课件：刘红星-综合性血液病分子诊断体系.pptx

综合性血液病分子诊断体系 的建立和实践,刘红星 陆道培血液肿瘤中心 分子诊断室,我们一直在进步,更强的团队力量 更好的硬件支持 更多的新项目 优化的项目设置,血液病诊断和治疗已经进入分子生物学时代,第二代测序临床应用,定量PCR临床应用,定性PCR临床应用,基因组学的研究推动疾病分子标记 的发现和临床应用,97.3%的AML患者携带其中一种或以上的基因突变 预后差：FLT3-ITD、MLL-PTD、ASXL1、PHF6 预后好：CEBPA、IDH2、NPM1伴IDH1/IDH2突变 伴DNMT3A、NPM1突变、MLL易位患者，采用大剂量的柔红霉素治疗可提高生存率,Prognostic Relevance of Integrated Genetic Profiling in Acute Myeloid Leukemia Jay P. Patel, et al., N Engl J Med 2012;366:1079-89,肿瘤的突变组,每一个肿瘤的发生都是一个基因团伙在犯罪 每一个肿瘤基因组都是不同的基因突变的组合 白血病分子诊断 只根据一种融合基因分类的患者仍有异质性 AML1-ETO VS. AML1-ETO+KIT突变 只检测一种突变也是不够的 NPM1 VS. FLT3 VS. NPM1+FLT3 新的突变出现提前可能预示临床进展 急变、耐药等 对肿瘤突变组的全面了解有助于指导个性化治疗,分子诊断的发展趋势及挑战,Lucy A. Godley, DOI:0.1056/NEJMe1200409,分子诊断临床应用遇到的问题,临床医师如何认识新的项目？ 实验室如果向临床医师推荐新的项目？ 如何提高突变的检测灵敏度？ 如何降低检测费用？提高发现分子标记的速度？,综合性血液病分子诊断体系,个体差异相关的药物代谢、药物不良反应等,其它项目：移植后嵌合状态；IG、TCR克隆性；BCR-ABL1变异分析等,孟德尔遗传病：先天性免疫缺陷、范可尼贫血等,“活在当下”与“追本溯源” 用初治时的石蜡、形态涂片标本进行基因突变筛查 从实验方案和流程设计上加快报告速度 新技术的应用和技术创新 融合基因和基因突变筛查 针对性监测 降低总体检测费用，争取宝贵时间 内容将不断增加，价格一般不再调整,综合性血液病分子诊断体系,高通量基因测序的应用,降低单位检测成本 肿瘤“突变组”分析变为可能 深度测序 突变MRD监测 IG、TCR免疫组库分析,白血病融合基因和基因突变检测,V2.3版31种融合基因筛查,新的融合基因筛查项目,AML融合基因筛查（13种） AML1-EAP(1)；AML1-ETO(1)；AML1-MDS1(2)；CBFB-MYH11(8)；DEK-CAN(1)；NPM-ALK(1)；NPM-MLF1(1)；NPM-RARA(2)；PLZF-RARA(2)；PML-RARA(5)；SET-CAN(1)；TEL-ABL1(2)；TLS-ERG(5) ALL融合基因筛查（10种） BCR-ABL1(6)；E2A-HLF(3)；E2A-PBX1(2)；NPM-ALK(1)；NPM-MLF1(1)；SET-CAN(1)；SIL-TAL1(1)；TEL-ABL1(2)；TEL-AML1(2)；TLS-ERG(5) MPN融合基因筛查（23种） AML1-MDS1(2)；BCR-ABL1(6)；FIP1L1-PDGFRA(5) ；TEL-ABL1(2)；18种PDGFRB fusion gene；TLS-ERG(5) MLL融合基因筛查(11种) MLL-PTD；MLL-AF1p(4)；MLL-AF1q(4)；MLL-AF4(12)；MLL-AF6(4)；MLL-AF9(8)；MLL-AF10(18)；MLL-AF17(1)；MLL-AFX(4)；MLL-ELL(8)；MLL-ENL(4),融合基因筛查的特点和意义,从分子水平快速鉴定患者基因异常 