目 录,最后点击“DICOM 图像分类”,输出图像分辨率 为 256*256。 常用的图像格式还有 ANALYZE 和 NIFTI,ANALYZE 格式的图像包括图像文件.img 和头文件.hdr, 应用于 SPM2。NIFTI 把图像文件和头文件合并为.nii 文件,应用于 SPM8、FSL、FreeSurfer 等。可以利用 MRICron 软件的 dcm2niigui.exe 插件把 DICOM 格式 转化为 ANALYAZE 和 NIFTI 格式。 在 Help 下的 preference 处可设置输出参数: 2. 读取与显示 DICOM 图像 Matlab 提供了 dicominfo、dicomdict、dicomdisp、dicomread、dicomuid 、dicomwrite 函数, 可实现 DICOM 格式图像的读取、显示、保存等操作,以及查看扫描信息。 3. 读取与显示 NIFTI 格式图像 MRIcro 软件可以 显示 NIFTI 图像 NIfTI 这个 Matlab 程序可以读取显示、保存、制作核磁共振图像。 具体如下: hdr,filetype,fileprefix,machine = load_nii_hdr(output.hdr); img,hdr = load_nii_img(hdr,filetype,fileprefix,machine); save_nii(nii, filename, old_RGB); SPM 方法: help spm_read_vols V = spm_vol_nifti(output.hdr) Y,XYZ = spm_read_vols(V); 4. Freesurfer 的 mgh 图像读取与显示 Freesurfer 安装目录下有一
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