节省时间和总体费用 大多数情况下，某一患者只有一种融合基因阳性 提供按WHO2008标准分类的依据 预后判断和指导用药 提供灵敏的MRD监测指标,病例：格列卫治疗FIP1L1-PDGFRA白血病,男，43岁，贫血，血小板低，嗜酸粒细胞增多 31种融合基因筛查：FIP1L1-PDGFRA阳性 格列卫每周200mg每周100mg治疗 血象很快转为正常 FIP1L1-PDGFRA定量逐渐降低 20090728 32.56% 20091021 5.83% 20100426 0.0089%,基因突变筛查项目,AML基因突变筛查（11种） CEBPA；DNMT3A；FLT3-ITD/TKD；IDH1；IDH2；KIT；KRAS；NPM1；NRAS；TET2；WT1 ALL基因突变筛查（11种） FBXW7；FLT3；KRAS；IKZF1；JAK1；JAK2；NOTCH1；NRAS；PAX5；PHF6；MLL-PTD MPN基因突变筛查（7种） IDH1；IDH2；JAK2；KIT；MPL；SH2B3(LNK)；TET2 MDS基因突变筛查（8种） DNMT3A；IDH1；IDH2；JAK2；MPL；SF3B1；SRSF2；TET2,基因突变筛查的特点和意义,同一患者可能同时存在多种基因突变 可与融合基因或其它基因突变同时存在 同一患者的同一基因可能存在不同的突变 克隆性判断；诊断分型；预后判断；个体化用药 基因突变在疾病发展过程中可能会变化 FLT3、IKZF1等，与疾病进展有关 目前大多数基因突变作为MRD监测指标有困难 用高通量测序进行深度测序分析可帮助实现 可以用初诊时的石蜡、涂片标本回顾性分析,KIT基因突变,主要见于伴inv(16) /CBFB-MYH11融合基因的M4和伴t(8;21)/ AML1-ETO的M2 伴KIT突变的患者预后相对较差 伴KIT突变的患者用格列卫治疗有一定效果,IKZF1基因突变,主要见于ALL 约20%儿童B-ALL；30%成人B-ALL；5% T-ALL 约63.083.7%的BCR-ABL1阳性B-ALL 约20%染色体核型正常的B-ALL患者 MLL融合基因阳性的ALL患者常伴IKZF1突变 B-ALL患者独立的预后不良因素 CML患者急淋变时约86%发生IKZF1突变 建议CML患者复诊时检测，可提前预警急变,病例,男，30岁，形态学为M1型，柔红霉素+阿糖胞苷化疗一疗程后 NPM1突变阳性 42.15% FLT3突变阳性 31种融合基因阴性，HOX11表达阳性,血液系统遗传病分子诊断,血液系统遗传病检测项目,噬血细胞综合征相关基因突变 PRF1、UNC13D、STXBP2、STX11 SH2D1A、XIAP 范可尼贫血基因突变 FANCA 60% 、FANCC 15% 、FANCG 10% WAS综合征 遗传性铁粒幼细胞性贫血,噬血细胞综合征相关基因突变 和疱疹病毒检查结果,基因突变谱型,疱疹病毒感染谱型,先天遗传因素和疾病表型关系,范可尼贫血突变检测,部分患者可无显著的先天畸形 部分患者可染色体断裂实验阴性而基因突变阳性，不能相互替代 可提供范可尼贫血与继发再障鉴别诊断的依据,范可尼贫血基因突变患者示例,女，6岁，患者骨髓造血衰竭、发育迟缓、身材矮小、皮肤黑、两眼间距宽、多指。 染色体断裂实验及彗星电泳实验结果阳性。,致谢,分子诊断室： 王芳、滕文、王岩、牛倩、王旭、郭磊、王昊、樊江燕、管少帅、王绵绵、尹青 检验科其它实验室和临床协作 其它协作医院,Email: 新浪微博：解码生命-刘红星,后面内容直接删除就行 资料可以编辑修改使用 资料可以编辑修改使用 资料仅供参考，实际情况实际分析,主要经营：课件设计，文档制作，网络软件设计、图文设计制作、发布广告等 秉着以优质的服务对待每一位客户，做到让客户满意！ 致力于数据挖掘，合同简历、论文写作、PPT设计、计